MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Blaberus giganteus) chromosome

Total Repeats: 172

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017924	TAAA	2	8	10638	10645	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017924	CTTT	2	8	10999	11006	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017924	AATC	2	8	15574	15581	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017924	TAAA	2	8	26484	26491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017924	AATT	2	8	26513	26520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017924	AAAG	2	8	36822	36829	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017924	TATT	2	8	36849	36856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017924	AAAT	2	8	39756	39763	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017924	GTTT	2	8	43856	43863	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017924	ATTT	2	8	45056	45063	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017924	GATA	2	8	53544	53551	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017924	ATTT	2	8	62017	62024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017924	ATAA	2	8	77098	77105	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017924	TATT	2	8	78941	78948	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017924	TAAA	2	8	81477	81484	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017924	ATAA	2	8	81495	81502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017924	ATTA	2	8	81596	81603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017924	ATTT	2	8	91518	91525	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017924	TATT	2	8	94473	94480	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017924	AAAT	2	8	95875	95882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017924	TTAA	2	8	99780	99787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017924	ATTT	2	8	102154	102161	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017924	TTTG	2	8	102326	102333	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017924	TTCA	2	8	102352	102359	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017924	AAAT	2	8	109506	109513	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017924	ATAA	2	8	114083	114090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017924	ATTA	2	8	115937	115944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017924	TTTA	2	8	120937	120944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017924	CATC	2	8	126804	126811	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017924	AGAA	2	8	126834	126841	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017924	TGTA	2	8	130028	130035	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017924	GTAA	2	8	130044	130051	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017924	TAGT	3	12	130061	130072	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017924	AATT	2	8	130129	130136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017924	TACA	2	8	133592	133599	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017924	GTTT	2	8	133619	133626	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017924	TGAA	2	8	138661	138668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017924	AAAT	2	8	138725	138732	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017924	CTTT	2	8	144814	144821	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017924	ACAA	2	8	144860	144867	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017924	AGTC	2	8	144932	144939	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017924	TAAA	2	8	144999	145006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017924	TAAT	2	8	148524	148531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017924	ATTT	2	8	150666	150673	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017924	ATTT	2	8	153428	153435	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017924	TTTA	2	8	153483	153490	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017924	GGAT	2	8	153508	153515	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017924	ATTT	2	8	154737	154744	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017924	AAAT	2	8	167707	167714	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017924	ATTA	2	8	178399	178406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017924	TAAT	2	8	178411	178418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017924	TTTA	2	8	202547	202554	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017924	TAAA	2	8	208333	208340	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017924	ATCA	2	8	208409	208416	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017924	AAAG	2	8	209230	209237	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017924	TTTC	2	8	212529	212536	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017924	AAAT	2	8	222047	222054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017924	GTTT	2	8	223106	223113	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017924	TGAT	2	8	229437	229444	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017924	CAAT	2	8	233314	233321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017924	TTAA	2	8	233340	233347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017924	ATAA	2	8	233405	233412	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017924	TAAT	2	8	246118	246125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017924	ATAA	2	8	249744	249751	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017924	AGTT	2	8	250621	250628	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017924	TTTG	2	8	250646	250653	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017924	TAAA	2	8	256287	256294	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017924	ATAA	2	8	279101	279108	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017924	ATTC	2	8	279169	279176	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017924	TATT	2	8	283042	283049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017924	GTTT	2	8	286952	286959	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017924	ATAA	2	8	289043	289050	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017924	TTAA	2	8	293092	293099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017924	ATTA	2	8	294010	294017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017924	GAAA	2	8	294029	294036	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017924	ATTA	2	8	297262	297269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017924	TAAA	2	8	298513	298520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017924	GAAT	2	8	301704	301711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017924	TTCA	2	8	307049	307056	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017924	ATCA	2	8	313132	313139	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017924	TTTA	2	8	313289	313296	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017924	ATAA	2	8	319702	319709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017924	TAAG	2	8	321842	321849	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017924	CATA	2	8	329052	329059	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017924	TAAA	2	8	329155	329162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017924	AATC	2	8	329272	329279	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017924	ATCA	2	8	329487	329494	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017924	AATA	2	8	333682	333689	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017924	TTAT	2	8	336530	336537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017924	TTAT	2	8	344823	344830	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017924	TTAA	2	8	344877	344884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017924	TAAA	2	8	352913	352920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017924	AATT	2	8	353030	353037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017924	TAAA	2	8	353180	353187	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017924	ATAG	2	8	353366	353373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017924	CGTA	2	8	354502	354509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017924	GATT	2	8	354772	354779	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017924	AATC	2	8	354784	354791	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017924	TGAT	2	8	355645	355652	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017924	TCGC	2	8	355748	355755	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017924	TATG	2	8	356012	356019	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017924	AAGC	2	8	356082	356089	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017924	CAAT	2	8	356206	356213	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017924	TCCG	2	8	356803	356810	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017924	AACT	2	8	357581	357588	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017924	TACG	2	8	357709	357716	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017924	TAAA	2	8	357842	357849	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017924	TAAA	2	8	357974	357981	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017924	TTAA	2	8	365217	365224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017924	CATA	2	8	368294	368301	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017924	TAAA	2	8	381325	381332	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017924	CAAA	2	8	383133	383140	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017924	TTTA	2	8	383253	383260	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017924	CTTC	2	8	383319	383326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017924	ATTA	2	8	385692	385699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017924	TAAA	2	8	403058	403065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017924	ATAA	2	8	407869	407876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017924	ATAA	2	8	409637	409644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017924	ATTT	2	8	411194	411201	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017924	TAAT	2	8	413613	413620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017924	TTTA	2	8	413667	413674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017924	TAAA	2	8	416364	416371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017924	TAAA	2	8	419568	419575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017924	ATTT	2	8	419590	419597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017924	TTAT	2	8	423890	423897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017924	GTTT	2	8	424083	424090	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017924	AAAT	3	12	428510	428521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017924	ATTT	2	8	428583	428590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017924	AAAT	2	8	428611	428618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017924	TTTG	2	8	428627	428634	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017924	AAAT	2	8	429801	429808	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017924	TTTG	2	8	429913	429920	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017924	TAGA	2	8	430013	430020	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017924	CATA	2	8	431517	431524	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017924	AAAT	2	8	431824	431831	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017924	TTAA	2	8	431887	431894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017924	CATA	3	12	436320	436331	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017924	AATA	2	8	436680	436687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017924	AATT	2	8	447298	447305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017924	ATTT	2	8	466172	466179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017924	ACGG	2	8	468688	468695	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017924	AAAT	2	8	470119	470126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017924	TTAT	2	8	477753	477760	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017924	TAAT	2	8	490339	490346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017924	GATA	2	8	492971	492978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017924	TATG	2	8	494422	494429	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017924	TAAA	2	8	498321	498328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017924	ATAA	2	8	506109	506116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017924	TGAA	2	8	506132	506139	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017924	CATA	2	8	507886	507893	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017924	CATA	3	12	507895	507906	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_017924	GTTT	2	8	514114	514121	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017924	ATTT	2	8	520382	520389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017924	CATA	2	8	530212	530219	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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157	NC_017924	TACA	2	8	535553	535560	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
158	NC_017924	AATA	2	8	540085	540092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017924	TATT	2	8	543126	543133	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017924	AATC	2	8	559821	559828	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
161	NC_017924	TGTC	2	8	565355	565362	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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170	NC_017924	ATTT	2	8	616392	616399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_017924	ATCC	2	8	620402	620409	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
172	NC_017924	TTCT	2	8	629007	629014	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.