MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM300

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017943	A	6	6	1570	1575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017943	C	6	6	6483	6488	0 %	0 %	0 %	100 %	389848593
3	NC_017943	T	6	6	10578	10583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017943	G	6	6	12963	12968	0 %	0 %	100 %	0 %	389848600
5	NC_017943	A	6	6	13695	13700	100 %	0 %	0 %	0 %	389848600
6	NC_017943	A	7	7	15256	15262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017943	G	6	6	20836	20841	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017943	C	6	6	22011	22016	0 %	0 %	0 %	100 %	389848607
9	NC_017943	A	7	7	31354	31360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017943	A	7	7	36145	36151	100 %	0 %	0 %	0 %	389848621
11	NC_017943	G	6	6	36881	36886	0 %	0 %	100 %	0 %	389848622
12	NC_017943	T	6	6	39072	39077	0 %	100 %	0 %	0 %	389848623
13	NC_017943	G	6	6	40918	40923	0 %	0 %	100 %	0 %	389848624
14	NC_017943	G	6	6	44715	44720	0 %	0 %	100 %	0 %	389848626
15	NC_017943	G	6	6	45865	45870	0 %	0 %	100 %	0 %	389848627
16	NC_017943	A	6	6	57531	57536	100 %	0 %	0 %	0 %	389848635
17	NC_017943	T	8	8	58464	58471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017943	T	6	6	59716	59721	0 %	100 %	0 %	0 %	389848637
19	NC_017943	T	6	6	59785	59790	0 %	100 %	0 %	0 %	389848637
20	NC_017943	T	6	6	60698	60703	0 %	100 %	0 %	0 %	389848638
21	NC_017943	T	6	6	73505	73510	0 %	100 %	0 %	0 %	389848648
22	NC_017943	T	6	6	74889	74894	0 %	100 %	0 %	0 %	389848650
23	NC_017943	C	6	6	78751	78756	0 %	0 %	0 %	100 %	389848656
24	NC_017943	T	6	6	86817	86822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017943	A	6	6	87763	87768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017943	T	6	6	89732	89737	0 %	100 %	0 %	0 %	389848667
27	NC_017943	C	7	7	120042	120048	0 %	0 %	0 %	100 %	389848697
28	NC_017943	T	6	6	121555	121560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017943	A	6	6	129981	129986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017943	C	6	6	131472	131477	0 %	0 %	0 %	100 %	389848704
31	NC_017943	T	6	6	140391	140396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017943	G	6	6	140650	140655	0 %	0 %	100 %	0 %	389848713
33	NC_017943	C	6	6	153177	153182	0 %	0 %	0 %	100 %	389848722
34	NC_017943	T	6	6	153367	153372	0 %	100 %	0 %	0 %	389848722
35	NC_017943	T	6	6	153465	153470	0 %	100 %	0 %	0 %	389848722
36	NC_017943	A	6	6	155169	155174	100 %	0 %	0 %	0 %	389848723
37	NC_017943	C	6	6	155797	155802	0 %	0 %	0 %	100 %	389848724
38	NC_017943	C	6	6	161873	161878	0 %	0 %	0 %	100 %	389848730
39	NC_017943	A	6	6	164550	164555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017943	G	6	6	167595	167600	0 %	0 %	100 %	0 %	389848735
41	NC_017943	T	6	6	167608	167613	0 %	100 %	0 %	0 %	389848735
42	NC_017943	C	6	6	168570	168575	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43	NC_017943	G	6	6	171813	171818	0 %	0 %	100 %	0 %	389848742
44	NC_017943	A	6	6	178545	178550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017943	C	6	6	180895	180900	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_017943	C	6	6	180982	180987	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_017943	T	6	6	189153	189158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017943	G	6	6	196672	196677	0 %	0 %	100 %	0 %	389848763
49	NC_017943	G	6	6	198499	198504	0 %	0 %	100 %	0 %	389848763
50	NC_017943	G	6	6	200009	200014	0 %	0 %	100 %	0 %	389848765
51	NC_017943	A	6	6	203566	203571	100 %	0 %	0 %	0 %	389848769
52	NC_017943	C	6	6	205684	205689	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_017943	A	6	6	206524	206529	100 %	0 %	0 %	0 %	389848773
54	NC_017943	C	6	6	212454	212459	0 %	0 %	0 %	100 %	389848776
55	NC_017943	A	6	6	216732	216737	100 %	0 %	0 %	0 %	389848779
56	NC_017943	C	6	6	217253	217258	0 %	0 %	0 %	100 %	389848780
57	NC_017943	A	6	6	224191	224196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017943	C	6	6	233218	233223	0 %	0 %	0 %	100 %	389848796
59	NC_017943	G	6	6	237603	237608	0 %	0 %	100 %	0 %	389848801
60	NC_017943	T	6	6	240246	240251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017943	T	6	6	242697	242702	0 %	100 %	0 %	0 %	389848809
62	NC_017943	C	6	6	246411	246416	0 %	0 %	0 %	100 %	389848814
63	NC_017943	C	6	6	249510	249515	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64	NC_017943	G	6	6	263468	263473	0 %	0 %	100 %	0 %	389848832
65	NC_017943	G	6	6	265858	265863	0 %	0 %	100 %	0 %	389848832
66	NC_017943	C	6	6	268586	268591	0 %	0 %	0 %	100 %	389848832
67	NC_017943	T	6	6	282286	282291	0 %	100 %	0 %	0 %	389848841
68	NC_017943	G	6	6	285408	285413	0 %	0 %	100 %	0 %	389848845
69	NC_017943	T	6	6	286027	286032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017943	A	7	7	287158	287164	100 %	0 %	0 %	0 %	389848846
71	NC_017943	T	6	6	287273	287278	0 %	100 %	0 %	0 %	389848847
72	NC_017943	T	6	6	287430	287435	0 %	100 %	0 %	0 %	389848847
73	NC_017943	A	6	6	289328	289333	100 %	0 %	0 %	0 %	389848848
74	NC_017943	G	6	6	291713	291718	0 %	0 %	100 %	0 %	389848851
75	NC_017943	C	7	7	295264	295270	0 %	0 %	0 %	100 %	389848854
76	NC_017943	C	6	6	296917	296922	0 %	0 %	0 %	100 %	389848856
77	NC_017943	G	7	7	299595	299601	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017943	G	6	6	300270	300275	0 %	0 %	100 %	0 %	389848859
79	NC_017943	G	6	6	302632	302637	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017943	A	6	6	305728	305733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017943	T	6	6	305789	305794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017943	G	7	7	308779	308785	0 %	0 %	100 %	0 %	389848868
83	NC_017943	C	6	6	319199	319204	0 %	0 %	0 %	100 %	389848876
84	NC_017943	C	6	6	321486	321491	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
85	NC_017943	C	7	7	321696	321702	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.