MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM100

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017942	AC	3	6	3274	3279	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017942	AT	3	6	7169	7174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017942	TA	3	6	7240	7245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017942	CT	3	6	7609	7614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017942	TC	3	6	7644	7649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017942	AT	3	6	19541	19546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017942	AT	3	6	21431	21436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017942	CT	3	6	23458	23463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017942	GT	3	6	26243	26248	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017942	AT	3	6	26285	26290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017942	TA	3	6	28685	28690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017942	TC	3	6	28704	28709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017942	GA	3	6	28808	28813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017942	GA	3	6	30420	30425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017942	CG	3	6	30581	30586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017942	GA	3	6	30633	30638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017942	CT	3	6	32026	32031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017942	CG	3	6	33342	33347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017942	CT	3	6	34734	34739	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017942	GA	3	6	35407	35412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017942	TA	3	6	35582	35587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017942	TG	3	6	35783	35788	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017942	AG	3	6	35816	35821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017942	AT	3	6	35957	35962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017942	TC	3	6	36657	36662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017942	TC	3	6	36664	36669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017942	AT	3	6	37000	37005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017942	GC	3	6	37561	37566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017942	AT	3	6	37800	37805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017942	TG	3	6	39567	39572	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017942	GT	3	6	39574	39579	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017942	AT	3	6	50469	50474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017942	CA	3	6	51147	51152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017942	AG	3	6	53549	53554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017942	AT	3	6	54659	54664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017942	AT	3	6	54713	54718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017942	TC	3	6	54850	54855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017942	CA	3	6	63506	63511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017942	CT	3	6	64579	64584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017942	AC	3	6	65701	65706	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017942	CT	3	6	68136	68141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017942	GT	3	6	68467	68472	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017942	CT	3	6	68700	68705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017942	GT	3	6	68768	68773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017942	GT	3	6	69062	69067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017942	GC	3	6	69290	69295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017942	CA	3	6	69615	69620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017942	AC	3	6	70069	70074	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017942	CT	3	6	70737	70742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017942	TC	3	6	74540	74545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017942	AG	3	6	77960	77965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017942	TC	3	6	78241	78246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017942	CT	3	6	78290	78295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017942	CA	3	6	78558	78563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017942	CT	3	6	81513	81518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017942	CT	3	6	84206	84211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017942	AT	3	6	85459	85464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017942	CT	3	6	86834	86839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017942	GT	3	6	87174	87179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017942	AT	3	6	89339	89344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017942	AT	3	6	89360	89365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017942	CA	3	6	90907	90912	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017942	AC	4	8	90998	91005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017942	TC	4	8	91109	91116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017942	AC	3	6	92232	92237	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017942	AC	3	6	92271	92276	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017942	GC	4	8	98851	98858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017942	GC	3	6	100005	100010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017942	GC	3	6	100055	100060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017942	CG	3	6	100086	100091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017942	CG	3	6	100185	100190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017942	GC	3	6	100201	100206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017942	AC	3	6	100631	100636	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017942	TG	3	6	102640	102645	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017942	GT	3	6	103597	103602	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017942	AG	3	6	103634	103639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017942	CA	3	6	103730	103735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017942	CA	3	6	107610	107615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017942	TA	3	6	107869	107874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017942	GT	3	6	109438	109443	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017942	CT	3	6	116328	116333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017942	TA	3	6	122337	122342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017942	CT	4	8	122483	122490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017942	CA	3	6	122506	122511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017942	CT	3	6	122571	122576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017942	TC	3	6	124298	124303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017942	TG	3	6	124417	124422	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017942	AT	3	6	124541	124546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017942	TC	3	6	124709	124714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017942	GT	3	6	124751	124756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017942	GA	3	6	125237	125242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017942	CT	3	6	125315	125320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017942	AT	3	6	125382	125387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017942	AG	3	6	125735	125740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017942	AT	3	6	127654	127659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017942	GT	3	6	128959	128964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017942	TC	3	6	129119	129124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.