MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM100

Total Repeats: 181

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017942	CG	3	6	358	363	0 %	0 %	50 %	50 %	389848446
2	NC_017942	AG	3	6	726	731	50 %	0 %	50 %	0 %	389848446
3	NC_017942	TC	3	6	828	833	0 %	50 %	0 %	50 %	389848446
4	NC_017942	GT	3	6	2469	2474	0 %	50 %	50 %	0 %	389848448
5	NC_017942	TG	3	6	4198	4203	0 %	50 %	50 %	0 %	389848450
6	NC_017942	TC	3	6	4588	4593	0 %	50 %	0 %	50 %	389848450
7	NC_017942	TC	3	6	5117	5122	0 %	50 %	0 %	50 %	389848451
8	NC_017942	GC	3	6	6893	6898	0 %	0 %	50 %	50 %	389848452
9	NC_017942	AC	3	6	7080	7085	50 %	0 %	0 %	50 %	389848452
10	NC_017942	CA	3	6	8094	8099	50 %	0 %	0 %	50 %	389848453
11	NC_017942	CT	3	6	8920	8925	0 %	50 %	0 %	50 %	389848454
12	NC_017942	CG	3	6	8963	8968	0 %	0 %	50 %	50 %	389848454
13	NC_017942	GC	4	8	10577	10584	0 %	0 %	50 %	50 %	389848457
14	NC_017942	AG	3	6	10805	10810	50 %	0 %	50 %	0 %	389848457
15	NC_017942	CT	3	6	11346	11351	0 %	50 %	0 %	50 %	389848457
16	NC_017942	TC	3	6	11580	11585	0 %	50 %	0 %	50 %	389848459
17	NC_017942	AC	3	6	12185	12190	50 %	0 %	0 %	50 %	389848459
18	NC_017942	CT	3	6	13544	13549	0 %	50 %	0 %	50 %	389848460
19	NC_017942	GC	3	6	14527	14532	0 %	0 %	50 %	50 %	389848460
20	NC_017942	TC	3	6	15716	15721	0 %	50 %	0 %	50 %	389848461
21	NC_017942	GC	3	6	17034	17039	0 %	0 %	50 %	50 %	389848462
22	NC_017942	CG	3	6	18086	18091	0 %	0 %	50 %	50 %	389848464
23	NC_017942	AG	3	6	18843	18848	50 %	0 %	50 %	0 %	389848464
24	NC_017942	AG	3	6	21583	21588	50 %	0 %	50 %	0 %	389848467
25	NC_017942	CG	3	6	21757	21762	0 %	0 %	50 %	50 %	389848467
26	NC_017942	GC	3	6	21882	21887	0 %	0 %	50 %	50 %	389848467
27	NC_017942	GC	3	6	22837	22842	0 %	0 %	50 %	50 %	389848467
28	NC_017942	GC	3	6	24317	24322	0 %	0 %	50 %	50 %	389848468
29	NC_017942	GC	3	6	24602	24607	0 %	0 %	50 %	50 %	389848468
30	NC_017942	CG	3	6	25301	25306	0 %	0 %	50 %	50 %	389848469
31	NC_017942	GC	3	6	25395	25400	0 %	0 %	50 %	50 %	389848469
32	NC_017942	GT	3	6	26021	26026	0 %	50 %	50 %	0 %	389848469
33	NC_017942	GA	3	6	27756	27761	50 %	0 %	50 %	0 %	389848472
34	NC_017942	TA	3	6	27888	27893	50 %	50 %	0 %	0 %	389848472
35	NC_017942	GA	3	6	28094	28099	50 %	0 %	50 %	0 %	389848473
36	NC_017942	TC	3	6	28424	28429	0 %	50 %	0 %	50 %	389848474
37	NC_017942	TA	3	6	29076	29081	50 %	50 %	0 %	0 %	389848475
38	NC_017942	CA	4	8	29109	29116	50 %	0 %	0 %	50 %	389848475
39	NC_017942	AG	3	6	29813	29818	50 %	0 %	50 %	0 %	389848476
40	NC_017942	CT	3	6	29990	29995	0 %	50 %	0 %	50 %	389848476
41	NC_017942	CG	3	6	31447	31452	0 %	0 %	50 %	50 %	389848478
42	NC_017942	GC	3	6	32909	32914	0 %	0 %	50 %	50 %	389848480
43	NC_017942	CG	3	6	33158	33163	0 %	0 %	50 %	50 %	389848480
44	NC_017942	AG	3	6	34167	34172	50 %	0 %	50 %	0 %	389848483
45	NC_017942	AG	3	6	34221	34226	50 %	0 %	50 %	0 %	389848483
46	NC_017942	TG	3	6	35152	35157	0 %	50 %	50 %	0 %	389848484
47	NC_017942	AC	3	6	36242	36247	50 %	0 %	0 %	50 %	389848485
48	NC_017942	CG	3	6	36450	36455	0 %	0 %	50 %	50 %	389848485
49	NC_017942	AG	3	6	38165	38170	50 %	0 %	50 %	0 %	389848486
50	NC_017942	TC	3	6	38496	38501	0 %	50 %	0 %	50 %	389848486
51	NC_017942	CG	3	6	38942	38947	0 %	0 %	50 %	50 %	389848488
52	NC_017942	GT	3	6	39023	39028	0 %	50 %	50 %	0 %	389848488
53	NC_017942	CA	3	6	39602	39607	50 %	0 %	0 %	50 %	389848489
54	NC_017942	GC	3	6	40680	40685	0 %	0 %	50 %	50 %	389848489
55	NC_017942	CG	3	6	41428	41433	0 %	0 %	50 %	50 %	389848490
56	NC_017942	GC	3	6	41445	41450	0 %	0 %	50 %	50 %	389848490
57	NC_017942	CT	3	6	43353	43358	0 %	50 %	0 %	50 %	389848492
58	NC_017942	GC	3	6	43692	43697	0 %	0 %	50 %	50 %	389848492
59	NC_017942	GC	4	8	43793	43800	0 %	0 %	50 %	50 %	389848492
60	NC_017942	CG	3	6	44636	44641	0 %	0 %	50 %	50 %	389848493
61	NC_017942	GC	3	6	45610	45615	0 %	0 %	50 %	50 %	389848494
62	NC_017942	TC	3	6	46035	46040	0 %	50 %	0 %	50 %	389848494
63	NC_017942	TC	3	6	47295	47300	0 %	50 %	0 %	50 %	389848495
64	NC_017942	AG	3	6	47659	47664	50 %	0 %	50 %	0 %	389848495
65	NC_017942	GC	3	6	48244	48249	0 %	0 %	50 %	50 %	389848496
66	NC_017942	GA	3	6	48325	48330	50 %	0 %	50 %	0 %	389848496
67	NC_017942	AT	3	6	48753	48758	50 %	50 %	0 %	0 %	389848496
68	NC_017942	AG	3	6	48992	48997	50 %	0 %	50 %	0 %	389848496
69	NC_017942	GC	3	6	49356	49361	0 %	0 %	50 %	50 %	389848497
70	NC_017942	CG	4	8	50008	50015	0 %	0 %	50 %	50 %	389848497
71	NC_017942	AC	3	6	50527	50532	50 %	0 %	0 %	50 %	389848498
72	NC_017942	CG	3	6	50583	50588	0 %	0 %	50 %	50 %	389848498
73	NC_017942	AG	3	6	50681	50686	50 %	0 %	50 %	0 %	389848498
74	NC_017942	CG	3	6	52292	52297	0 %	0 %	50 %	50 %	389848500
75	NC_017942	CT	4	8	52473	52480	0 %	50 %	0 %	50 %	389848500
76	NC_017942	TG	3	6	53212	53217	0 %	50 %	50 %	0 %	389848501
77	NC_017942	AT	3	6	53679	53684	50 %	50 %	0 %	0 %	389848502
78	NC_017942	TC	3	6	53754	53759	0 %	50 %	0 %	50 %	389848502
79	NC_017942	CG	3	6	53947	53952	0 %	0 %	50 %	50 %	389848502
80	NC_017942	GT	4	8	57843	57850	0 %	50 %	50 %	0 %	389848503
81	NC_017942	GA	3	6	58969	58974	50 %	0 %	50 %	0 %	389848504
82	NC_017942	CG	3	6	59019	59024	0 %	0 %	50 %	50 %	389848504
83	NC_017942	GA	3	6	59991	59996	50 %	0 %	50 %	0 %	389848506
84	NC_017942	TC	3	6	60851	60856	0 %	50 %	0 %	50 %	389848507
85	NC_017942	AC	4	8	61690	61697	50 %	0 %	0 %	50 %	389848509
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87	NC_017942	TC	3	6	63600	63605	0 %	50 %	0 %	50 %	389848511
88	NC_017942	CT	3	6	64125	64130	0 %	50 %	0 %	50 %	389848511
89	NC_017942	AC	3	6	64779	64784	50 %	0 %	0 %	50 %	389848512
90	NC_017942	TC	3	6	64981	64986	0 %	50 %	0 %	50 %	389848512
91	NC_017942	TG	3	6	66036	66041	0 %	50 %	50 %	0 %	389848513
92	NC_017942	GT	3	6	66402	66407	0 %	50 %	50 %	0 %	389848514
93	NC_017942	CG	3	6	66871	66876	0 %	0 %	50 %	50 %	389848514
94	NC_017942	GA	3	6	67002	67007	50 %	0 %	50 %	0 %	389848514
95	NC_017942	AC	3	6	67033	67038	50 %	0 %	0 %	50 %	389848514
96	NC_017942	GC	3	6	67170	67175	0 %	0 %	50 %	50 %	389848514
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99	NC_017942	CG	3	6	71689	71694	0 %	0 %	50 %	50 %	389848517
100	NC_017942	GA	3	6	72338	72343	50 %	0 %	50 %	0 %	389848517
101	NC_017942	CA	3	6	72670	72675	50 %	0 %	0 %	50 %	389848517
102	NC_017942	TC	3	6	72718	72723	0 %	50 %	0 %	50 %	389848517
103	NC_017942	GT	3	6	73030	73035	0 %	50 %	50 %	0 %	389848519
104	NC_017942	TG	3	6	74153	74158	0 %	50 %	50 %	0 %	389848519
105	NC_017942	GC	3	6	75646	75651	0 %	0 %	50 %	50 %	389848521
106	NC_017942	CA	3	6	77216	77221	50 %	0 %	0 %	50 %	389848523
107	NC_017942	CG	3	6	77514	77519	0 %	0 %	50 %	50 %	389848523
108	NC_017942	GT	3	6	78805	78810	0 %	50 %	50 %	0 %	389848525
109	NC_017942	CG	3	6	79144	79149	0 %	0 %	50 %	50 %	389848526
110	NC_017942	TC	3	6	79252	79257	0 %	50 %	0 %	50 %	389848526
111	NC_017942	GT	3	6	80206	80211	0 %	50 %	50 %	0 %	389848529
112	NC_017942	TG	3	6	80267	80272	0 %	50 %	50 %	0 %	389848529
113	NC_017942	GA	4	8	81800	81807	50 %	0 %	50 %	0 %	389848532
114	NC_017942	TG	3	6	81893	81898	0 %	50 %	50 %	0 %	389848532
115	NC_017942	GC	3	6	82694	82699	0 %	0 %	50 %	50 %	389848534
116	NC_017942	GT	3	6	83347	83352	0 %	50 %	50 %	0 %	389848534
117	NC_017942	GA	3	6	84483	84488	50 %	0 %	50 %	0 %	389848536
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119	NC_017942	AG	3	6	85070	85075	50 %	0 %	50 %	0 %	389848536
120	NC_017942	CT	3	6	85908	85913	0 %	50 %	0 %	50 %	389848537
121	NC_017942	CG	3	6	86577	86582	0 %	0 %	50 %	50 %	389848537
122	NC_017942	AC	3	6	87424	87429	50 %	0 %	0 %	50 %	389848538
123	NC_017942	AG	3	6	89020	89025	50 %	0 %	50 %	0 %	389848540
124	NC_017942	TC	4	8	89099	89106	0 %	50 %	0 %	50 %	389848540
125	NC_017942	TC	3	6	89533	89538	0 %	50 %	0 %	50 %	389848541
126	NC_017942	TC	3	6	89590	89595	0 %	50 %	0 %	50 %	389848542
127	NC_017942	CT	3	6	89639	89644	0 %	50 %	0 %	50 %	389848542
128	NC_017942	TG	3	6	89647	89652	0 %	50 %	50 %	0 %	389848542
129	NC_017942	AG	3	6	90198	90203	50 %	0 %	50 %	0 %	389848542
130	NC_017942	GT	3	6	90425	90430	0 %	50 %	50 %	0 %	389848542
131	NC_017942	TC	3	6	90472	90477	0 %	50 %	0 %	50 %	389848542
132	NC_017942	TC	3	6	91957	91962	0 %	50 %	0 %	50 %	389848543
133	NC_017942	GA	3	6	92671	92676	50 %	0 %	50 %	0 %	389848545
134	NC_017942	TC	3	6	92762	92767	0 %	50 %	0 %	50 %	389848545
135	NC_017942	AC	3	6	92945	92950	50 %	0 %	0 %	50 %	389848545
136	NC_017942	GA	3	6	93141	93146	50 %	0 %	50 %	0 %	389848545
137	NC_017942	GA	3	6	93481	93486	50 %	0 %	50 %	0 %	389848545
138	NC_017942	GA	3	6	93997	94002	50 %	0 %	50 %	0 %	389848545
139	NC_017942	TA	3	6	94345	94350	50 %	50 %	0 %	0 %	389848545
140	NC_017942	GA	3	6	94812	94817	50 %	0 %	50 %	0 %	389848545
141	NC_017942	GA	3	6	95912	95917	50 %	0 %	50 %	0 %	389848545
142	NC_017942	CT	3	6	96241	96246	0 %	50 %	0 %	50 %	389848545
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.