Hexa-nucleotide Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM500

Total Repeats: 213

Go To Repeat Summary Page

Download The Result in

S.No.Genome IDMotifIterationsLengthStartEndA%T%G%C% Protein ID
1NC_017944ATGGCG212102511026216.67 %16.67 %50 %16.67 %389848888
2NC_017944CTGGCG21211835118460 %16.67 %50 %33.33 %389848891
3NC_017944ACGAGC212121771218833.33 %0 %33.33 %33.33 %389848891
4NC_017944TTTTCG21212787127980 %66.67 %16.67 %16.67 %389848892
5NC_017944TCCCCG21213400134110 %16.67 %16.67 %66.67 %389848892
6NC_017944CACGAC212136471365833.33 %0 %16.67 %50 %389848892
7NC_017944TACGAC212143751438633.33 %16.67 %16.67 %33.33 %389848893
8NC_017944CGGAGG212161731618416.67 %0 %66.67 %16.67 %389848894
9NC_017944TCGTCT21220068200790 %50 %16.67 %33.33 %389848899
10NC_017944CGAACG212213312134233.33 %0 %33.33 %33.33 %389848901
11NC_017944AGTACA212220062201750 %16.67 %16.67 %16.67 %389848902
12NC_017944ATCGAC212263922640333.33 %16.67 %16.67 %33.33 %389848905
13NC_017944TCGAAC212264412645233.33 %16.67 %16.67 %33.33 %389848905
14NC_017944TTCGAG212265902660116.67 %33.33 %33.33 %16.67 %389848905
15NC_017944CATCGA212268382684933.33 %16.67 %16.67 %33.33 %389848905
16NC_017944GGACAT212270392705033.33 %16.67 %33.33 %16.67 %389848905
17NC_017944GAAGGG212273682737933.33 %0 %66.67 %0 %389848906
18NC_017944CGAGGA212341553416633.33 %0 %50 %16.67 %389848909
19NC_017944ATGACG212368463685733.33 %16.67 %33.33 %16.67 %389848910
20NC_017944GACTCC212418994191016.67 %16.67 %16.67 %50 %389848915
21NC_017944GCTGAA212577635777433.33 %16.67 %33.33 %16.67 %389848928
22NC_017944GGTGAT212627636277416.67 %33.33 %50 %0 %389848933
23NC_017944CTGTCG21264200642110 %33.33 %33.33 %33.33 %389848934
24NC_017944TCGGGG21264414644250 %16.67 %66.67 %16.67 %389848934
25NC_017944GAGGTA212702167022733.33 %16.67 %50 %0 %389848940
26NC_017944CATGTT212703337034416.67 %50 %16.67 %16.67 %389848940
27NC_017944TGGGTG21273811738220 %33.33 %66.67 %0 %389848941
28NC_017944CTCTCG21275076750870 %33.33 %16.67 %50 %389848942
29NC_017944GTCGAC212756977570816.67 %16.67 %33.33 %33.33 %389848942
30NC_017944GCGACG212826868269716.67 %0 %50 %33.33 %389848943
31NC_017944AACCGA212839248393550 %0 %16.67 %33.33 %389848945
32NC_017944CACGGG212925289253916.67 %0 %50 %33.33 %389848955
33NC_017944CGACCG212928169282716.67 %0 %33.33 %50 %389848955
34NC_017944AGACGA212937629377350 %0 %33.33 %16.67 %389848957
35NC_017944CCGAGA21210210710211833.33 %0 %33.33 %33.33 %389848963
36NC_017944GTTCGG2121025961026070 %33.33 %50 %16.67 %389848963
37NC_017944ACTTCG21210510010511116.67 %33.33 %16.67 %33.33 %389848967
38NC_017944GGAGAT21210667910669033.33 %16.67 %50 %0 %389848969
39NC_017944GAACAA21210785710786866.67 %0 %16.67 %16.67 %389848971
40NC_017944TCATCG21211239311240416.67 %33.33 %16.67 %33.33 %389848977
41NC_017944GCGCTC2121145931146040 %16.67 %33.33 %50 %389848981
42NC_017944CATACA21211687311688450 %16.67 %0 %33.33 %389848983
43NC_017944GGTATG21212269412270516.67 %33.33 %50 %0 %389848990
44NC_017944GCAGTC21213167313168416.67 %16.67 %33.33 %33.33 %389848999
45NC_017944GTTCGA21213176513177616.67 %33.33 %33.33 %16.67 %389848999
46NC_017944ACCTGC21213857413858516.67 %16.67 %16.67 %50 %389849002
47NC_017944TCGGTG2121433231433340 %33.33 %50 %16.67 %389849005
48NC_017944ACTCCA21214637114638233.33 %16.67 %0 %50 %389849007
49NC_017944ACCGGC21214716114717216.67 %0 %33.33 %50 %389849007
50NC_017944TCGATA21214778114779233.33 %33.33 %16.67 %16.67 %389849008
51NC_017944GGGTCG2121479941480050 %16.67 %66.67 %16.67 %389849008
52NC_017944GATTCG21214939714940816.67 %33.33 %33.33 %16.67 %389849009
53NC_017944TGACGA21214956614957733.33 %16.67 %33.33 %16.67 %389849009
54NC_017944CTGTCA21214990814991916.67 %33.33 %16.67 %33.33 %389849010
55NC_017944ACATTC21215485515486633.33 %33.33 %0 %33.33 %389849014
56NC_017944GTCGTG2121560881560990 %33.33 %50 %16.67 %389849015
57NC_017944CATCAC21215840515841633.33 %16.67 %0 %50 %389849017
58NC_017944GTTGTG2121611551611660 %50 %50 %0 %389849019
59NC_017944TGTCGT2121611961612070 %50 %33.33 %16.67 %389849019
60NC_017944CATTGT21216153416154516.67 %50 %16.67 %16.67 %389849019
61NC_017944CCGTCG2121658541658650 %16.67 %33.33 %50 %389849022
62NC_017944CGCTGG2121672691672800 %16.67 %50 %33.33 %389849023
63NC_017944TGACGG21216798316799416.67 %16.67 %50 %16.67 %389849024
64NC_017944TCGAGT21217067417068516.67 %33.33 %33.33 %16.67 %389849026
65NC_017944CTCACT21217477417478516.67 %33.33 %0 %50 %389849031
66NC_017944CCCGAC21217785317786416.67 %0 %16.67 %66.67 %389849033
67NC_017944CCGATA21217955117956233.33 %16.67 %16.67 %33.33 %389849034
68NC_017944GCTGAC21218194118195216.67 %16.67 %33.33 %33.33 %389849036
69NC_017944TAGAGA21218535818536950 %16.67 %33.33 %0 %389849038
70NC_017944GTCCCA21218586418587516.67 %16.67 %16.67 %50 %389849039
71NC_017944GGGACT21218963718964816.67 %16.67 %50 %16.67 %389849042
72NC_017944GGGACT21218965518966616.67 %16.67 %50 %16.67 %389849042
73NC_017944GTTGAT21218992618993716.67 %50 %33.33 %0 %389849042
74NC_017944GGTGAC21219647519648616.67 %16.67 %50 %16.67 %389849047
75NC_017944GCGTCG2122011532011640 %16.67 %50 %33.33 %389849051
76NC_017944TTCAGG21220935620936716.67 %33.33 %33.33 %16.67 %389849060
77NC_017944CGGGCA21221413521414616.67 %0 %50 %33.33 %389849065
78NC_017944CGTGTT2122208002208110 %50 %33.33 %16.67 %389849072
79NC_017944TCCCTG2122230752230860 %33.33 %16.67 %50 %389849073
80NC_017944GCGGTC2122242922243030 %16.67 %50 %33.33 %389849074
81NC_017944GTTGGC2122249012249120 %33.33 %50 %16.67 %389849074
82NC_017944CAGAGA21222942322943450 %0 %33.33 %16.67 %389849080
83NC_017944CCATCG21223207523208616.67 %16.67 %16.67 %50 %389849084
84NC_017944CGACAT21223248423249533.33 %16.67 %16.67 %33.33 %389849084
85NC_017944AGCCTC21223873323874416.67 %16.67 %16.67 %50 %389849090
86NC_017944CGTCAG21223918523919616.67 %16.67 %33.33 %33.33 %389849090
87NC_017944GAACGA21223993623994750 %0 %33.33 %16.67 %389849091
88NC_017944CGGTGA21224037024038116.67 %16.67 %50 %16.67 %389849091
89NC_017944GTCACT21224048224049316.67 %33.33 %16.67 %33.33 %389849091
90NC_017944CGTCAG21224509224510316.67 %16.67 %33.33 %33.33 %389849093
91NC_017944CGACAC21224680124681233.33 %0 %16.67 %50 %389849094
92NC_017944CGTTCG2122469802469910 %33.33 %33.33 %33.33 %389849094
93NC_017944CATCGA21224768324769433.33 %16.67 %16.67 %33.33 %389849094
94NC_017944CAGCGA21224873824874933.33 %0 %33.33 %33.33 %389849095
95NC_017944GTTCGA21225243825244916.67 %33.33 %33.33 %16.67 %389849099
96NC_017944TCTACC21225404525405616.67 %33.33 %0 %50 %389849100
97NC_017944CGTTCA21225519125520216.67 %33.33 %16.67 %33.33 %389849102
98NC_017944GTTCGA21226016026017116.67 %33.33 %33.33 %16.67 %389849106
99NC_017944CGCTGA21226023526024616.67 %16.67 %33.33 %33.33 %389849106
100NC_017944GTCCCG2122730562730670 %16.67 %33.33 %50 %389849123
101NC_017944CAACGA21227744727745850 %0 %16.67 %33.33 %389849128
102NC_017944CCAGCG21228241228242316.67 %0 %33.33 %50 %389849134
103NC_017944CCGTTC2122839722839830 %33.33 %16.67 %50 %389849138
104NC_017944TCCTGT2122848972849080 %50 %16.67 %33.33 %389849138
105NC_017944GGTCGG2122858222858330 %16.67 %66.67 %16.67 %389849139
106NC_017944GCCGCG2122859532859640 %0 %50 %50 %389849139
107NC_017944CTCGTC2122882972883080 %33.33 %16.67 %50 %389849140
108NC_017944GTTGAC21228831828832916.67 %33.33 %33.33 %16.67 %389849140
109NC_017944GACGTC21228919528920616.67 %16.67 %33.33 %33.33 %389849141
110NC_017944CGACAT21228957228958333.33 %16.67 %16.67 %33.33 %389849141
111NC_017944GAACCC21229198529199633.33 %0 %16.67 %50 %389849143
112NC_017944TACGTC21229256129257216.67 %33.33 %16.67 %33.33 %389849143
113NC_017944TACGTC21229659329660416.67 %33.33 %16.67 %33.33 %389849147
114NC_017944TTTCGC2122983132983240 %50 %16.67 %33.33 %389849149
115NC_017944TCACCG21230037130038216.67 %16.67 %16.67 %50 %389849150
116NC_017944CCACGT21230062730063816.67 %16.67 %16.67 %50 %389849150
117NC_017944CGACGG21230643530644616.67 %0 %50 %33.33 %389849157
118NC_017944GACCAC21230796830797933.33 %0 %16.67 %50 %389849158
119NC_017944CGCGGC2123100453100560 %0 %50 %50 %389849162
120NC_017944CAACGC21231012331013433.33 %0 %16.67 %50 %389849162
121NC_017944ACACCG21232063432064533.33 %0 %16.67 %50 %389849173
122NC_017944AGCCGA21232452632453733.33 %0 %33.33 %33.33 %389849177
123NC_017944TCGGCG2123261603261710 %16.67 %50 %33.33 %389849178
124NC_017944ACGAGG21232718032719133.33 %0 %50 %16.67 %389849178
125NC_017944CAACTC21232734432735533.33 %16.67 %0 %50 %389849178
126NC_017944CACGAA21233676533677650 %0 %16.67 %33.33 %389849188
127NC_017944GAACGA21233861533862650 %0 %33.33 %16.67 %389849189
128NC_017944TCGTCC2123462493462600 %33.33 %16.67 %50 %389849195
129NC_017944TCGATT21234957934959016.67 %50 %16.67 %16.67 %389849200
130NC_017944GCGTCG2123508013508120 %16.67 %50 %33.33 %389849201
131NC_017944CGCGGC2123511603511710 %0 %50 %50 %389849201
132NC_017944TCGGCA21235159635160716.67 %16.67 %33.33 %33.33 %389849201
133NC_017944GACGTG21235250635251716.67 %16.67 %50 %16.67 %389849202
134NC_017944GGCACG21235383035384116.67 %0 %50 %33.33 %389849203
135NC_017944GGCGAG21235445235446316.67 %0 %66.67 %16.67 %389849204
136NC_017944GTAGCG21236124036125116.67 %16.67 %50 %16.67 %389849210
137NC_017944GGAGTT21236319536320616.67 %33.33 %50 %0 %389849212
138NC_017944ACCGAA21236326736327850 %0 %16.67 %33.33 %389849212
139NC_017944GCCCGC2123716323716430 %0 %33.33 %66.67 %389849219
140NC_017944GTCGGC2123768143768250 %16.67 %50 %33.33 %389849227
141NC_017944CGACCT21237803437804516.67 %16.67 %16.67 %50 %389849228
142NC_017944CTACGG21238140738141816.67 %16.67 %33.33 %33.33 %389849231
143NC_017944TGACGA21238321838322933.33 %16.67 %33.33 %16.67 %389849233
144NC_017944GGTGGC2123851123851230 %16.67 %66.67 %16.67 %389849236
145NC_017944TCGCGC2123853713853820 %16.67 %33.33 %50 %389849236
146NC_017944GTTCGG2123868403868510 %33.33 %50 %16.67 %389849237
147NC_017944CGGTAT21238763238764316.67 %33.33 %33.33 %16.67 %389849238
148NC_017944GACGTG21239151439152516.67 %16.67 %50 %16.67 %389849244
149NC_017944TGGGCG2123952973953080 %16.67 %66.67 %16.67 %389849250
150NC_017944CGGCGA21239714239715316.67 %0 %50 %33.33 %389849252
151NC_017944ATCGAA21240097640098750 %16.67 %16.67 %16.67 %389849255
152NC_017944CAGCAT21240350340351433.33 %16.67 %16.67 %33.33 %389849261
153NC_017944TCAACG21240439140440233.33 %16.67 %16.67 %33.33 %389849262
154NC_017944TACGAC21240980440981533.33 %16.67 %16.67 %33.33 %389849269
155NC_017944GTCGAG21241068641069716.67 %16.67 %50 %16.67 %389849270
156NC_017944GTCCTC2124107794107900 %33.33 %16.67 %50 %389849270
157NC_017944CCCATC21241096041097116.67 %16.67 %0 %66.67 %389849270
158NC_017944ACTCGA21241203941205033.33 %16.67 %16.67 %33.33 %389849272
159NC_017944CGCCGA21241495441496516.67 %0 %33.33 %50 %389849275
160NC_017944CGAGCG21241624041625116.67 %0 %50 %33.33 %389849276
161NC_017944CGGAAT21241665541666633.33 %16.67 %33.33 %16.67 %389849276
162NC_017944GTACGA21241971741972833.33 %16.67 %33.33 %16.67 %389849279
163NC_017944CGAGTG21242264742265816.67 %16.67 %50 %16.67 %389849282
164NC_017944GTGAGG21242330642331716.67 %16.67 %66.67 %0 %389849283
165NC_017944CGACGT21242899242900316.67 %16.67 %33.33 %33.33 %389849293
166NC_017944GCTGTC2124441924442030 %33.33 %33.33 %33.33 %389849308
167NC_017944GGTCGA21244769244770316.67 %16.67 %50 %16.67 %389849311
168NC_017944CTTCGA21244771344772416.67 %33.33 %16.67 %33.33 %389849311
169NC_017944TCGACA21244933544934633.33 %16.67 %16.67 %33.33 %389849312
170NC_017944TCTCGA21244973244974316.67 %33.33 %16.67 %33.33 %389849312
171NC_017944TCGACG21244985144986216.67 %16.67 %33.33 %33.33 %389849312
172NC_017944ACGTCG21244990244991316.67 %16.67 %33.33 %33.33 %389849312
173NC_017944CCTCGA21244995744996816.67 %16.67 %16.67 %50 %389849312
174NC_017944GTCCCC2124503284503390 %16.67 %16.67 %66.67 %389849312
175NC_017944TCGACA21245096245097333.33 %16.67 %16.67 %33.33 %389849313
176NC_017944CTCGAA21245113245114333.33 %16.67 %16.67 %33.33 %389849313
177NC_017944GTCGAT21245133345134416.67 %33.33 %33.33 %16.67 %389849313
178NC_017944ACGTCG21245167645168716.67 %16.67 %33.33 %33.33 %389849313
179NC_017944CTTCGA21245173145174216.67 %33.33 %16.67 %33.33 %389849313
180NC_017944CATCGC21245189945191016.67 %16.67 %16.67 %50 %389849313
181NC_017944TGTGGT2124549464549570 %50 %50 %0 %389849317
182NC_017944CGAGTT21245568845569916.67 %33.33 %33.33 %16.67 %389849318
183NC_017944CGACCC21245592845593916.67 %0 %16.67 %66.67 %389849318
184NC_017944GAGACC21245612445613533.33 %0 %33.33 %33.33 %389849318
185NC_017944ACGAAT21245638245639350 %16.67 %16.67 %16.67 %389849319
186NC_017944CCATCG21245738445739516.67 %16.67 %16.67 %50 %389849319
187NC_017944GACAGT21245809145810233.33 %16.67 %33.33 %16.67 %389849319
188NC_017944ATGTCC21245944445945516.67 %33.33 %16.67 %33.33 %389849320
189NC_017944TCGACA21245982545983633.33 %16.67 %16.67 %33.33 %389849320
190NC_017944TCGAAG21246005046006133.33 %16.67 %33.33 %16.67 %389849320
191NC_017944TCTCGA21246022246023316.67 %33.33 %16.67 %33.33 %389849320
192NC_017944TCGAGG21246134046135116.67 %16.67 %50 %16.67 %389849321
193NC_017944CTCGAA21246163646164733.33 %16.67 %16.67 %33.33 %389849321
194NC_017944ACGTCG21246218046219116.67 %16.67 %33.33 %33.33 %389849321
195NC_017944GTCATC21246224846225916.67 %33.33 %16.67 %33.33 %389849321
196NC_017944GCTGTC2124662174662280 %33.33 %33.33 %33.33 %389849323
197NC_017944TCGAGT21246833146834216.67 %33.33 %33.33 %16.67 %389849325
198NC_017944GAGTCG21246842346843416.67 %16.67 %50 %16.67 %389849325
199NC_017944GAGATA21246860646861750 %16.67 %33.33 %0 %389849325
200NC_017944CGGTGC2124725564725670 %16.67 %50 %33.33 %389849330
201NC_017944CGAGGG21247267347268416.67 %0 %66.67 %16.67 %389849330
202NC_017944GTTTTC2124772284772390 %66.67 %16.67 %16.67 %389849335
203NC_017944CGGTCG2124798464798570 %16.67 %50 %33.33 %389849337
204NC_017944CGGGGA21248275048276116.67 %0 %66.67 %16.67 %389849338
205NC_017944CAGCAA21248365648366750 %0 %16.67 %33.33 %389849338
206NC_017944GGATTC21248547548548616.67 %33.33 %33.33 %16.67 %389849339
207NC_017944GCGATA21248876948878033.33 %16.67 %33.33 %16.67 %389849342
208NC_017944CGAGCG21249658449659516.67 %0 %50 %33.33 %389849350
209NC_017944GCTGTG2124968084968190 %33.33 %50 %16.67 %389849350
210NC_017944GCTGTG2124968354968460 %33.33 %50 %16.67 %389849350
211NC_017944GCGGAT21249685049686116.67 %16.67 %50 %16.67 %389849350
212NC_017944CGAGTT21250116550117616.67 %33.33 %33.33 %16.67 %389849355
213NC_017944GTGGAT21250222450223516.67 %33.33 %50 %0 %389849356