MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM500

Total Repeats: 7220

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017944	GAT	2	6	43	48	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848880
2	NC_017944	CGA	2	6	93	98	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848880
3	NC_017944	ACA	2	6	278	283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389848880
4	NC_017944	CGG	2	6	309	314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848880
5	NC_017944	CGT	2	6	319	324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848880
6	NC_017944	GTC	2	6	425	430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848880
7	NC_017944	TCG	2	6	490	495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848880
8	NC_017944	CAC	2	6	501	506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848880
9	NC_017944	GGA	2	6	623	628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848880
10	NC_017944	GAC	2	6	653	658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848880
11	NC_017944	GTT	2	6	742	747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848880
12	NC_017944	GTC	2	6	778	783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848880
13	NC_017944	TCG	2	6	800	805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848880
14	NC_017944	GAT	2	6	811	816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848880
15	NC_017944	CCG	2	6	1005	1010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848880
16	NC_017944	TGA	2	6	1104	1109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848880
17	NC_017944	GCT	2	6	1121	1126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848880
18	NC_017944	CTC	2	6	1132	1137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848880
19	NC_017944	GTC	2	6	1162	1167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848880
20	NC_017944	GAG	2	6	1230	1235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848880
21	NC_017944	TGT	2	6	1239	1244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848880
22	NC_017944	GTC	2	6	2165	2170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848881
23	NC_017944	ACC	2	6	2243	2248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848881
24	NC_017944	GAG	2	6	2249	2254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848881
25	NC_017944	ACT	2	6	2343	2348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848881
26	NC_017944	GAT	2	6	2422	2427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848881
27	NC_017944	AGT	2	6	2473	2478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848881
28	NC_017944	CCA	2	6	2482	2487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848881
29	NC_017944	GAC	2	6	2626	2631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848881
30	NC_017944	CGA	2	6	2719	2724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848881
31	NC_017944	TTC	2	6	2825	2830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848881
32	NC_017944	CTT	2	6	2908	2913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848881
33	NC_017944	CCA	2	6	3083	3088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848881
34	NC_017944	CCG	2	6	3127	3132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848881
35	NC_017944	GTC	2	6	3137	3142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848881
36	NC_017944	CAC	2	6	3160	3165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848881
37	NC_017944	GAA	2	6	3181	3186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848881
38	NC_017944	GTA	2	6	3495	3500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848881
39	NC_017944	TCG	2	6	3519	3524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848881
40	NC_017944	TAC	2	6	3778	3783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848882
41	NC_017944	TTC	2	6	3855	3860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848882
42	NC_017944	GTC	2	6	3897	3902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848882
43	NC_017944	GGT	2	6	3903	3908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848882
44	NC_017944	CGA	2	6	3953	3958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848882
45	NC_017944	ATG	2	6	4155	4160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848883
46	NC_017944	TGA	2	6	4165	4170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848883
47	NC_017944	GCC	2	6	4184	4189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848883
48	NC_017944	CGA	2	6	4243	4248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848883
49	NC_017944	CGC	2	6	4279	4284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848883
50	NC_017944	GCC	2	6	4340	4345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848883
51	NC_017944	GGA	2	6	4420	4425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848883
52	NC_017944	ATC	2	6	4469	4474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848883
53	NC_017944	CGA	2	6	4516	4521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848883
54	NC_017944	CGC	2	6	4522	4527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848883
55	NC_017944	TCA	2	6	4542	4547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848883
56	NC_017944	GAC	2	6	4556	4561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848883
57	NC_017944	GCC	2	6	4577	4582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848883
58	NC_017944	TCG	2	6	4605	4610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848883
59	NC_017944	TTC	2	6	4628	4633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848883
60	NC_017944	CAT	2	6	4643	4648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848883
61	NC_017944	CGC	2	6	4649	4654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848883
62	NC_017944	GAT	2	6	4703	4708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848883
63	NC_017944	CTC	2	6	4892	4897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848883
64	NC_017944	AGG	2	6	4909	4914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848883
65	NC_017944	GAT	2	6	4916	4921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848883
66	NC_017944	TCT	2	6	4954	4959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848883
67	NC_017944	TCA	2	6	5104	5109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848883
68	NC_017944	AAC	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389848884
69	NC_017944	TCC	2	6	5750	5755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848884
70	NC_017944	CGA	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848884
71	NC_017944	GGC	4	12	6300	6311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848885
72	NC_017944	GTC	2	6	6445	6450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848885
73	NC_017944	GCC	3	9	6496	6504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848885
74	NC_017944	CGG	2	6	6544	6549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848885
75	NC_017944	GCT	2	6	6579	6584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848885
76	NC_017944	TTG	2	6	6640	6645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848885
77	NC_017944	TCC	2	6	6694	6699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848885
78	NC_017944	ACC	2	6	6730	6735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848885
79	NC_017944	GTG	2	6	6769	6774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848885
80	NC_017944	TTC	2	6	6856	6861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848885
81	NC_017944	TCA	2	6	6905	6910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848885
82	NC_017944	CGG	2	6	6982	6987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848885
83	NC_017944	TCG	2	6	7082	7087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848885
84	NC_017944	ACT	2	6	7092	7097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848885
85	NC_017944	TAC	2	6	7127	7132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848885
86	NC_017944	CGT	2	6	7164	7169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848885
87	NC_017944	GTC	2	6	7225	7230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848885
88	NC_017944	CTC	2	6	7488	7493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848886
89	NC_017944	ACG	2	6	7545	7550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848886
90	NC_017944	TCC	2	6	7573	7578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848886
91	NC_017944	GTC	2	6	7661	7666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848886
92	NC_017944	ATC	2	6	7755	7760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848886
93	NC_017944	TGT	2	6	7820	7825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848886
94	NC_017944	CTC	2	6	7833	7838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848886
95	NC_017944	ACG	2	6	7862	7867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848886
96	NC_017944	GTC	2	6	7887	7892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848886
97	NC_017944	GGC	2	6	8270	8275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848887
98	NC_017944	CGG	2	6	8398	8403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848887
99	NC_017944	GAC	2	6	8434	8439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848887
100	NC_017944	CTG	2	6	8445	8450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848887
101	NC_017944	CTC	2	6	8453	8458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848887
102	NC_017944	GCT	2	6	8503	8508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848887
103	NC_017944	TCA	2	6	8529	8534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848887
104	NC_017944	TCC	2	6	8637	8642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848887
105	NC_017944	TCG	2	6	8733	8738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848887
106	NC_017944	CGA	2	6	8820	8825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848887
107	NC_017944	GAC	2	6	8845	8850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848887
108	NC_017944	TCG	2	6	8925	8930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848887
109	NC_017944	GTC	2	6	8939	8944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848887
110	NC_017944	GCT	2	6	8953	8958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848887
111	NC_017944	TCG	2	6	9006	9011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848887
112	NC_017944	GCA	2	6	9236	9241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848887
113	NC_017944	GCT	2	6	9328	9333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848887
114	NC_017944	GGT	2	6	9364	9369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848887
115	NC_017944	GTC	2	6	9377	9382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848887
116	NC_017944	TCG	2	6	9603	9608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848888
117	NC_017944	TCG	2	6	9634	9639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848888
118	NC_017944	GTG	2	6	9642	9647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848888
119	NC_017944	AGC	2	6	9692	9697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848888
120	NC_017944	GGT	2	6	9698	9703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848888
121	NC_017944	TCG	2	6	9841	9846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848888
122	NC_017944	TGG	2	6	9863	9868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848888
123	NC_017944	ACG	2	6	9888	9893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848888
124	NC_017944	CCT	2	6	9932	9937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848888
125	NC_017944	CTT	2	6	9998	10003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848888
126	NC_017944	GAA	3	9	10032	10040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848888
127	NC_017944	GAA	2	6	10065	10070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848888
128	NC_017944	GTT	2	6	10139	10144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848888
129	NC_017944	CGT	2	6	10145	10150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848888
130	NC_017944	TCG	2	6	10243	10248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848888
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252	NC_017944	CGG	2	6	19127	19132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848898
253	NC_017944	ACT	2	6	19175	19180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848898
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498	NC_017944	AAG	2	6	38109	38114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848911
499	NC_017944	CGA	2	6	38179	38184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848911
500	NC_017944	GAG	2	6	38578	38583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848912

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