MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM500

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017944	G	6	6	1877	1882	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017944	A	6	6	3737	3742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017944	C	6	6	7429	7434	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NC_017944	T	6	6	8336	8341	0 %	100 %	0 %	0 %	389848887
5	NC_017944	G	6	6	12903	12908	0 %	0 %	100 %	0 %	389848892
6	NC_017944	G	6	6	18581	18586	0 %	0 %	100 %	0 %	389848897
7	NC_017944	G	6	6	31800	31805	0 %	0 %	100 %	0 %	389848908
8	NC_017944	C	6	6	41581	41586	0 %	0 %	0 %	100 %	389848915
9	NC_017944	A	7	7	48254	48260	100 %	0 %	0 %	0 %	389848919
10	NC_017944	G	6	6	49952	49957	0 %	0 %	100 %	0 %	389848920
11	NC_017944	T	6	6	50849	50854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017944	C	6	6	51870	51875	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13	NC_017944	C	6	6	54574	54579	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14	NC_017944	A	7	7	60019	60025	100 %	0 %	0 %	0 %	389848930
15	NC_017944	C	6	6	60501	60506	0 %	0 %	0 %	100 %	389848930
16	NC_017944	C	6	6	64396	64401	0 %	0 %	0 %	100 %	389848934
17	NC_017944	G	6	6	72247	72252	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017944	T	6	6	72408	72413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017944	T	6	6	83657	83662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017944	C	8	8	87185	87192	0 %	0 %	0 %	100 %	389848948
21	NC_017944	A	7	7	87363	87369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017944	G	7	7	89004	89010	0 %	0 %	100 %	0 %	389848952
23	NC_017944	T	6	6	89046	89051	0 %	100 %	0 %	0 %	389848952
24	NC_017944	C	6	6	90470	90475	0 %	0 %	0 %	100 %	389848954
25	NC_017944	C	6	6	96333	96338	0 %	0 %	0 %	100 %	389848959
26	NC_017944	A	7	7	98875	98881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017944	T	6	6	100698	100703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017944	T	6	6	101549	101554	0 %	100 %	0 %	0 %	389848963
29	NC_017944	C	6	6	106089	106094	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_017944	G	6	6	112248	112253	0 %	0 %	100 %	0 %	389848977
31	NC_017944	A	6	6	115257	115262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017944	A	7	7	116963	116969	100 %	0 %	0 %	0 %	389848983
33	NC_017944	C	6	6	119273	119278	0 %	0 %	0 %	100 %	389848984
34	NC_017944	T	6	6	120348	120353	0 %	100 %	0 %	0 %	389848985
35	NC_017944	C	6	6	120975	120980	0 %	0 %	0 %	100 %	389848986
36	NC_017944	T	7	7	122819	122825	0 %	100 %	0 %	0 %	389848990
37	NC_017944	C	6	6	124214	124219	0 %	0 %	0 %	100 %	389848992
38	NC_017944	G	6	6	124510	124515	0 %	0 %	100 %	0 %	389848992
39	NC_017944	C	6	6	125130	125135	0 %	0 %	0 %	100 %	389848993
40	NC_017944	A	7	7	125976	125982	100 %	0 %	0 %	0 %	389848994
41	NC_017944	A	6	6	128442	128447	100 %	0 %	0 %	0 %	389848996
42	NC_017944	C	6	6	129849	129854	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43	NC_017944	A	8	8	130686	130693	100 %	0 %	0 %	0 %	389848998
44	NC_017944	A	6	6	131311	131316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017944	G	6	6	132264	132269	0 %	0 %	100 %	0 %	389848999
46	NC_017944	A	6	6	137256	137261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017944	G	6	6	140181	140186	0 %	0 %	100 %	0 %	389849004
48	NC_017944	C	6	6	141679	141684	0 %	0 %	0 %	100 %	389849004
49	NC_017944	T	7	7	151224	151230	0 %	100 %	0 %	0 %	389849011
50	NC_017944	G	6	6	153284	153289	0 %	0 %	100 %	0 %	389849012
51	NC_017944	G	6	6	157852	157857	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017944	C	6	6	160175	160180	0 %	0 %	0 %	100 %	389849018
53	NC_017944	C	6	6	163383	163388	0 %	0 %	0 %	100 %	389849019
54	NC_017944	T	6	6	170733	170738	0 %	100 %	0 %	0 %	389849026
55	NC_017944	A	6	6	172688	172693	100 %	0 %	0 %	0 %	389849028
56	NC_017944	C	6	6	186296	186301	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57	NC_017944	C	6	6	201394	201399	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
58	NC_017944	T	6	6	203159	203164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017944	T	6	6	205573	205578	0 %	100 %	0 %	0 %	389849056
60	NC_017944	T	6	6	205584	205589	0 %	100 %	0 %	0 %	389849056
61	NC_017944	C	6	6	210773	210778	0 %	0 %	0 %	100 %	389849061
62	NC_017944	T	6	6	214058	214063	0 %	100 %	0 %	0 %	389849065
63	NC_017944	T	6	6	217836	217841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017944	T	7	7	218931	218937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017944	C	6	6	220492	220497	0 %	0 %	0 %	100 %	389849072
66	NC_017944	C	6	6	221287	221292	0 %	0 %	0 %	100 %	389849072
67	NC_017944	A	6	6	238032	238037	100 %	0 %	0 %	0 %	389849089
68	NC_017944	G	6	6	249526	249531	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017944	G	6	6	258457	258462	0 %	0 %	100 %	0 %	389849104
70	NC_017944	A	6	6	260036	260041	100 %	0 %	0 %	0 %	389849106
71	NC_017944	C	6	6	263404	263409	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
72	NC_017944	T	6	6	265322	265327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017944	A	6	6	266514	266519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017944	T	6	6	271742	271747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017944	A	6	6	273371	273376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017944	T	6	6	274446	274451	0 %	100 %	0 %	0 %	389849124
77	NC_017944	A	6	6	274636	274641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017944	A	6	6	280030	280035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017944	C	6	6	285169	285174	0 %	0 %	0 %	100 %	389849138
80	NC_017944	C	6	6	289589	289594	0 %	0 %	0 %	100 %	389849141
81	NC_017944	G	7	7	290211	290217	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017944	C	6	6	295899	295904	0 %	0 %	0 %	100 %	389849147
83	NC_017944	G	6	6	302467	302472	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017944	A	6	6	305995	306000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017944	C	6	6	314087	314092	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
86	NC_017944	C	6	6	314357	314362	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
87	NC_017944	G	6	6	316375	316380	0 %	0 %	100 %	0 %	389849167
88	NC_017944	G	6	6	323494	323499	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017944	T	6	6	324199	324204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017944	G	6	6	334463	334468	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017944	A	6	6	337908	337913	100 %	0 %	0 %	0 %	389849188
92	NC_017944	T	6	6	340218	340223	0 %	100 %	0 %	0 %	389849191
93	NC_017944	C	6	6	344431	344436	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
94	NC_017944	G	6	6	344437	344442	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017944	A	6	6	346105	346110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017944	T	6	6	348497	348502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017944	T	6	6	348792	348797	0 %	100 %	0 %	0 %	389849199
98	NC_017944	C	6	6	355674	355679	0 %	0 %	0 %	100 %	389849205
99	NC_017944	C	6	6	356135	356140	0 %	0 %	0 %	100 %	389849205
100	NC_017944	C	6	6	360410	360415	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
101	NC_017944	G	6	6	369204	369209	0 %	0 %	100 %	0 %	389849217
102	NC_017944	C	6	6	384846	384851	0 %	0 %	0 %	100 %	389849235
103	NC_017944	A	6	6	393424	393429	100 %	0 %	0 %	0 %	389849246
104	NC_017944	G	6	6	396464	396469	0 %	0 %	100 %	0 %	389849251
105	NC_017944	A	6	6	398303	398308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017944	T	6	6	399882	399887	0 %	100 %	0 %	0 %	389849254
107	NC_017944	T	6	6	407522	407527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017944	G	6	6	407701	407706	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017944	A	6	6	409517	409522	100 %	0 %	0 %	0 %	389849269
110	NC_017944	T	6	6	421306	421311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017944	A	6	6	421407	421412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017944	T	6	6	440377	440382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017944	G	7	7	441986	441992	0 %	0 %	100 %	0 %	389849308
114	NC_017944	G	6	6	452725	452730	0 %	0 %	100 %	0 %	389849314
115	NC_017944	C	6	6	455499	455504	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
116	NC_017944	G	6	6	457539	457544	0 %	0 %	100 %	0 %	389849319
117	NC_017944	C	7	7	458224	458230	0 %	0 %	0 %	100 %	389849319
118	NC_017944	C	7	7	463475	463481	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
119	NC_017944	T	6	6	464233	464238	0 %	100 %	0 %	0 %	389849323
120	NC_017944	G	6	6	471965	471970	0 %	0 %	100 %	0 %	389849329
121	NC_017944	G	6	6	472920	472925	0 %	0 %	100 %	0 %	389849330
122	NC_017944	G	6	6	473234	473239	0 %	0 %	100 %	0 %	389849331
123	NC_017944	G	6	6	474936	474941	0 %	0 %	100 %	0 %	389849332
124	NC_017944	C	6	6	479557	479562	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
125	NC_017944	T	6	6	480946	480951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017944	G	6	6	492233	492238	0 %	0 %	100 %	0 %	389849346
127	NC_017944	T	6	6	493125	493130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017944	C	6	6	494185	494190	0 %	0 %	0 %	100 %	389849348
129	NC_017944	A	6	6	496122	496127	100 %	0 %	0 %	0 %	389849349
130	NC_017944	G	6	6	500285	500290	0 %	0 %	100 %	0 %	389849354
131	NC_017944	G	6	6	500687	500692	0 %	0 %	100 %	0 %	389849355

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.