MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 258 chromosome

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017945	AGCTTC	2	12	21361	21372	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017945	TATTGG	2	12	110714	110725	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017945	CTCACT	2	12	121776	121787	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017945	TTGATC	2	12	166414	166425	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017945	TGAGGG	2	12	171826	171837	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017945	TGGGGC	2	12	181839	181850	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017945	TCCTGA	2	12	187332	187343	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017945	TTTGCC	2	12	315433	315444	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017945	AGTGGG	2	12	345245	345256	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017945	GCTATA	2	12	373039	373050	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017945	ACGTTG	2	12	373570	373581	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017945	TGAGTA	2	12	386283	386294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017945	CTAAAA	2	12	393369	393380	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017945	CGCCCG	2	12	397107	397118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017945	TGGGGG	2	12	400015	400026	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017945	GTGCCT	2	12	476391	476402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017945	CCCCCG	2	12	518696	518707	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
18	NC_017945	GCGCAA	2	12	520407	520418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017945	ATAAGA	2	12	583907	583918	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017945	GTTTTT	2	12	584159	584170	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017945	GTTTTT	2	12	609442	609453	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017945	AGCGAA	2	12	610522	610533	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017945	TGCGCG	2	12	634743	634754	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017945	CTCTGG	2	12	675259	675270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017945	TGCGTA	2	12	700304	700315	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017945	TTCATA	2	12	736292	736303	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017945	GGCTGC	2	12	758674	758685	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017945	AATTTA	2	12	779134	779145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017945	AGGGGT	2	12	862640	862651	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017945	CCTTTT	2	12	921659	921670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017945	GTGGTT	2	12	954486	954497	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017945	TTTGAG	2	12	981284	981295	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017945	GTAAAG	2	12	988613	988624	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017945	GTTTTT	2	12	1023375	1023386	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017945	AGCGAA	2	12	1024454	1024465	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017945	TCAACT	2	12	1070068	1070079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017945	GGTTTG	2	12	1086025	1086036	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017945	GCGTCC	2	12	1087407	1087418	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017945	TGGGGG	2	12	1095218	1095229	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017945	GATCGC	2	12	1123483	1123494	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017945	AGAAAA	2	12	1135840	1135851	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017945	AAGCTC	2	12	1192681	1192692	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017945	GCTTCT	2	12	1271762	1271773	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017945	CAAGAA	2	12	1274623	1274634	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017945	CCCTAT	2	12	1276660	1276671	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017945	AATCTA	2	12	1401965	1401976	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017945	TATTTC	2	12	1416108	1416119	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017945	GACGGT	2	12	1434990	1435001	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017945	GTCTGT	2	12	1462721	1462732	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017945	AATTTC	2	12	1496151	1496162	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017945	CGTCAT	2	12	1525981	1525992	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017945	TCCATT	2	12	1529316	1529327	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017945	CTGTGC	2	12	1536533	1536544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017945	CAGCGA	2	12	1570101	1570112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017945	CCCCTC	2	12	1661004	1661015	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
56	NC_017945	GGCTTA	2	12	1696091	1696102	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017945	TTAGCG	2	12	1710861	1710872	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017945	ATTTTT	2	12	1719016	1719027	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017945	AGCTTT	2	12	1782935	1782946	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017945	TCATTT	2	12	1801133	1801144	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017945	ACCTTT	2	12	1808515	1808526	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017945	CCTAAC	2	12	1817747	1817758	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017945	AAGTTC	2	12	1818284	1818295	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017945	ATCCCT	2	12	1819175	1819186	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017945	CAAAGG	2	12	1819333	1819344	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017945	TTCGCT	2	12	1830323	1830334	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017945	AAAAAC	2	12	1831400	1831411	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017945	CCAGAA	2	12	1855531	1855542	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017945	AAACAA	2	12	1927739	1927750	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017945	CATTAT	2	12	1954010	1954021	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017945	CTTTCG	2	12	1960695	1960706	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017945	GGCTTT	2	12	1960844	1960855	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017945	TCCTTG	2	12	2008414	2008425	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017945	CGTATA	2	12	2010428	2010439	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017945	TACCCC	2	12	2019276	2019287	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017945	ATCTAA	2	12	2021265	2021276	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017945	TTCAAT	2	12	2045919	2045930	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017945	TTTCAT	2	12	2051545	2051556	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017945	CTTTAG	2	12	2072419	2072430	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017945	CCCCCG	2	12	2099301	2099312	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
81	NC_017945	ACTGCT	2	12	2145495	2145506	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017945	TCAAAG	2	12	2147626	2147637	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017945	CATAGA	2	12	2164170	2164181	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017945	AGAAAA	2	12	2172505	2172516	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017945	TTCGCT	2	12	2207652	2207663	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017945	AAAAAC	2	12	2208732	2208743	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017945	TTACCC	2	12	2216265	2216276	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017945	GAATAG	2	12	2217257	2217268	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017945	CACCGG	2	12	2224008	2224019	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017945	TTTTCT	2	12	2304053	2304064	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.