MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. KJ006 plasmid pKJ006

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017923	GGTC	2	8	2198	2205	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017923	CAAC	2	8	3020	3027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017923	TCGG	2	8	3051	3058	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017923	GACG	2	8	5053	5060	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017923	GACC	2	8	5105	5112	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017923	CGGC	2	8	5254	5261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017923	CCGG	2	8	5642	5649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017923	GTCC	2	8	6439	6446	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017923	TTCC	2	8	7165	7172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017923	TCCG	2	8	7591	7598	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017923	ATCG	2	8	7610	7617	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017923	CGGC	2	8	9137	9144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017923	CGAC	2	8	9730	9737	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017923	GCCC	2	8	14158	14165	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_017923	CGCC	2	8	14814	14821	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16	NC_017923	GGCA	2	8	14925	14932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017923	GCAA	2	8	16414	16421	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017923	CGCA	2	8	16461	16468	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017923	GCCA	2	8	17120	17127	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017923	AACG	2	8	17377	17384	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017923	ACCG	2	8	17460	17467	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017923	TCAG	2	8	18029	18036	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017923	CTTC	2	8	19421	19428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017923	GGTT	2	8	19507	19514	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017923	CGGG	2	8	21174	21181	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017923	CGAC	2	8	22920	22927	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017923	TCGA	2	8	23438	23445	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017923	CGAG	2	8	23613	23620	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017923	CGTT	2	8	23893	23900	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017923	TCGC	2	8	32487	32494	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017923	AGTA	2	8	32562	32569	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017923	AGCC	2	8	36494	36501	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017923	TTAG	2	8	40078	40085	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017923	CGGC	2	8	41781	41788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017923	GTGG	2	8	42037	42044	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017923	GGGC	2	8	43545	43552	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017923	CGGC	2	8	44765	44772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.