MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris NZ9000 chromosome

Total Repeats: 29689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017949	ATT	2	6	164	169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853199
2	NC_017949	GAT	2	6	222	227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853199
3	NC_017949	ATG	2	6	248	253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853199
4	NC_017949	CGT	2	6	274	279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389853199
5	NC_017949	TGA	2	6	300	305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853199
6	NC_017949	GCA	2	6	412	417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389853199
7	NC_017949	TGG	2	6	468	473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389853199
8	NC_017949	GAT	2	6	658	663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853199
9	NC_017949	AAG	2	6	683	688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853199
10	NC_017949	ACT	2	6	826	831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389853199
11	NC_017949	CTA	2	6	871	876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389853199
12	NC_017949	CAA	2	6	1069	1074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389853199
13	NC_017949	ATT	2	6	1121	1126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853199
14	NC_017949	TGG	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389853199
15	NC_017949	ACA	2	6	1270	1275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389853199
16	NC_017949	TAA	2	6	1539	1544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389853200
17	NC_017949	ATA	2	6	1703	1708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389853200
18	NC_017949	TTA	2	6	1747	1752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853200
19	NC_017949	GCT	2	6	1756	1761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389853200
20	NC_017949	GTA	2	6	1774	1779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853200
21	NC_017949	TTG	2	6	1834	1839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853200
22	NC_017949	TTC	2	6	1917	1922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389853200
23	NC_017949	AGA	2	6	2097	2102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853200
24	NC_017949	ATG	2	6	2171	2176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853200
25	NC_017949	AAG	2	6	2177	2182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853200
26	NC_017949	TCA	2	6	2195	2200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389853200
27	NC_017949	TTA	2	6	2238	2243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853200
28	NC_017949	TGC	2	6	2328	2333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389853200
29	NC_017949	GAA	2	6	2464	2469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853200
30	NC_017949	AAG	2	6	2486	2491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853200
31	NC_017949	GAA	2	6	2617	2622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853200
32	NC_017949	ATT	2	6	2814	2819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853201
33	NC_017949	GAA	2	6	2833	2838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853201
34	NC_017949	TAC	2	6	2860	2865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389853201
35	NC_017949	CTT	2	6	2873	2878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389853201
36	NC_017949	CAG	2	6	2936	2941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389853201
37	NC_017949	AAC	2	6	2969	2974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389853201
38	NC_017949	TTA	2	6	2979	2984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853201
39	NC_017949	CAA	2	6	3005	3010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389853201
40	NC_017949	TTG	2	6	3296	3301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853201
41	NC_017949	CAG	2	6	3316	3321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389853201
42	NC_017949	GAA	2	6	3370	3375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853201
43	NC_017949	TGT	2	6	3417	3422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853201
44	NC_017949	TGA	2	6	3435	3440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853201
45	NC_017949	GAT	2	6	3489	3494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853201
46	NC_017949	CTT	2	6	3539	3544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389853201
47	NC_017949	TTA	2	6	3605	3610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853201
48	NC_017949	TGA	2	6	3612	3617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853201
49	NC_017949	AGA	2	6	3636	3641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853201
50	NC_017949	CAG	2	6	3770	3775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389853201
51	NC_017949	AAG	2	6	3794	3799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853201
52	NC_017949	AAG	2	6	3836	3841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853201
53	NC_017949	GAT	2	6	3916	3921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853201
54	NC_017949	TGA	2	6	3966	3971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853201
55	NC_017949	AGA	2	6	4038	4043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853201
56	NC_017949	ACT	2	6	4098	4103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389853201
57	NC_017949	AAT	2	6	4138	4143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389853201
58	NC_017949	TGA	2	6	4332	4337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853201
59	NC_017949	TTG	2	6	4448	4453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853201
60	NC_017949	TGA	2	6	4572	4577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853201
61	NC_017949	TGA	2	6	4746	4751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853201
62	NC_017949	TTG	2	6	5138	5143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853201
63	NC_017949	CAG	2	6	5195	5200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389853201
64	NC_017949	TGA	2	6	5208	5213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853201
65	NC_017949	AAG	2	6	5234	5239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853201
66	NC_017949	AGA	2	6	5304	5309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853201
67	NC_017949	TGA	2	6	5355	5360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853201
68	NC_017949	AGT	2	6	5383	5388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853201
69	NC_017949	TGA	2	6	5427	5432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853201
70	NC_017949	GAA	2	6	5447	5452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853201
71	NC_017949	ATG	2	6	5540	5545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853201
72	NC_017949	AGA	2	6	5727	5732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853201
73	NC_017949	GCA	2	6	5734	5739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389853201
74	NC_017949	GAA	3	9	5794	5802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853201
75	NC_017949	AAT	2	6	5886	5891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389853201
76	NC_017949	TTG	2	6	6177	6182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853202
77	NC_017949	TGA	2	6	6304	6309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853202
78	NC_017949	AAG	2	6	6477	6482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853202
79	NC_017949	TGA	2	6	6517	6522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853202
80	NC_017949	ATA	2	6	6840	6845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389853202
81	NC_017949	ATT	2	6	6898	6903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853202
82	NC_017949	TTC	2	6	6934	6939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389853202
83	NC_017949	TAG	2	6	6996	7001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853202
84	NC_017949	TTG	2	6	7035	7040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853202
85	NC_017949	ATT	2	6	7118	7123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853202
86	NC_017949	AGA	2	6	7210	7215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853202
87	NC_017949	ATG	2	6	7251	7256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853202
88	NC_017949	CTT	2	6	7313	7318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389853202
89	NC_017949	AGA	2	6	7555	7560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853202
90	NC_017949	CTT	2	6	7625	7630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389853202
91	NC_017949	GAA	2	6	7655	7660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853202
92	NC_017949	AGA	2	6	7663	7668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853202
93	NC_017949	GCA	2	6	7706	7711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389853202
94	NC_017949	TAA	4	12	7783	7794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389853202
95	NC_017949	GTT	2	6	7829	7834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853202
96	NC_017949	CAA	2	6	8140	8145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389853202
97	NC_017949	TAT	2	6	8189	8194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853202
98	NC_017949	AAT	2	6	8339	8344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389853202
99	NC_017949	TGA	2	6	8439	8444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853202
100	NC_017949	AGA	2	6	8479	8484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853202
101	NC_017949	ATG	2	6	8745	8750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853202
102	NC_017949	GAA	2	6	8936	8941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853202
103	NC_017949	ATA	2	6	8955	8960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389853202
104	NC_017949	TGA	2	6	8974	8979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853202
105	NC_017949	AAG	2	6	8985	8990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853202
106	NC_017949	TCA	2	6	9019	9024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389853202
107	NC_017949	GCT	2	6	9026	9031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389853202
108	NC_017949	CTG	2	6	9177	9182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389853202
109	NC_017949	TGA	2	6	9265	9270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853202
110	NC_017949	TGA	2	6	9280	9285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853202
111	NC_017949	AAG	2	6	9381	9386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853202
112	NC_017949	TGA	2	6	9409	9414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853202
113	NC_017949	AGG	2	6	9631	9636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389853202
114	NC_017949	TGA	3	9	9856	9864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853203
115	NC_017949	ACC	2	6	10047	10052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389853204
116	NC_017949	GAC	2	6	10389	10394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389853204
117	NC_017949	CAG	2	6	10767	10772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389853205
118	NC_017949	CAA	2	6	10860	10865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389853205
119	NC_017949	CAA	2	6	10950	10955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389853205
120	NC_017949	GAG	2	6	11001	11006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389853205
121	NC_017949	ATT	2	6	11054	11059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853205
122	NC_017949	GTT	2	6	11063	11068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853205
123	NC_017949	TGA	3	9	11077	11085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853205
124	NC_017949	AAT	2	6	11102	11107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389853205
125	NC_017949	TGA	2	6	11320	11325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853205
126	NC_017949	TTG	2	6	11357	11362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853205
127	NC_017949	AGA	2	6	11398	11403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853205
128	NC_017949	GCG	2	6	11456	11461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389853205
129	NC_017949	GAA	3	9	11501	11509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853205
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263	NC_017949	ATT	2	6	23016	23021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853217
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