MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori XZ274 plasmid pXZ274

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017919	AATTT	2	10	1121	1130	40 %	60 %	0 %	0 %	387908783
2	NC_017919	AAAAG	2	10	1244	1253	80 %	0 %	20 %	0 %	387908783
3	NC_017919	GCTAT	2	10	3174	3183	20 %	40 %	20 %	20 %	387908785
4	NC_017919	GCCAA	2	10	3212	3221	40 %	0 %	20 %	40 %	387908785
5	NC_017919	AAAGC	2	10	4729	4738	60 %	0 %	20 %	20 %	387908787
6	NC_017919	TTTCA	2	10	5597	5606	20 %	60 %	0 %	20 %	387908788
7	NC_017919	TTTAA	2	10	7962	7971	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017919	CTACA	2	10	8027	8036	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_017919	ATTTT	2	10	9519	9528	20 %	80 %	0 %	0 %	387908791
10	NC_017919	TTTCA	2	10	10199	10208	20 %	60 %	0 %	20 %	387908792
11	NC_017919	AATCA	2	10	10739	10748	60 %	20 %	0 %	20 %	387908793
12	NC_017919	TAAGT	2	10	11750	11759	40 %	40 %	20 %	0 %	387908795
13	NC_017919	TATTC	2	10	12232	12241	20 %	60 %	0 %	20 %	387908796
14	NC_017919	TAGAT	2	10	12372	12381	40 %	40 %	20 %	0 %	387908796
15	NC_017919	ATATT	2	10	13020	13029	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017919	TAATG	2	10	17383	17392	40 %	40 %	20 %	0 %	387908803
17	NC_017919	TAAAG	2	10	18433	18442	60 %	20 %	20 %	0 %	387908803
18	NC_017919	GTATT	2	10	19826	19835	20 %	60 %	20 %	0 %	387908804

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.