MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia sp. KJ006 plasmid pKJ006

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017923	CATCG	2	10	1562	1571	20 %	20 %	20 %	40 %	387906745
2	NC_017923	TGAGT	2	10	1759	1768	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017923	TAACA	2	10	1886	1895	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017923	GATGC	2	10	3081	3090	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017923	GGTTC	2	10	5623	5632	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017923	AGCCG	2	10	5751	5760	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_017923	GTCAC	2	10	10813	10822	20 %	20 %	20 %	40 %	387906757
8	NC_017923	GTCGA	2	10	11690	11699	20 %	20 %	40 %	20 %	387906757
9	NC_017923	GTTCG	2	10	11931	11940	0 %	40 %	40 %	20 %	387906757
10	NC_017923	TTCGA	2	10	13546	13555	20 %	40 %	20 %	20 %	387906757
11	NC_017923	AATAA	2	10	16559	16568	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017923	CGAAC	2	10	19223	19232	40 %	0 %	20 %	40 %	387906766
13	NC_017923	ACTGA	2	10	20378	20387	40 %	20 %	20 %	20 %	387906767
14	NC_017923	GGCAG	2	10	20687	20696	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017923	ACAAG	2	10	21043	21052	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017923	CGACC	2	10	21724	21733	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_017923	GTCCA	2	10	23103	23112	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017923	AGCCT	2	10	23174	23183	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017923	GGTGG	2	10	24713	24722	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017923	ATCAA	2	10	25861	25870	60 %	20 %	0 %	20 %	387906769
21	NC_017923	CGAGC	2	10	26757	26766	20 %	0 %	40 %	40 %	387906769
22	NC_017923	ACGCG	2	10	29519	29528	20 %	0 %	40 %	40 %	387906773
23	NC_017923	GACGA	2	10	29533	29542	40 %	0 %	40 %	20 %	387906773
24	NC_017923	CAAGA	2	10	29848	29857	60 %	0 %	20 %	20 %	387906773
25	NC_017923	AAAGC	2	10	30471	30480	60 %	0 %	20 %	20 %	387906773
26	NC_017923	GGGCA	2	10	32096	32105	20 %	0 %	60 %	20 %	387906775
27	NC_017923	CGCTG	2	10	32929	32938	0 %	20 %	40 %	40 %	387906776
28	NC_017923	CGACG	2	10	33227	33236	20 %	0 %	40 %	40 %	387906776
29	NC_017923	GCCAA	2	10	34404	34413	40 %	0 %	20 %	40 %	387906778
30	NC_017923	TCGGA	2	10	34678	34687	20 %	20 %	40 %	20 %	387906778
31	NC_017923	AGGGA	2	10	37973	37982	40 %	0 %	60 %	0 %	387906781
32	NC_017923	CGCGA	2	10	39077	39086	20 %	0 %	40 %	40 %	387906782
33	NC_017923	GCCGA	2	10	39554	39563	20 %	0 %	40 %	40 %	387906783
34	NC_017923	GCGCC	2	10	40208	40217	0 %	0 %	40 %	60 %	387906784
35	NC_017923	GTCGA	2	10	40241	40250	20 %	20 %	40 %	20 %	387906784
36	NC_017923	CCGGC	2	10	42114	42123	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
37	NC_017923	GCTTG	2	10	44898	44907	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017923	CGGCG	2	10	45168	45177	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.