MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori XZ274 chromosome

Total Repeats: 626

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017926	CCGCAG	2	12	1138	1149	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	387907370
2	NC_017926	ATTATA	2	12	1890	1901	50 %	50 %	0 %	0 %	387907371
3	NC_017926	GCGATA	2	12	3822	3833	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387907373
4	NC_017926	GCTTGC	2	12	6372	6383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387907374
5	NC_017926	GTATGT	2	12	6833	6844	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387907374
6	NC_017926	CCGTTC	2	12	7062	7073	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	387907374
7	NC_017926	TGAAAC	2	12	7860	7871	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387907375
8	NC_017926	AAATGC	2	12	8098	8109	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387907375
9	NC_017926	AGAAAA	2	12	18781	18792	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387907384
10	NC_017926	GATAAA	2	12	22337	22348	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387907387
11	NC_017926	TTTCTT	2	12	23065	23076	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387907388
12	NC_017926	ATGCAA	2	12	27365	27376	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387907391
13	NC_017926	ACCTTA	2	12	37415	37426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907399
14	NC_017926	AGTGGG	2	12	42126	42137	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	387907402
15	NC_017926	CCCTAA	2	12	42720	42731	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387907403
16	NC_017926	AGTGGC	2	12	42898	42909	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387907403
17	NC_017926	CATGGA	2	12	45148	45159	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387907406
18	NC_017926	TTTTAT	2	12	48758	48769	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387907407
19	NC_017926	TTCTTT	2	12	49427	49438	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387907408
20	NC_017926	TGTTGG	2	12	51840	51851	0 %	50 %	50 %	0 %	387907412
21	NC_017926	ACAAAA	2	12	52766	52777	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	387907413
22	NC_017926	ATTGAA	2	12	54649	54660	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387907415
23	NC_017926	GGCACA	2	12	59595	59606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387907416
24	NC_017926	TGAGCA	2	12	61562	61573	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387907418
25	NC_017926	GTGCCT	2	12	64683	64694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387907421
26	NC_017926	GATTTT	2	12	65019	65030	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387907421
27	NC_017926	ATTTGC	2	12	74141	74152	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387907428
28	NC_017926	TAAAAA	2	12	75747	75758	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387907429
29	NC_017926	TTTTGT	2	12	83451	83462	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	387907435
30	NC_017926	AAAGAG	2	12	83730	83741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387907435
31	NC_017926	GGACAA	2	12	87023	87034	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387907439
32	NC_017926	ACGCCC	2	12	95463	95474	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	387907448
33	NC_017926	TAAGGG	2	12	98180	98191	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387907451
34	NC_017926	GGCATG	2	12	101688	101699	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387907453
35	NC_017926	GCAACG	2	12	102736	102747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387907453
36	NC_017926	ATATTG	2	12	103535	103546	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387907455
37	NC_017926	AAACCA	2	12	120054	120065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387907466
38	NC_017926	TTTGCT	2	12	121579	121590	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387907469
39	NC_017926	ATTGAA	2	12	124923	124934	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387907472
40	NC_017926	ATTCAA	2	12	125084	125095	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387907472
41	NC_017926	CCTTAG	2	12	125617	125628	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387907472
42	NC_017926	TAGAAC	2	12	127445	127456	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387907473
43	NC_017926	TAGAAG	2	12	127649	127660	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387907473
44	NC_017926	GGTTAT	2	12	128086	128097	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387907473
45	NC_017926	GCTCAA	2	12	128706	128717	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387907474
46	NC_017926	TAGAAG	2	12	129136	129147	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387907474
47	NC_017926	GGTTAT	2	12	129573	129584	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387907474
48	NC_017926	CGAGCG	2	12	133951	133962	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387907477
49	NC_017926	GGCTTG	2	12	138572	138583	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387907481
50	NC_017926	TAACGC	2	12	144562	144573	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387907487
51	NC_017926	AATATT	2	12	151181	151192	50 %	50 %	0 %	0 %	387907493
52	NC_017926	AATTAA	2	12	153853	153864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387907494
53	NC_017926	CACCGC	2	12	154388	154399	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	387907494
54	NC_017926	TTTTGA	2	12	155089	155100	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387907495
55	NC_017926	TGAGTT	2	12	156586	156597	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387907496
56	NC_017926	TCTAAT	2	12	158461	158472	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387907499
57	NC_017926	ATTTTT	2	12	159965	159976	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387907500
58	NC_017926	TCATGA	2	12	165059	165070	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387907504
59	NC_017926	CTAATG	2	12	166206	166217	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387907505
60	NC_017926	ATCCTT	2	12	172286	172297	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387907513
61	NC_017926	TAGCGA	2	12	173734	173745	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387907515
62	NC_017926	TTAGCG	2	12	176639	176650	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387907517
63	NC_017926	TATCGC	2	12	176851	176862	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387907517
64	NC_017926	GGCTTA	2	12	177500	177511	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387907518
65	NC_017926	ATCGCT	2	12	178559	178570	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387907518
66	NC_017926	CCTAAA	2	12	180781	180792	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387907519
67	NC_017926	TTCTAT	2	12	181941	181952	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387907520
68	NC_017926	TTGTTT	2	12	184929	184940	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	387907525
69	NC_017926	TTGGGT	2	12	190368	190379	0 %	50 %	50 %	0 %	387907531
70	NC_017926	GATTTT	2	12	190880	190891	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387907532
71	NC_017926	GATGGC	2	12	194110	194121	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387907535
72	NC_017926	CTTTCT	2	12	194362	194373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387907535
73	NC_017926	CCGCTC	2	12	196344	196355	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	387907537
74	NC_017926	GCTCTC	2	12	198768	198779	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	387907540
75	NC_017926	TTCTAA	2	12	201089	201100	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387907542
76	NC_017926	TCAATA	2	12	202771	202782	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387907544
77	NC_017926	CGTTTT	2	12	202880	202891	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387907544
78	NC_017926	ATCGTT	2	12	203193	203204	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387907544
79	NC_017926	TAAAAT	2	12	204819	204830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387907545
80	NC_017926	ATTTTG	2	12	206632	206643	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387907547
81	NC_017926	CGCTTT	2	12	207109	207120	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387907547
82	NC_017926	GTTTAA	2	12	207893	207904	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387907548
83	NC_017926	CCGCTC	2	12	210544	210555	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	387907551
84	NC_017926	GAAAAA	2	12	214166	214177	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387907554
85	NC_017926	AGGCAT	2	12	214255	214266	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387907554
86	NC_017926	GCATTT	2	12	215968	215979	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387907556
87	NC_017926	TCAAAC	2	12	216535	216546	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387907557
88	NC_017926	ATAAAG	2	12	216696	216707	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387907557
89	NC_017926	ATTCTT	2	12	217020	217031	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387907558
90	NC_017926	GGTATT	2	12	220480	220491	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387907561
91	NC_017926	TCTAAA	2	12	220710	220721	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387907561
92	NC_017926	TGGGCA	2	12	221778	221789	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387907562
93	NC_017926	TTCTAA	2	12	222257	222268	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387907563
94	NC_017926	ATTTTC	2	12	224202	224213	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387907563
95	NC_017926	TGGGGC	2	12	231614	231625	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	387907572
96	NC_017926	ATTCTA	2	12	243444	243455	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387907580
97	NC_017926	CATAGC	2	12	245200	245211	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387907581
98	NC_017926	GTTTTG	2	12	245705	245716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387907581
99	NC_017926	TTATTT	2	12	247337	247348	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387907582
100	NC_017926	TAATTA	2	12	250250	250261	50 %	50 %	0 %	0 %	387907585
101	NC_017926	GCTAAA	2	12	253760	253771	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387907589
102	NC_017926	AATGCC	2	12	258429	258440	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387907593
103	NC_017926	AGGGCC	2	12	261073	261084	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387907594
104	NC_017926	GGTGAT	2	12	262669	262680	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387907595
105	NC_017926	CACGCC	2	12	263586	263597	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	387907596
106	NC_017926	GCTTTG	2	12	264832	264843	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387907597
107	NC_017926	GCTAGG	2	12	266210	266221	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387907598
108	NC_017926	TGGAGG	2	12	266758	266769	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	387907599
109	NC_017926	GTTTTT	2	12	278181	278192	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	387907611
110	NC_017926	ATTGTC	2	12	281341	281352	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387907614
111	NC_017926	TCCCGC	2	12	284338	284349	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	387907616
112	NC_017926	GTGGGT	2	12	287527	287538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387907619
113	NC_017926	TGAGCG	2	12	292181	292192	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387907624
114	NC_017926	AGCTTT	2	12	300692	300703	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387907629
115	NC_017926	GATTTT	2	12	305228	305239	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387907636
116	NC_017926	ATTAGA	2	12	305350	305361	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387907636
117	NC_017926	AAATAC	2	12	307772	307783	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387907639
118	NC_017926	AAATCA	2	12	308133	308144	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387907640
119	NC_017926	GCGTTA	2	12	309889	309900	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387907641
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232	NC_017926	TTAGCC	2	12	585469	585480	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387907885
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452	NC_017926	TACCAA	2	12	1152214	1152225	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387908341
453	NC_017926	GAATTT	2	12	1152309	1152320	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387908341
454	NC_017926	CGCCAT	2	12	1160408	1160419	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387908349
455	NC_017926	CCATCG	2	12	1160557	1160568	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387908349
456	NC_017926	TAGCGA	2	12	1162707	1162718	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387908351
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458	NC_017926	TTTGAA	2	12	1164996	1165007	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387908353
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