MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens Y2 chromosome

Total Repeats: 628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017912	ATATT	2	10	418	427	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017912	ATTAT	2	10	2184	2193	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017912	TCGTG	2	10	11111	11120	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017912	CATTC	2	10	11660	11669	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_017912	GGACG	2	10	11812	11821	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017912	CCTTT	2	10	15864	15873	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_017912	GAAAT	2	10	23511	23520	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017912	TCGTG	2	10	32677	32686	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017912	CATTC	2	10	33226	33235	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017912	GGACG	2	10	33378	33387	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017912	ACAAA	2	10	36477	36486	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017912	TTTTG	2	10	54072	54081	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017912	TAAAG	2	10	65037	65046	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017912	TAAAA	2	10	83724	83733	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017912	TCGTG	2	10	92533	92542	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017912	CATTC	2	10	93082	93091	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017912	GGACG	2	10	93234	93243	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017912	TCGTG	2	10	98360	98369	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017912	CATTC	2	10	98909	98918	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_017912	GGACG	2	10	99061	99070	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017912	TTACG	2	10	120812	120821	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017912	TAAAA	2	10	121452	121461	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017912	AAACA	2	10	149279	149288	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017912	TTGTG	2	10	154685	154694	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017912	TGCTT	2	10	155464	155473	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017912	CGGCC	2	10	159495	159504	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_017912	TCGTG	2	10	162953	162962	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017912	CATTC	2	10	163502	163511	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_017912	GGACG	2	10	163654	163663	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017912	GTTCA	2	10	166949	166958	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017912	TACAT	2	10	167217	167226	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017912	TCGTG	2	10	167869	167878	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017912	GGACG	2	10	168744	168753	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017912	TCGTG	2	10	173225	173234	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017912	CATTC	2	10	173774	173783	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_017912	GGACG	2	10	173926	173935	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017912	TTTTC	2	10	181769	181778	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017912	TTCCT	2	10	181837	181846	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017912	GATGA	2	10	197074	197083	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017912	AACAA	2	10	203871	203880	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017912	AGTAC	2	10	206358	206367	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017912	GAAAG	2	10	206793	206802	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017912	TTAGA	2	10	206803	206812	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017912	ACAAA	2	10	228874	228883	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017912	AAATT	2	10	231032	231041	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017912	TCCTT	2	10	233852	233861	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_017912	AATAA	2	10	248293	248302	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017912	TGATA	2	10	248366	248375	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017912	GAATA	2	10	251081	251090	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017912	TAAAA	2	10	258351	258360	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017912	AAATG	2	10	307584	307593	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017912	TATCA	2	10	356584	356593	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017912	ATCGG	2	10	407316	407325	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017912	AAGAA	2	10	425564	425573	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017912	AAGAC	2	10	425575	425584	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017912	ACGGG	2	10	437019	437028	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017912	TGCTG	2	10	437249	437258	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017912	TTTTA	2	10	441525	441534	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017912	CTCAA	2	10	442133	442142	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_017912	TGTAG	2	10	444119	444128	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017912	AGGAA	2	10	456170	456179	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017912	ATAAA	2	10	462673	462682	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017912	CAGTT	2	10	482729	482738	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017912	AGATT	2	10	494408	494417	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017912	AACTT	2	10	495025	495034	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017912	ATTTT	2	10	496454	496463	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017912	AATGA	2	10	499975	499984	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017912	AAATC	2	10	501850	501859	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017912	CTTTT	2	10	505125	505134	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017912	TGCTC	2	10	514461	514470	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_017912	AGGTA	2	10	515092	515101	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017912	AAAAT	2	10	517740	517749	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017912	TAACG	2	10	518049	518058	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017912	AGAAA	2	10	518403	518412	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017912	TATCT	2	10	523636	523645	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017912	TAAAC	2	10	536394	536403	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017912	CGCGG	2	10	537943	537952	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017912	TCGTA	2	10	551880	551889	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017912	AAAGG	2	10	555093	555102	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017912	TCCGC	2	10	559358	559367	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
81	NC_017912	GTTCG	2	10	561120	561129	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017912	CAAAA	2	10	569218	569227	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017912	TAAAA	2	10	575897	575906	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017912	AAATC	2	10	579237	579246	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017912	ATTCA	2	10	579274	579283	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017912	TCGTG	2	10	583789	583798	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017912	CATTC	2	10	584338	584347	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_017912	GGACG	2	10	584490	584499	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017912	AAACG	2	10	587722	587731	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017912	ATTTC	2	10	599857	599866	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017912	GATGA	2	10	614995	615004	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017912	TGAAT	2	10	632903	632912	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017912	ATTGA	2	10	637780	637789	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017912	GCGGG	2	10	640672	640681	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017912	AGGAA	2	10	662993	663002	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017912	CATTT	2	10	666344	666353	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017912	TATAA	2	10	680376	680385	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017912	TTTTG	2	10	688932	688941	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017912	CAATT	2	10	734095	734104	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017912	GAATA	2	10	737053	737062	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017912	GACCG	2	10	744443	744452	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_017912	AGGCC	2	10	747419	747428	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_017912	GGTCA	2	10	747897	747906	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017912	CGAAA	2	10	748757	748766	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017912	TTCAA	2	10	768175	768184	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017912	ATCAG	2	10	773523	773532	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017912	AATTA	2	10	782750	782759	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017912	AGGGC	2	10	790903	790912	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017912	TCCCC	2	10	815782	815791	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
110	NC_017912	TGATA	2	10	821214	821223	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017912	AATGA	2	10	828350	828359	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017912	TTATA	2	10	834185	834194	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017912	TTTTC	2	10	837418	837427	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017912	AAGGA	2	10	840436	840445	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017912	CCTTT	2	10	841430	841439	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_017912	TCGTG	2	10	859611	859620	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017912	CATTC	2	10	860160	860169	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_017912	GGACG	2	10	860312	860321	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017912	GTTTC	2	10	885216	885225	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017912	ATATA	2	10	904946	904955	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017912	TCAGC	2	10	906801	906810	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_017912	GTGAT	2	10	909563	909572	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017912	GGTTA	2	10	923144	923153	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017912	ATAAA	2	10	927784	927793	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017912	CTTTT	2	10	931955	931964	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017912	AAGTC	2	10	935289	935298	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017912	ATATT	2	10	937225	937234	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017912	GGAAG	2	10	941156	941165	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017912	AGTGG	2	10	968711	968720	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017912	TTTTG	2	10	976680	976689	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017912	ACTTC	2	10	980988	980997	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_017912	AAATT	2	10	986564	986573	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017912	ATTAC	2	10	987271	987280	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017912	TTTTC	2	10	989042	989051	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017912	AATAA	2	10	989064	989073	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017912	CAAAA	2	10	992279	992288	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017912	AGAAA	2	10	1011691	1011700	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017912	TGAAA	2	10	1028892	1028901	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017912	TGTGA	2	10	1029640	1029649	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017912	GATAG	2	10	1031904	1031913	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017912	CCGAT	2	10	1033073	1033082	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_017912	GATGC	2	10	1033657	1033666	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017912	AGGCA	2	10	1033796	1033805	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017912	TTTAT	2	10	1041522	1041531	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017912	AAATA	2	10	1075367	1075376	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_017912	CTTTT	2	10	1084544	1084553	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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455	NC_017912	CTTTT	2	10	2952747	2952756	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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466	NC_017912	CATTT	2	10	3045752	3045761	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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