Penta-nucleotide Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM500

Total Repeats: 288

Go To Repeat Summary Page

Download The Result in

S.No.Genome IDMotifIterationsLengthStartEndA%T%G%C% Protein ID
1NC_017944GATGT21089290120 %40 %40 %0 %389848880
2NC_017944CGTTT210241024190 %60 %20 %20 %389848881
3NC_017944CAGTG2104202421120 %20 %40 %20 %389848883
4NC_017944CGGAG2107607761620 %0 %60 %20 %389848886
5NC_017944GGATG2109956996520 %20 %60 %0 %389848888
6NC_017944AGTCC210106871069620 %20 %20 %40 %389848889
7NC_017944CCGTC21010985109940 %20 %20 %60 %389848889
8NC_017944GAGTG210123421235120 %20 %60 %0 %389848891
9NC_017944GACAA210124881249760 %0 %20 %20 %389848892
10NC_017944GTGGC21012836128450 %20 %60 %20 %389848892
11NC_017944GCGGT21016017160260 %20 %60 %20 %389848894
12NC_017944GTCTC21018124181330 %40 %20 %40 %389848897
13NC_017944ACGGT210195091951820 %20 %40 %20 %389848899
14NC_017944TTCGA210207072071620 %40 %20 %20 %389848900
15NC_017944ACACC210223972240640 %0 %0 %60 %389848902
16NC_017944AGAAC210288072881660 %0 %20 %20 %389848907
17NC_017944AACAA210288782888780 %0 %0 %20 %389848907
18NC_017944GCGAG210356323564120 %0 %60 %20 %389848910
19NC_017944AACGA210359073591660 %0 %20 %20 %389848910
20NC_017944TGGGC21036760367690 %20 %60 %20 %389848910
21NC_017944CGATT210369443695320 %40 %20 %20 %389848910
22NC_017944GCGAC210374103741920 %0 %40 %40 %389848911
23NC_017944ACGTC210405174052620 %20 %20 %40 %389848914
24NC_017944GCACG210428914290020 %0 %40 %40 %389848916
25NC_017944GAAGC210430414305040 %0 %40 %20 %389848916
26NC_017944ATCGA210440414405040 %20 %20 %20 %389848917
27NC_017944ATTCG210479994800820 %40 %20 %20 %389848919
28NC_017944GAGCC210525135252220 %0 %40 %40 %389848923
29NC_017944AGTCG210586005860920 %20 %40 %20 %389848929
30NC_017944CGGGG21059408594170 %0 %80 %20 %389848929
31NC_017944TCGCT21062124621330 %40 %20 %40 %389848932
32NC_017944GTTCG21062189621980 %40 %40 %20 %389848932
33NC_017944CCCTC21063799638080 %20 %0 %80 %389848934
34NC_017944CTCGA210652206522920 %20 %20 %40 %389848934
35NC_017944GGTTC21065462654710 %40 %40 %20 %389848934
36NC_017944CGTCG21067412674210 %20 %40 %40 %389848937
37NC_017944GTCCG21067795678040 %20 %40 %40 %389848938
38NC_017944GTTCT21070303703120 %60 %20 %20 %389848940
39NC_017944TTCGA210737747378320 %40 %20 %20 %389848941
40NC_017944ATCAC210745927460140 %20 %0 %40 %389848942
41NC_017944GTCGG21074606746150 %20 %60 %20 %389848942
42NC_017944GCGAT210749007490920 %20 %40 %20 %389848942
43NC_017944GCTCC21075575755840 %20 %20 %60 %389848942
44NC_017944AGCGG210756367564520 %0 %60 %20 %389848942
45NC_017944ACGCC210758727588120 %0 %20 %60 %389848942
46NC_017944CCCGT21076182761910 %20 %20 %60 %389848942
47NC_017944GCGAC210783357834420 %0 %40 %40 %389848942
48NC_017944TCGAC210786367864520 %20 %20 %40 %389848942
49NC_017944GACGG210787007870920 %0 %60 %20 %389848942
50NC_017944GACCG210804098041820 %0 %40 %40 %389848943
51NC_017944CGTTG21081599816080 %40 %40 %20 %389848943
52NC_017944ACGTG210896228963120 %20 %40 %20 %389848953
53NC_017944ACGTC210919949200320 %20 %20 %40 %389848955
54NC_017944GTGCG21093900939090 %20 %60 %20 %389848957
55NC_017944AACGT210939569396540 %20 %20 %20 %389848957
56NC_017944CCAAC210951489515740 %0 %0 %60 %389848958
57NC_017944AAACC210975929760160 %0 %0 %40 %389848959
58NC_017944ACGTC21010162910163820 %20 %20 %40 %389848963
59NC_017944TCGAA21010260910261840 %20 %20 %20 %389848963
60NC_017944GAAGC21010589410590340 %0 %40 %20 %389848968
61NC_017944AATCC21010658110659040 %20 %0 %40 %389848969
62NC_017944CCTGT2101091161091250 %40 %20 %40 %389848972
63NC_017944GTGAC21011608611609520 %20 %40 %20 %389848982
64NC_017944GGCGA21011630311631220 %0 %60 %20 %389848982
65NC_017944GGCTC2101207281207370 %20 %40 %40 %389848986
66NC_017944GTCGC2101231021231110 %20 %40 %40 %389848990
67NC_017944TTTTG2101247081247170 %80 %20 %0 %389848992
68NC_017944GTCGA21012655412656320 %20 %40 %20 %389848994
69NC_017944TGTTC2101295941296030 %60 %20 %20 %389848997
70NC_017944TCAAA21013014813015760 %20 %0 %20 %389848998
71NC_017944GGTCG2101323591323680 %20 %60 %20 %389848999
72NC_017944TCACG21013310013310920 %20 %20 %40 %389848999
73NC_017944GCGAC21013349213350120 %0 %40 %40 %389848999
74NC_017944GACCC21013374913375820 %0 %20 %60 %389848999
75NC_017944CCCAC21013442613443520 %0 %0 %80 %389848999
76NC_017944CCGAC21013457513458420 %0 %20 %60 %389848999
77NC_017944AGTCG21013529113530020 %20 %40 %20 %389849000
78NC_017944TGTCG2101358091358180 %40 %40 %20 %389849000
79NC_017944ACGGC21013981713982620 %0 %40 %40 %389849003
80NC_017944GTCCC2101435791435880 %20 %20 %60 %389849005
81NC_017944GATGA21014606014606940 %20 %40 %0 %389849006
82NC_017944CTTCG2101482451482540 %40 %20 %40 %389849008
83NC_017944TCACG21015026915027820 %20 %20 %40 %389849010
84NC_017944CCGAG21015347315348220 %0 %40 %40 %389849012
85NC_017944GACAG21015444815445740 %0 %40 %20 %389849014
86NC_017944TCGGA21015630315631220 %20 %40 %20 %389849015
87NC_017944GAACG21015865715866640 %0 %40 %20 %389849017
88NC_017944GTTCG2101587071587160 %40 %40 %20 %389849017
89NC_017944TCGAA21015882215883140 %20 %20 %20 %389849017
90NC_017944CTCGC2101650481650570 %20 %20 %60 %389849021
91NC_017944GTCTC2101657621657710 %40 %20 %40 %389849022
92NC_017944CGGTT2101662811662900 %40 %40 %20 %389849022
93NC_017944CGAGA21017034417035340 %0 %40 %20 %389849026
94NC_017944GATGG21017035617036520 %20 %60 %0 %389849026
95NC_017944TCGAC21017042017042920 %20 %20 %40 %389849026
96NC_017944CGCGA21017566117567020 %0 %40 %40 %389849031
97NC_017944TGGTC2101759701759790 %40 %40 %20 %389849031
98NC_017944CTTCG2101760431760520 %40 %20 %40 %389849031
99NC_017944GACGA21017966217967140 %0 %40 %20 %389849034
100NC_017944CGCGG2101802351802440 %0 %60 %40 %389849035
101NC_017944GACGG21018170618171520 %0 %60 %20 %389849036
102NC_017944TATCA21018643818644740 %40 %0 %20 %389849040
103NC_017944AACAG21018656418657360 %0 %20 %20 %389849040
104NC_017944TCTGC2101882361882450 %40 %20 %40 %389849041
105NC_017944GGTTG2101904211904300 %40 %60 %0 %389849042
106NC_017944GACGG21019553119554020 %0 %60 %20 %389849046
107NC_017944GGAAC21019788719789640 %0 %40 %20 %389849049
108NC_017944GGAGC21020345520346420 %0 %60 %20 %389849053
109NC_017944CGACT21020559020559920 %20 %20 %40 %389849056
110NC_017944TCGTA21020569020569920 %40 %20 %20 %389849056
111NC_017944CGCGA21020670520671420 %0 %40 %40 %389849057
112NC_017944CCGCG2102096372096460 %0 %40 %60 %389849060
113NC_017944GAACG21020999421000340 %0 %40 %20 %389849061
114NC_017944AGTCG21021379921380820 %20 %40 %20 %389849064
115NC_017944AGCGA21021547321548240 %0 %40 %20 %389849066
116NC_017944CCTCG2102180042180130 %20 %20 %60 %389849069
117NC_017944GGTTG2102204592204680 %40 %60 %0 %389849072
118NC_017944TCTCG2102212322212410 %40 %20 %40 %389849072
119NC_017944TCGGT2102217352217440 %40 %40 %20 %389849072
120NC_017944GTTTC2102218232218320 %60 %20 %20 %389849072
121NC_017944GTGTC2102219222219310 %40 %40 %20 %389849072
122NC_017944GCTCC2102225292225380 %20 %20 %60 %389849073
123NC_017944CGGCG2102236232236320 %0 %60 %40 %389849073
124NC_017944CCGGA21022426122427020 %0 %40 %40 %389849074
125NC_017944TCGGT2102250772250860 %40 %40 %20 %389849074
126NC_017944CGAGA21022692322693240 %0 %40 %20 %389849075
127NC_017944CGTTG2102297292297380 %40 %40 %20 %389849080
128NC_017944ACGGA21023071323072240 %0 %40 %20 %389849082
129NC_017944ATCGA21023206223207140 %20 %20 %20 %389849084
130NC_017944ACAGT21023375723376640 %20 %20 %20 %389849085
131NC_017944GTCGA21023579523580420 %20 %40 %20 %389849087
132NC_017944ATCGC21023826223827120 %20 %20 %40 %389849089
133NC_017944CGCCT2102402212402300 %20 %20 %60 %389849091
134NC_017944CGCCT2102405482405570 %20 %20 %60 %389849091
135NC_017944GTCGA21024130824131720 %20 %40 %20 %389849091
136NC_017944ACCGA21024194924195840 %0 %20 %40 %389849091
137NC_017944CGACG21024215924216820 %0 %40 %40 %389849091
138NC_017944CTGGC2102428872428960 %20 %40 %40 %389849092
139NC_017944GCGAG21024388724389620 %0 %60 %20 %389849092
140NC_017944GTGAC21024556424557320 %20 %40 %20 %389849093
141NC_017944ACGTC21025000625001520 %20 %20 %40 %389849097
142NC_017944GCGAC21025045725046620 %0 %40 %40 %389849097
143NC_017944CCGTT2102505432505520 %40 %20 %40 %389849097
144NC_017944TGGAC21025063125064020 %20 %40 %20 %389849097
145NC_017944CGATG21025136525137420 %20 %40 %20 %389849098
146NC_017944TCTCG2102538002538090 %40 %20 %40 %389849100
147NC_017944CGGAC21025577325578220 %0 %40 %40 %389849102
148NC_017944CGAGT31525793125794520 %20 %40 %20 %389849104
149NC_017944GTCGG2102586982587070 %20 %60 %20 %389849105
150NC_017944GCGAA21025883325884240 %0 %40 %20 %389849105
151NC_017944GAGCC21026057426058320 %0 %40 %40 %389849106
152NC_017944GACGA21026285526286440 %0 %40 %20 %389849109
153NC_017944GGCCG2102636862636950 %0 %60 %40 %389849110
154NC_017944CTTCG2102655642655730 %40 %20 %40 %389849112
155NC_017944GGCGA21026945526946420 %0 %60 %20 %389849118
156NC_017944AGTCG21026994926995820 %20 %40 %20 %389849119
157NC_017944AGTAC21027219127220040 %20 %20 %20 %389849123
158NC_017944CCGAG21027272527273420 %0 %40 %40 %389849123
159NC_017944ATCGA21027539627540540 %20 %20 %20 %389849126
160NC_017944AACGT21027599327600240 %20 %20 %20 %389849127
161NC_017944GGCGA21027831827832720 %0 %60 %20 %389849129
162NC_017944CGTCC2102823432823520 %20 %20 %60 %389849134
163NC_017944ACGGT21028465128466020 %20 %40 %20 %389849138
164NC_017944GTCGG2102864882864970 %20 %60 %20 %389849140
165NC_017944TGCCG2102873102873190 %20 %40 %40 %389849140
166NC_017944GCGTC2102875132875220 %20 %40 %40 %389849140
167NC_017944CGGCG2102911022911110 %0 %60 %40 %389849143
168NC_017944CGGGA21029217929218820 %0 %60 %20 %389849143
169NC_017944GGGCT2102923722923810 %20 %60 %20 %389849143
170NC_017944CTTCC2102934882934970 %40 %0 %60 %389849145
171NC_017944ACCGA21029539429540340 %0 %20 %40 %389849146
172NC_017944CGCGG2102964312964400 %0 %60 %40 %389849147
173NC_017944TCGAT21029657129658020 %40 %20 %20 %389849147
174NC_017944ACCGC21029687129688020 %0 %20 %60 %389849147
175NC_017944CGTGG2103028793028880 %20 %60 %20 %389849153
176NC_017944CCCGG2103062743062830 %0 %40 %60 %389849157
177NC_017944GGTCG2103067423067510 %20 %60 %20 %389849157
178NC_017944TGCGA21030881230882120 %20 %40 %20 %389849160
179NC_017944TTGGA21031184831185720 %40 %40 %0 %389849164
180NC_017944ACAGT21031222931223840 %20 %20 %20 %389849164
181NC_017944TCGAA21031272331273240 %20 %20 %20 %389849165
182NC_017944GTCGC2103157343157430 %20 %40 %40 %389849166
183NC_017944AGACG21031615131616040 %0 %40 %20 %389849167
184NC_017944CTGTT2103163533163620 %60 %20 %20 %389849167
185NC_017944GAGAT21031882731883640 %20 %40 %0 %389849171
186NC_017944TCTCG2103189093189180 %40 %20 %40 %389849171
187NC_017944TCGCT2103194963195050 %40 %20 %40 %389849171
188NC_017944ACGCG21031970731971620 %0 %40 %40 %389849171
189NC_017944GCCGA21032088232089120 %0 %40 %40 %389849173
190NC_017944GAAGC21032370932371840 %0 %40 %20 %389849176
191NC_017944CGGGC2103252473252560 %0 %60 %40 %389849177
192NC_017944TCGTG2103278303278390 %40 %40 %20 %389849179
193NC_017944CGAGT21033009433010320 %20 %40 %20 %389849184
194NC_017944AGTTC21033067733068620 %40 %20 %20 %389849185
195NC_017944CCGCC2103307633307720 %0 %20 %80 %389849185
196NC_017944CAGCG21033249533250420 %0 %40 %40 %389849186
197NC_017944GACCG21033267333268220 %0 %40 %40 %389849186
198NC_017944AAACC21033599333600260 %0 %0 %40 %389849187
199NC_017944TCGCT2103361023361110 %40 %20 %40 %389849188
200NC_017944TCGAG21033887333888220 %20 %40 %20 %389849189
201NC_017944ATCGA21033903733904640 %20 %20 %20 %389849189
202NC_017944TCACG21034059834060720 %20 %20 %40 %389849191
203NC_017944ACCAC21034255634256540 %0 %0 %60 %389849191
204NC_017944GGCCG2103473153473240 %0 %60 %40 %389849197
205NC_017944GGCGT2103501603501690 %20 %60 %20 %389849201
206NC_017944ACGAG21035188335189240 %0 %40 %20 %389849202
207NC_017944CTGAC21035275135276020 %20 %20 %40 %389849203
208NC_017944CTCGC2103545873545960 %20 %20 %60 %389849204
209NC_017944TCGAC21035522435523320 %20 %20 %40 %389849204
210NC_017944TGCTT2103574983575070 %60 %20 %20 %389849207
211NC_017944GTCGA21035798035798920 %20 %40 %20 %389849207
212NC_017944TCGTC2103620453620540 %40 %20 %40 %389849211
213NC_017944CTGGA21036308936309820 %20 %40 %20 %389849212
214NC_017944CGAAG21036336136337040 %0 %40 %20 %389849212
215NC_017944CGACC21036448936449820 %0 %20 %60 %389849213
216NC_017944GTGCG2103661343661430 %20 %60 %20 %389849214
217NC_017944CGACC21036880536881420 %0 %20 %60 %389849217
218NC_017944CGGCG2103699023699110 %0 %60 %40 %389849217
219NC_017944CGGCA21037056337057220 %0 %40 %40 %389849218
220NC_017944TTCTT2103750763750850 %80 %0 %20 %389849225
221NC_017944CTCGC2103758593758680 %20 %20 %60 %389849226
222NC_017944GTCGG2103760383760470 %20 %60 %20 %389849226
223NC_017944CTATC21037748537749420 %40 %0 %40 %389849228
224NC_017944TCCCG2103785963786050 %20 %20 %60 %389849229
225NC_017944GCACC21037884437885320 %0 %20 %60 %389849229
226NC_017944ACCGC21037913437914320 %0 %20 %60 %389849229
227NC_017944AGCGA21037947637948540 %0 %40 %20 %389849229
228NC_017944CGCGA21038020638021520 %0 %40 %40 %389849230
229NC_017944TTCGA21038066838067720 %40 %20 %20 %389849230
230NC_017944TCGCC2103841183841270 %20 %20 %60 %389849235
231NC_017944GACCG21038516238517120 %0 %40 %40 %389849236
232NC_017944CGCGT2103859673859760 %20 %40 %40 %389849236
233NC_017944GTCTC2103873463873550 %40 %20 %40 %389849238
234NC_017944GCGCC2103878483878570 %0 %40 %60 %389849238
235NC_017944CCGTC2103885693885780 %20 %20 %60 %389849240
236NC_017944CGGAC21038882938883820 %0 %40 %40 %389849240
237NC_017944GCGTC2103892583892670 %20 %40 %40 %389849241
238NC_017944CGAAA21039042839043760 %0 %20 %20 %389849243
239NC_017944TCGCA21039240039240920 %20 %20 %40 %389849245
240NC_017944GCCGC2103963463963550 %0 %40 %60 %389849251
241NC_017944TCGCG2103967413967500 %20 %40 %40 %389849251
242NC_017944CACCG21039726539727420 %0 %20 %60 %389849252
243NC_017944CTCGA21040357640358520 %20 %20 %40 %389849261
244NC_017944CGTCG2104057034057120 %20 %40 %40 %389849264
245NC_017944CTCGT2104082384082470 %40 %20 %40 %389849268
246NC_017944CGATT21040878740879620 %40 %20 %20 %389849268
247NC_017944GAGGT21041070241071120 %20 %60 %0 %389849270
248NC_017944GTCGG2104110584110670 %20 %60 %20 %389849270
249NC_017944GCGAC21041556641557520 %0 %40 %40 %389849275
250NC_017944TTCGA21041877741878620 %40 %20 %20 %389849278
251NC_017944TCGAT21041910241911120 %40 %20 %20 %389849278
252NC_017944CGGCC2104201914202000 %0 %40 %60 %389849279
253NC_017944ACTGC21042260742261620 %20 %20 %40 %389849282
254NC_017944CAGAG21042517742518640 %0 %40 %20 %389849287
255NC_017944GGCTT2104283284283370 %40 %40 %20 %389849291
256NC_017944CCGCT2104300534300620 %20 %20 %60 %389849293
257NC_017944GCAGT21043110843111720 %20 %40 %20 %389849295
258NC_017944GAGCG21043764743765620 %0 %60 %20 %389849303
259NC_017944CCCGA21044077444078320 %0 %20 %60 %389849306
260NC_017944ACGCG21044400644401520 %0 %40 %40 %389849308
261NC_017944AGTCG21044540744541620 %20 %40 %20 %389849309
262NC_017944TGGAC21045369345370220 %20 %40 %20 %389849315
263NC_017944ACCAC21045566045566940 %0 %0 %60 %389849318
264NC_017944GACCG21045734045734920 %0 %40 %40 %389849319
265NC_017944ACTCG21046320246321120 %20 %20 %40 %389849322
266NC_017944TACGA21046446146447040 %20 %20 %20 %389849323
267NC_017944ACCGC21046453746454620 %0 %20 %60 %389849323
268NC_017944AACGG21046585646586540 %0 %40 %20 %389849323
269NC_017944AAATC21047273947274860 %20 %0 %20 %389849330
270NC_017944CCCAG21047562547563420 %0 %20 %60 %389849333
271NC_017944ATTTG21047733247734120 %60 %20 %0 %389849335
272NC_017944GAGGT21047749847750720 %20 %60 %0 %389849335
273NC_017944CCGCT2104780914781000 %20 %20 %60 %389849335
274NC_017944AACGG21048146848147740 %0 %40 %20 %389849338
275NC_017944ACGTC21048212948213820 %20 %20 %40 %389849338
276NC_017944CGGGA21048282348283220 %0 %60 %20 %389849338
277NC_017944TACGG21048485948486820 %20 %40 %20 %389849339
278NC_017944CCCGT2104852184852270 %20 %20 %60 %389849339
279NC_017944GCCGT2104887274887360 %20 %40 %40 %389849342
280NC_017944GTTTG2104922054922140 %60 %40 %0 %389849345
281NC_017944CGTGG2104960654960740 %20 %60 %20 %389849349
282NC_017944AAGAC21049712649713560 %0 %20 %20 %389849350
283NC_017944CGATC21049737049737920 %20 %20 %40 %389849350
284NC_017944CGAAG21049783249784140 %0 %40 %20 %389849350
285NC_017944CGGCG2104979524979610 %0 %60 %40 %389849350
286NC_017944GTTCG2104986284986370 %40 %40 %20 %389849351
287NC_017944AGTCC21050161650162520 %20 %20 %40 %389849356
288NC_017944TCGAT21050239050239920 %40 %20 %20 %389849357