MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori XZ274 plasmid pXZ274

Total Repeats: 256

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017919	TTC	2	6	49	54	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017919	TTG	2	6	193	198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017919	TAA	2	6	234	239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017919	TTA	2	6	269	274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017919	TGA	2	6	395	400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908782
6	NC_017919	CAA	2	6	522	527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387908782
7	NC_017919	GAT	2	6	528	533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908782
8	NC_017919	ACT	2	6	622	627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908782
9	NC_017919	ATT	2	6	707	712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908782
10	NC_017919	GGT	2	6	764	769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387908782
11	NC_017919	ATC	2	6	771	776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908782
12	NC_017919	TGA	2	6	785	790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908782
13	NC_017919	GAA	3	9	804	812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908782
14	NC_017919	AAG	2	6	907	912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908782
15	NC_017919	TAA	2	6	913	918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908782
16	NC_017919	TAA	2	6	966	971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908783
17	NC_017919	ATT	2	6	1319	1324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908783
18	NC_017919	TGA	2	6	1446	1451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908783
19	NC_017919	ATA	2	6	1490	1495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908783
20	NC_017919	TAA	2	6	1662	1667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908783
21	NC_017919	TAA	2	6	1896	1901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908783
22	NC_017919	GCT	2	6	2041	2046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387908783
23	NC_017919	TAG	2	6	2066	2071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908783
24	NC_017919	AAT	2	6	2131	2136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908783
25	NC_017919	ACA	2	6	2169	2174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387908783
26	NC_017919	GTA	2	6	2227	2232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017919	CCT	2	6	2357	2362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387908784
28	NC_017919	GAT	2	6	2417	2422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908784
29	NC_017919	AAG	2	6	2478	2483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908784
30	NC_017919	AGA	2	6	2539	2544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908784
31	NC_017919	TGG	2	6	2596	2601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387908784
32	NC_017919	AAT	2	6	2656	2661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017919	ACC	2	6	2736	2741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_017919	TAA	2	6	2744	2749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017919	ATA	2	6	2783	2788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017919	GAT	2	6	2888	2893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908785
37	NC_017919	AGG	2	6	2915	2920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387908785
38	NC_017919	ATT	2	6	2960	2965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908785
39	NC_017919	TAA	2	6	3026	3031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908785
40	NC_017919	GAT	2	6	3107	3112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908785
41	NC_017919	CAC	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387908785
42	NC_017919	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908785
43	NC_017919	CTA	2	6	3319	3324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908785
44	NC_017919	ATA	2	6	3403	3408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908785
45	NC_017919	ATG	2	6	3508	3513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908785
46	NC_017919	AAC	2	6	3598	3603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017919	CAA	2	6	3684	3689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387908786
48	NC_017919	AGA	2	6	3714	3719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908786
49	NC_017919	TGA	2	6	3758	3763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908786
50	NC_017919	AGA	2	6	3771	3776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908786
51	NC_017919	AAG	2	6	3827	3832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908786
52	NC_017919	AAC	2	6	4061	4066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387908787
53	NC_017919	AAG	2	6	4143	4148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908787
54	NC_017919	CAT	2	6	4273	4278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908787
55	NC_017919	CGT	2	6	4292	4297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387908787
56	NC_017919	GCT	2	6	4302	4307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387908787
57	NC_017919	AAG	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908787
58	NC_017919	AAG	2	6	4584	4589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908787
59	NC_017919	AAG	2	6	4797	4802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908787
60	NC_017919	GAA	2	6	4856	4861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908787
61	NC_017919	AGA	2	6	4993	4998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908787
62	NC_017919	AGA	2	6	5071	5076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908787
63	NC_017919	TGG	2	6	5191	5196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387908788
64	NC_017919	TAA	2	6	5294	5299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908788
65	NC_017919	CTT	2	6	5474	5479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387908788
66	NC_017919	TAA	2	6	5549	5554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908788
67	NC_017919	ATC	2	6	5585	5590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908788
68	NC_017919	TTC	2	6	5891	5896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387908788
69	NC_017919	GGT	2	6	5969	5974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387908788
70	NC_017919	TTA	2	6	5989	5994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908788
71	NC_017919	GTT	2	6	6085	6090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387908788
72	NC_017919	TAA	2	6	6152	6157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908788
73	NC_017919	TTG	2	6	6483	6488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387908788
74	NC_017919	TCA	2	6	6624	6629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908788
75	NC_017919	TAA	2	6	6680	6685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908788
76	NC_017919	TGA	2	6	6829	6834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908788
77	NC_017919	TTC	2	6	6869	6874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387908788
78	NC_017919	CTT	2	6	6913	6918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387908788
79	NC_017919	TAG	2	6	6921	6926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908788
80	NC_017919	TGA	2	6	6970	6975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908788
81	NC_017919	TAT	2	6	7102	7107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017919	TTA	2	6	7309	7314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017919	ATT	2	6	7338	7343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908789
84	NC_017919	TAA	2	6	7677	7682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908790
85	NC_017919	TTG	2	6	7727	7732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387908790
86	NC_017919	CAA	2	6	7759	7764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387908790
87	NC_017919	CAA	3	9	7941	7949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017919	ATC	2	6	8068	8073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017919	CAA	2	6	8115	8120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017919	AAG	2	6	8125	8130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017919	CTT	2	6	8200	8205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387908791
92	NC_017919	ATA	2	6	8258	8263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908791
93	NC_017919	ATA	2	6	8337	8342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908791
94	NC_017919	CTT	2	6	8455	8460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387908791
95	NC_017919	ATC	2	6	8486	8491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908791
96	NC_017919	ATT	2	6	8502	8507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908791
97	NC_017919	TCT	2	6	8541	8546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387908791
98	NC_017919	ATA	2	6	8552	8557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908791
99	NC_017919	TAA	2	6	8633	8638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908791
100	NC_017919	TTC	2	6	8690	8695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387908791
101	NC_017919	TAA	2	6	8965	8970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908791
102	NC_017919	ATT	2	6	9026	9031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908791
103	NC_017919	CAT	2	6	9040	9045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908791
104	NC_017919	TTG	2	6	9536	9541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387908791
105	NC_017919	AAC	2	6	9564	9569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387908791
106	NC_017919	AGG	2	6	9653	9658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387908791
107	NC_017919	CAT	2	6	9685	9690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908791
108	NC_017919	AGA	2	6	9776	9781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908791
109	NC_017919	TAA	2	6	9828	9833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908791
110	NC_017919	AAT	2	6	9924	9929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908792
111	NC_017919	ACT	2	6	10005	10010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908792
112	NC_017919	ACA	2	6	10116	10121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387908792
113	NC_017919	TAA	2	6	10189	10194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908792
114	NC_017919	TAA	2	6	10280	10285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908792
115	NC_017919	AAT	2	6	10346	10351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908792
116	NC_017919	AAT	2	6	10399	10404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908792
117	NC_017919	TAT	2	6	10495	10500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908793
118	NC_017919	TAA	2	6	10502	10507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908793
119	NC_017919	TAA	2	6	10705	10710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908793
120	NC_017919	AAT	2	6	10729	10734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908793
121	NC_017919	TCT	2	6	10924	10929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387908794
122	NC_017919	ATT	2	6	10941	10946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908794
123	NC_017919	CTT	2	6	11231	11236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387908795
124	NC_017919	CAT	2	6	11260	11265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908795
125	NC_017919	ATT	2	6	11268	11273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908795
126	NC_017919	AAT	2	6	11326	11331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908795
127	NC_017919	ACC	2	6	11360	11365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387908795
128	NC_017919	TAT	2	6	11482	11487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908795
129	NC_017919	TAA	3	9	11504	11512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908795
130	NC_017919	CTA	2	6	11584	11589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908795
131	NC_017919	ACC	2	6	11646	11651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387908795
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133	NC_017919	TTA	2	6	11722	11727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908795
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256	NC_017919	TTG	2	6	22394	22399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.