MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 chromosome

Total Repeats: 1409

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017941	GTCC	2	8	14941	14948	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017941	GTTC	2	8	15307	15314	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017941	GTCG	2	8	19600	19607	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017941	ACCC	2	8	23594	23601	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_017941	GTCT	2	8	31407	31414	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017941	CACG	2	8	31461	31468	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017941	AAAC	2	8	32064	32071	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017941	GTCG	2	8	50023	50030	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017941	TCGC	2	8	50090	50097	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017941	ACCC	2	8	53192	53199	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_017941	TTCG	2	8	56008	56015	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017941	TTTG	2	8	67392	67399	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017941	ACTC	2	8	67820	67827	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017941	AAAC	2	8	73447	73454	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017941	GAGT	2	8	73997	74004	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017941	TCGA	2	8	79216	79223	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017941	AGAT	2	8	79248	79255	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017941	TCCA	2	8	79348	79355	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017941	TCGA	2	8	79763	79770	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017941	AATA	2	8	79851	79858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017941	AGTT	2	8	81140	81147	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017941	ATAA	2	8	82065	82072	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017941	CGTC	2	8	82923	82930	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017941	TTAT	2	8	83169	83176	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017941	GTCA	2	8	87663	87670	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017941	CTGT	2	8	87735	87742	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017941	CTCA	2	8	88271	88278	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017941	CAGG	2	8	94490	94497	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017941	CCGC	2	8	94649	94656	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_017941	ATTT	2	8	99181	99188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017941	ATTG	2	8	101397	101404	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017941	TCGG	2	8	102714	102721	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017941	ACAT	2	8	104610	104617	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017941	CCCT	2	8	107070	107077	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_017941	AGAC	2	8	111582	111589	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017941	ATTA	2	8	111636	111643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017941	TTGT	2	8	111688	111695	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017941	GTTC	2	8	111977	111984	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017941	ACCC	2	8	114954	114961	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_017941	GGGA	2	8	121533	121540	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017941	ACCG	2	8	124136	124143	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017941	CGCC	2	8	133384	133391	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_017941	CCCT	2	8	135543	135550	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
44	NC_017941	ACTC	2	8	136754	136761	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017941	AACA	2	8	136879	136886	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017941	TTGT	2	8	138895	138902	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017941	TCGC	2	8	140414	140421	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017941	AAAC	2	8	145669	145676	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017941	GACC	2	8	149034	149041	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017941	TTTG	2	8	150747	150754	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017941	TATT	2	8	151383	151390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017941	CAAC	2	8	153305	153312	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017941	GGGT	2	8	153994	154001	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017941	GTCT	2	8	167054	167061	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017941	GTTC	2	8	168232	168239	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017941	CGAC	2	8	169633	169640	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017941	CCTT	2	8	169675	169682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017941	TTGA	2	8	169734	169741	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017941	GAGT	2	8	182754	182761	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017941	GTCA	2	8	182881	182888	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017941	GTTC	2	8	183180	183187	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017941	GGTC	2	8	183192	183199	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017941	CTCG	2	8	185281	185288	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017941	CGGT	2	8	185324	185331	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017941	GTTG	2	8	189879	189886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017941	GTGA	2	8	191266	191273	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017941	GGAA	2	8	195485	195492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017941	TCTT	2	8	198387	198394	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017941	GACG	2	8	198430	198437	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017941	TCGC	2	8	198445	198452	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017941	TCTT	2	8	200188	200195	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017941	CGTC	2	8	200231	200238	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017941	ACAT	2	8	201541	201548	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017941	CACG	2	8	201910	201917	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017941	GTTA	2	8	201978	201985	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017941	TTAT	2	8	202038	202045	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017941	TAAT	2	8	202934	202941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017941	CATC	2	8	205085	205092	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017941	GATT	2	8	205916	205923	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017941	CGAA	2	8	205975	205982	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017941	AATC	2	8	208810	208817	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017941	CCCT	2	8	208902	208909	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
83	NC_017941	GGCT	2	8	211011	211018	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017941	GTCG	2	8	220773	220780	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017941	TTTG	2	8	221815	221822	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017941	CACC	2	8	222385	222392	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
87	NC_017941	GCGG	2	8	224161	224168	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017941	TAGC	2	8	227439	227446	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017941	CCGC	2	8	227483	227490	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_017941	AACC	2	8	231765	231772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017941	GGCA	2	8	238560	238567	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017941	TCAC	2	8	242758	242765	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017941	GCTC	2	8	242803	242810	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017941	CTCG	2	8	245181	245188	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017941	CCGA	2	8	247190	247197	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017941	GAAC	2	8	247547	247554	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017941	TGAG	2	8	247658	247665	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017941	GGCT	2	8	248411	248418	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017941	GTGC	2	8	254445	254452	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017941	CGTA	2	8	257498	257505	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017941	CACG	2	8	257508	257515	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017941	TTCG	2	8	257562	257569	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017941	CATC	2	8	257907	257914	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017941	CCGT	2	8	259051	259058	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017941	GTAC	2	8	270033	270040	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017941	CCCT	2	8	278995	279002	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
107	NC_017941	GTCC	2	8	291250	291257	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017941	AACC	2	8	293600	293607	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017941	CACC	2	8	293646	293653	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
110	NC_017941	CATC	2	8	293696	293703	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017941	CACC	2	8	293732	293739	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
112	NC_017941	CACC	2	8	293774	293781	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
113	NC_017941	CAGC	2	8	293825	293832	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017941	AACC	2	8	299868	299875	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017941	ACCA	2	8	306001	306008	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017941	CGTC	2	8	327399	327406	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017941	CTTC	2	8	327637	327644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017941	TTCC	2	8	327685	327692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017941	TCGT	2	8	327748	327755	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017941	CTAT	2	8	327790	327797	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017941	CATC	2	8	328088	328095	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017941	CGCC	2	8	328151	328158	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
123	NC_017941	TTCG	2	8	332876	332883	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017941	ACCG	2	8	345471	345478	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017941	CAGG	2	8	345495	345502	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017941	GGTC	2	8	349158	349165	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017941	CCTC	2	8	349218	349225	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
128	NC_017941	CCAC	2	8	349391	349398	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
129	NC_017941	ACCC	4	16	349399	349414	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
130	NC_017941	CGAC	2	8	351015	351022	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017941	TCGG	2	8	354207	354214	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017941	ACTG	2	8	355969	355976	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017941	GATG	2	8	356031	356038	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017941	GTTT	2	8	356041	356048	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017941	TCCC	2	8	364396	364403	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
136	NC_017941	GGTC	2	8	364462	364469	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017941	GGAA	2	8	369775	369782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017941	GGAA	2	8	372996	373003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017941	GTCG	2	8	373519	373526	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017941	CGAG	2	8	373529	373536	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017941	CGTT	2	8	379056	379063	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017941	GGCA	2	8	379372	379379	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017941	GCAG	2	8	379685	379692	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017941	TTCG	2	8	381077	381084	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017941	GTTG	2	8	384433	384440	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017941	TCTT	2	8	387191	387198	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017941	CAGA	2	8	388340	388347	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017941	GCGG	2	8	391285	391292	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017941	TAAT	2	8	391409	391416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017941	GACC	2	8	391472	391479	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017941	AGAC	2	8	391484	391491	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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162	NC_017941	GTTG	2	8	397904	397911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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