MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM500

Total Repeats: 1431

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017944	GCGG	2	8	289	296	0 %	0 %	75 %	25 %	389848880
2	NC_017944	GGAT	2	8	1983	1990	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017944	GATA	2	8	1996	2003	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017944	CCCA	2	8	2189	2196	25 %	0 %	0 %	75 %	389848881
5	NC_017944	GTAG	2	8	2210	2217	25 %	25 %	50 %	0 %	389848881
6	NC_017944	ACCG	2	8	2973	2980	25 %	0 %	25 %	50 %	389848881
7	NC_017944	CAGC	2	8	3001	3008	25 %	0 %	25 %	50 %	389848881
8	NC_017944	CGCC	2	8	3172	3179	0 %	0 %	25 %	75 %	389848881
9	NC_017944	TGCC	2	8	3315	3322	0 %	25 %	25 %	50 %	389848881
10	NC_017944	CGAG	2	8	3544	3551	25 %	0 %	50 %	25 %	389848881
11	NC_017944	GAGT	2	8	3751	3758	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017944	GACT	2	8	3811	3818	25 %	25 %	25 %	25 %	389848882
13	NC_017944	GAGT	2	8	4003	4010	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017944	GCTT	2	8	4500	4507	0 %	50 %	25 %	25 %	389848883
15	NC_017944	CCGT	2	8	4659	4666	0 %	25 %	25 %	50 %	389848883
16	NC_017944	TGGG	2	8	4898	4905	0 %	25 %	75 %	0 %	389848883
17	NC_017944	GTTG	2	8	5324	5331	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017944	GGGA	2	8	5738	5745	25 %	0 %	75 %	0 %	389848884
19	NC_017944	ACGA	2	8	5897	5904	50 %	0 %	25 %	25 %	389848884
20	NC_017944	TGAC	2	8	6003	6010	25 %	25 %	25 %	25 %	389848884
21	NC_017944	GGTG	2	8	6555	6562	0 %	25 %	75 %	0 %	389848885
22	NC_017944	TCGT	2	8	7412	7419	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017944	CTAT	2	8	7975	7982	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017944	TGGG	2	8	8796	8803	0 %	25 %	75 %	0 %	389848887
25	NC_017944	CGTT	2	8	9718	9725	0 %	50 %	25 %	25 %	389848888
26	NC_017944	GGGA	2	8	10044	10051	25 %	0 %	75 %	0 %	389848888
27	NC_017944	CCGT	2	8	10177	10184	0 %	25 %	25 %	50 %	389848888
28	NC_017944	CGAG	2	8	10606	10613	25 %	0 %	50 %	25 %	389848889
29	NC_017944	ACGT	2	8	10741	10748	25 %	25 %	25 %	25 %	389848889
30	NC_017944	CCGT	2	8	10999	11006	0 %	25 %	25 %	50 %	389848889
31	NC_017944	TTCG	2	8	11040	11047	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017944	GCTC	2	8	11257	11264	0 %	25 %	25 %	50 %	389848890
33	NC_017944	AGTC	2	8	11349	11356	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017944	TGGG	2	8	11571	11578	0 %	25 %	75 %	0 %	389848891
35	NC_017944	CGCA	2	8	11743	11750	25 %	0 %	25 %	50 %	389848891
36	NC_017944	GGGT	2	8	12364	12371	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017944	CTGC	2	8	12689	12696	0 %	25 %	25 %	50 %	389848892
38	NC_017944	TTCA	2	8	13543	13550	25 %	50 %	0 %	25 %	389848892
39	NC_017944	CGAA	2	8	13583	13590	50 %	0 %	25 %	25 %	389848892
40	NC_017944	GGCA	2	8	14256	14263	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017944	TGCT	2	8	15411	15418	0 %	50 %	25 %	25 %	389848894
42	NC_017944	GAGC	2	8	15887	15894	25 %	0 %	50 %	25 %	389848894
43	NC_017944	AGTA	2	8	16248	16255	50 %	25 %	25 %	0 %	389848894
44	NC_017944	TTGT	2	8	16749	16756	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017944	TGCC	2	8	16765	16772	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017944	AGCG	2	8	17219	17226	25 %	0 %	50 %	25 %	389848896
47	NC_017944	GAGT	2	8	17539	17546	25 %	25 %	50 %	0 %	389848896
48	NC_017944	CGGT	2	8	18151	18158	0 %	25 %	50 %	25 %	389848897
49	NC_017944	GGTC	2	8	18251	18258	0 %	25 %	50 %	25 %	389848897
50	NC_017944	CGGT	2	8	18341	18348	0 %	25 %	50 %	25 %	389848897
51	NC_017944	GGGT	2	8	18356	18363	0 %	25 %	75 %	0 %	389848897
52	NC_017944	ACTC	2	8	18562	18569	25 %	25 %	0 %	50 %	389848897
53	NC_017944	ACCG	2	8	18777	18784	25 %	0 %	25 %	50 %	389848897
54	NC_017944	CAAT	2	8	18829	18836	50 %	25 %	0 %	25 %	389848897
55	NC_017944	AGTG	2	8	19296	19303	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017944	ACCC	2	8	19520	19527	25 %	0 %	0 %	75 %	389848899
57	NC_017944	GGCG	2	8	20135	20142	0 %	0 %	75 %	25 %	389848899
58	NC_017944	ACCC	2	8	20470	20477	25 %	0 %	0 %	75 %	389848900
59	NC_017944	GACC	2	8	20783	20790	25 %	0 %	25 %	50 %	389848900
60	NC_017944	TCGG	2	8	21350	21357	0 %	25 %	50 %	25 %	389848901
61	NC_017944	TGAG	2	8	21397	21404	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017944	TCTG	2	8	21441	21448	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017944	ACGG	2	8	21501	21508	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017944	GCGA	2	8	21597	21604	25 %	0 %	50 %	25 %	389848902
65	NC_017944	GATG	2	8	21741	21748	25 %	25 %	50 %	0 %	389848902
66	NC_017944	TGGC	2	8	22154	22161	0 %	25 %	50 %	25 %	389848902
67	NC_017944	ATCC	2	8	22291	22298	25 %	25 %	0 %	50 %	389848902
68	NC_017944	CCAT	2	8	22481	22488	25 %	25 %	0 %	50 %	389848902
69	NC_017944	TTGG	2	8	22494	22501	0 %	50 %	50 %	0 %	389848902
70	NC_017944	GCTC	2	8	22616	22623	0 %	25 %	25 %	50 %	389848902
71	NC_017944	TTTC	2	8	22800	22807	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017944	CAGC	2	8	22951	22958	25 %	0 %	25 %	50 %	389848903
73	NC_017944	TCGC	2	8	23835	23842	0 %	25 %	25 %	50 %	389848903
74	NC_017944	GAAT	2	8	24296	24303	50 %	25 %	25 %	0 %	389848904
75	NC_017944	ATTC	2	8	24391	24398	25 %	50 %	0 %	25 %	389848904
76	NC_017944	CGAA	2	8	24450	24457	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017944	AGCG	2	8	24524	24531	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017944	ACTC	2	8	24602	24609	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017944	ACCT	2	8	24632	24639	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017944	CGGC	2	8	24706	24713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017944	AGTG	2	8	25042	25049	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017944	ACTC	2	8	25540	25547	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017944	GATG	2	8	25659	25666	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017944	CCCG	2	8	27766	27773	0 %	0 %	25 %	75 %	389848906
85	NC_017944	ACTG	2	8	27920	27927	25 %	25 %	25 %	25 %	389848906
86	NC_017944	TGGA	2	8	28355	28362	25 %	25 %	50 %	0 %	389848906
87	NC_017944	GAGG	2	8	29044	29051	25 %	0 %	75 %	0 %	389848907
88	NC_017944	CGTA	2	8	29169	29176	25 %	25 %	25 %	25 %	389848907
89	NC_017944	ACCG	2	8	29738	29745	25 %	0 %	25 %	50 %	389848907
90	NC_017944	CACG	2	8	29898	29905	25 %	0 %	25 %	50 %	389848907
91	NC_017944	ACCG	2	8	29974	29981	25 %	0 %	25 %	50 %	389848907
92	NC_017944	CGTT	2	8	30096	30103	0 %	50 %	25 %	25 %	389848907
93	NC_017944	CGAA	2	8	30432	30439	50 %	0 %	25 %	25 %	389848907
94	NC_017944	GTCT	2	8	30452	30459	0 %	50 %	25 %	25 %	389848907
95	NC_017944	CGAC	2	8	30501	30508	25 %	0 %	25 %	50 %	389848907
96	NC_017944	CCAA	2	8	31315	31322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017944	ACGT	2	8	31947	31954	25 %	25 %	25 %	25 %	389848908
98	NC_017944	CTTC	2	8	32495	32502	0 %	50 %	0 %	50 %	389848908
99	NC_017944	CGAG	2	8	32578	32585	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017944	ACCG	2	8	32665	32672	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017944	TCGG	2	8	32691	32698	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017944	ACAG	2	8	32718	32725	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017944	TCGC	2	8	32783	32790	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017944	TCGC	2	8	32895	32902	0 %	25 %	25 %	50 %	389848909
105	NC_017944	CGAC	2	8	33209	33216	25 %	0 %	25 %	50 %	389848909
106	NC_017944	AGCG	2	8	33279	33286	25 %	0 %	50 %	25 %	389848909
107	NC_017944	GTCC	2	8	33348	33355	0 %	25 %	25 %	50 %	389848909
108	NC_017944	CGAG	2	8	33479	33486	25 %	0 %	50 %	25 %	389848909
109	NC_017944	CGTC	2	8	33764	33771	0 %	25 %	25 %	50 %	389848909
110	NC_017944	CGGG	2	8	33819	33826	0 %	0 %	75 %	25 %	389848909
111	NC_017944	CTGG	2	8	34219	34226	0 %	25 %	50 %	25 %	389848909
112	NC_017944	GGCA	2	8	34819	34826	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017944	ACCG	2	8	36074	36081	25 %	0 %	25 %	50 %	389848910
114	NC_017944	AGCA	2	8	36403	36410	50 %	0 %	25 %	25 %	389848910
115	NC_017944	GGGT	2	8	36444	36451	0 %	25 %	75 %	0 %	389848910
116	NC_017944	CGAC	2	8	36799	36806	25 %	0 %	25 %	50 %	389848910
117	NC_017944	GTCA	2	8	37754	37761	25 %	25 %	25 %	25 %	389848911
118	NC_017944	ACGA	2	8	38213	38220	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017944	TTTC	2	8	39403	39410	0 %	75 %	0 %	25 %	389848913
120	NC_017944	TTGG	2	8	40098	40105	0 %	50 %	50 %	0 %	389848914
121	NC_017944	GGCT	2	8	40404	40411	0 %	25 %	50 %	25 %	389848914
122	NC_017944	CCGC	2	8	40430	40437	0 %	0 %	25 %	75 %	389848914
123	NC_017944	CGAC	2	8	40562	40569	25 %	0 %	25 %	50 %	389848914
124	NC_017944	CTTC	2	8	41607	41614	0 %	50 %	0 %	50 %	389848915
125	NC_017944	TTTC	2	8	42507	42514	0 %	75 %	0 %	25 %	389848916
126	NC_017944	TCGT	2	8	42653	42660	0 %	50 %	25 %	25 %	389848916
127	NC_017944	GTCC	2	8	42687	42694	0 %	25 %	25 %	50 %	389848916
128	NC_017944	TCGC	2	8	42743	42750	0 %	25 %	25 %	50 %	389848916
129	NC_017944	AGAA	2	8	44084	44091	75 %	0 %	25 %	0 %	389848917
130	NC_017944	AGGA	2	8	44383	44390	50 %	0 %	50 %	0 %	389848917
131	NC_017944	TTGG	2	8	44804	44811	0 %	50 %	50 %	0 %	389848917
132	NC_017944	CCAC	2	8	45042	45049	25 %	0 %	0 %	75 %	389848917
133	NC_017944	CACC	2	8	45111	45118	25 %	0 %	0 %	75 %	389848917
134	NC_017944	ACCG	2	8	45147	45154	25 %	0 %	25 %	50 %	389848917
135	NC_017944	TTGC	2	8	45928	45935	0 %	50 %	25 %	25 %	389848918
136	NC_017944	GTCG	2	8	46005	46012	0 %	25 %	50 %	25 %	389848918
137	NC_017944	CCTG	2	8	46331	46338	0 %	25 %	25 %	50 %	389848918
138	NC_017944	TACT	2	8	46648	46655	25 %	50 %	0 %	25 %	389848918
139	NC_017944	TGCT	2	8	46798	46805	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017944	CATG	2	8	46970	46977	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017944	AGCC	2	8	47175	47182	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017944	CGTT	2	8	47688	47695	0 %	50 %	25 %	25 %	389848919
143	NC_017944	TGGC	2	8	48516	48523	0 %	25 %	50 %	25 %	389848919
144	NC_017944	CGGT	2	8	49025	49032	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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