MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM500

Total Repeats: 8362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017944	GAT	2	6	43	48	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848880
2	NC_017944	CGA	2	6	93	98	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848880
3	NC_017944	ACA	2	6	278	283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389848880
4	NC_017944	CGG	2	6	309	314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848880
5	NC_017944	CGT	2	6	319	324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848880
6	NC_017944	GTC	2	6	425	430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848880
7	NC_017944	TCG	2	6	490	495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848880
8	NC_017944	CAC	2	6	501	506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848880
9	NC_017944	GGA	2	6	623	628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848880
10	NC_017944	GAC	2	6	653	658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848880
11	NC_017944	GTT	2	6	742	747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848880
12	NC_017944	GTC	2	6	778	783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848880
13	NC_017944	TCG	2	6	800	805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848880
14	NC_017944	GAT	2	6	811	816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848880
15	NC_017944	CCG	2	6	1005	1010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848880
16	NC_017944	TGA	2	6	1104	1109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848880
17	NC_017944	GCT	2	6	1121	1126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848880
18	NC_017944	CTC	2	6	1132	1137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848880
19	NC_017944	GTC	2	6	1162	1167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848880
20	NC_017944	GAG	2	6	1230	1235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848880
21	NC_017944	TGT	2	6	1239	1244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848880
22	NC_017944	ACC	2	6	1281	1286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017944	ACC	2	6	1308	1313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017944	GTT	2	6	1349	1354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017944	GTT	2	6	1383	1388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017944	ACG	2	6	1465	1470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017944	CCA	2	6	1484	1489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_017944	AAT	2	6	1649	1654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017944	GGT	2	6	1803	1808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017944	GAC	2	6	2060	2065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017944	TCC	2	6	2075	2080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017944	GTC	2	6	2165	2170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848881
33	NC_017944	ACC	2	6	2243	2248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848881
34	NC_017944	GAG	2	6	2249	2254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848881
35	NC_017944	ACT	2	6	2343	2348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848881
36	NC_017944	GAT	2	6	2422	2427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848881
37	NC_017944	AGT	2	6	2473	2478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848881
38	NC_017944	CCA	2	6	2482	2487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848881
39	NC_017944	GAC	2	6	2626	2631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848881
40	NC_017944	CGA	2	6	2719	2724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848881
41	NC_017944	TTC	2	6	2825	2830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848881
42	NC_017944	CTT	2	6	2908	2913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848881
43	NC_017944	CCA	2	6	3083	3088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848881
44	NC_017944	CCG	2	6	3127	3132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848881
45	NC_017944	GTC	2	6	3137	3142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848881
46	NC_017944	CAC	2	6	3160	3165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848881
47	NC_017944	GAA	2	6	3181	3186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848881
48	NC_017944	GTA	2	6	3495	3500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848881
49	NC_017944	TCG	2	6	3519	3524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848881
50	NC_017944	GAC	2	6	3743	3748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017944	TAC	2	6	3778	3783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848882
52	NC_017944	TTC	2	6	3855	3860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848882
53	NC_017944	GTC	2	6	3897	3902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848882
54	NC_017944	GGT	2	6	3903	3908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848882
55	NC_017944	CGA	2	6	3953	3958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848882
56	NC_017944	CGG	2	6	3987	3992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017944	CAC	2	6	4067	4072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017944	ATG	2	6	4155	4160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848883
59	NC_017944	TGA	2	6	4165	4170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848883
60	NC_017944	GCC	2	6	4184	4189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848883
61	NC_017944	CGA	2	6	4243	4248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848883
62	NC_017944	CGC	2	6	4279	4284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848883
63	NC_017944	GCC	2	6	4340	4345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848883
64	NC_017944	GGA	2	6	4420	4425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848883
65	NC_017944	ATC	2	6	4469	4474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848883
66	NC_017944	CGA	2	6	4516	4521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848883
67	NC_017944	CGC	2	6	4522	4527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848883
68	NC_017944	TCA	2	6	4542	4547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848883
69	NC_017944	GAC	2	6	4556	4561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848883
70	NC_017944	GCC	2	6	4577	4582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848883
71	NC_017944	TCG	2	6	4605	4610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848883
72	NC_017944	TTC	2	6	4628	4633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848883
73	NC_017944	CAT	2	6	4643	4648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848883
74	NC_017944	CGC	2	6	4649	4654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848883
75	NC_017944	GAT	2	6	4703	4708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848883
76	NC_017944	CTC	2	6	4892	4897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848883
77	NC_017944	AGG	2	6	4909	4914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848883
78	NC_017944	GAT	2	6	4916	4921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848883
79	NC_017944	TCT	2	6	4954	4959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848883
80	NC_017944	TCA	2	6	5104	5109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848883
81	NC_017944	ATC	2	6	5441	5446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017944	AAC	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389848884
83	NC_017944	TCC	2	6	5750	5755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848884
84	NC_017944	CGA	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848884
85	NC_017944	CTG	2	6	6013	6018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017944	CGA	2	6	6036	6041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017944	GAT	2	6	6055	6060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017944	CGA	3	9	6075	6083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017944	GGC	4	12	6300	6311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848885
90	NC_017944	GTC	2	6	6445	6450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848885
91	NC_017944	GCC	3	9	6496	6504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848885
92	NC_017944	CGG	2	6	6544	6549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848885
93	NC_017944	GCT	2	6	6579	6584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848885
94	NC_017944	TTG	2	6	6640	6645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848885
95	NC_017944	TCC	2	6	6694	6699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848885
96	NC_017944	ACC	2	6	6730	6735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848885
97	NC_017944	GTG	2	6	6769	6774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848885
98	NC_017944	TTC	2	6	6856	6861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848885
99	NC_017944	TCA	2	6	6905	6910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848885
100	NC_017944	CGG	2	6	6982	6987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848885
101	NC_017944	TCG	2	6	7082	7087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848885
102	NC_017944	ACT	2	6	7092	7097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848885
103	NC_017944	TAC	2	6	7127	7132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848885
104	NC_017944	CGT	2	6	7164	7169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848885
105	NC_017944	GTC	2	6	7225	7230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848885
106	NC_017944	TAG	2	6	7273	7278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017944	CTA	2	6	7347	7352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017944	TAG	2	6	7353	7358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017944	CTC	2	6	7488	7493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848886
110	NC_017944	ACG	2	6	7545	7550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848886
111	NC_017944	TCC	2	6	7573	7578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848886
112	NC_017944	GTC	2	6	7661	7666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848886
113	NC_017944	ATC	2	6	7755	7760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848886
114	NC_017944	TGT	2	6	7820	7825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848886
115	NC_017944	CTC	2	6	7833	7838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848886
116	NC_017944	ACG	2	6	7862	7867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848886
117	NC_017944	GTC	2	6	7887	7892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848886
118	NC_017944	CTG	2	6	7937	7942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017944	GTT	2	6	8032	8037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017944	GGC	2	6	8270	8275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848887
121	NC_017944	CGG	2	6	8398	8403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848887
122	NC_017944	GAC	2	6	8434	8439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848887
123	NC_017944	CTG	2	6	8445	8450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848887
124	NC_017944	CTC	2	6	8453	8458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848887
125	NC_017944	GCT	2	6	8503	8508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848887
126	NC_017944	TCA	2	6	8529	8534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848887
127	NC_017944	TCC	2	6	8637	8642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848887
128	NC_017944	TCG	2	6	8733	8738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848887
129	NC_017944	CGA	2	6	8820	8825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848887
130	NC_017944	GAC	2	6	8845	8850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848887
131	NC_017944	TCG	2	6	8925	8930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848887
132	NC_017944	GTC	2	6	8939	8944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848887
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141	NC_017944	ATT	2	6	9588	9593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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248	NC_017944	TTG	2	6	16701	16706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_017944	CGT	2	6	17475	17480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848896
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