MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM500

Total Repeats: 1093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017944	GCGG	2	8	289	296	0 %	0 %	75 %	25 %	389848880
2	NC_017944	CCCA	2	8	2189	2196	25 %	0 %	0 %	75 %	389848881
3	NC_017944	GTAG	2	8	2210	2217	25 %	25 %	50 %	0 %	389848881
4	NC_017944	ACCG	2	8	2973	2980	25 %	0 %	25 %	50 %	389848881
5	NC_017944	CAGC	2	8	3001	3008	25 %	0 %	25 %	50 %	389848881
6	NC_017944	CGCC	2	8	3172	3179	0 %	0 %	25 %	75 %	389848881
7	NC_017944	TGCC	2	8	3315	3322	0 %	25 %	25 %	50 %	389848881
8	NC_017944	CGAG	2	8	3544	3551	25 %	0 %	50 %	25 %	389848881
9	NC_017944	GACT	2	8	3811	3818	25 %	25 %	25 %	25 %	389848882
10	NC_017944	GCTT	2	8	4500	4507	0 %	50 %	25 %	25 %	389848883
11	NC_017944	CCGT	2	8	4659	4666	0 %	25 %	25 %	50 %	389848883
12	NC_017944	TGGG	2	8	4898	4905	0 %	25 %	75 %	0 %	389848883
13	NC_017944	GGGA	2	8	5738	5745	25 %	0 %	75 %	0 %	389848884
14	NC_017944	ACGA	2	8	5897	5904	50 %	0 %	25 %	25 %	389848884
15	NC_017944	TGAC	2	8	6003	6010	25 %	25 %	25 %	25 %	389848884
16	NC_017944	GGTG	2	8	6555	6562	0 %	25 %	75 %	0 %	389848885
17	NC_017944	TGGG	2	8	8796	8803	0 %	25 %	75 %	0 %	389848887
18	NC_017944	CGTT	2	8	9718	9725	0 %	50 %	25 %	25 %	389848888
19	NC_017944	GGGA	2	8	10044	10051	25 %	0 %	75 %	0 %	389848888
20	NC_017944	CCGT	2	8	10177	10184	0 %	25 %	25 %	50 %	389848888
21	NC_017944	CGAG	2	8	10606	10613	25 %	0 %	50 %	25 %	389848889
22	NC_017944	ACGT	2	8	10741	10748	25 %	25 %	25 %	25 %	389848889
23	NC_017944	CCGT	2	8	10999	11006	0 %	25 %	25 %	50 %	389848889
24	NC_017944	GCTC	2	8	11257	11264	0 %	25 %	25 %	50 %	389848890
25	NC_017944	TGGG	2	8	11571	11578	0 %	25 %	75 %	0 %	389848891
26	NC_017944	CGCA	2	8	11743	11750	25 %	0 %	25 %	50 %	389848891
27	NC_017944	CTGC	2	8	12689	12696	0 %	25 %	25 %	50 %	389848892
28	NC_017944	TTCA	2	8	13543	13550	25 %	50 %	0 %	25 %	389848892
29	NC_017944	CGAA	2	8	13583	13590	50 %	0 %	25 %	25 %	389848892
30	NC_017944	TGCT	2	8	15411	15418	0 %	50 %	25 %	25 %	389848894
31	NC_017944	GAGC	2	8	15887	15894	25 %	0 %	50 %	25 %	389848894
32	NC_017944	AGTA	2	8	16248	16255	50 %	25 %	25 %	0 %	389848894
33	NC_017944	AGCG	2	8	17219	17226	25 %	0 %	50 %	25 %	389848896
34	NC_017944	GAGT	2	8	17539	17546	25 %	25 %	50 %	0 %	389848896
35	NC_017944	CGGT	2	8	18151	18158	0 %	25 %	50 %	25 %	389848897
36	NC_017944	GGTC	2	8	18251	18258	0 %	25 %	50 %	25 %	389848897
37	NC_017944	CGGT	2	8	18341	18348	0 %	25 %	50 %	25 %	389848897
38	NC_017944	GGGT	2	8	18356	18363	0 %	25 %	75 %	0 %	389848897
39	NC_017944	ACTC	2	8	18562	18569	25 %	25 %	0 %	50 %	389848897
40	NC_017944	ACCG	2	8	18777	18784	25 %	0 %	25 %	50 %	389848897
41	NC_017944	CAAT	2	8	18829	18836	50 %	25 %	0 %	25 %	389848897
42	NC_017944	ACCC	2	8	19520	19527	25 %	0 %	0 %	75 %	389848899
43	NC_017944	GGCG	2	8	20135	20142	0 %	0 %	75 %	25 %	389848899
44	NC_017944	ACCC	2	8	20470	20477	25 %	0 %	0 %	75 %	389848900
45	NC_017944	GACC	2	8	20783	20790	25 %	0 %	25 %	50 %	389848900
46	NC_017944	TCGG	2	8	21350	21357	0 %	25 %	50 %	25 %	389848901
47	NC_017944	GCGA	2	8	21597	21604	25 %	0 %	50 %	25 %	389848902
48	NC_017944	GATG	2	8	21741	21748	25 %	25 %	50 %	0 %	389848902
49	NC_017944	TGGC	2	8	22154	22161	0 %	25 %	50 %	25 %	389848902
50	NC_017944	ATCC	2	8	22291	22298	25 %	25 %	0 %	50 %	389848902
51	NC_017944	CCAT	2	8	22481	22488	25 %	25 %	0 %	50 %	389848902
52	NC_017944	TTGG	2	8	22494	22501	0 %	50 %	50 %	0 %	389848902
53	NC_017944	GCTC	2	8	22616	22623	0 %	25 %	25 %	50 %	389848902
54	NC_017944	CAGC	2	8	22951	22958	25 %	0 %	25 %	50 %	389848903
55	NC_017944	TCGC	2	8	23835	23842	0 %	25 %	25 %	50 %	389848903
56	NC_017944	GAAT	2	8	24296	24303	50 %	25 %	25 %	0 %	389848904
57	NC_017944	ATTC	2	8	24391	24398	25 %	50 %	0 %	25 %	389848904
58	NC_017944	CCCG	2	8	27766	27773	0 %	0 %	25 %	75 %	389848906
59	NC_017944	ACTG	2	8	27920	27927	25 %	25 %	25 %	25 %	389848906
60	NC_017944	TGGA	2	8	28355	28362	25 %	25 %	50 %	0 %	389848906
61	NC_017944	GAGG	2	8	29044	29051	25 %	0 %	75 %	0 %	389848907
62	NC_017944	CGTA	2	8	29169	29176	25 %	25 %	25 %	25 %	389848907
63	NC_017944	ACCG	2	8	29738	29745	25 %	0 %	25 %	50 %	389848907
64	NC_017944	CACG	2	8	29898	29905	25 %	0 %	25 %	50 %	389848907
65	NC_017944	ACCG	2	8	29974	29981	25 %	0 %	25 %	50 %	389848907
66	NC_017944	CGTT	2	8	30096	30103	0 %	50 %	25 %	25 %	389848907
67	NC_017944	CGAA	2	8	30432	30439	50 %	0 %	25 %	25 %	389848907
68	NC_017944	GTCT	2	8	30452	30459	0 %	50 %	25 %	25 %	389848907
69	NC_017944	CGAC	2	8	30501	30508	25 %	0 %	25 %	50 %	389848907
70	NC_017944	ACGT	2	8	31947	31954	25 %	25 %	25 %	25 %	389848908
71	NC_017944	CTTC	2	8	32495	32502	0 %	50 %	0 %	50 %	389848908
72	NC_017944	TCGC	2	8	32895	32902	0 %	25 %	25 %	50 %	389848909
73	NC_017944	CGAC	2	8	33209	33216	25 %	0 %	25 %	50 %	389848909
74	NC_017944	AGCG	2	8	33279	33286	25 %	0 %	50 %	25 %	389848909
75	NC_017944	GTCC	2	8	33348	33355	0 %	25 %	25 %	50 %	389848909
76	NC_017944	CGAG	2	8	33479	33486	25 %	0 %	50 %	25 %	389848909
77	NC_017944	CGTC	2	8	33764	33771	0 %	25 %	25 %	50 %	389848909
78	NC_017944	CGGG	2	8	33819	33826	0 %	0 %	75 %	25 %	389848909
79	NC_017944	CTGG	2	8	34219	34226	0 %	25 %	50 %	25 %	389848909
80	NC_017944	ACCG	2	8	36074	36081	25 %	0 %	25 %	50 %	389848910
81	NC_017944	AGCA	2	8	36403	36410	50 %	0 %	25 %	25 %	389848910
82	NC_017944	GGGT	2	8	36444	36451	0 %	25 %	75 %	0 %	389848910
83	NC_017944	CGAC	2	8	36799	36806	25 %	0 %	25 %	50 %	389848910
84	NC_017944	GTCA	2	8	37754	37761	25 %	25 %	25 %	25 %	389848911
85	NC_017944	TTTC	2	8	39403	39410	0 %	75 %	0 %	25 %	389848913
86	NC_017944	TTGG	2	8	40098	40105	0 %	50 %	50 %	0 %	389848914
87	NC_017944	GGCT	2	8	40404	40411	0 %	25 %	50 %	25 %	389848914
88	NC_017944	CCGC	2	8	40430	40437	0 %	0 %	25 %	75 %	389848914
89	NC_017944	CGAC	2	8	40562	40569	25 %	0 %	25 %	50 %	389848914
90	NC_017944	CTTC	2	8	41607	41614	0 %	50 %	0 %	50 %	389848915
91	NC_017944	TTTC	2	8	42507	42514	0 %	75 %	0 %	25 %	389848916
92	NC_017944	TCGT	2	8	42653	42660	0 %	50 %	25 %	25 %	389848916
93	NC_017944	GTCC	2	8	42687	42694	0 %	25 %	25 %	50 %	389848916
94	NC_017944	TCGC	2	8	42743	42750	0 %	25 %	25 %	50 %	389848916
95	NC_017944	AGAA	2	8	44084	44091	75 %	0 %	25 %	0 %	389848917
96	NC_017944	AGGA	2	8	44383	44390	50 %	0 %	50 %	0 %	389848917
97	NC_017944	TTGG	2	8	44804	44811	0 %	50 %	50 %	0 %	389848917
98	NC_017944	CCAC	2	8	45042	45049	25 %	0 %	0 %	75 %	389848917
99	NC_017944	CACC	2	8	45111	45118	25 %	0 %	0 %	75 %	389848917
100	NC_017944	ACCG	2	8	45147	45154	25 %	0 %	25 %	50 %	389848917
101	NC_017944	TTGC	2	8	45928	45935	0 %	50 %	25 %	25 %	389848918
102	NC_017944	GTCG	2	8	46005	46012	0 %	25 %	50 %	25 %	389848918
103	NC_017944	CCTG	2	8	46331	46338	0 %	25 %	25 %	50 %	389848918
104	NC_017944	TACT	2	8	46648	46655	25 %	50 %	0 %	25 %	389848918
105	NC_017944	CGTT	2	8	47688	47695	0 %	50 %	25 %	25 %	389848919
106	NC_017944	TGGC	2	8	48516	48523	0 %	25 %	50 %	25 %	389848919
107	NC_017944	CGGT	2	8	49833	49840	0 %	25 %	50 %	25 %	389848920
108	NC_017944	GAAG	2	8	50425	50432	50 %	0 %	50 %	0 %	389848921
109	NC_017944	AGTT	2	8	50441	50448	25 %	50 %	25 %	0 %	389848921
110	NC_017944	ACGG	2	8	51017	51024	25 %	0 %	50 %	25 %	389848922
111	NC_017944	TCGT	2	8	52351	52358	0 %	50 %	25 %	25 %	389848923
112	NC_017944	ATCT	2	8	53035	53042	25 %	50 %	0 %	25 %	389848924
113	NC_017944	CTGG	2	8	53203	53210	0 %	25 %	50 %	25 %	389848924
114	NC_017944	TGCC	2	8	53443	53450	0 %	25 %	25 %	50 %	389848924
115	NC_017944	ATGT	2	8	54932	54939	25 %	50 %	25 %	0 %	389848926
116	NC_017944	GCAA	2	8	55346	55353	50 %	0 %	25 %	25 %	389848927
117	NC_017944	CCCG	2	8	55599	55606	0 %	0 %	25 %	75 %	389848927
118	NC_017944	ACGT	2	8	55662	55669	25 %	25 %	25 %	25 %	389848927
119	NC_017944	ACGA	2	8	55953	55960	50 %	0 %	25 %	25 %	389848927
120	NC_017944	AGGG	2	8	57169	57176	25 %	0 %	75 %	0 %	389848928
121	NC_017944	CGAC	2	8	57194	57201	25 %	0 %	25 %	50 %	389848928
122	NC_017944	CCTG	2	8	57525	57532	0 %	25 %	25 %	50 %	389848928
123	NC_017944	ACGG	2	8	58480	58487	25 %	0 %	50 %	25 %	389848929
124	NC_017944	CGGT	2	8	59262	59269	0 %	25 %	50 %	25 %	389848929
125	NC_017944	TAGT	2	8	59813	59820	25 %	50 %	25 %	0 %	389848930
126	NC_017944	GCCC	2	8	59867	59874	0 %	0 %	25 %	75 %	389848930
127	NC_017944	ATCC	2	8	59878	59885	25 %	25 %	0 %	50 %	389848930
128	NC_017944	CCAA	2	8	59983	59990	50 %	0 %	0 %	50 %	389848930
129	NC_017944	GCCG	2	8	60147	60154	0 %	0 %	50 %	50 %	389848930
130	NC_017944	GCGG	2	8	60585	60592	0 %	0 %	75 %	25 %	389848930
131	NC_017944	GAAA	2	8	60857	60864	75 %	0 %	25 %	0 %	389848930
132	NC_017944	GGAG	2	8	61020	61027	25 %	0 %	75 %	0 %	389848931
133	NC_017944	CCGT	2	8	61550	61557	0 %	25 %	25 %	50 %	389848931
134	NC_017944	ACGA	2	8	61876	61883	50 %	0 %	25 %	25 %	389848931
135	NC_017944	TACG	2	8	61923	61930	25 %	25 %	25 %	25 %	389848931
136	NC_017944	GCTG	2	8	62745	62752	0 %	25 %	50 %	25 %	389848933
137	NC_017944	CTTA	2	8	64282	64289	25 %	50 %	0 %	25 %	389848934
138	NC_017944	ACCG	2	8	64428	64435	25 %	0 %	25 %	50 %	389848934
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