MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia sp. KJ006 chromosome 3

Total Repeats: 1211

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017922	CGCGC	2	10	1400	1409	0 %	0 %	40 %	60 %	387905814
2	NC_017922	GCTGC	2	10	1598	1607	0 %	20 %	40 %	40 %	387905814
3	NC_017922	CGTGC	2	10	2301	2310	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017922	CGAAT	2	10	4240	4249	40 %	20 %	20 %	20 %	387905816
5	NC_017922	TCGAC	2	10	4481	4490	20 %	20 %	20 %	40 %	387905816
6	NC_017922	AAATG	2	10	4707	4716	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017922	TCGAA	2	10	6210	6219	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017922	CGGCA	2	10	6459	6468	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_017922	ACCGC	2	10	7407	7416	20 %	0 %	20 %	60 %	387905819
10	NC_017922	TCAGG	2	10	11814	11823	20 %	20 %	40 %	20 %	387905821
11	NC_017922	GCAGC	2	10	12278	12287	20 %	0 %	40 %	40 %	387905822
12	NC_017922	CATCG	2	10	13371	13380	20 %	20 %	20 %	40 %	387905823
13	NC_017922	CGGCG	2	10	14115	14124	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017922	CGCGG	2	10	14182	14191	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017922	GTTGC	2	10	15340	15349	0 %	40 %	40 %	20 %	387905825
16	NC_017922	GGTGC	2	10	15755	15764	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017922	GCGAT	2	10	17380	17389	20 %	20 %	40 %	20 %	387905827
18	NC_017922	CACAA	2	10	17665	17674	60 %	0 %	0 %	40 %	387905828
19	NC_017922	TCTCG	2	10	20073	20082	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_017922	CGGCG	2	10	22259	22268	0 %	0 %	60 %	40 %	387905831
21	NC_017922	TGAAC	2	10	22540	22549	40 %	20 %	20 %	20 %	387905831
22	NC_017922	CGGCG	2	10	25224	25233	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23	NC_017922	AGCTG	2	10	25834	25843	20 %	20 %	40 %	20 %	387905832
24	NC_017922	ACCGG	2	10	27671	27680	20 %	0 %	40 %	40 %	387905834
25	NC_017922	GCGAC	2	10	28057	28066	20 %	0 %	40 %	40 %	387905834
26	NC_017922	CGCAG	2	10	28142	28151	20 %	0 %	40 %	40 %	387905834
27	NC_017922	GCCGC	2	10	28544	28553	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_017922	CGTGC	2	10	28695	28704	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_017922	CGTTT	2	10	29963	29972	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017922	ACGCG	2	10	30387	30396	20 %	0 %	40 %	40 %	387905836
31	NC_017922	TGCAC	2	10	30412	30421	20 %	20 %	20 %	40 %	387905836
32	NC_017922	GGCGA	2	10	30546	30555	20 %	0 %	60 %	20 %	387905836
33	NC_017922	CGGTT	2	10	30789	30798	0 %	40 %	40 %	20 %	387905836
34	NC_017922	ATGGC	2	10	32492	32501	20 %	20 %	40 %	20 %	387905838
35	NC_017922	GCGCG	2	10	33142	33151	0 %	0 %	60 %	40 %	387905840
36	NC_017922	GCGAA	2	10	34925	34934	40 %	0 %	40 %	20 %	387905841
37	NC_017922	GTGCG	2	10	36559	36568	0 %	20 %	60 %	20 %	387905842
38	NC_017922	CGCGC	2	10	39314	39323	0 %	0 %	40 %	60 %	387905843
39	NC_017922	CCGGC	2	10	40226	40235	0 %	0 %	40 %	60 %	387905843
40	NC_017922	GCGCG	2	10	41187	41196	0 %	0 %	60 %	40 %	387905845
41	NC_017922	CGCGG	2	10	41211	41220	0 %	0 %	60 %	40 %	387905845
42	NC_017922	GCGGT	2	10	42716	42725	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017922	TCGTG	2	10	44142	44151	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017922	GGGAG	2	10	45635	45644	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017922	CTCAT	2	10	47635	47644	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017922	CACAG	2	10	49129	49138	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_017922	CTCGG	2	10	49393	49402	0 %	20 %	40 %	40 %	387905848
48	NC_017922	GCGGA	2	10	49705	49714	20 %	0 %	60 %	20 %	387905848
49	NC_017922	CGCTG	2	10	49805	49814	0 %	20 %	40 %	40 %	387905848
50	NC_017922	GCCGC	2	10	50091	50100	0 %	0 %	40 %	60 %	387905848
51	NC_017922	TCGCG	2	10	51578	51587	0 %	20 %	40 %	40 %	387905849
52	NC_017922	AGCGG	2	10	53731	53740	20 %	0 %	60 %	20 %	387905851
53	NC_017922	GCGTC	2	10	54060	54069	0 %	20 %	40 %	40 %	387905851
54	NC_017922	CGCAT	2	10	54113	54122	20 %	20 %	20 %	40 %	387905851
55	NC_017922	GCTTT	2	10	54178	54187	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017922	CAGAT	2	10	54366	54375	40 %	20 %	20 %	20 %	387905852
57	NC_017922	CGAGC	2	10	54530	54539	20 %	0 %	40 %	40 %	387905852
58	NC_017922	GCCGC	2	10	55998	56007	0 %	0 %	40 %	60 %	387905854
59	NC_017922	CGTGC	2	10	56421	56430	0 %	20 %	40 %	40 %	387905854
60	NC_017922	GACGC	2	10	56461	56470	20 %	0 %	40 %	40 %	387905854
61	NC_017922	CGGCG	2	10	57590	57599	0 %	0 %	60 %	40 %	387905855
62	NC_017922	TCCGC	2	10	58170	58179	0 %	20 %	20 %	60 %	387905856
63	NC_017922	CGGCC	2	10	58802	58811	0 %	0 %	40 %	60 %	387905856
64	NC_017922	CGGCG	2	10	59967	59976	0 %	0 %	60 %	40 %	387905857
65	NC_017922	TCGCG	2	10	62595	62604	0 %	20 %	40 %	40 %	387905859
66	NC_017922	GCGTC	2	10	63267	63276	0 %	20 %	40 %	40 %	387905859
67	NC_017922	GATCG	2	10	63523	63532	20 %	20 %	40 %	20 %	387905859
68	NC_017922	GCGCC	2	10	64879	64888	0 %	0 %	40 %	60 %	387905861
69	NC_017922	CGCGC	2	10	66125	66134	0 %	0 %	40 %	60 %	387905861
70	NC_017922	CGCGC	2	10	66247	66256	0 %	0 %	40 %	60 %	387905861
71	NC_017922	ATCGA	2	10	67762	67771	40 %	20 %	20 %	20 %	387905864
72	NC_017922	CGCTG	2	10	69050	69059	0 %	20 %	40 %	40 %	387905865
73	NC_017922	TGCGG	2	10	69333	69342	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017922	GCTGG	2	10	69906	69915	0 %	20 %	60 %	20 %	387905866
75	NC_017922	ACGCG	2	10	71919	71928	20 %	0 %	40 %	40 %	387905868
76	NC_017922	AGGTC	2	10	74685	74694	20 %	20 %	40 %	20 %	387905868
77	NC_017922	CCGAT	2	10	76042	76051	20 %	20 %	20 %	40 %	387905869
78	NC_017922	GCGCG	2	10	76391	76400	0 %	0 %	60 %	40 %	387905869
79	NC_017922	CGGGC	2	10	79947	79956	0 %	0 %	60 %	40 %	387905873
80	NC_017922	CTGCG	2	10	81718	81727	0 %	20 %	40 %	40 %	387905874
81	NC_017922	GGTCT	2	10	84397	84406	0 %	40 %	40 %	20 %	387905877
82	NC_017922	GGCGC	2	10	84414	84423	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
83	NC_017922	CGGCG	2	10	85376	85385	0 %	0 %	60 %	40 %	387905879
84	NC_017922	GCGCC	2	10	86321	86330	0 %	0 %	40 %	60 %	387905879
85	NC_017922	CTGGC	2	10	87256	87265	0 %	20 %	40 %	40 %	387905880
86	NC_017922	CGCGC	2	10	87312	87321	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
87	NC_017922	GCGCG	2	10	88391	88400	0 %	0 %	60 %	40 %	387905881
88	NC_017922	GCGCG	3	15	88866	88880	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
89	NC_017922	CGCGC	2	10	90924	90933	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
90	NC_017922	CGCGA	2	10	91807	91816	20 %	0 %	40 %	40 %	387905884
91	NC_017922	GACGT	2	10	92188	92197	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017922	TGCCG	2	10	93623	93632	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017922	GCCGC	2	10	95669	95678	0 %	0 %	40 %	60 %	387905886
94	NC_017922	GCCGA	2	10	96499	96508	20 %	0 %	40 %	40 %	387905887
95	NC_017922	CATCG	2	10	96693	96702	20 %	20 %	20 %	40 %	387905887
96	NC_017922	TGAAG	2	10	99007	99016	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017922	GCCGC	2	10	100755	100764	0 %	0 %	40 %	60 %	387905890
98	NC_017922	GCTCG	2	10	100792	100801	0 %	20 %	40 %	40 %	387905890
99	NC_017922	CGCGC	2	10	101687	101696	0 %	0 %	40 %	60 %	387905891
100	NC_017922	GCGCC	2	10	101911	101920	0 %	0 %	40 %	60 %	387905891
101	NC_017922	TGCCG	2	10	102249	102258	0 %	20 %	40 %	40 %	387905892
102	NC_017922	TTGCG	2	10	104111	104120	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017922	GCGTC	2	10	104881	104890	0 %	20 %	40 %	40 %	387905893
104	NC_017922	CCGGC	2	10	105544	105553	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
105	NC_017922	TGGTG	2	10	108346	108355	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017922	CACGC	2	10	108568	108577	20 %	0 %	20 %	60 %	387905896
107	NC_017922	GCGCC	2	10	109108	109117	0 %	0 %	40 %	60 %	387905896
108	NC_017922	GAAGG	2	10	111095	111104	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017922	GCGCC	2	10	111300	111309	0 %	0 %	40 %	60 %	387905898
110	NC_017922	AGCGG	2	10	112162	112171	20 %	0 %	60 %	20 %	387905899
111	NC_017922	CCGCG	2	10	112227	112236	0 %	0 %	40 %	60 %	387905899
112	NC_017922	CGTGG	2	10	112790	112799	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017922	CGGCG	2	10	113303	113312	0 %	0 %	60 %	40 %	387905900
114	NC_017922	GCGCG	2	10	114132	114141	0 %	0 %	60 %	40 %	387905900
115	NC_017922	CGTCG	2	10	114602	114611	0 %	20 %	40 %	40 %	387905901
116	NC_017922	GTCGC	2	10	115293	115302	0 %	20 %	40 %	40 %	387905901
117	NC_017922	CGCTG	2	10	116448	116457	0 %	20 %	40 %	40 %	387905903
118	NC_017922	TGCCG	2	10	116559	116568	0 %	20 %	40 %	40 %	387905903
119	NC_017922	AACGA	2	10	116809	116818	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017922	CGACG	2	10	118320	118329	20 %	0 %	40 %	40 %	387905905
121	NC_017922	CCGCG	2	10	118487	118496	0 %	0 %	40 %	60 %	387905905
122	NC_017922	TCGGC	2	10	120825	120834	0 %	20 %	40 %	40 %	387905906
123	NC_017922	TCGCG	2	10	121579	121588	0 %	20 %	40 %	40 %	387905906
124	NC_017922	CGCGG	2	10	124667	124676	0 %	0 %	60 %	40 %	387905909
125	NC_017922	CGGCG	2	10	126089	126098	0 %	0 %	60 %	40 %	387905911
126	NC_017922	CCGAC	2	10	126748	126757	20 %	0 %	20 %	60 %	387905911
127	NC_017922	CGGCG	2	10	129950	129959	0 %	0 %	60 %	40 %	387905912
128	NC_017922	CGATG	2	10	130633	130642	20 %	20 %	40 %	20 %	387905912
129	NC_017922	GCAGC	2	10	131770	131779	20 %	0 %	40 %	40 %	387905914
130	NC_017922	CGGCG	2	10	132076	132085	0 %	0 %	60 %	40 %	387905914
131	NC_017922	GAATG	2	10	133670	133679	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017922	CGGTG	2	10	134462	134471	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017922	TCGAC	2	10	136184	136193	20 %	20 %	20 %	40 %	387905919
134	NC_017922	CGGTG	2	10	136635	136644	0 %	20 %	60 %	20 %	387905919
135	NC_017922	GCAAC	2	10	136887	136896	40 %	0 %	20 %	40 %	387905919
136	NC_017922	CGGGC	2	10	137259	137268	0 %	0 %	60 %	40 %	387905919
137	NC_017922	TGGCG	2	10	138018	138027	0 %	20 %	60 %	20 %	387905920
138	NC_017922	AATCG	2	10	138603	138612	40 %	20 %	20 %	20 %	387905921
139	NC_017922	CCTCG	2	10	139510	139519	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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141	NC_017922	TCGCG	2	10	141280	141289	0 %	20 %	40 %	40 %	387905922
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272	NC_017922	CTTCG	2	10	272643	272652	0 %	40 %	20 %	40 %	387906027
273	NC_017922	CCTTG	2	10	273050	273059	0 %	40 %	20 %	40 %	387906027
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286	NC_017922	CGGCA	2	10	288120	288129	20 %	0 %	40 %	40 %	387906045
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292	NC_017922	CGGCG	2	10	290694	290703	0 %	0 %	60 %	40 %	387906050
293	NC_017922	AGCCG	2	10	292522	292531	20 %	0 %	40 %	40 %	387906052
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381	NC_017922	TCGAT	2	10	365949	365958	20 %	40 %	20 %	20 %	387906119
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383	NC_017922	CGGCG	2	10	366476	366485	0 %	0 %	60 %	40 %	387906120
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385	NC_017922	GATGC	2	10	367347	367356	20 %	20 %	40 %	20 %	387906121
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387	NC_017922	AGGGG	2	10	368127	368136	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
388	NC_017922	CGCTG	2	10	368792	368801	0 %	20 %	40 %	40 %	387906122
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393	NC_017922	ATGGG	2	10	372170	372179	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
394	NC_017922	GTCGC	2	10	372918	372927	0 %	20 %	40 %	40 %	387906126
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399	NC_017922	GCGCG	2	10	378950	378959	0 %	0 %	60 %	40 %	387906132
400	NC_017922	CGCAG	2	10	380109	380118	20 %	0 %	40 %	40 %	387906133
401	NC_017922	GCGCG	2	10	382424	382433	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
402	NC_017922	CGGGC	2	10	382847	382856	0 %	0 %	60 %	40 %	387906137
403	NC_017922	GCGCC	2	10	383107	383116	0 %	0 %	40 %	60 %	387906137
404	NC_017922	GCGAC	2	10	384020	384029	20 %	0 %	40 %	40 %	387906138
405	NC_017922	CGCAC	2	10	384125	384134	20 %	0 %	20 %	60 %	387906138
406	NC_017922	GTCGC	2	10	385634	385643	0 %	20 %	40 %	40 %	387906141
407	NC_017922	CGCGG	2	10	386841	386850	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
408	NC_017922	CCGTG	2	10	387093	387102	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
409	NC_017922	CCCGG	2	10	387269	387278	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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411	NC_017922	CGATG	2	10	388529	388538	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
412	NC_017922	GCGCG	2	10	388731	388740	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
413	NC_017922	CTCGC	2	10	389400	389409	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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430	NC_017922	TGGTG	2	10	407584	407593	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
431	NC_017922	GTGTG	2	10	407670	407679	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
432	NC_017922	AGCGA	2	10	407803	407812	40 %	0 %	40 %	20 %	387906158
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438	NC_017922	GTGCG	2	10	413643	413652	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
439	NC_017922	GGCGC	2	10	413683	413692	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
440	NC_017922	GTTGC	2	10	413757	413766	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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