MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens Y2 chromosome

Total Repeats: 1935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017912	CCTC	2	8	72	79	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_017912	CTTA	2	8	103	110	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017912	TAAA	2	8	9992	9999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017912	AGTC	2	8	10018	10025	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017912	CCTG	2	8	10161	10168	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017912	GTGA	2	8	10443	10450	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017912	AGCC	2	8	11497	11504	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017912	AAGC	2	8	11848	11855	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017912	CACG	2	8	12544	12551	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017912	GCGA	2	8	13332	13339	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017912	TAGG	2	8	13907	13914	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017912	CGGG	2	8	14003	14010	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017912	ATCG	2	8	14668	14675	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017912	AAGA	2	8	18926	18933	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017912	ATCT	2	8	19003	19010	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017912	TGAA	2	8	26468	26475	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017912	ATTT	2	8	27723	27730	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017912	TAAG	2	8	27829	27836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017912	GGAA	2	8	27891	27898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017912	ATAA	2	8	30175	30182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017912	TAAA	2	8	31558	31565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017912	AGTC	2	8	31584	31591	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017912	CCTG	2	8	31727	31734	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017912	GTGA	2	8	32009	32016	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017912	AGCC	2	8	33063	33070	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017912	AAGC	2	8	33414	33421	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017912	CACG	2	8	34110	34117	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017912	GCGA	2	8	34898	34905	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017912	TAGG	2	8	35473	35480	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017912	CGGG	2	8	35569	35576	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017912	ATCG	2	8	36234	36241	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017912	AATA	2	8	36917	36924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017912	AATG	2	8	40856	40863	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017912	TTGT	2	8	46295	46302	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017912	AGTA	2	8	46319	46326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017912	TTTA	2	8	46501	46508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017912	ATAG	2	8	46563	46570	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017912	CTTC	2	8	49562	49569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017912	GCAA	2	8	51040	51047	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017912	ATTC	2	8	52586	52593	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017912	TGTA	2	8	56781	56788	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017912	CCCG	2	8	60434	60441	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_017912	GAGG	2	8	60487	60494	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017912	ATAA	2	8	61070	61077	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017912	GAAA	2	8	61235	61242	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017912	ATCT	2	8	70147	70154	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017912	TTTA	2	8	70540	70547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017912	AAAC	2	8	70557	70564	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017912	GCCG	2	8	75775	75782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017912	CTGC	2	8	77837	77844	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017912	TAAA	2	8	91414	91421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017912	AGTC	2	8	91440	91447	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017912	CCTG	2	8	91583	91590	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017912	GTGA	2	8	91865	91872	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017912	AGCC	2	8	92919	92926	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017912	AAGC	2	8	93270	93277	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017912	CACG	2	8	93966	93973	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017912	GCGA	2	8	94754	94761	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017912	TAGG	2	8	95329	95336	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017912	CGGG	2	8	95425	95432	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017912	ATCG	2	8	96090	96097	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017912	CATT	2	8	96854	96861	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017912	TTGA	2	8	97169	97176	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017912	TAAA	2	8	97241	97248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017912	AGTC	2	8	97267	97274	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017912	CCTG	2	8	97410	97417	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017912	GTGA	2	8	97692	97699	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017912	AGCC	2	8	98746	98753	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017912	AAGC	2	8	99097	99104	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017912	CACG	2	8	99793	99800	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017912	GCGA	2	8	100581	100588	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017912	TAGG	2	8	101156	101163	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017912	CGGG	2	8	101252	101259	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017912	ATCG	2	8	101917	101924	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017912	AGAA	2	8	113428	113435	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017912	TCTA	2	8	117465	117472	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017912	AATG	2	8	118206	118213	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017912	GGGA	2	8	118734	118741	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017912	AGCT	2	8	119369	119376	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017912	TCAT	2	8	119387	119394	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017912	TCTT	2	8	122734	122741	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017912	TGAT	2	8	126381	126388	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017912	TCGT	2	8	130899	130906	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017912	AAAT	2	8	130990	130997	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017912	GCTT	2	8	133684	133691	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017912	TAAA	2	8	136084	136091	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017912	GACG	2	8	139250	139257	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017912	TATC	2	8	139486	139493	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017912	CCGC	2	8	139643	139650	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_017912	TACT	2	8	141398	141405	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017912	TCGT	2	8	141527	141534	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017912	AAAT	2	8	141714	141721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017912	AAGG	2	8	142066	142073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017912	CAAA	2	8	143974	143981	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017912	GTGA	2	8	145451	145458	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017912	AAAG	2	8	146973	146980	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017912	GATT	2	8	147086	147093	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017912	ATCA	2	8	148340	148347	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017912	TAAT	2	8	148853	148860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017912	TTTG	2	8	149660	149667	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017912	TTAT	2	8	149709	149716	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017912	AGAT	2	8	150005	150012	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017912	GTAT	2	8	154648	154655	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017912	TTAA	2	8	155186	155193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017912	TTGT	2	8	155695	155702	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017912	TGGC	2	8	157116	157123	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017912	GGGA	2	8	157616	157623	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017912	TCCT	2	8	160073	160080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017912	TAAA	2	8	161834	161841	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017912	AGTC	2	8	161860	161867	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017912	CCTG	2	8	162003	162010	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017912	GTGA	2	8	162285	162292	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017912	AGCC	2	8	163339	163346	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017912	AAGC	2	8	163690	163697	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017912	CACG	2	8	164386	164393	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017912	GCGA	2	8	165174	165181	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017912	TAGG	2	8	165749	165756	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017912	CGGG	2	8	165845	165852	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017912	ATCG	2	8	166510	166517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017912	TAAT	2	8	167053	167060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017912	AATA	2	8	167168	167175	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017912	ATTG	2	8	167335	167342	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017912	AGCC	2	8	168255	168262	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017912	AAGC	2	8	168780	168787	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017912	CACG	2	8	169476	169483	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017912	GCGA	2	8	170264	170271	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017912	TAGG	2	8	170839	170846	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017912	CGGG	2	8	170935	170942	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017912	ATCG	2	8	171600	171607	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017912	TAAA	2	8	172106	172113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017912	AGTC	2	8	172132	172139	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017912	CCTG	2	8	172275	172282	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017912	GTGA	2	8	172557	172564	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017912	AGCC	2	8	173611	173618	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017912	AAGC	2	8	173962	173969	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017912	CACG	2	8	174658	174665	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017912	GCGA	2	8	175446	175453	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017912	TAGG	2	8	176021	176028	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017912	CGGG	2	8	176117	176124	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017912	ATCG	2	8	176782	176789	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017912	TTAT	2	8	181779	181786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017912	GCCT	2	8	181889	181896	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017912	AATG	2	8	183475	183482	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017912	GAAT	2	8	188282	188289	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017912	CATT	2	8	189936	189943	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017912	AAAT	2	8	189976	189983	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017912	TCCC	2	8	194563	194570	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
148	NC_017912	CCTG	2	8	198761	198768	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017912	ATAA	2	8	206085	206092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017912	GCTT	2	8	206471	206478	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017912	GAAT	2	8	206959	206966	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017912	TGAA	2	8	207087	207094	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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