MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus amyloliquefaciens Y2 chromosome

Total Repeats: 1485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017912	AAAAGA	2	12	4465	4476	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387896528
2	NC_017912	TCCGGA	2	12	5660	5671	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387896530
3	NC_017912	TGAAGA	2	12	8761	8772	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387896531
4	NC_017912	TTTGAA	2	12	17523	17534	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017912	ACTGGC	2	12	17633	17644	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387896534
6	NC_017912	GAAGGT	2	12	29048	29059	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387896545
7	NC_017912	TTAAAT	2	12	29554	29565	50 %	50 %	0 %	0 %	387896545
8	NC_017912	CAGGCG	2	12	37728	37739	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387896552
9	NC_017912	AATGTG	2	12	42631	42642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896557
10	NC_017912	GAACTC	2	12	45427	45438	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387896562
11	NC_017912	GAAAAA	2	12	48009	48020	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387896564
12	NC_017912	AGCGGA	2	12	55274	55285	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	387896572
13	NC_017912	TTGCCA	2	12	58685	58696	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387896576
14	NC_017912	GAATCG	2	12	60890	60901	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387896579
15	NC_017912	TCATAT	2	12	65704	65715	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017912	ATGATC	2	12	75393	75404	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387896593
17	NC_017912	AGCTGC	2	12	76890	76901	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387896594
18	NC_017912	TGTCGG	2	12	78631	78642	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387896596
19	NC_017912	AACACC	2	12	80022	80033	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017912	ATGAGG	2	12	84192	84203	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387896601
21	NC_017912	TCAAAT	2	12	89897	89908	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387896609
22	NC_017912	GTATCG	2	12	91039	91050	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387896609
23	NC_017912	AGTCAA	2	12	102303	102314	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017912	TGGCAC	2	12	104494	104505	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387896613
25	NC_017912	ACTCGG	2	12	104609	104620	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387896613
26	NC_017912	TGCCGA	2	12	109270	109281	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387896615
27	NC_017912	GTCATT	2	12	110132	110143	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387896616
28	NC_017912	CCAAGC	2	12	110628	110639	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387896616
29	NC_017912	CATTTA	2	12	119658	119669	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387896630
30	NC_017912	TCTGGT	2	12	119723	119734	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387896630
31	NC_017912	GAAGCT	2	12	120240	120251	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387896631
32	NC_017912	CTTGCA	2	12	121385	121396	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387896632
33	NC_017912	CTGTAG	2	12	121592	121603	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387896633
34	NC_017912	AGTTGA	2	12	131816	131827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896639
35	NC_017912	TAAAGG	2	12	136945	136956	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387896643
36	NC_017912	GTCGGT	2	12	143564	143575	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387896655
37	NC_017912	ATCGAA	2	12	143657	143668	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387896655
38	NC_017912	AATAAA	2	12	144944	144955	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387896658
39	NC_017912	GCGATT	2	12	146081	146092	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387896661
40	NC_017912	CATTAA	2	12	147098	147109	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017912	GAAAAG	2	12	148797	148808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017912	AAACAA	2	12	148838	148849	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017912	AAAAAG	2	12	150566	150577	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387896664
44	NC_017912	TTAACT	2	12	155363	155374	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017912	CGGTTG	2	12	155807	155818	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387896669
46	NC_017912	AGGTAT	2	12	166989	167000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017912	ACGGAT	2	12	182708	182719	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387896681
48	NC_017912	TCCGGC	3	18	185956	185973	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	387896684
49	NC_017912	ATAAAT	2	12	187611	187622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387896686
50	NC_017912	TCTGAT	2	12	187632	187643	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387896686
51	NC_017912	ATCGTC	2	12	190575	190586	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387896688
52	NC_017912	TTCTTT	2	12	196075	196086	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387896692
53	NC_017912	TGTTGA	2	12	201692	201703	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387896698
54	NC_017912	AAATAA	2	12	202298	202309	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387896698
55	NC_017912	AGACAA	2	12	202358	202369	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387896698
56	NC_017912	GACGGC	2	12	203219	203230	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387896699
57	NC_017912	TGGCCG	2	12	205109	205120	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	387896702
58	NC_017912	GAAATG	2	12	205621	205632	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387896702
59	NC_017912	TTAAAC	2	12	207144	207155	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017912	AGGCTG	2	12	212673	212684	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387896707
61	NC_017912	ATCAGA	2	12	213302	213313	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387896708
62	NC_017912	TGCGGA	2	12	215230	215241	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387896710
63	NC_017912	TATCTT	2	12	217331	217342	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387896713
64	NC_017912	GTGAAC	2	12	222775	222786	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387896718
65	NC_017912	CTTTTC	2	12	223534	223545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896719
66	NC_017912	AAGCGA	2	12	228306	228317	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387896725
67	NC_017912	GATAAA	2	12	229648	229659	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387896726
68	NC_017912	GAAAAG	2	12	229908	229919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896727
69	NC_017912	GAACAT	2	12	236225	236236	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387896732
70	NC_017912	TGAGGC	2	12	241340	241351	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387896737
71	NC_017912	TTTTAT	2	12	244580	244591	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387896741
72	NC_017912	ACCATC	2	12	247549	247560	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387896745
73	NC_017912	CTGCCG	2	12	247930	247941	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	387896745
74	NC_017912	GAGACG	2	12	249891	249902	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	387896747
75	NC_017912	ATGCCG	2	12	253728	253739	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387896751
76	NC_017912	CGAGGA	2	12	256214	256225	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	387896753
77	NC_017912	GCGGAA	2	12	259503	259514	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	387896757
78	NC_017912	CGTTTG	2	12	260658	260669	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387896759
79	NC_017912	AGCGGG	2	12	261378	261389	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	387896759
80	NC_017912	CAGGAT	2	12	266569	266580	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387896765
81	NC_017912	GAGAAT	2	12	268957	268968	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017912	TGAGAT	2	12	276190	276201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896775
83	NC_017912	TTTTCA	2	12	278870	278881	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387896778
84	NC_017912	TCATTG	2	12	279924	279935	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387896779
85	NC_017912	GAAGAG	2	12	280289	280300	50 %	0 %	50 %	0 %	387896779
86	NC_017912	CCACAG	2	12	280324	280335	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387896779
87	NC_017912	TTCTGC	2	12	282329	282340	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387896781
88	NC_017912	GAAGCG	2	12	284682	284693	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	387896784
89	NC_017912	GGGCGA	2	12	285202	285213	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	387896785
90	NC_017912	TTTATC	2	12	285808	285819	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387896786
91	NC_017912	AAAATC	2	12	288056	288067	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387896788
92	NC_017912	CATTGA	2	12	288978	288989	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387896788
93	NC_017912	AAACAG	2	12	291785	291796	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387896790
94	NC_017912	TTTCGG	2	12	294203	294214	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387896793
95	NC_017912	GATGGT	2	12	295104	295115	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387896794
96	NC_017912	AGAGTG	2	12	296681	296692	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387896796
97	NC_017912	GAAAGA	2	12	296694	296705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896796
98	NC_017912	ACGCTG	2	12	299186	299197	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387896797
99	NC_017912	GGAAAA	2	12	303075	303086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896801
100	NC_017912	AGGATG	2	12	306675	306686	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387896805
101	NC_017912	AGAATG	2	12	306830	306841	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387896805
102	NC_017912	ATTGAT	2	12	310950	310961	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387896810
103	NC_017912	GATCTC	2	12	313841	313852	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387896814
104	NC_017912	GATAAA	2	12	317676	317687	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017912	ATGGGG	2	12	318301	318312	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	387896818
106	NC_017912	ATTGAT	2	12	319083	319094	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017912	TGTGCG	2	12	325933	325944	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387896823
108	NC_017912	ATCAAT	2	12	329938	329949	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387896826
109	NC_017912	TTTGAG	2	12	331302	331313	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387896827
110	NC_017912	GAGCAG	2	12	331605	331616	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	387896827
111	NC_017912	ATATCA	2	12	333937	333948	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017912	GCCTGA	2	12	336927	336938	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387896835
113	NC_017912	AAATGC	2	12	346327	346338	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387896840
114	NC_017912	CGGCGA	2	12	347599	347610	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387896840
115	NC_017912	TCTGGA	2	12	348697	348708	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387896840
116	NC_017912	AATGTC	2	12	351903	351914	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387896841
117	NC_017912	TCCTCT	2	12	356492	356503	0 %	50 %	0 %	50 %	387896845
118	NC_017912	ATGAAA	2	12	361661	361672	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387896852
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232	NC_017912	TTTCTC	2	12	670069	670080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
233	NC_017912	TGAAAA	2	12	670380	670391	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387897181
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343	NC_017912	TGTGGT	2	12	991257	991268	0 %	50 %	50 %	0 %	387897512
344	NC_017912	GAAAAA	2	12	998828	998839	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387897522
345	NC_017912	CATTAT	2	12	998900	998911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387897522
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445	NC_017912	GGCCTC	2	12	1317557	1317568	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	387897875
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449	NC_017912	TATTCG	2	12	1334336	1334347	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387897896
450	NC_017912	ATCGGC	2	12	1343914	1343925	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387897907
451	NC_017912	AAACGG	2	12	1345576	1345587	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387897909
452	NC_017912	GCTGGA	2	12	1345776	1345787	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387897909
453	NC_017912	ATTGCG	2	12	1352964	1352975	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387897916
454	NC_017912	CGATTC	2	12	1354459	1354470	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387897916
455	NC_017912	GGCTTA	2	12	1354476	1354487	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387897916
456	NC_017912	GGAAGC	2	12	1354919	1354930	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	387897917
457	NC_017912	AGCTTG	2	12	1355926	1355937	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387897918
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459	NC_017912	AACGGA	2	12	1362114	1362125	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387897923
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