MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens Y2 chromosome

Total Repeats: 200

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017912	TTTGAA	2	12	17523	17534	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017912	TCATAT	2	12	65704	65715	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017912	AACACC	2	12	80022	80033	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017912	AGTCAA	2	12	102303	102314	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017912	CATTAA	2	12	147098	147109	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017912	GAAAAG	2	12	148797	148808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017912	AAACAA	2	12	148838	148849	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017912	TTAACT	2	12	155363	155374	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017912	AGGTAT	2	12	166989	167000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017912	TTAAAC	2	12	207144	207155	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017912	GAGAAT	2	12	268957	268968	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017912	GATAAA	2	12	317676	317687	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017912	ATTGAT	2	12	319083	319094	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017912	ATATCA	2	12	333937	333948	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017912	TTTTTC	2	12	418527	418538	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017912	ACTAAA	2	12	441788	441799	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017912	AATAAA	2	12	444398	444409	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017912	CGGCTC	2	12	457407	457418	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017912	TCATAT	2	12	461281	461292	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017912	TAAAGA	2	12	494224	494235	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017912	ATCCTC	2	12	501754	501765	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017912	TCACAA	2	12	518455	518466	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017912	ATGTGA	2	12	547056	547067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017912	ACTTTT	2	12	599371	599382	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017912	AAAAGG	2	12	614973	614984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017912	TCAATC	2	12	637888	637899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017912	CTTTCT	2	12	650136	650147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017912	TTTCTC	2	12	670069	670080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017912	CAATCC	2	12	680528	680539	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017912	CCAATA	2	12	688948	688959	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017912	AAATGA	2	12	697079	697090	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017912	AAAACT	2	12	709427	709438	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017912	GGCGGG	2	12	731427	731438	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017912	ATTTTT	2	12	733465	733476	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017912	ACAAAA	2	12	733605	733616	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017912	ATTTTT	2	12	739999	740010	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017912	AAGTGA	2	12	745030	745041	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017912	TCAGGA	2	12	747999	748010	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017912	TTTTTC	2	12	790872	790883	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017912	GGATTT	2	12	803104	803115	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017912	TAAAAA	2	12	804923	804934	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017912	CACTGA	2	12	829656	829667	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017912	TCATTT	2	12	834203	834214	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017912	TTATAT	2	12	864983	864994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017912	GTGCTG	2	12	867834	867845	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017912	CATCTT	2	12	869685	869696	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017912	CCTTTC	2	12	907091	907102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017912	CTGATT	2	12	946534	946545	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017912	CGGCAG	2	12	1008938	1008949	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017912	TCTTTT	2	12	1025869	1025880	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017912	GAAAAG	2	12	1034334	1034345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017912	TTACTA	2	12	1039494	1039505	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017912	GGCTGC	2	12	1144617	1144628	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017912	ATAAAA	2	12	1159326	1159337	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017912	AAAAAT	2	12	1163846	1163857	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017912	TTAATT	2	12	1164111	1164122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017912	ATAAAA	2	12	1168494	1168505	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017912	ATAAGG	2	12	1174418	1174429	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017912	TGAAAT	2	12	1192498	1192509	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017912	GTAACA	2	12	1199048	1199059	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017912	GCGGAA	2	12	1282854	1282865	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017912	TAATTG	2	12	1361277	1361288	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017912	ATCATT	2	12	1374729	1374740	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017912	ATCATT	2	12	1377967	1377978	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017912	ATAAAA	2	12	1490183	1490194	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017912	ATCTAA	2	12	1505880	1505891	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017912	TTTGTC	2	12	1517299	1517310	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017912	AATAAA	2	12	1524684	1524695	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017912	ACAAAA	2	12	1524745	1524756	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017912	AATAAA	2	12	1525981	1525992	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017912	TCAAAC	2	12	1532531	1532542	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017912	CTTTTT	2	12	1576905	1576916	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017912	TCCGGT	2	12	1654855	1654866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017912	TTTGTT	2	12	1729096	1729107	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017912	AAAACA	2	12	1730907	1730918	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017912	CTCGCG	2	12	1731418	1731429	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017912	AAAGGA	2	12	1781014	1781025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017912	CTGAAA	2	12	1783349	1783360	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017912	GCTTGA	2	12	1857335	1857346	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017912	TAATTA	2	12	1861659	1861670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017912	CATTAA	2	12	1864937	1864948	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017912	GCCTTT	2	12	1865576	1865587	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017912	GCATAT	2	12	1881561	1881572	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017912	TTTCTT	2	12	1896965	1896976	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017912	CTATTT	2	12	1904950	1904961	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017912	TATCAA	2	12	1912502	1912513	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017912	AAAAAG	2	12	1916398	1916409	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017912	CTTAAA	2	12	1919082	1919093	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017912	AATAAA	2	12	1919249	1919260	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017912	AATAAA	2	12	1922994	1923005	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017912	ATCTTC	2	12	1934674	1934685	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017912	AATAAA	2	12	1935144	1935155	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017912	AATAAA	2	12	1936888	1936899	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017912	ATTACA	2	12	1943646	1943657	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017912	ATAAAA	2	12	1944251	1944262	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017912	TAACAA	2	12	1946505	1946516	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017912	AATAAA	2	12	1955848	1955859	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017912	ATAAAA	2	12	1956287	1956298	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017912	AATAAA	2	12	1970603	1970614	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017912	AATAAA	2	12	1970864	1970875	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017912	AATAAA	2	12	1977174	1977185	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017912	ATTTTT	2	12	1983360	1983371	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017912	AATAAA	2	12	1985458	1985469	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017912	AATAAA	2	12	1985547	1985558	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017912	TTTCCA	2	12	1985605	1985616	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017912	CACATT	2	12	1985956	1985967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017912	GAGATA	2	12	1991083	1991094	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017912	CTTGAT	2	12	1991741	1991752	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017912	AGATGA	2	12	1991954	1991965	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017912	TGGAGG	2	12	1993898	1993909	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017912	GAAAGC	2	12	2000132	2000143	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017912	TGTTCT	2	12	2017336	2017347	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017912	AACAAA	2	12	2024296	2024307	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017912	TAAAAA	2	12	2042776	2042787	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017912	CTCTAT	2	12	2075068	2075079	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017912	GTTCTG	2	12	2150980	2150991	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017912	ATTCAC	2	12	2155375	2155386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017912	CTTTAT	2	12	2163115	2163126	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017912	TTTTCA	2	12	2177539	2177550	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017912	ATAAAA	2	12	2183420	2183431	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017912	AAGAGA	2	12	2183497	2183508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017912	GACCAA	2	12	2191831	2191842	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017912	GCGTCA	2	12	2192157	2192168	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017912	TATTGC	2	12	2213466	2213477	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017912	CTTTTT	2	12	2224980	2224991	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017912	AATATT	2	12	2231088	2231099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017912	CCTTCC	2	12	2256768	2256779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_017912	TTTCCT	2	12	2271556	2271567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.