MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM300

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017943	GA	3	6	3741	3746	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017943	AT	3	6	3769	3774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017943	AT	4	8	8052	8059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017943	TC	3	6	12258	12263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017943	AC	4	8	12306	12313	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017943	GA	3	6	15514	15519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017943	CT	3	6	15932	15937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017943	AT	3	6	20737	20742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017943	CG	3	6	20756	20761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017943	AT	3	6	20797	20802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017943	AG	3	6	21155	21160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017943	TC	3	6	21484	21489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017943	TC	3	6	24855	24860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017943	TC	3	6	25007	25012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017943	TG	3	6	25499	25504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017943	TG	3	6	25703	25708	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017943	TA	3	6	25710	25715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017943	CT	3	6	25761	25766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017943	GC	3	6	25814	25819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017943	TA	3	6	27046	27051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017943	AT	4	8	33293	33300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017943	TG	3	6	34783	34788	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017943	AC	3	6	34810	34815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017943	AC	3	6	38077	38082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017943	TC	3	6	42968	42973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017943	TG	3	6	43171	43176	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017943	CT	3	6	43177	43182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017943	TG	3	6	44844	44849	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017943	CA	4	8	44884	44891	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017943	AT	3	6	44927	44932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017943	GT	3	6	45278	45283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017943	CT	3	6	45669	45674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017943	AT	3	6	45705	45710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017943	TG	3	6	45728	45733	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017943	AT	3	6	54425	54430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017943	TG	3	6	58023	58028	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017943	GT	3	6	58497	58502	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017943	AT	3	6	80351	80356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017943	CT	3	6	82529	82534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017943	GT	3	6	82584	82589	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017943	CT	3	6	86786	86791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017943	CG	3	6	91174	91179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017943	TA	3	6	99345	99350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017943	GA	3	6	99638	99643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017943	AC	3	6	99689	99694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017943	AC	3	6	101883	101888	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017943	TC	3	6	121724	121729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017943	AG	3	6	123779	123784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017943	CT	4	8	123813	123820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017943	GT	3	6	124062	124067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017943	TA	3	6	124193	124198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017943	TA	3	6	124434	124439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017943	TA	3	6	129976	129981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017943	AT	3	6	132551	132556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017943	CT	3	6	132696	132701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017943	AT	3	6	136294	136299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017943	AT	3	6	136309	136314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017943	AT	3	6	137460	137465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017943	GT	3	6	140194	140199	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017943	CT	3	6	140262	140267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017943	GT	3	6	142430	142435	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017943	GA	3	6	146508	146513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017943	AT	3	6	153628	153633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017943	AC	3	6	156595	156600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017943	CT	3	6	161260	161265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017943	TC	3	6	163603	163608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017943	GT	3	6	164123	164128	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017943	GA	3	6	169636	169641	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017943	TG	3	6	172260	172265	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017943	AG	3	6	173965	173970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017943	AG	3	6	178559	178564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017943	GC	4	8	180528	180535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017943	AT	3	6	180701	180706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017943	TC	3	6	181017	181022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017943	TA	3	6	181055	181060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017943	GA	3	6	181179	181184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017943	CA	3	6	185549	185554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017943	TG	3	6	186284	186289	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017943	AT	3	6	188883	188888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017943	GA	3	6	189095	189100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017943	AT	4	8	198971	198978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017943	TA	3	6	204462	204467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017943	GA	4	8	204539	204546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017943	CA	3	6	205751	205756	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017943	GA	3	6	207090	207095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017943	AT	3	6	224264	224269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017943	CG	3	6	225521	225526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017943	AG	3	6	229964	229969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017943	TC	3	6	230019	230024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017943	AG	3	6	231305	231310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017943	AT	3	6	237351	237356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017943	AC	3	6	241409	241414	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017943	GA	3	6	241490	241495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017943	GT	3	6	241743	241748	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017943	AT	3	6	243369	243374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017943	GT	3	6	245392	245397	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017943	TA	3	6	245543	245548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017943	CG	3	6	257002	257007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017943	AC	3	6	257249	257254	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017943	AG	3	6	259584	259589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017943	GT	3	6	259682	259687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017943	AT	3	6	262837	262842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017943	GA	3	6	284587	284592	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017943	TG	3	6	287606	287611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017943	AG	3	6	287650	287655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017943	TA	3	6	296405	296410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017943	AG	3	6	299359	299364	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017943	GT	3	6	301984	301989	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017943	TA	3	6	305109	305114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017943	GA	3	6	305130	305135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017943	TC	4	8	305221	305228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017943	GA	3	6	305673	305678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017943	GA	4	8	306862	306869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017943	AC	4	8	306885	306892	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017943	TC	3	6	307757	307762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017943	TA	3	6	307931	307936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017943	TC	3	6	310316	310321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017943	GT	3	6	313769	313774	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017943	AG	3	6	316716	316721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017943	GA	3	6	316855	316860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017943	AT	3	6	320496	320501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017943	TG	3	6	320583	320588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017943	CA	4	8	321427	321434	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017943	GA	3	6	321460	321465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017943	AC	3	6	321481	321486	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.