MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM100

Total Repeats: 1683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017942	CGC	2	6	42	47	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848446
2	NC_017942	TGA	2	6	87	92	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848446
3	NC_017942	CCT	2	6	141	146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848446
4	NC_017942	TCG	2	6	213	218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848446
5	NC_017942	TGG	2	6	237	242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848446
6	NC_017942	ACC	2	6	428	433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848446
7	NC_017942	ATC	2	6	505	510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848446
8	NC_017942	GTT	2	6	535	540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848446
9	NC_017942	CGA	2	6	543	548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848446
10	NC_017942	GAC	2	6	571	576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848446
11	NC_017942	TGA	2	6	744	749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848446
12	NC_017942	AGA	2	6	834	839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848446
13	NC_017942	ATT	2	6	841	846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389848446
14	NC_017942	GAT	3	9	934	942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848446
15	NC_017942	GAT	2	6	982	987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848446
16	NC_017942	CGC	2	6	1050	1055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848446
17	NC_017942	AAT	2	6	1206	1211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389848446
18	NC_017942	CTT	2	6	1267	1272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848446
19	NC_017942	GAC	2	6	1273	1278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848446
20	NC_017942	TCG	2	6	1857	1862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848447
21	NC_017942	TTC	2	6	1919	1924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848447
22	NC_017942	CGG	2	6	2025	2030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848447
23	NC_017942	TGC	2	6	2052	2057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848447
24	NC_017942	TGT	2	6	2082	2087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848447
25	NC_017942	TTC	2	6	2190	2195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848447
26	NC_017942	ACG	2	6	2329	2334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848448
27	NC_017942	GGT	2	6	2343	2348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848448
28	NC_017942	GTT	2	6	2523	2528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848448
29	NC_017942	CTG	2	6	2565	2570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848448
30	NC_017942	GTT	2	6	2916	2921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848448
31	NC_017942	CCT	2	6	3044	3049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848448
32	NC_017942	TCT	2	6	3109	3114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848448
33	NC_017942	CGA	2	6	3553	3558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848449
34	NC_017942	ACT	2	6	3636	3641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848449
35	NC_017942	CGA	2	6	3668	3673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848449
36	NC_017942	GTT	2	6	3675	3680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848449
37	NC_017942	GTA	2	6	4109	4114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848450
38	NC_017942	GCC	2	6	4140	4145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848450
39	NC_017942	TCG	2	6	4293	4298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848450
40	NC_017942	GGC	2	6	4344	4349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848450
41	NC_017942	GAT	2	6	4382	4387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848450
42	NC_017942	GAC	2	6	4421	4426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848450
43	NC_017942	GAA	2	6	4456	4461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848450
44	NC_017942	TCG	2	6	4482	4487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848450
45	NC_017942	AGG	2	6	4488	4493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848450
46	NC_017942	CTG	2	6	4788	4793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848451
47	NC_017942	CGA	2	6	4823	4828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848451
48	NC_017942	ACG	2	6	4864	4869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848451
49	NC_017942	GAG	2	6	4920	4925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848451
50	NC_017942	CGC	2	6	4958	4963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848451
51	NC_017942	GCG	2	6	5055	5060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848451
52	NC_017942	ACG	2	6	5206	5211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848451
53	NC_017942	TCG	2	6	5218	5223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848451
54	NC_017942	CCT	2	6	5296	5301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848451
55	NC_017942	GAG	2	6	5436	5441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848451
56	NC_017942	CGC	2	6	5540	5545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848451
57	NC_017942	CCT	2	6	5561	5566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848451
58	NC_017942	GAC	2	6	5586	5591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848451
59	NC_017942	TCC	2	6	5599	5604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848451
60	NC_017942	CGA	2	6	5792	5797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848451
61	NC_017942	CAA	2	6	5822	5827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389848451
62	NC_017942	TTG	2	6	5913	5918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848452
63	NC_017942	CGT	2	6	5957	5962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848452
64	NC_017942	GTG	2	6	6076	6081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848452
65	NC_017942	AGC	2	6	6259	6264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848452
66	NC_017942	CGA	2	6	6284	6289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848452
67	NC_017942	GCG	2	6	6304	6309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848452
68	NC_017942	CAT	2	6	6335	6340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848452
69	NC_017942	CGC	2	6	6341	6346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848452
70	NC_017942	CGT	4	12	6386	6397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848452
71	NC_017942	GAC	2	6	6462	6467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848452
72	NC_017942	ACC	2	6	6472	6477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848452
73	NC_017942	ACG	2	6	6478	6483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848452
74	NC_017942	TCG	2	6	6574	6579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848452
75	NC_017942	GCA	2	6	6636	6641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848452
76	NC_017942	TCG	3	9	6649	6657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848452
77	NC_017942	TCC	2	6	6679	6684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848452
78	NC_017942	CGG	2	6	6695	6700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848452
79	NC_017942	TCG	2	6	6781	6786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848452
80	NC_017942	CGC	2	6	6875	6880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848452
81	NC_017942	GCC	2	6	7011	7016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848452
82	NC_017942	ACC	2	6	7088	7093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848452
83	NC_017942	CGA	2	6	7818	7823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848453
84	NC_017942	TCG	2	6	7901	7906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848453
85	NC_017942	CGA	2	6	7943	7948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848453
86	NC_017942	CGA	2	6	8022	8027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848453
87	NC_017942	GAG	2	6	8074	8079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848453
88	NC_017942	GAT	2	6	8195	8200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848453
89	NC_017942	ACG	2	6	8375	8380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848454
90	NC_017942	CGG	2	6	8381	8386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848454
91	NC_017942	GGT	2	6	8424	8429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848454
92	NC_017942	GTC	2	6	8463	8468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848454
93	NC_017942	TGT	2	6	8499	8504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848454
94	NC_017942	CGT	2	6	8540	8545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848454
95	NC_017942	TGA	2	6	8582	8587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848454
96	NC_017942	CGC	2	6	8598	8603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848454
97	NC_017942	TGA	2	6	8657	8662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848454
98	NC_017942	ACC	2	6	8823	8828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848454
99	NC_017942	CTC	2	6	8832	8837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848454
100	NC_017942	ACC	2	6	8974	8979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848454
101	NC_017942	GTC	2	6	9082	9087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848454
102	NC_017942	CGA	2	6	9301	9306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848455
103	NC_017942	ACC	2	6	9334	9339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848455
104	NC_017942	GAC	2	6	9406	9411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848455
105	NC_017942	GGC	2	6	9706	9711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848456
106	NC_017942	CGA	2	6	9727	9732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848456
107	NC_017942	GAG	2	6	9828	9833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848456
108	NC_017942	CGG	2	6	9921	9926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848456
109	NC_017942	CGG	2	6	10018	10023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848456
110	NC_017942	GAC	2	6	10031	10036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848456
111	NC_017942	GAC	2	6	10053	10058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848456
112	NC_017942	CGA	2	6	10082	10087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848456
113	NC_017942	CGC	2	6	10166	10171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848457
114	NC_017942	GAT	2	6	10263	10268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848457
115	NC_017942	CCA	2	6	10330	10335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848457
116	NC_017942	GCG	2	6	10441	10446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848457
117	NC_017942	GCG	2	6	10465	10470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848457
118	NC_017942	CGC	2	6	10543	10548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848457
119	NC_017942	CGC	2	6	10742	10747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848457
120	NC_017942	TCG	2	6	10837	10842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848457
121	NC_017942	CAG	2	6	10857	10862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848457
122	NC_017942	CGT	2	6	10884	10889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848457
123	NC_017942	CCA	2	6	10890	10895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848457
124	NC_017942	CTT	2	6	10929	10934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848457
125	NC_017942	GTC	2	6	10939	10944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848457
126	NC_017942	ATC	2	6	10948	10953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848457
127	NC_017942	GAG	2	6	11124	11129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848457
128	NC_017942	CTC	2	6	11193	11198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848457
129	NC_017942	CGT	2	6	11219	11224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848457
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251	NC_017942	CGT	2	6	18917	18922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848464
252	NC_017942	GTC	3	9	18948	18956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848464
253	NC_017942	TCC	2	6	18981	18986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848464
254	NC_017942	ACG	2	6	19009	19014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848464
255	NC_017942	GTC	2	6	19029	19034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848464
256	NC_017942	ACC	2	6	19078	19083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848464
257	NC_017942	CGC	2	6	19088	19093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848464
258	NC_017942	GAC	3	9	19146	19154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848464
259	NC_017942	GCC	2	6	19155	19160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848464
260	NC_017942	CGC	2	6	19260	19265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848464
261	NC_017942	CGT	2	6	19304	19309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848464
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263	NC_017942	AGT	2	6	19735	19740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848465
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265	NC_017942	GAG	2	6	19880	19885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848465
266	NC_017942	GCC	2	6	19901	19906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848465
267	NC_017942	TCC	2	6	19926	19931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848465
268	NC_017942	ACG	2	6	19947	19952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848465
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270	NC_017942	CTC	2	6	20090	20095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848465
271	NC_017942	CAT	2	6	20451	20456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848466
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273	NC_017942	GGC	2	6	20482	20487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848466
274	NC_017942	CGC	2	6	20552	20557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848466
275	NC_017942	CCT	2	6	20558	20563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848466
276	NC_017942	GGT	2	6	20568	20573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848466
277	NC_017942	CCG	2	6	20596	20601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848466
278	NC_017942	CGT	2	6	20711	20716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848466
279	NC_017942	CGA	2	6	20780	20785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848466
280	NC_017942	CGC	2	6	20846	20851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848466
281	NC_017942	CGA	2	6	20978	20983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848466
282	NC_017942	CTC	2	6	21012	21017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848466
283	NC_017942	GTC	2	6	21130	21135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848466
284	NC_017942	CGA	2	6	21179	21184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848466
285	NC_017942	ATG	2	6	21229	21234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848466
286	NC_017942	AGT	2	6	21561	21566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848467
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290	NC_017942	CGT	2	6	21693	21698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848467
291	NC_017942	TCG	2	6	21773	21778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848467
292	NC_017942	TCG	2	6	21821	21826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848467
293	NC_017942	GTC	2	6	21844	21849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848467
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324	NC_017942	TCG	2	6	22982	22987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848467
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372	NC_017942	CGA	2	6	26539	26544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848470
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498	NC_017942	GAC	2	6	40554	40559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848489
499	NC_017942	GAC	2	6	40586	40591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848489
500	NC_017942	CCG	2	6	40636	40641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848489

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