MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus thermophilus MN-ZLW-002 chromosome

Total Repeats: 1290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017927	AAAGG	2	10	2050	2059	60 %	0 %	40 %	0 %	387908810
2	NC_017927	CAAAT	2	10	2387	2396	60 %	20 %	0 %	20 %	387908810
3	NC_017927	TGATT	2	10	2673	2682	20 %	60 %	20 %	0 %	387908810
4	NC_017927	GAGAT	2	10	5641	5650	40 %	20 %	40 %	0 %	387908814
5	NC_017927	TTATG	2	10	7448	7457	20 %	60 %	20 %	0 %	387908814
6	NC_017927	CTTTT	2	10	8597	8606	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017927	GGAAA	2	10	8720	8729	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017927	TCAGA	2	10	9231	9240	40 %	20 %	20 %	20 %	387908816
9	NC_017927	CAGTA	2	10	12769	12778	40 %	20 %	20 %	20 %	387908821
10	NC_017927	GGTAA	2	10	12849	12858	40 %	20 %	40 %	0 %	387908821
11	NC_017927	ACCGA	2	10	15573	15582	40 %	0 %	20 %	40 %	387908823
12	NC_017927	TCGTG	2	10	18890	18899	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017927	GTTAA	2	10	19637	19646	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017927	GGGAG	2	10	20155	20164	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017927	AGGGA	2	10	22364	22373	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017927	TTGAG	2	10	22598	22607	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017927	CTAGT	2	10	25531	25540	20 %	40 %	20 %	20 %	387908830
18	NC_017927	CAATC	2	10	25867	25876	40 %	20 %	0 %	40 %	387908831
19	NC_017927	ATTCA	2	10	27013	27022	40 %	40 %	0 %	20 %	387908831
20	NC_017927	TGATT	2	10	28232	28241	20 %	60 %	20 %	0 %	387908832
21	NC_017927	ACCTT	2	10	28975	28984	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_017927	TTTTG	2	10	29860	29869	0 %	80 %	20 %	0 %	387908834
23	NC_017927	ATGAA	2	10	31213	31222	60 %	20 %	20 %	0 %	387908835
24	NC_017927	GTAGA	2	10	32577	32586	40 %	20 %	40 %	0 %	387908837
25	NC_017927	AAATG	2	10	38689	38698	60 %	20 %	20 %	0 %	387908840
26	NC_017927	AAAAT	2	10	40864	40873	80 %	20 %	0 %	0 %	387908843
27	NC_017927	GTGAA	2	10	41803	41812	40 %	20 %	40 %	0 %	387908843
28	NC_017927	AGTGG	2	10	41955	41964	20 %	20 %	60 %	0 %	387908843
29	NC_017927	TCAAA	2	10	42118	42127	60 %	20 %	0 %	20 %	387908843
30	NC_017927	ACTAT	2	10	44740	44749	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017927	TTGAT	2	10	45090	45099	20 %	60 %	20 %	0 %	387908848
32	NC_017927	GAAGC	2	10	48048	48057	40 %	0 %	40 %	20 %	387908850
33	NC_017927	ATTTT	2	10	48358	48367	20 %	80 %	0 %	0 %	387908851
34	NC_017927	GCTTG	2	10	49666	49675	0 %	40 %	40 %	20 %	387908853
35	NC_017927	CTTTT	2	10	51670	51679	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017927	TAGCT	2	10	62888	62897	20 %	40 %	20 %	20 %	387908865
37	NC_017927	TTCTT	2	10	64582	64591	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017927	TTTGA	2	10	64592	64601	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017927	GATAA	2	10	64697	64706	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017927	TTGAT	2	10	64976	64985	20 %	60 %	20 %	0 %	387908867
41	NC_017927	TCGTG	2	10	66627	66636	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017927	GTTAA	2	10	67374	67383	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017927	GGGAG	2	10	67892	67901	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017927	AGGGA	2	10	70101	70110	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017927	TTGAG	2	10	70335	70344	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017927	CAAAT	2	10	73989	73998	60 %	20 %	0 %	20 %	387908868
47	NC_017927	GAATC	2	10	76328	76337	40 %	20 %	20 %	20 %	387908869
48	NC_017927	AGAAA	2	10	76382	76391	80 %	0 %	20 %	0 %	387908869
49	NC_017927	TCAAA	2	10	77262	77271	60 %	20 %	0 %	20 %	387908869
50	NC_017927	AATTT	2	10	77824	77833	40 %	60 %	0 %	0 %	387908871
51	NC_017927	AAGAT	2	10	78565	78574	60 %	20 %	20 %	0 %	387908872
52	NC_017927	AAAGA	2	10	81518	81527	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017927	GGGGC	2	10	82523	82532	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017927	CAGCC	2	10	82534	82543	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
55	NC_017927	AAAAG	2	10	83637	83646	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017927	TCAGC	2	10	84713	84722	20 %	20 %	20 %	40 %	387908879
57	NC_017927	TTTTA	2	10	94251	94260	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017927	GCTTC	2	10	95284	95293	0 %	40 %	20 %	40 %	387908885
59	NC_017927	AAGCC	2	10	95413	95422	40 %	0 %	20 %	40 %	387908885
60	NC_017927	CTGTT	2	10	95493	95502	0 %	60 %	20 %	20 %	387908885
61	NC_017927	AAATA	2	10	98466	98475	80 %	20 %	0 %	0 %	387908891
62	NC_017927	AAATG	2	10	99699	99708	60 %	20 %	20 %	0 %	387908893
63	NC_017927	AACAA	2	10	101462	101471	80 %	0 %	0 %	20 %	387908895
64	NC_017927	CACAC	2	10	101596	101605	40 %	0 %	0 %	60 %	387908895
65	NC_017927	TTTAC	2	10	104207	104216	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017927	ATTTT	2	10	104626	104635	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017927	TTTAT	2	10	107757	107766	20 %	80 %	0 %	0 %	387908899
68	NC_017927	TATTT	2	10	109261	109270	20 %	80 %	0 %	0 %	387908901
69	NC_017927	GACGA	2	10	109688	109697	40 %	0 %	40 %	20 %	387908901
70	NC_017927	ATTAT	2	10	110084	110093	40 %	60 %	0 %	0 %	387908901
71	NC_017927	ATGGC	2	10	111048	111057	20 %	20 %	40 %	20 %	387908903
72	NC_017927	AAAAG	2	10	111215	111224	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017927	TTTGT	2	10	113395	113404	0 %	80 %	20 %	0 %	387908906
74	NC_017927	ATTGT	2	10	117383	117392	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017927	TCTGT	2	10	118929	118938	0 %	60 %	20 %	20 %	387908912
76	NC_017927	CGGTT	2	10	119580	119589	0 %	40 %	40 %	20 %	387908913
77	NC_017927	CAGTT	2	10	121724	121733	20 %	40 %	20 %	20 %	387908916
78	NC_017927	AAGGT	2	10	121946	121955	40 %	20 %	40 %	0 %	387908916
79	NC_017927	TTAGT	2	10	122195	122204	20 %	60 %	20 %	0 %	387908916
80	NC_017927	GTATC	2	10	124424	124433	20 %	40 %	20 %	20 %	387908918
81	NC_017927	AAGTG	2	10	125129	125138	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017927	TTCGT	2	10	125158	125167	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017927	AAATA	2	10	125171	125180	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017927	AAAGG	2	10	126254	126263	60 %	0 %	40 %	0 %	387908919
85	NC_017927	TGATA	2	10	126545	126554	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017927	TCGTG	2	10	129980	129989	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017927	GTTAA	2	10	130727	130736	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017927	GGGAG	2	10	131245	131254	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017927	AGGGA	2	10	133454	133463	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017927	TTGAG	2	10	133688	133697	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017927	TCCTT	2	10	135301	135310	0 %	60 %	0 %	40 %	387908923
92	NC_017927	GGATC	2	10	135416	135425	20 %	20 %	40 %	20 %	387908923
93	NC_017927	GGATG	2	10	138567	138576	20 %	20 %	60 %	0 %	387908926
94	NC_017927	TATTT	2	10	140727	140736	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017927	AAATT	2	10	142208	142217	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017927	TAAAC	2	10	142344	142353	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017927	GGTTT	2	10	146739	146748	0 %	60 %	40 %	0 %	387908933
98	NC_017927	TTTGG	2	10	150022	150031	0 %	60 %	40 %	0 %	387908939
99	NC_017927	AAGGT	2	10	150048	150057	40 %	20 %	40 %	0 %	387908939
100	NC_017927	CTGGT	2	10	151632	151641	0 %	40 %	40 %	20 %	387908941
101	NC_017927	ATAAA	2	10	152321	152330	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017927	TGATT	2	10	153149	153158	20 %	60 %	20 %	0 %	387908943
103	NC_017927	GAGAT	2	10	154201	154210	40 %	20 %	40 %	0 %	387908943
104	NC_017927	ATTGA	2	10	154506	154515	40 %	40 %	20 %	0 %	387908943
105	NC_017927	AATGA	2	10	157575	157584	60 %	20 %	20 %	0 %	387908948
106	NC_017927	GGTTG	2	10	159262	159271	0 %	40 %	60 %	0 %	387908949
107	NC_017927	TATTT	2	10	159351	159360	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017927	AAGTA	2	10	162345	162354	60 %	20 %	20 %	0 %	387908954
109	NC_017927	CACAA	2	10	163336	163345	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_017927	CGTAG	2	10	166660	166669	20 %	20 %	40 %	20 %	387908958
111	NC_017927	AGATA	2	10	167015	167024	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017927	TTTTA	2	10	167416	167425	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017927	GTCTT	2	10	170751	170760	0 %	60 %	20 %	20 %	387908962
114	NC_017927	AAGTT	2	10	171102	171111	40 %	40 %	20 %	0 %	387908962
115	NC_017927	CTCAG	2	10	173897	173906	20 %	20 %	20 %	40 %	387908965
116	NC_017927	CTTTA	2	10	175148	175157	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017927	TTGAT	2	10	176918	176927	20 %	60 %	20 %	0 %	387908972
118	NC_017927	TCATC	2	10	177005	177014	20 %	40 %	0 %	40 %	387908972
119	NC_017927	AGCTT	2	10	180740	180749	20 %	40 %	20 %	20 %	387908979
120	NC_017927	TCCAA	2	10	183149	183158	40 %	20 %	0 %	40 %	387908981
121	NC_017927	TTGGT	2	10	185312	185321	0 %	60 %	40 %	0 %	387908984
122	NC_017927	TTGCC	2	10	185743	185752	0 %	40 %	20 %	40 %	387908985
123	NC_017927	GAAAT	2	10	186691	186700	60 %	20 %	20 %	0 %	387908986
124	NC_017927	CAAGT	2	10	188383	188392	40 %	20 %	20 %	20 %	387908989
125	NC_017927	TTGGT	2	10	188608	188617	0 %	60 %	40 %	0 %	387908989
126	NC_017927	ATCGT	2	10	192464	192473	20 %	40 %	20 %	20 %	387908993
127	NC_017927	ATAAA	2	10	198109	198118	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017927	TGGCT	2	10	199826	199835	0 %	40 %	40 %	20 %	387908998
129	NC_017927	GAAGC	2	10	204547	204556	40 %	0 %	40 %	20 %	387909006
130	NC_017927	CAATG	2	10	205233	205242	40 %	20 %	20 %	20 %	387909007
131	NC_017927	TACAA	2	10	205348	205357	60 %	20 %	0 %	20 %	387909007
132	NC_017927	TTTCT	2	10	205717	205726	0 %	80 %	0 %	20 %	387909008
133	NC_017927	TGGTA	2	10	205870	205879	20 %	40 %	40 %	0 %	387909008
134	NC_017927	TTTCT	2	10	205912	205921	0 %	80 %	0 %	20 %	387909008
135	NC_017927	CAATC	2	10	206368	206377	40 %	20 %	0 %	40 %	387909010
136	NC_017927	AGTTC	2	10	210854	210863	20 %	40 %	20 %	20 %	387909014
137	NC_017927	TTTGG	2	10	211935	211944	0 %	60 %	40 %	0 %	387909016
138	NC_017927	AATCC	2	10	212896	212905	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_017927	TAGTA	2	10	214021	214030	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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