MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. KJ006 chromosome 2

Total Repeats: 1476

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017921	ACGC	2	8	168	175	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017921	GATG	2	8	2838	2845	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017921	TGGC	2	8	2887	2894	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017921	GCCC	2	8	2898	2905	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_017921	CCGG	2	8	3967	3974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017921	CGGC	2	8	3977	3984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017921	TGCT	2	8	7892	7899	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017921	CGGT	2	8	8150	8157	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017921	CGAT	2	8	8159	8166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017921	TCGA	2	8	8213	8220	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017921	CCGG	2	8	8644	8651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017921	GCCC	2	8	8791	8798	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_017921	CAAT	2	8	10095	10102	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017921	TGCT	2	8	10275	10282	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017921	TTGC	2	8	10479	10486	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017921	CTGT	2	8	10631	10638	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017921	CCGA	2	8	10716	10723	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017921	ACGG	2	8	12076	12083	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017921	ACTC	2	8	13040	13047	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017921	ATGC	2	8	13096	13103	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017921	CACG	2	8	13136	13143	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017921	CGAT	2	8	15399	15406	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017921	GGCG	2	8	15419	15426	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017921	CCGG	2	8	20726	20733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017921	GAGC	2	8	20908	20915	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017921	ACCA	2	8	21973	21980	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017921	CGGC	2	8	23406	23413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017921	GCAC	2	8	24435	24442	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017921	CCTG	2	8	30914	30921	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017921	TGCG	2	8	37478	37485	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017921	AACG	2	8	38492	38499	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017921	CGGC	2	8	39197	39204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017921	GCCC	2	8	39215	39222	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_017921	CGGG	2	8	39226	39233	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017921	TCAA	2	8	41953	41960	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017921	AGCC	2	8	41963	41970	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017921	CGTC	2	8	44230	44237	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017921	CCGG	2	8	44246	44253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017921	ATGC	2	8	44313	44320	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017921	GCGT	2	8	44368	44375	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017921	CGGC	2	8	46840	46847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017921	GCCG	2	8	46860	46867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017921	CGCC	2	8	47259	47266	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_017921	CCCG	2	8	48799	48806	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_017921	GATC	2	8	53531	53538	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017921	CCGC	2	8	56306	56313	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47	NC_017921	ACGC	2	8	64776	64783	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017921	GCGG	2	8	64816	64823	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017921	GGAT	2	8	66069	66076	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017921	CCAG	2	8	66626	66633	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017921	CAGC	2	8	66684	66691	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017921	TTGC	2	8	68173	68180	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017921	TGAT	2	8	68296	68303	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017921	ATTC	2	8	68603	68610	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017921	TCGA	2	8	68866	68873	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017921	CTAC	2	8	68876	68883	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017921	GTTG	2	8	69454	69461	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017921	TGGA	2	8	79514	79521	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017921	GCGG	2	8	79527	79534	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017921	GCCG	2	8	80334	80341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017921	CCAA	2	8	80364	80371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017921	CGGC	2	8	80549	80556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017921	CGCA	2	8	81367	81374	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017921	GCGG	3	12	87997	88008	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017921	CGGT	2	8	99743	99750	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017921	GGCA	2	8	99817	99824	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017921	TCCA	2	8	100890	100897	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017921	GGAA	2	8	103965	103972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017921	TGGC	2	8	103976	103983	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017921	GCTG	2	8	103998	104005	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017921	GACG	2	8	104151	104158	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017921	TCGT	2	8	105181	105188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017921	AAAG	2	8	110775	110782	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017921	ACGG	2	8	111863	111870	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017921	CGTG	2	8	121070	121077	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017921	GCGT	2	8	124931	124938	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017921	GCCG	2	8	125195	125202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017921	CCGG	2	8	125206	125213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017921	CGAC	2	8	125510	125517	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017921	GTCA	2	8	125723	125730	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017921	GTCG	2	8	126515	126522	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017921	CCGC	2	8	126659	126666	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_017921	ACCC	2	8	126829	126836	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
84	NC_017921	TTGA	2	8	129688	129695	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017921	GCCT	2	8	134853	134860	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017921	CGCC	2	8	134921	134928	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
87	NC_017921	CGGC	2	8	135558	135565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017921	TGCG	2	8	137790	137797	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017921	GCAG	2	8	139690	139697	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017921	CGTA	2	8	139786	139793	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017921	ATTT	2	8	139939	139946	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017921	AAAT	2	8	140037	140044	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017921	TGAT	2	8	140049	140056	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017921	TGCA	2	8	140089	140096	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017921	CAGC	2	8	140212	140219	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017921	CGTT	2	8	145236	145243	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017921	ACGC	2	8	146730	146737	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017921	CGGC	2	8	146741	146748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017921	GCGG	2	8	146844	146851	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017921	GTGG	2	8	147895	147902	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017921	AAGC	2	8	148293	148300	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017921	GGGA	2	8	149426	149433	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017921	TTTA	2	8	149990	149997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017921	CACG	2	8	153490	153497	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017921	GTGG	2	8	157409	157416	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017921	GACT	2	8	157448	157455	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017921	TTCG	2	8	164393	164400	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017921	GCCG	2	8	164447	164454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017921	ACGC	2	8	164664	164671	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017921	GCAC	2	8	164835	164842	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017921	GCCG	2	8	165034	165041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017921	GATC	2	8	165100	165107	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017921	CACG	2	8	168568	168575	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017921	CATT	2	8	168667	168674	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017921	ACGC	2	8	168734	168741	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017921	GCCG	2	8	170978	170985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017921	CAGC	2	8	171365	171372	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017921	CGGC	2	8	172552	172559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017921	CAGC	2	8	174679	174686	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017921	CGGC	2	8	182268	182275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017921	CCAA	2	8	182750	182757	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017921	CCGC	2	8	183573	183580	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
123	NC_017921	CGCC	2	8	185361	185368	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_017921	AGCG	2	8	185493	185500	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017921	GCCC	2	8	185553	185560	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126	NC_017921	GCGG	2	8	185572	185579	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017921	GCGG	2	8	186293	186300	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017921	GGCA	2	8	186607	186614	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017921	CGGC	2	8	186702	186709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017921	CCGG	2	8	194866	194873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017921	CCGC	2	8	195722	195729	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132	NC_017921	AACC	2	8	195910	195917	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017921	CAAT	2	8	203648	203655	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017921	CGGC	2	8	205150	205157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017921	CGCC	2	8	211215	211222	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
136	NC_017921	TTGT	2	8	219144	219151	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017921	GAAA	2	8	219440	219447	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017921	TCGT	2	8	221273	221280	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017921	CGGC	2	8	224696	224703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017921	GGCA	2	8	224713	224720	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017921	CAAT	2	8	225203	225210	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017921	CGAT	2	8	225520	225527	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017921	ATGC	2	8	227927	227934	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017921	GTCC	2	8	228410	228417	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017921	GACC	2	8	228689	228696	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017921	ATCC	2	8	228715	228722	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017921	CTGT	2	8	228961	228968	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017921	CCGC	2	8	238663	238670	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
149	NC_017921	AGGA	2	8	247493	247500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017921	TCCG	2	8	248883	248890	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017921	CGCA	2	8	249977	249984	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_017921	GGAA	2	8	252817	252824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_017921	CATC	2	8	748809	748816	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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499	NC_017921	GTGC	2	8	768829	768836	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
500	NC_017921	GGCG	2	8	769006	769013	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

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