MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 chromosome

Total Repeats: 5945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017941	AC	3	6	530	535	50 %	0 %	0 %	50 %	389845494
2	NC_017941	TC	3	6	879	884	0 %	50 %	0 %	50 %	389845494
3	NC_017941	CG	3	6	1137	1142	0 %	0 %	50 %	50 %	389845494
4	NC_017941	CG	3	6	1144	1149	0 %	0 %	50 %	50 %	389845494
5	NC_017941	CA	3	6	1407	1412	50 %	0 %	0 %	50 %	389845494
6	NC_017941	CT	3	6	1513	1518	0 %	50 %	0 %	50 %	389845494
7	NC_017941	CA	3	6	2468	2473	50 %	0 %	0 %	50 %	389845495
8	NC_017941	GC	3	6	2750	2755	0 %	0 %	50 %	50 %	389845496
9	NC_017941	GC	3	6	4521	4526	0 %	0 %	50 %	50 %	389845497
10	NC_017941	GC	4	8	5334	5341	0 %	0 %	50 %	50 %	389845497
11	NC_017941	TC	3	6	6488	6493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017941	GT	3	6	6861	6866	0 %	50 %	50 %	0 %	389845499
13	NC_017941	CT	3	6	7223	7228	0 %	50 %	0 %	50 %	389845500
14	NC_017941	CG	3	6	7735	7740	0 %	0 %	50 %	50 %	389845500
15	NC_017941	CT	3	6	8016	8021	0 %	50 %	0 %	50 %	389845500
16	NC_017941	TC	3	6	8413	8418	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017941	CT	3	6	9608	9613	0 %	50 %	0 %	50 %	389845501
18	NC_017941	GC	3	6	9831	9836	0 %	0 %	50 %	50 %	389845501
19	NC_017941	GT	3	6	10942	10947	0 %	50 %	50 %	0 %	389845503
20	NC_017941	CG	3	6	11195	11200	0 %	0 %	50 %	50 %	389845503
21	NC_017941	CG	3	6	11664	11669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017941	GC	3	6	12629	12634	0 %	0 %	50 %	50 %	389845505
23	NC_017941	TC	3	6	12989	12994	0 %	50 %	0 %	50 %	389845505
24	NC_017941	TC	3	6	13256	13261	0 %	50 %	0 %	50 %	389845505
25	NC_017941	CG	3	6	14528	14533	0 %	0 %	50 %	50 %	389845505
26	NC_017941	GT	3	6	15091	15096	0 %	50 %	50 %	0 %	389845506
27	NC_017941	CG	3	6	15871	15876	0 %	0 %	50 %	50 %	389845507
28	NC_017941	CT	3	6	16043	16048	0 %	50 %	0 %	50 %	389845507
29	NC_017941	AG	3	6	16789	16794	50 %	0 %	50 %	0 %	389845508
30	NC_017941	GA	3	6	17373	17378	50 %	0 %	50 %	0 %	389845509
31	NC_017941	GC	3	6	17467	17472	0 %	0 %	50 %	50 %	389845509
32	NC_017941	CG	3	6	17532	17537	0 %	0 %	50 %	50 %	389845509
33	NC_017941	AC	3	6	18255	18260	50 %	0 %	0 %	50 %	389845510
34	NC_017941	AC	3	6	19758	19763	50 %	0 %	0 %	50 %	389845512
35	NC_017941	GA	3	6	22115	22120	50 %	0 %	50 %	0 %	389845513
36	NC_017941	TG	3	6	22558	22563	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017941	GC	3	6	22798	22803	0 %	0 %	50 %	50 %	389845514
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39	NC_017941	GA	3	6	24728	24733	50 %	0 %	50 %	0 %	389845516
40	NC_017941	GC	3	6	25716	25721	0 %	0 %	50 %	50 %	389845516
41	NC_017941	CT	4	8	26340	26347	0 %	50 %	0 %	50 %	389845517
42	NC_017941	CG	3	6	26636	26641	0 %	0 %	50 %	50 %	389845517
43	NC_017941	GT	3	6	27294	27299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017941	GC	3	6	27424	27429	0 %	0 %	50 %	50 %	389845518
45	NC_017941	CG	3	6	27456	27461	0 %	0 %	50 %	50 %	389845518
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47	NC_017941	GC	3	6	28508	28513	0 %	0 %	50 %	50 %	389845519
48	NC_017941	CA	3	6	29450	29455	50 %	0 %	0 %	50 %	389845519
49	NC_017941	CG	3	6	29786	29791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017941	CG	3	6	30185	30190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017941	TC	3	6	30302	30307	0 %	50 %	0 %	50 %	389845520
52	NC_017941	GC	3	6	30705	30710	0 %	0 %	50 %	50 %	389845520
53	NC_017941	AC	3	6	31398	31403	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017941	CG	3	6	31681	31686	0 %	0 %	50 %	50 %	389845521
55	NC_017941	AC	3	6	31822	31827	50 %	0 %	0 %	50 %	389845521
56	NC_017941	GC	3	6	34397	34402	0 %	0 %	50 %	50 %	389845522
57	NC_017941	GC	3	6	35288	35293	0 %	0 %	50 %	50 %	389845523
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60	NC_017941	TC	4	8	39306	39313	0 %	50 %	0 %	50 %	389845529
61	NC_017941	CG	3	6	39362	39367	0 %	0 %	50 %	50 %	389845529
62	NC_017941	CT	3	6	40804	40809	0 %	50 %	0 %	50 %	389845531
63	NC_017941	GC	3	6	40856	40861	0 %	0 %	50 %	50 %	389845531
64	NC_017941	GA	3	6	40990	40995	50 %	0 %	50 %	0 %	389845531
65	NC_017941	CG	3	6	41029	41034	0 %	0 %	50 %	50 %	389845531
66	NC_017941	CT	3	6	42812	42817	0 %	50 %	0 %	50 %	389845531
67	NC_017941	GA	3	6	42966	42971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017941	GT	3	6	44378	44383	0 %	50 %	50 %	0 %	389845533
69	NC_017941	TG	3	6	44401	44406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017941	CA	3	6	44569	44574	50 %	0 %	0 %	50 %	389845534
71	NC_017941	CG	3	6	44665	44670	0 %	0 %	50 %	50 %	389845534
72	NC_017941	CG	3	6	44918	44923	0 %	0 %	50 %	50 %	389845534
73	NC_017941	CG	3	6	45623	45628	0 %	0 %	50 %	50 %	389845535
74	NC_017941	GC	3	6	46368	46373	0 %	0 %	50 %	50 %	389845535
75	NC_017941	GA	3	6	47270	47275	50 %	0 %	50 %	0 %	389845536
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80	NC_017941	AG	3	6	48473	48478	50 %	0 %	50 %	0 %	389845537
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82	NC_017941	GA	3	6	49695	49700	50 %	0 %	50 %	0 %	389845539
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89	NC_017941	GC	3	6	54326	54331	0 %	0 %	50 %	50 %	389845543
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91	NC_017941	CG	3	6	55191	55196	0 %	0 %	50 %	50 %	389845543
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93	NC_017941	CG	3	6	55755	55760	0 %	0 %	50 %	50 %	389845544
94	NC_017941	GC	3	6	55859	55864	0 %	0 %	50 %	50 %	389845544
95	NC_017941	GA	3	6	55950	55955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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99	NC_017941	GC	3	6	57287	57292	0 %	0 %	50 %	50 %	389845546
100	NC_017941	GC	3	6	57870	57875	0 %	0 %	50 %	50 %	389845546
101	NC_017941	CG	3	6	58125	58130	0 %	0 %	50 %	50 %	389845546
102	NC_017941	CG	3	6	58542	58547	0 %	0 %	50 %	50 %	389845547
103	NC_017941	GC	3	6	58984	58989	0 %	0 %	50 %	50 %	389845547
104	NC_017941	CA	3	6	59326	59331	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017941	TG	3	6	60459	60464	0 %	50 %	50 %	0 %	389845550
106	NC_017941	TG	3	6	60654	60659	0 %	50 %	50 %	0 %	389845550
107	NC_017941	CG	3	6	60912	60917	0 %	0 %	50 %	50 %	389845550
108	NC_017941	GT	4	8	60997	61004	0 %	50 %	50 %	0 %	389845550
109	NC_017941	AG	3	6	61105	61110	50 %	0 %	50 %	0 %	389845550
110	NC_017941	TG	3	6	61358	61363	0 %	50 %	50 %	0 %	389845550
111	NC_017941	TG	5	10	61789	61798	0 %	50 %	50 %	0 %	389845550
112	NC_017941	CT	3	6	61814	61819	0 %	50 %	0 %	50 %	389845551
113	NC_017941	GA	3	6	64581	64586	50 %	0 %	50 %	0 %	389845553
114	NC_017941	GC	3	6	64905	64910	0 %	0 %	50 %	50 %	389845553
115	NC_017941	GC	3	6	65483	65488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017941	AG	3	6	66746	66751	50 %	0 %	50 %	0 %	389845554
117	NC_017941	GC	3	6	67049	67054	0 %	0 %	50 %	50 %	389845554
118	NC_017941	AG	3	6	67453	67458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017941	TA	3	6	67553	67558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017941	CA	3	6	68102	68107	50 %	0 %	0 %	50 %	389845556
121	NC_017941	CT	3	6	68119	68124	0 %	50 %	0 %	50 %	389845556
122	NC_017941	TC	3	6	70056	70061	0 %	50 %	0 %	50 %	389845557
123	NC_017941	CA	3	6	70263	70268	50 %	0 %	0 %	50 %	389845557
124	NC_017941	TC	3	6	71286	71291	0 %	50 %	0 %	50 %	389845557
125	NC_017941	TC	3	6	71821	71826	0 %	50 %	0 %	50 %	389845557
126	NC_017941	CA	3	6	72202	72207	50 %	0 %	0 %	50 %	389845557
127	NC_017941	GA	3	6	72487	72492	50 %	0 %	50 %	0 %	389845557
128	NC_017941	AC	3	6	72542	72547	50 %	0 %	0 %	50 %	389845557
129	NC_017941	CT	3	6	72575	72580	0 %	50 %	0 %	50 %	389845557
130	NC_017941	TG	3	6	72627	72632	0 %	50 %	50 %	0 %	389845557
131	NC_017941	AT	3	6	73699	73704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017941	GC	4	8	73718	73725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017941	AT	3	6	73914	73919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017941	GC	3	6	75058	75063	0 %	0 %	50 %	50 %	389845558
135	NC_017941	CG	3	6	76258	76263	0 %	0 %	50 %	50 %	389845559
136	NC_017941	AT	3	6	76612	76617	50 %	50 %	0 %	0 %	389845560
137	NC_017941	GC	3	6	76876	76881	0 %	0 %	50 %	50 %	389845560
138	NC_017941	GA	3	6	77123	77128	50 %	0 %	50 %	0 %	389845560
139	NC_017941	GC	3	6	78464	78469	0 %	0 %	50 %	50 %	389845560
140	NC_017941	GT	3	6	78748	78753	0 %	50 %	50 %	0 %	389845561
141	NC_017941	CT	3	6	79779	79784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017941	CA	3	6	80125	80130	50 %	0 %	0 %	50 %	389845563
143	NC_017941	GA	3	6	80714	80719	50 %	0 %	50 %	0 %	389845563
144	NC_017941	GA	3	6	81445	81450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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