MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mesotoga prima MesG1.Ag.4.2 chromosome

Total Repeats: 32038

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017934	TAT	2	6	70	75	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389842921
2	NC_017934	GAA	3	9	85	93	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842921
3	NC_017934	TCA	2	6	186	191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389842921
4	NC_017934	TGA	2	6	354	359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389842921
5	NC_017934	CTT	2	6	472	477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842921
6	NC_017934	TCT	2	6	511	516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842921
7	NC_017934	AAG	2	6	557	562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842921
8	NC_017934	AAC	2	6	620	625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389842921
9	NC_017934	GAA	2	6	652	657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842921
10	NC_017934	TTC	2	6	666	671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842921
11	NC_017934	GAG	2	6	791	796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389842921
12	NC_017934	CAG	2	6	811	816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842921
13	NC_017934	AGC	2	6	894	899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842921
14	NC_017934	GAT	2	6	929	934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389842921
15	NC_017934	ACA	2	6	954	959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389842921
16	NC_017934	AGA	2	6	974	979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842921
17	NC_017934	AGT	2	6	1013	1018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389842921
18	NC_017934	GAA	2	6	1225	1230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842921
19	NC_017934	GAA	2	6	1303	1308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842921
20	NC_017934	ATG	2	6	1325	1330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389842921
21	NC_017934	CAA	2	6	1341	1346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389842921
22	NC_017934	ACG	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842921
23	NC_017934	ATA	2	6	1373	1378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389842921
24	NC_017934	ATC	2	6	1604	1609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389842922
25	NC_017934	ATC	2	6	1770	1775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389842923
26	NC_017934	AAT	2	6	1915	1920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389842923
27	NC_017934	ACT	2	6	2922	2927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389842924
28	NC_017934	GTT	2	6	2928	2933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389842924
29	NC_017934	GAC	2	6	2961	2966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842924
30	NC_017934	AAG	2	6	2999	3004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842924
31	NC_017934	TGA	2	6	3131	3136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389842924
32	NC_017934	TTG	3	9	3151	3159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389842924
33	NC_017934	TGC	2	6	3302	3307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389842924
34	NC_017934	GAA	2	6	3345	3350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842924
35	NC_017934	CGC	2	6	3377	3382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389842924
36	NC_017934	ACG	2	6	3403	3408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842924
37	NC_017934	GGT	2	6	3412	3417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389842924
38	NC_017934	CAG	2	6	3427	3432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842924
39	NC_017934	ACG	2	6	3547	3552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842924
40	NC_017934	GTA	3	9	3592	3600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389842924
41	NC_017934	AGC	2	6	3626	3631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842924
42	NC_017934	CAT	2	6	3657	3662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389842924
43	NC_017934	GAT	2	6	3771	3776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389842924
44	NC_017934	CTT	2	6	3903	3908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842925
45	NC_017934	TTC	2	6	3913	3918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842925
46	NC_017934	CTC	2	6	3977	3982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389842925
47	NC_017934	AGA	2	6	4184	4189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842925
48	NC_017934	GTT	2	6	4212	4217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389842925
49	NC_017934	TCG	2	6	4218	4223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389842925
50	NC_017934	GAA	2	6	4313	4318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842925
51	NC_017934	GAT	2	6	4320	4325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389842925
52	NC_017934	GCT	2	6	4373	4378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389842925
53	NC_017934	TCA	2	6	4576	4581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389842925
54	NC_017934	AAT	2	6	4751	4756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389842925
55	NC_017934	TAC	3	9	4782	4790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389842925
56	NC_017934	AAG	2	6	4809	4814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842925
57	NC_017934	TCG	2	6	4887	4892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389842925
58	NC_017934	TAC	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389842925
59	NC_017934	CTA	2	6	5039	5044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389842925
60	NC_017934	GCG	2	6	5323	5328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389842925
61	NC_017934	TCC	2	6	5363	5368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389842925
62	NC_017934	TAT	2	6	5463	5468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389842925
63	NC_017934	TCT	2	6	5527	5532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842925
64	NC_017934	TCG	2	6	5677	5682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389842925
65	NC_017934	CTA	2	6	5969	5974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389842925
66	NC_017934	CCG	2	6	6024	6029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389842925
67	NC_017934	CAG	2	6	6308	6313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842925
68	NC_017934	TTC	2	6	6316	6321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842925
69	NC_017934	TCT	2	6	6358	6363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842925
70	NC_017934	GAA	2	6	6420	6425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842925
71	NC_017934	TTC	2	6	6443	6448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842925
72	NC_017934	GTC	2	6	6543	6548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389842925
73	NC_017934	TTC	2	6	6712	6717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842925
74	NC_017934	AGC	2	6	6794	6799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842925
75	NC_017934	GAA	2	6	6813	6818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842925
76	NC_017934	CAA	2	6	6836	6841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389842925
77	NC_017934	CAG	2	6	7091	7096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842925
78	NC_017934	GTC	2	6	7122	7127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389842925
79	NC_017934	GAC	2	6	7191	7196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842925
80	NC_017934	GAA	2	6	7215	7220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842925
81	NC_017934	GAC	2	6	7248	7253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842925
82	NC_017934	ATT	2	6	7276	7281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389842925
83	NC_017934	CGA	2	6	7286	7291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842925
84	NC_017934	GGA	2	6	7346	7351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389842925
85	NC_017934	CGG	2	6	7496	7501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389842925
86	NC_017934	GAG	2	6	7626	7631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389842925
87	NC_017934	ACA	2	6	7716	7721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389842925
88	NC_017934	GTT	2	6	7743	7748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389842925
89	NC_017934	CTA	2	6	7946	7951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389842925
90	NC_017934	TGA	2	6	7952	7957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389842925
91	NC_017934	TGC	2	6	8083	8088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389842925
92	NC_017934	GAG	2	6	8109	8114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389842925
93	NC_017934	ACT	3	9	8161	8169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389842925
94	NC_017934	CTT	3	9	8213	8221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842925
95	NC_017934	AGG	2	6	8228	8233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389842925
96	NC_017934	GGA	2	6	8257	8262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389842925
97	NC_017934	GTG	2	6	8272	8277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389842925
98	NC_017934	TGG	2	6	8379	8384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389842926
99	NC_017934	GAA	2	6	8456	8461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842926
100	NC_017934	TCT	2	6	8470	8475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842926
101	NC_017934	TAA	2	6	8517	8522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389842926
102	NC_017934	AGA	2	6	8587	8592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842926
103	NC_017934	AGA	2	6	8701	8706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842926
104	NC_017934	ATT	2	6	8781	8786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389842926
105	NC_017934	GCT	2	6	8826	8831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389842926
106	NC_017934	GTT	2	6	8879	8884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389842926
107	NC_017934	TGA	2	6	8902	8907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389842926
108	NC_017934	ATA	2	6	8928	8933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389842927
109	NC_017934	TCT	2	6	9104	9109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842927
110	NC_017934	CAG	2	6	9163	9168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842927
111	NC_017934	GGC	2	6	9212	9217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389842927
112	NC_017934	TTA	2	6	9238	9243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389842927
113	NC_017934	GAC	2	6	9267	9272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842927
114	NC_017934	TGA	2	6	9296	9301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389842927
115	NC_017934	GAA	2	6	9305	9310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842927
116	NC_017934	ATA	2	6	9378	9383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389842927
117	NC_017934	AAG	2	6	9512	9517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842927
118	NC_017934	TAC	2	6	9756	9761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389842927
119	NC_017934	CTT	2	6	9795	9800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842927
120	NC_017934	ATT	2	6	9912	9917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389842927
121	NC_017934	TTA	2	6	9986	9991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389842927
122	NC_017934	TGG	2	6	10031	10036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389842927
123	NC_017934	TTC	2	6	10097	10102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842927
124	NC_017934	TCT	2	6	10187	10192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842927
125	NC_017934	TAT	2	6	10310	10315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389842927
126	NC_017934	GAA	2	6	10362	10367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842927
127	NC_017934	CTG	2	6	10554	10559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389842927
128	NC_017934	CTG	2	6	10590	10595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389842927
129	NC_017934	TCT	2	6	10826	10831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842928
130	NC_017934	CAC	2	6	10946	10951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389842928
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