MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens Y2 chromosome

Total Repeats: 2754

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017912	ATCGG	2	10	1049	1058	20 %	20 %	40 %	20 %	387896525
2	NC_017912	AATTT	2	10	2545	2554	40 %	60 %	0 %	0 %	387896526
3	NC_017912	AGTGA	2	10	4816	4825	40 %	20 %	40 %	0 %	387896528
4	NC_017912	TTGCA	2	10	5917	5926	20 %	40 %	20 %	20 %	387896530
5	NC_017912	GGGAC	2	10	6458	6467	20 %	0 %	60 %	20 %	387896530
6	NC_017912	TTCGG	2	10	7604	7613	0 %	40 %	40 %	20 %	387896531
7	NC_017912	ACGAT	2	10	8937	8946	40 %	20 %	20 %	20 %	387896531
8	NC_017912	CTTCA	2	10	15493	15502	20 %	40 %	0 %	40 %	387896532
9	NC_017912	AATAA	2	10	15810	15819	80 %	20 %	0 %	0 %	387896532
10	NC_017912	CTGAA	2	10	16784	16793	40 %	20 %	20 %	20 %	387896533
11	NC_017912	AAGAG	2	10	17331	17340	60 %	0 %	40 %	0 %	387896533
12	NC_017912	AGCAC	2	10	18396	18405	40 %	0 %	20 %	40 %	387896534
13	NC_017912	CGGAA	2	10	18408	18417	40 %	0 %	40 %	20 %	387896534
14	NC_017912	AGAGA	2	10	21043	21052	60 %	0 %	40 %	0 %	387896537
15	NC_017912	CCAAG	2	10	21957	21966	40 %	0 %	20 %	40 %	387896537
16	NC_017912	ATCTG	2	10	22523	22532	20 %	40 %	20 %	20 %	387896538
17	NC_017912	CCCGC	2	10	22988	22997	0 %	0 %	20 %	80 %	387896538
18	NC_017912	ACTCC	2	10	24920	24929	20 %	20 %	0 %	60 %	387896540
19	NC_017912	GTTTT	2	10	25884	25893	0 %	80 %	20 %	0 %	387896541
20	NC_017912	ATGAC	2	10	30106	30115	40 %	20 %	20 %	20 %	387896546
21	NC_017912	AGGCA	2	10	30791	30800	40 %	0 %	40 %	20 %	387896548
22	NC_017912	GAAGC	2	10	30983	30992	40 %	0 %	40 %	20 %	387896548
23	NC_017912	TTGCT	2	10	31125	31134	0 %	60 %	20 %	20 %	387896549
24	NC_017912	AAGAA	2	10	37136	37145	80 %	0 %	20 %	0 %	387896551
25	NC_017912	TGCTC	2	10	37373	37382	0 %	40 %	20 %	40 %	387896551
26	NC_017912	AAAGA	2	10	37780	37789	80 %	0 %	20 %	0 %	387896552
27	NC_017912	CTGAT	2	10	37816	37825	20 %	40 %	20 %	20 %	387896552
28	NC_017912	TGTGC	2	10	40467	40476	0 %	40 %	40 %	20 %	387896554
29	NC_017912	GAAAA	2	10	41767	41776	80 %	0 %	20 %	0 %	387896557
30	NC_017912	GCAGA	2	10	43751	43760	40 %	0 %	40 %	20 %	387896559
31	NC_017912	GCGAT	2	10	46753	46762	20 %	20 %	40 %	20 %	387896564
32	NC_017912	TGACA	2	10	48930	48939	40 %	20 %	20 %	20 %	387896565
33	NC_017912	AGATC	2	10	50567	50576	40 %	20 %	20 %	20 %	387896566
34	NC_017912	TCAAA	2	10	51584	51593	60 %	20 %	0 %	20 %	387896567
35	NC_017912	TGAAG	2	10	58398	58407	40 %	20 %	40 %	0 %	387896576
36	NC_017912	AAGCA	2	10	58452	58461	60 %	0 %	20 %	20 %	387896576
37	NC_017912	AACAC	2	10	61338	61347	60 %	0 %	0 %	40 %	387896580
38	NC_017912	TTTGC	2	10	63370	63379	0 %	60 %	20 %	20 %	387896581
39	NC_017912	AACGG	2	10	63599	63608	40 %	0 %	40 %	20 %	387896581
40	NC_017912	CGGCG	2	10	66122	66131	0 %	0 %	60 %	40 %	387896583
41	NC_017912	ATGAT	2	10	66247	66256	40 %	40 %	20 %	0 %	387896583
42	NC_017912	GACGG	2	10	66585	66594	20 %	0 %	60 %	20 %	387896583
43	NC_017912	GGAGA	2	10	68835	68844	40 %	0 %	60 %	0 %	387896584
44	NC_017912	GAAAG	2	10	71381	71390	60 %	0 %	40 %	0 %	387896590
45	NC_017912	GGCCT	2	10	72001	72010	0 %	20 %	40 %	40 %	387896591
46	NC_017912	TTTCA	2	10	72143	72152	20 %	60 %	0 %	20 %	387896591
47	NC_017912	GTTCG	2	10	73269	73278	0 %	40 %	40 %	20 %	387896591
48	NC_017912	TTATT	2	10	77967	77976	20 %	80 %	0 %	0 %	387896596
49	NC_017912	TGAAG	2	10	82473	82482	40 %	20 %	40 %	0 %	387896599
50	NC_017912	CGGAG	2	10	83001	83010	20 %	0 %	60 %	20 %	387896600
51	NC_017912	GATCA	2	10	83386	83395	40 %	20 %	20 %	20 %	387896600
52	NC_017912	CGGAA	2	10	84025	84034	40 %	0 %	40 %	20 %	387896601
53	NC_017912	AGAGC	2	10	85475	85484	40 %	0 %	40 %	20 %	387896602
54	NC_017912	GGCCG	2	10	89212	89221	0 %	0 %	60 %	40 %	387896608
55	NC_017912	GGGAC	2	10	103879	103888	20 %	0 %	60 %	20 %	387896612
56	NC_017912	TCAAA	2	10	104035	104044	60 %	20 %	0 %	20 %	387896612
57	NC_017912	GAACA	2	10	104764	104773	60 %	0 %	20 %	20 %	387896613
58	NC_017912	AAATG	2	10	107762	107771	60 %	20 %	20 %	0 %	387896614
59	NC_017912	CGGAA	2	10	109007	109016	40 %	0 %	40 %	20 %	387896615
60	NC_017912	CCGTA	2	10	109880	109889	20 %	20 %	20 %	40 %	387896616
61	NC_017912	GAAAA	2	10	114023	114032	80 %	0 %	20 %	0 %	387896621
62	NC_017912	CGGAA	2	10	114202	114211	40 %	0 %	40 %	20 %	387896621
63	NC_017912	GTTTG	2	10	115449	115458	0 %	60 %	40 %	0 %	387896622
64	NC_017912	TGAAT	2	10	119135	119144	40 %	40 %	20 %	0 %	387896629
65	NC_017912	TTGAA	2	10	121532	121541	40 %	40 %	20 %	0 %	387896633
66	NC_017912	GTGAA	2	10	126515	126524	40 %	20 %	40 %	0 %	387896636
67	NC_017912	ACCGG	2	10	127354	127363	20 %	0 %	40 %	40 %	387896636
68	NC_017912	GAAGA	2	10	128197	128206	60 %	0 %	40 %	0 %	387896636
69	NC_017912	CAAAG	2	10	128467	128476	60 %	0 %	20 %	20 %	387896636
70	NC_017912	GTGCT	2	10	129011	129020	0 %	40 %	40 %	20 %	387896636
71	NC_017912	CTGAC	2	10	129551	129560	20 %	20 %	20 %	40 %	387896636
72	NC_017912	GTCCT	2	10	129788	129797	0 %	40 %	20 %	40 %	387896636
73	NC_017912	CAATT	2	10	132031	132040	40 %	40 %	0 %	20 %	387896639
74	NC_017912	CTGAA	2	10	132262	132271	40 %	20 %	20 %	20 %	387896639
75	NC_017912	AAATG	2	10	133274	133283	60 %	20 %	20 %	0 %	387896639
76	NC_017912	GAGGG	2	10	135632	135641	20 %	0 %	80 %	0 %	387896641
77	NC_017912	CAAAA	2	10	136260	136269	80 %	0 %	0 %	20 %	387896642
78	NC_017912	AATCA	2	10	137587	137596	60 %	20 %	0 %	20 %	387896645
79	NC_017912	TGGTA	2	10	139949	139958	20 %	40 %	40 %	0 %	387896648
80	NC_017912	AAAGT	2	10	140864	140873	60 %	20 %	20 %	0 %	387896650
81	NC_017912	CAAAC	2	10	144860	144869	60 %	0 %	0 %	40 %	387896658
82	NC_017912	TAAAT	2	10	147709	147718	60 %	40 %	0 %	0 %	387896662
83	NC_017912	TTATC	2	10	150361	150370	20 %	60 %	0 %	20 %	387896664
84	NC_017912	TTAAA	2	10	152040	152049	60 %	40 %	0 %	0 %	387896665
85	NC_017912	CGTTT	2	10	153384	153393	0 %	60 %	20 %	20 %	387896667
86	NC_017912	ATGGA	2	10	153451	153460	40 %	20 %	40 %	0 %	387896667
87	NC_017912	CGAAG	2	10	154511	154520	40 %	0 %	40 %	20 %	387896668
88	NC_017912	GCACC	2	10	154540	154549	20 %	0 %	20 %	60 %	387896668
89	NC_017912	ATTCC	2	10	156287	156296	20 %	40 %	0 %	40 %	387896669
90	NC_017912	TTTTC	2	10	160197	160206	0 %	80 %	0 %	20 %	387896675
91	NC_017912	TTTGC	2	10	177074	177083	0 %	60 %	20 %	20 %	387896677
92	NC_017912	ATTAT	2	10	179484	179493	40 %	60 %	0 %	0 %	387896678
93	NC_017912	TTGAA	2	10	180134	180143	40 %	40 %	20 %	0 %	387896679
94	NC_017912	GCGAT	2	10	180176	180185	20 %	20 %	40 %	20 %	387896679
95	NC_017912	CGGAC	2	10	180898	180907	20 %	0 %	40 %	40 %	387896680
96	NC_017912	AATGG	2	10	181102	181111	40 %	20 %	40 %	0 %	387896680
97	NC_017912	TGGCT	2	10	184245	184254	0 %	40 %	40 %	20 %	387896682
98	NC_017912	GCGGA	2	10	184740	184749	20 %	0 %	60 %	20 %	387896683
99	NC_017912	CTTTT	2	10	186271	186280	0 %	80 %	0 %	20 %	387896685
100	NC_017912	TCCGA	2	10	186432	186441	20 %	20 %	20 %	40 %	387896685
101	NC_017912	TCCTT	2	10	188131	188140	0 %	60 %	0 %	40 %	387896686
102	NC_017912	TTTTG	2	10	191917	191926	0 %	80 %	20 %	0 %	387896689
103	NC_017912	CTGAA	2	10	192655	192664	40 %	20 %	20 %	20 %	387896689
104	NC_017912	ATCAG	2	10	195121	195130	40 %	20 %	20 %	20 %	387896691
105	NC_017912	TAAAA	2	10	197389	197398	80 %	20 %	0 %	0 %	387896693
106	NC_017912	CCGTT	2	10	197847	197856	0 %	40 %	20 %	40 %	387896694
107	NC_017912	AAGAT	2	10	198945	198954	60 %	20 %	20 %	0 %	387896695
108	NC_017912	CTGAG	2	10	200478	200487	20 %	20 %	40 %	20 %	387896697
109	NC_017912	AGTGA	2	10	200861	200870	40 %	20 %	40 %	0 %	387896697
110	NC_017912	CATTG	2	10	201083	201092	20 %	40 %	20 %	20 %	387896698
111	NC_017912	GGAAG	2	10	201772	201781	40 %	0 %	60 %	0 %	387896698
112	NC_017912	ATGAA	2	10	203592	203601	60 %	20 %	20 %	0 %	387896699
113	NC_017912	CTGCA	2	10	206015	206024	20 %	20 %	20 %	40 %	387896702
114	NC_017912	TCATT	2	10	211735	211744	20 %	60 %	0 %	20 %	387896706
115	NC_017912	CTTGG	2	10	212091	212100	0 %	40 %	40 %	20 %	387896707
116	NC_017912	GGATC	2	10	214537	214546	20 %	20 %	40 %	20 %	387896709
117	NC_017912	AATAA	2	10	216086	216095	80 %	20 %	0 %	0 %	387896711
118	NC_017912	AATTT	2	10	217587	217596	40 %	60 %	0 %	0 %	387896713
119	NC_017912	CTTTG	2	10	217781	217790	0 %	60 %	20 %	20 %	387896713
120	NC_017912	CGGGG	2	10	220123	220132	0 %	0 %	80 %	20 %	387896715
121	NC_017912	TTTTA	2	10	222344	222353	20 %	80 %	0 %	0 %	387896718
122	NC_017912	GATGC	2	10	222837	222846	20 %	20 %	40 %	20 %	387896718
123	NC_017912	AATCA	2	10	222947	222956	60 %	20 %	0 %	20 %	387896718
124	NC_017912	ATTGG	2	10	225915	225924	20 %	40 %	40 %	0 %	387896723
125	NC_017912	ATCGT	2	10	228023	228032	20 %	40 %	20 %	20 %	387896725
126	NC_017912	AAATG	2	10	233201	233210	60 %	20 %	20 %	0 %	387896730
127	NC_017912	CATGG	2	10	233463	233472	20 %	20 %	40 %	20 %	387896730
128	NC_017912	GAACG	2	10	234677	234686	40 %	0 %	40 %	20 %	387896731
129	NC_017912	TGAGC	2	10	235138	235147	20 %	20 %	40 %	20 %	387896731
130	NC_017912	GCCCG	2	10	235668	235677	0 %	0 %	40 %	60 %	387896731
131	NC_017912	CAGAT	2	10	236652	236661	40 %	20 %	20 %	20 %	387896732
132	NC_017912	TGAAG	2	10	236706	236715	40 %	20 %	40 %	0 %	387896732
133	NC_017912	TTTGC	2	10	236882	236891	0 %	60 %	20 %	20 %	387896732
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