MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM300

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017943	TTTAC	2	10	1657	1666	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017943	TTGTG	2	10	15374	15383	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017943	TTAAT	2	10	20812	20821	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017943	TACGG	2	10	25472	25481	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017943	TCGTC	2	10	33371	33380	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017943	CAGCT	2	10	45338	45347	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_017943	GCGGG	2	10	68921	68930	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017943	TCATA	2	10	90813	90822	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017943	AGATG	2	10	99599	99608	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017943	AGCGA	2	10	102085	102094	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017943	CCGAG	2	10	114850	114859	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017943	GAACT	2	10	123673	123682	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017943	GTCGA	2	10	133053	133062	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017943	CGACA	2	10	135200	135209	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017943	TGAGT	2	10	153680	153689	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017943	GAATC	2	10	158360	158369	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017943	GTCGT	2	10	164461	164470	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017943	AGCAC	2	10	164725	164734	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017943	TGCGA	2	10	180719	180728	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017943	CTGCC	2	10	185818	185827	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_017943	TCGCT	2	10	193925	193934	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_017943	GTATT	2	10	203405	203414	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017943	GATTC	2	10	203419	203428	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017943	CGACC	2	10	207066	207075	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_017943	ACGTT	2	10	227634	227643	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017943	GACCG	2	10	231292	231301	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_017943	TCACG	2	10	234420	234429	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017943	ACCAA	2	10	241719	241728	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_017943	ACCAG	2	10	243434	243443	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_017943	GATTG	2	10	260446	260455	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017943	GACTG	2	10	285848	285857	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017943	AACCA	2	10	287813	287822	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_017943	GGGTT	2	10	296695	296704	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017943	ACACA	2	10	309951	309960	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017943	AGTGG	2	10	310306	310315	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017943	ACTAT	2	10	321312	321321	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017943	TATGT	2	10	321384	321393	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.