MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus MN-ZLW-002 chromosome

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017927	GAAGTG	2	12	22475	22486	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017927	ACTAAT	2	12	22505	22516	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017927	GAAGTG	2	12	70212	70223	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017927	ACTAAT	2	12	70242	70253	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017927	TTCGGG	2	12	71128	71139	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017927	TTTATA	2	12	78166	78177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017927	GCAAAA	2	12	80063	80074	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017927	TAAAAA	2	12	112955	112966	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017927	TCCAAC	2	12	128132	128143	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017927	GAAGTG	2	12	133565	133576	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017927	ACTAAT	2	12	133595	133606	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017927	TTAAGT	2	12	134585	134596	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017927	TACAGC	2	12	139538	139549	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017927	ATTTAT	2	12	140781	140792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017927	CAAATA	2	12	155269	155280	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017927	CAAAAA	2	12	185589	185600	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017927	GAAAGA	2	12	206519	206530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017927	AGATAA	2	12	307338	307349	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017927	ATGATA	2	12	307417	307428	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017927	ATTTTT	2	12	316332	316343	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017927	GAAGTG	2	12	350805	350816	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017927	ACTAAT	2	12	350835	350846	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017927	TTTCTT	2	12	351598	351609	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017927	ATATCC	2	12	370965	370976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017927	GTTTTT	2	12	376428	376439	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017927	TGACAA	2	12	383248	383259	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017927	AAAAGG	2	12	392094	392105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017927	CAATAC	2	12	406385	406396	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017927	ATGGGG	2	12	421426	421437	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017927	TCAAGC	2	12	421893	421904	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017927	AGTGGG	2	12	425965	425976	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017927	CAAGCC	2	12	437659	437670	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017927	TAGTAA	2	12	464728	464739	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017927	CAAAAA	2	12	482619	482630	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017927	GTCTTT	2	12	484095	484106	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017927	ATTTTT	2	12	487244	487255	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017927	CCCCTA	2	12	492377	492388	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017927	TCTATA	2	12	500492	500503	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017927	GGATGA	2	12	500876	500887	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017927	CTATCA	2	12	542265	542276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017927	TTCGGG	2	12	562117	562128	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017927	ATTTGA	2	12	595625	595636	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017927	CTTAGA	2	12	598683	598694	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017927	CTTAGG	2	12	654510	654521	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017927	AAAAGC	2	12	680034	680045	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017927	TAGTTT	2	12	730020	730031	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017927	GATATA	2	12	756314	756325	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017927	TGGTTA	2	12	785548	785559	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017927	GATAAA	2	12	785938	785949	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017927	TACAGG	2	12	791337	791348	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017927	AATTTT	2	12	793526	793537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017927	TAAGGA	2	12	806081	806092	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017927	TTTGAG	2	12	838840	838851	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017927	GACAAC	2	12	847394	847405	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017927	AGTAAC	2	12	848626	848637	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017927	TTCATT	2	12	889303	889314	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017927	CACGAA	2	12	890915	890926	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017927	AGGATA	2	12	918436	918447	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017927	TAGTTA	2	12	923488	923499	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017927	TTTGAT	2	12	930366	930377	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017927	GAAACT	2	12	942541	942552	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017927	TTAATT	2	12	992295	992306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017927	GCAATA	2	12	992902	992913	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017927	GGTTTG	2	12	993885	993896	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017927	ATAGTT	2	12	998878	998889	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017927	ATTTTT	2	12	1033060	1033071	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017927	CTTCAT	2	12	1035107	1035118	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017927	TGTAAC	2	12	1063073	1063084	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017927	TAGTTG	2	12	1079514	1079525	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017927	GACAAT	2	12	1112135	1112146	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017927	CAAAGG	2	12	1112272	1112283	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017927	ACAGAG	2	12	1198904	1198915	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017927	CTCTGC	2	12	1199340	1199351	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017927	TTAAAG	2	12	1199836	1199847	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017927	AAGATT	2	12	1227961	1227972	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017927	TTATCG	2	12	1258720	1258731	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017927	AATTGT	2	12	1286068	1286079	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017927	ACGTTG	2	12	1322780	1322791	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017927	TTTTTA	2	12	1358965	1358976	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017927	AGATAA	2	12	1362930	1362941	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017927	TCGGCT	3	18	1393288	1393305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017927	ATCTCA	2	12	1442600	1442611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017927	CAAAAT	2	12	1461407	1461418	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017927	TTTTTC	2	12	1476066	1476077	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017927	ATAAAA	2	12	1487100	1487111	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017927	ATAGTA	2	12	1487326	1487337	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017927	ATCAAA	2	12	1494101	1494112	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017927	TTGTAT	2	12	1495553	1495564	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017927	TTTTAT	2	12	1495879	1495890	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017927	ACACAA	2	12	1505025	1505036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017927	TCATAA	2	12	1525416	1525427	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017927	TTTATT	2	12	1528765	1528776	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017927	AAAAAG	2	12	1531193	1531204	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017927	ACGAAA	2	12	1537839	1537850	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017927	GATTTT	2	12	1538813	1538824	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017927	CATTGT	2	12	1542801	1542812	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017927	CTTTTA	2	12	1547449	1547460	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017927	GAAAAA	2	12	1576275	1576286	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017927	TTTAGT	2	12	1596445	1596456	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017927	CCTCTA	2	12	1597103	1597114	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017927	CATAAA	2	12	1597233	1597244	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017927	GCCACT	2	12	1600828	1600839	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017927	TCCTGA	2	12	1609394	1609405	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017927	AGCTTC	2	12	1631806	1631817	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017927	GAAATA	2	12	1649636	1649647	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017927	TATTAG	2	12	1650568	1650579	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017927	TCATCG	2	12	1655773	1655784	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017927	TATTTA	2	12	1681300	1681311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017927	TTGGAG	2	12	1724060	1724071	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017927	ACATTT	2	12	1733364	1733375	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017927	AAAATG	2	12	1739898	1739909	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017927	CGATAA	2	12	1780673	1780684	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017927	GACTAT	2	12	1785728	1785739	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017927	TAAAAT	2	12	1803751	1803762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017927	TTCCTT	2	12	1804510	1804521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017927	TCAACT	2	12	1809156	1809167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017927	TATCTT	2	12	1809218	1809229	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017927	AATAAA	2	12	1840172	1840183	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.