MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus thermophilus MN-ZLW-002 chromosome

Total Repeats: 4798

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017927	AGTA	2	8	534	541	50 %	25 %	25 %	0 %	387908809
2	NC_017927	GTTT	2	8	761	768	0 %	75 %	25 %	0 %	387908809
3	NC_017927	TGAA	2	8	964	971	50 %	25 %	25 %	0 %	387908809
4	NC_017927	TGCT	2	8	1489	1496	0 %	50 %	25 %	25 %	387908809
5	NC_017927	ATTA	2	8	1905	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	387908810
6	NC_017927	TGAA	2	8	2636	2643	50 %	25 %	25 %	0 %	387908810
7	NC_017927	ACTT	2	8	2698	2705	25 %	50 %	0 %	25 %	387908810
8	NC_017927	AATT	2	8	2813	2820	50 %	50 %	0 %	0 %	387908810
9	NC_017927	AAAT	3	12	3286	3297	75 %	25 %	0 %	0 %	387908812
10	NC_017927	TCGT	2	8	3603	3610	0 %	50 %	25 %	25 %	387908812
11	NC_017927	ATCT	2	8	4686	4693	25 %	50 %	0 %	25 %	387908813
12	NC_017927	TACT	2	8	4965	4972	25 %	50 %	0 %	25 %	387908813
13	NC_017927	GGAA	2	8	5482	5489	50 %	0 %	50 %	0 %	387908814
14	NC_017927	CAGC	2	8	6090	6097	25 %	0 %	25 %	50 %	387908814
15	NC_017927	CAAA	2	8	6743	6750	75 %	0 %	0 %	25 %	387908814
16	NC_017927	AAGC	2	8	6755	6762	50 %	0 %	25 %	25 %	387908814
17	NC_017927	TTGG	2	8	6960	6967	0 %	50 %	50 %	0 %	387908814
18	NC_017927	CCTT	2	8	8105	8112	0 %	50 %	0 %	50 %	387908814
19	NC_017927	TTGA	2	8	8208	8215	25 %	50 %	25 %	0 %	387908814
20	NC_017927	AAGA	2	8	8463	8470	75 %	0 %	25 %	0 %	387908814
21	NC_017927	TAAG	2	8	8561	8568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017927	GAAG	2	8	9191	9198	50 %	0 %	50 %	0 %	387908816
23	NC_017927	TCTA	2	8	9336	9343	25 %	50 %	0 %	25 %	387908816
24	NC_017927	TAGC	2	8	9620	9627	25 %	25 %	25 %	25 %	387908818
25	NC_017927	ATTA	2	8	9825	9832	50 %	50 %	0 %	0 %	387908818
26	NC_017927	GTCT	2	8	10232	10239	0 %	50 %	25 %	25 %	387908818
27	NC_017927	ACCT	2	8	11355	11362	25 %	25 %	0 %	50 %	387908819
28	NC_017927	TCAA	2	8	11578	11585	50 %	25 %	0 %	25 %	387908819
29	NC_017927	AAGC	2	8	12490	12497	50 %	0 %	25 %	25 %	387908820
30	NC_017927	TATG	2	8	12561	12568	25 %	50 %	25 %	0 %	387908820
31	NC_017927	CCTT	2	8	12632	12639	0 %	50 %	0 %	50 %	387908820
32	NC_017927	CCTT	2	8	13115	13122	0 %	50 %	0 %	50 %	387908821
33	NC_017927	GATG	2	8	13631	13638	25 %	25 %	50 %	0 %	387908821
34	NC_017927	AACC	2	8	13676	13683	50 %	0 %	0 %	50 %	387908821
35	NC_017927	AAGA	2	8	13980	13987	75 %	0 %	25 %	0 %	387908821
36	NC_017927	GTTT	2	8	14976	14983	0 %	75 %	25 %	0 %	387908822
37	NC_017927	GTTG	2	8	15096	15103	0 %	50 %	50 %	0 %	387908822
38	NC_017927	GATA	2	8	15416	15423	50 %	25 %	25 %	0 %	387908823
39	NC_017927	TCTT	2	8	15427	15434	0 %	75 %	0 %	25 %	387908823
40	NC_017927	AACT	2	8	16068	16075	50 %	25 %	0 %	25 %	387908824
41	NC_017927	CAAC	2	8	16126	16133	50 %	0 %	0 %	50 %	387908824
42	NC_017927	GATT	2	8	16182	16189	25 %	50 %	25 %	0 %	387908824
43	NC_017927	TGAT	2	8	16260	16267	25 %	50 %	25 %	0 %	387908824
44	NC_017927	CCTA	2	8	16499	16506	25 %	25 %	0 %	50 %	387908825
45	NC_017927	CAGT	2	8	16967	16974	25 %	25 %	25 %	25 %	387908827
46	NC_017927	TCCA	2	8	17190	17197	25 %	25 %	0 %	50 %	387908827
47	NC_017927	TCTT	2	8	17239	17246	0 %	75 %	0 %	25 %	387908827
48	NC_017927	TCAC	2	8	17291	17298	25 %	25 %	0 %	50 %	387908827
49	NC_017927	AATT	2	8	17414	17421	50 %	50 %	0 %	0 %	387908828
50	NC_017927	CAGT	2	8	17435	17442	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017927	ATTT	2	8	18013	18020	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017927	GTGA	2	8	18223	18230	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017927	AGCG	2	8	18394	18401	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017927	TGGT	2	8	19059	19066	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017927	AGCC	2	8	19275	19282	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017927	GTAA	2	8	19550	19557	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017927	ATAG	2	8	19564	19571	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017927	GCGA	2	8	19879	19886	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017927	ATTC	2	8	20744	20751	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017927	CTAA	2	8	21098	21105	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017927	CTGA	2	8	21371	21378	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017927	TAGG	2	8	21753	21760	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017927	GCGT	2	8	23738	23745	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017927	GGTT	2	8	24925	24932	0 %	50 %	50 %	0 %	387908829
65	NC_017927	TGAT	2	8	25002	25009	25 %	50 %	25 %	0 %	387908829
66	NC_017927	CTAT	2	8	25232	25239	25 %	50 %	0 %	25 %	387908830
67	NC_017927	TTGT	2	8	25285	25292	0 %	75 %	25 %	0 %	387908830
68	NC_017927	TAAA	2	8	25616	25623	75 %	25 %	0 %	0 %	387908830
69	NC_017927	ATTT	2	8	27277	27284	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017927	CAAT	2	8	27601	27608	50 %	25 %	0 %	25 %	387908832
71	NC_017927	GTTG	2	8	27680	27687	0 %	50 %	50 %	0 %	387908832
72	NC_017927	TTGA	2	8	28008	28015	25 %	50 %	25 %	0 %	387908832
73	NC_017927	TGAT	2	8	28021	28028	25 %	50 %	25 %	0 %	387908832
74	NC_017927	TGAT	2	8	28201	28208	25 %	50 %	25 %	0 %	387908832
75	NC_017927	CAAT	2	8	29486	29493	50 %	25 %	0 %	25 %	387908834
76	NC_017927	CAAC	2	8	29940	29947	50 %	0 %	0 %	50 %	387908834
77	NC_017927	AACT	2	8	30045	30052	50 %	25 %	0 %	25 %	387908834
78	NC_017927	GAAA	2	8	31786	31793	75 %	0 %	25 %	0 %	387908836
79	NC_017927	AATG	2	8	32318	32325	50 %	25 %	25 %	0 %	387908836
80	NC_017927	GTTT	2	8	33040	33047	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017927	TTCT	2	8	33396	33403	0 %	75 %	0 %	25 %	387908838
82	NC_017927	TTGA	2	8	33616	33623	25 %	50 %	25 %	0 %	387908838
83	NC_017927	TTTG	2	8	34015	34022	0 %	75 %	25 %	0 %	387908839
84	NC_017927	CTTT	2	8	34110	34117	0 %	75 %	0 %	25 %	387908839
85	NC_017927	TTCA	2	8	34457	34464	25 %	50 %	0 %	25 %	387908839
86	NC_017927	TACT	2	8	34522	34529	25 %	50 %	0 %	25 %	387908839
87	NC_017927	GCAA	2	8	34612	34619	50 %	0 %	25 %	25 %	387908839
88	NC_017927	GATT	2	8	36364	36371	25 %	50 %	25 %	0 %	387908839
89	NC_017927	TGAA	2	8	36900	36907	50 %	25 %	25 %	0 %	387908839
90	NC_017927	CCAA	2	8	37200	37207	50 %	0 %	0 %	50 %	387908839
91	NC_017927	CAAG	2	8	37458	37465	50 %	0 %	25 %	25 %	387908839
92	NC_017927	TCGT	2	8	37713	37720	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017927	CCAA	2	8	38737	38744	50 %	0 %	0 %	50 %	387908840
94	NC_017927	ATTG	2	8	38974	38981	25 %	50 %	25 %	0 %	387908840
95	NC_017927	ACTT	2	8	39035	39042	25 %	50 %	0 %	25 %	387908840
96	NC_017927	TTGA	2	8	39056	39063	25 %	50 %	25 %	0 %	387908840
97	NC_017927	TGCT	2	8	39438	39445	0 %	50 %	25 %	25 %	387908841
98	NC_017927	GTAT	2	8	39663	39670	25 %	50 %	25 %	0 %	387908841
99	NC_017927	ACTC	2	8	39804	39811	25 %	25 %	0 %	50 %	387908841
100	NC_017927	GTTT	2	8	40480	40487	0 %	75 %	25 %	0 %	387908842
101	NC_017927	TGAA	2	8	40818	40825	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017927	AGAA	2	8	40844	40851	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017927	TTGG	2	8	40945	40952	0 %	50 %	50 %	0 %	387908843
104	NC_017927	AAAG	2	8	42021	42028	75 %	0 %	25 %	0 %	387908843
105	NC_017927	CCAA	2	8	42059	42066	50 %	0 %	0 %	50 %	387908843
106	NC_017927	TCCG	2	8	42195	42202	0 %	25 %	25 %	50 %	387908843
107	NC_017927	CTTT	2	8	42468	42475	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017927	CAAC	2	8	42652	42659	50 %	0 %	0 %	50 %	387908844
109	NC_017927	GATT	2	8	42708	42715	25 %	50 %	25 %	0 %	387908844
110	NC_017927	TGAT	2	8	42786	42793	25 %	50 %	25 %	0 %	387908844
111	NC_017927	AATC	2	8	43201	43208	50 %	25 %	0 %	25 %	387908845
112	NC_017927	TCAC	2	8	43589	43596	25 %	25 %	0 %	50 %	387908846
113	NC_017927	TTGG	2	8	44024	44031	0 %	50 %	50 %	0 %	387908847
114	NC_017927	AGCA	2	8	45447	45454	50 %	0 %	25 %	25 %	387908848
115	NC_017927	GCGA	2	8	46252	46259	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017927	AGTT	2	8	46439	46446	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017927	CTAT	2	8	47116	47123	25 %	50 %	0 %	25 %	387908850
118	NC_017927	CAGA	2	8	47722	47729	50 %	0 %	25 %	25 %	387908850
119	NC_017927	AAAC	2	8	48305	48312	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017927	CTAT	2	8	49239	49246	25 %	50 %	0 %	25 %	387908852
121	NC_017927	AATA	2	8	49439	49446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017927	AATA	2	8	49654	49661	75 %	25 %	0 %	0 %	387908853
123	NC_017927	ACAA	2	8	49919	49926	75 %	0 %	0 %	25 %	387908853
124	NC_017927	TTGA	2	8	50557	50564	25 %	50 %	25 %	0 %	387908853
125	NC_017927	TTGA	2	8	50683	50690	25 %	50 %	25 %	0 %	387908853
126	NC_017927	CTCA	2	8	50809	50816	25 %	25 %	0 %	50 %	387908853
127	NC_017927	AGGA	2	8	51013	51020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017927	ATGA	2	8	51109	51116	50 %	25 %	25 %	0 %	387908854
129	NC_017927	TGTA	2	8	52034	52041	25 %	50 %	25 %	0 %	387908855
130	NC_017927	AGAT	2	8	52076	52083	50 %	25 %	25 %	0 %	387908855
131	NC_017927	CAAG	2	8	52310	52317	50 %	0 %	25 %	25 %	387908855
132	NC_017927	CATC	2	8	52664	52671	25 %	25 %	0 %	50 %	387908855
133	NC_017927	TGAT	2	8	52987	52994	25 %	50 %	25 %	0 %	387908855
134	NC_017927	CTGG	2	8	54168	54175	0 %	25 %	50 %	25 %	387908857
135	NC_017927	GCAG	2	8	54254	54261	25 %	0 %	50 %	25 %	387908857
136	NC_017927	TTCG	2	8	55571	55578	0 %	50 %	25 %	25 %	387908858
137	NC_017927	AGCG	2	8	56399	56406	25 %	0 %	50 %	25 %	387908858
138	NC_017927	TTGA	2	8	57001	57008	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017927	AGAT	2	8	57059	57066	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017927	AGTG	2	8	57168	57175	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017927	TAGC	2	8	57218	57225	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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