MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM100

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017942	ATCTT	2	10	3388	3397	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017942	GCTGT	2	10	15313	15322	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017942	TCCGC	2	10	26462	26471	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_017942	GCTCT	2	10	28519	28528	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_017942	TTTTG	2	10	31126	31135	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017942	TAGTG	2	10	37369	37378	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017942	GGCGC	2	10	50379	50388	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_017942	TGTAT	2	10	58103	58112	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017942	GTGGC	2	10	59692	59701	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017942	TAAGT	2	10	67450	67459	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017942	GACGT	2	10	83856	83865	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017942	GCGTC	2	10	87230	87239	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017942	CGGAG	2	10	98930	98939	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017942	AGTGG	2	10	101996	102005	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017942	CGAAC	2	10	102281	102290	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017942	CGGTT	2	10	102291	102300	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017942	CATCG	2	10	104729	104738	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017942	GCCGC	2	10	112753	112762	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_017942	TGAAC	2	10	125701	125710	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017942	TGAGA	2	10	125766	125775	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017942	ATATA	2	10	126973	126982	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017942	CCCAC	2	10	127432	127441	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
23	NC_017942	CACTT	2	10	128203	128212	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_017942	TGTGG	2	10	128949	128958	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.