MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori XZ274 chromosome

Total Repeats: 174

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017926	TTGCAA	2	12	962	973	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017926	AAAAAG	2	12	5236	5247	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017926	AAACAC	2	12	18431	18442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017926	TCTTTG	2	12	71328	71339	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017926	TGAAAT	2	12	71833	71844	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017926	AGATAA	2	12	80391	80402	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017926	AGAAAA	2	12	80496	80507	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017926	GATGTG	2	12	81157	81168	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017926	AGCCAA	2	12	81235	81246	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017926	AAAAGA	2	12	82264	82275	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017926	AGAAAA	2	12	85478	85489	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017926	AGCGGG	2	12	87650	87661	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017926	CGCTAA	2	12	98544	98555	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017926	AGCGGT	2	12	99735	99746	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017926	AAAAGA	2	12	115886	115897	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017926	GAAAAA	2	12	116596	116607	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017926	TTTAAA	2	12	118060	118071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017926	TTAAAA	2	12	118589	118600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017926	CTAAAA	2	12	120567	120578	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017926	ATTTGT	2	12	160168	160179	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017926	AAAAAC	2	12	162363	162374	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017926	TTTGAA	2	12	162985	162996	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017926	CTCCAG	2	12	164665	164676	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017926	TTAAAA	2	12	171794	171805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017926	ATTAAG	2	12	179206	179217	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017926	TTATAA	2	12	193877	193888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017926	TAAAAA	2	12	199426	199437	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017926	AATTTC	2	12	203544	203555	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017926	ACTTAT	2	12	207206	207217	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017926	TTTTTA	2	12	232156	232167	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017926	AATTTT	2	12	235760	235771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017926	TATAAT	2	12	243124	243135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017926	ATTAAA	2	12	256576	256587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017926	AGTGAG	2	12	257884	257895	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017926	ATTTTA	2	12	279641	279652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017926	CTCAAG	2	12	285974	285985	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017926	TGGAAA	2	12	296404	296415	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017926	GATTTT	2	12	297284	297295	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017926	ATTTCA	2	12	332818	332829	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017926	GAAAAA	2	12	341207	341218	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017926	GAGCGG	2	12	341682	341693	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017926	GCTATG	2	12	342058	342069	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017926	TTTCTT	2	12	356767	356778	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017926	TTTCTT	2	12	356821	356832	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017926	TTTTTC	2	12	356951	356962	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017926	TTTTTC	2	12	356984	356995	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017926	TTTCTT	2	12	357112	357123	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017926	ATGGGG	2	12	367989	368000	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017926	GCACAT	2	12	382888	382899	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017926	GGTGTG	2	12	386967	386978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017926	TTTTCT	2	12	387251	387262	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017926	GATTTT	2	12	388275	388286	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017926	TTCTTT	2	12	388299	388310	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017926	GCTAAA	2	12	388578	388589	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017926	AAAAGC	2	12	389914	389925	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017926	TTATTT	2	12	398667	398678	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017926	AAAGAA	2	12	401675	401686	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017926	AGATGG	2	12	401716	401727	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017926	AGCAAG	2	12	426371	426382	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017926	ATTATC	2	12	430569	430580	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017926	CAAACT	2	12	431535	431546	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017926	AAAAAT	2	12	452322	452333	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017926	AAAAAG	2	12	457715	457726	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017926	AAAATA	2	12	458516	458527	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017926	TAAATA	2	12	466912	466923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017926	TTCTTT	2	12	469436	469447	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017926	TATTTT	2	12	497504	497515	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017926	ATTTGA	2	12	511097	511108	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017926	AAAATA	2	12	562498	562509	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017926	GAAATT	2	12	568240	568251	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017926	AATAGG	2	12	568532	568543	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017926	GCACAA	2	12	570787	570798	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017926	CAGCCA	2	12	597742	597753	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017926	TAAAAT	2	12	625710	625721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017926	AGCTTG	2	12	642111	642122	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017926	TCTTGC	2	12	644017	644028	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017926	GTTATT	2	12	645354	645365	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017926	AATTTC	2	12	646182	646193	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017926	GGAAAA	2	12	657317	657328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017926	AAGAAA	2	12	657364	657375	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017926	AGCATG	2	12	667640	667651	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017926	CAAATT	2	12	674443	674454	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017926	AATGAA	2	12	683469	683480	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017926	GAAAAA	2	12	685301	685312	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017926	TTCAAA	2	12	685996	686007	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017926	AATGTG	2	12	690486	690497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017926	TTTCTT	2	12	712127	712138	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017926	ATATTT	2	12	727962	727973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017926	GTTTAT	2	12	732282	732293	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017926	CTCATT	2	12	739386	739397	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017926	TAGTGA	2	12	748249	748260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017926	ATTTTT	2	12	748874	748885	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017926	GATTTT	2	12	750830	750841	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017926	CTTTTT	2	12	774559	774570	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017926	TTGGAA	2	12	800763	800774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017926	AGGGTT	2	12	802111	802122	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017926	ATCATA	2	12	802267	802278	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017926	ATGAAG	2	12	838672	838683	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017926	TTAAAA	2	12	847372	847383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017926	ATGCCC	2	12	877808	877819	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017926	TCCAAC	2	12	879456	879467	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017926	TTTAAA	2	12	880462	880473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017926	TTACAA	2	12	905578	905589	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017926	GAAAAA	2	12	909371	909382	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017926	GAAAAA	2	12	909695	909706	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017926	TGATTT	2	12	914604	914615	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017926	TTCAAT	2	12	921967	921978	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017926	AGCGAT	2	12	922401	922412	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017926	TCCAAA	2	12	927688	927699	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017926	ATAAAA	2	12	942341	942352	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017926	ATTAAA	2	12	942508	942519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017926	ATTATA	2	12	986360	986371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017926	ATTGAA	2	12	993843	993854	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017926	AAAATT	2	12	1011571	1011582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017926	TGTATA	2	12	1011609	1011620	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017926	ATTTTT	2	12	1018169	1018180	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017926	CCCCAG	2	12	1036809	1036820	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017926	TAAAAT	3	18	1040614	1040631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017926	CAAACC	2	12	1041627	1041638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017926	TAAAAA	2	12	1043478	1043489	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017926	CTAGCC	2	12	1062889	1062900	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017926	TTTGGC	2	12	1068225	1068236	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017926	TTTCTT	2	12	1070463	1070474	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017926	TTTCTT	2	12	1072599	1072610	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017926	TAGACT	5	30	1080033	1080062	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017926	TGCCAT	2	12	1107599	1107610	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017926	CTTTAG	2	12	1110388	1110399	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017926	ACAAAA	2	12	1118256	1118267	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017926	ATTGAC	2	12	1151029	1151040	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017926	ACAAAA	2	12	1177432	1177443	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017926	AATACC	2	12	1206946	1206957	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017926	AATGAA	2	12	1209218	1209229	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017926	AACGCT	2	12	1210730	1210741	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017926	AGCGCA	2	12	1232805	1232816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017926	ACAGAA	2	12	1242774	1242785	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_017926	TAAAAA	2	12	1253517	1253528	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017926	ATCCTT	2	12	1260635	1260646	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017926	TTGTAT	2	12	1263056	1263067	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017926	ACTTAA	2	12	1280035	1280046	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_017926	TTTGAT	2	12	1317379	1317390	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017926	ATTTTT	2	12	1334087	1334098	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017926	GGCTTT	2	12	1340311	1340322	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_017926	TCTCCA	2	12	1396630	1396641	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017926	TTTCTT	2	12	1409117	1409128	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_017926	AGTTTT	2	12	1424547	1424558	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017926	TTTATC	2	12	1425640	1425651	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_017926	AGCGGG	2	12	1435637	1435648	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_017926	TGTTTA	2	12	1437896	1437907	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017926	GTTTTA	2	12	1445728	1445739	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017926	TAAAAA	2	12	1446554	1446565	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017926	AAGCCA	2	12	1446705	1446716	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_017926	CTAAGT	2	12	1457881	1457892	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_017926	TCGCAT	2	12	1458217	1458228	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_017926	ATAGGG	2	12	1459893	1459904	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017926	TTTGAG	2	12	1459988	1459999	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017926	AAACAA	2	12	1460381	1460392	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_017926	AATGAA	2	12	1462289	1462300	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017926	AATTAG	2	12	1465530	1465541	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017926	TAGAAA	2	12	1469159	1469170	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017926	TTTTCT	2	12	1483733	1483744	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
161	NC_017926	AATCCC	2	12	1487338	1487349	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
162	NC_017926	AGAGCG	2	12	1515495	1515506	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_017926	CCTCTT	2	12	1540671	1540682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
164	NC_017926	ATCAGC	2	12	1561572	1561583	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_017926	TTAGTC	2	12	1571631	1571642	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
166	NC_017926	ATAAAA	2	12	1572705	1572716	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017926	AACCTA	2	12	1572837	1572848	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_017926	GCGAGC	2	12	1598902	1598913	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_017926	GGGCTT	2	12	1611708	1611719	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
170	NC_017926	ATCACC	2	12	1624737	1624748	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
171	NC_017926	TAATGA	2	12	1626256	1626267	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
172	NC_017926	TGCAAA	2	12	1626399	1626410	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
173	NC_017926	AAGTTT	2	12	1630132	1630143	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
174	NC_017926	ATGAAG	2	12	1631879	1631890	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.