MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens Y2 chromosome

Total Repeats: 10352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017912	CTGG	2	8	841	848	0 %	25 %	50 %	25 %	387896525
2	NC_017912	TTTA	2	8	1123	1130	25 %	75 %	0 %	0 %	387896525
3	NC_017912	AACA	2	8	1353	1360	75 %	0 %	0 %	25 %	387896525
4	NC_017912	CAAA	2	8	1405	1412	75 %	0 %	0 %	25 %	387896525
5	NC_017912	GATT	2	8	1488	1495	25 %	50 %	25 %	0 %	387896525
6	NC_017912	GAAA	2	8	1542	1549	75 %	0 %	25 %	0 %	387896525
7	NC_017912	GAAA	2	8	1999	2006	75 %	0 %	25 %	0 %	387896525
8	NC_017912	TCAT	2	8	2373	2380	25 %	50 %	0 %	25 %	387896526
9	NC_017912	CGAT	2	8	2413	2420	25 %	25 %	25 %	25 %	387896526
10	NC_017912	GCTG	2	8	3158	3165	0 %	25 %	50 %	25 %	387896526
11	NC_017912	TTCA	2	8	3194	3201	25 %	50 %	0 %	25 %	387896526
12	NC_017912	GAGC	2	8	3583	3590	25 %	0 %	50 %	25 %	387896527
13	NC_017912	GAAG	2	8	3923	3930	50 %	0 %	50 %	0 %	387896528
14	NC_017912	TCAG	2	8	4023	4030	25 %	25 %	25 %	25 %	387896528
15	NC_017912	GACA	2	8	4945	4952	50 %	0 %	25 %	25 %	387896529
16	NC_017912	GAAA	2	8	4953	4960	75 %	0 %	25 %	0 %	387896529
17	NC_017912	CCGT	2	8	4969	4976	0 %	25 %	25 %	50 %	387896529
18	NC_017912	CGGT	2	8	5386	5393	0 %	25 %	50 %	25 %	387896530
19	NC_017912	CGTC	2	8	5509	5516	0 %	25 %	25 %	50 %	387896530
20	NC_017912	GCGG	2	8	6438	6445	0 %	0 %	75 %	25 %	387896530
21	NC_017912	TCAG	2	8	7317	7324	25 %	25 %	25 %	25 %	387896531
22	NC_017912	AATG	2	8	7432	7439	50 %	25 %	25 %	0 %	387896531
23	NC_017912	ATCA	2	8	7993	8000	50 %	25 %	0 %	25 %	387896531
24	NC_017912	AGAA	2	8	8044	8051	75 %	0 %	25 %	0 %	387896531
25	NC_017912	ACAA	2	8	8238	8245	75 %	0 %	0 %	25 %	387896531
26	NC_017912	ACTG	2	8	8521	8528	25 %	25 %	25 %	25 %	387896531
27	NC_017912	ATCA	2	8	8607	8614	50 %	25 %	0 %	25 %	387896531
28	NC_017912	CTGA	2	8	9236	9243	25 %	25 %	25 %	25 %	387896531
29	NC_017912	CGTC	2	8	9640	9647	0 %	25 %	25 %	50 %	387896531
30	NC_017912	TTTA	2	8	15778	15785	25 %	75 %	0 %	0 %	387896532
31	NC_017912	GGAC	2	8	17227	17234	25 %	0 %	50 %	25 %	387896533
32	NC_017912	ATGA	2	8	17567	17574	50 %	25 %	25 %	0 %	387896534
33	NC_017912	AATG	2	8	18050	18057	50 %	25 %	25 %	0 %	387896534
34	NC_017912	TGAA	2	8	18115	18122	50 %	25 %	25 %	0 %	387896534
35	NC_017912	CAAG	2	8	18593	18600	50 %	0 %	25 %	25 %	387896534
36	NC_017912	TACA	2	8	18740	18747	50 %	25 %	0 %	25 %	387896534
37	NC_017912	AATG	2	8	19327	19334	50 %	25 %	25 %	0 %	387896535
38	NC_017912	TAAA	2	8	19464	19471	75 %	25 %	0 %	0 %	387896535
39	NC_017912	CGGG	2	8	20157	20164	0 %	0 %	75 %	25 %	387896536
40	NC_017912	TATT	2	8	20418	20425	25 %	75 %	0 %	0 %	387896536
41	NC_017912	TGAT	2	8	20935	20942	25 %	50 %	25 %	0 %	387896537
42	NC_017912	GCTT	2	8	21708	21715	0 %	50 %	25 %	25 %	387896537
43	NC_017912	CGTC	2	8	23117	23124	0 %	25 %	25 %	50 %	387896538
44	NC_017912	CTTT	2	8	23330	23337	0 %	75 %	0 %	25 %	387896538
45	NC_017912	GCAT	2	8	24157	24164	25 %	25 %	25 %	25 %	387896539
46	NC_017912	AAAT	2	8	24265	24272	75 %	25 %	0 %	0 %	387896539
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49	NC_017912	GAAA	2	8	25237	25244	75 %	0 %	25 %	0 %	387896541
50	NC_017912	TTAA	2	8	25286	25293	50 %	50 %	0 %	0 %	387896541
51	NC_017912	CGGC	2	8	26273	26280	0 %	0 %	50 %	50 %	387896541
52	NC_017912	TAAT	2	8	26726	26733	50 %	50 %	0 %	0 %	387896542
53	NC_017912	ATAA	2	8	26925	26932	75 %	25 %	0 %	0 %	387896542
54	NC_017912	TTTG	2	8	26987	26994	0 %	75 %	25 %	0 %	387896542
55	NC_017912	ATGA	2	8	27166	27173	50 %	25 %	25 %	0 %	387896543
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57	NC_017912	ATCA	2	8	28001	28008	50 %	25 %	0 %	25 %	387896544
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60	NC_017912	GAAG	2	8	29408	29415	50 %	0 %	50 %	0 %	387896545
61	NC_017912	CAAC	2	8	30609	30616	50 %	0 %	0 %	50 %	387896547
62	NC_017912	GAAG	2	8	30761	30768	50 %	0 %	50 %	0 %	387896547
63	NC_017912	ACAG	2	8	30885	30892	50 %	0 %	25 %	25 %	387896548
64	NC_017912	ATGA	2	8	36595	36602	50 %	25 %	25 %	0 %	387896550
65	NC_017912	TCGT	2	8	36743	36750	0 %	50 %	25 %	25 %	387896550
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67	NC_017912	CAGT	2	8	37075	37082	25 %	25 %	25 %	25 %	387896551
68	NC_017912	TGAG	2	8	37423	37430	25 %	25 %	50 %	0 %	387896551
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70	NC_017912	GCCG	2	8	38667	38674	0 %	0 %	50 %	50 %	387896552
71	NC_017912	TTTC	2	8	39001	39008	0 %	75 %	0 %	25 %	387896553
72	NC_017912	CATG	2	8	39169	39176	25 %	25 %	25 %	25 %	387896553
73	NC_017912	ACTT	2	8	39260	39267	25 %	50 %	0 %	25 %	387896553
74	NC_017912	GCGG	2	8	39697	39704	0 %	0 %	75 %	25 %	387896553
75	NC_017912	GCTG	2	8	39793	39800	0 %	25 %	50 %	25 %	387896553
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84	NC_017912	TTCA	2	8	42397	42404	25 %	50 %	0 %	25 %	387896557
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90	NC_017912	TTTA	2	8	44537	44544	25 %	75 %	0 %	0 %	387896560
91	NC_017912	GAAA	2	8	44902	44909	75 %	0 %	25 %	0 %	387896561
92	NC_017912	ACAG	2	8	45401	45408	50 %	0 %	25 %	25 %	387896562
93	NC_017912	AAAC	2	8	45769	45776	75 %	0 %	0 %	25 %	387896562
94	NC_017912	TACG	2	8	46146	46153	25 %	25 %	25 %	25 %	387896563
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103	NC_017912	GAAA	2	8	50411	50418	75 %	0 %	25 %	0 %	387896566
104	NC_017912	GAAA	2	8	50444	50451	75 %	0 %	25 %	0 %	387896566
105	NC_017912	GAAA	2	8	50920	50927	75 %	0 %	25 %	0 %	387896566
106	NC_017912	AATT	2	8	50949	50956	50 %	50 %	0 %	0 %	387896566
107	NC_017912	GATG	2	8	51428	51435	25 %	25 %	50 %	0 %	387896567
108	NC_017912	TCAT	2	8	51938	51945	25 %	50 %	0 %	25 %	387896568
109	NC_017912	TCCT	2	8	52140	52147	0 %	50 %	0 %	50 %	387896568
110	NC_017912	AAGC	2	8	52331	52338	50 %	0 %	25 %	25 %	387896568
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112	NC_017912	GAAA	2	8	52887	52894	75 %	0 %	25 %	0 %	387896569
113	NC_017912	ATGA	2	8	52910	52917	50 %	25 %	25 %	0 %	387896569
114	NC_017912	CTGA	2	8	53985	53992	25 %	25 %	25 %	25 %	387896570
115	NC_017912	AATC	2	8	54568	54575	50 %	25 %	0 %	25 %	387896572
116	NC_017912	ATCA	2	8	55561	55568	50 %	25 %	0 %	25 %	387896573
117	NC_017912	AGGC	2	8	55817	55824	25 %	0 %	50 %	25 %	387896573
118	NC_017912	TGAA	2	8	56176	56183	50 %	25 %	25 %	0 %	387896573
119	NC_017912	TGAA	2	8	56577	56584	50 %	25 %	25 %	0 %	387896574
120	NC_017912	CATC	2	8	56955	56962	25 %	25 %	0 %	50 %	387896575
121	NC_017912	TGAT	2	8	57000	57007	25 %	50 %	25 %	0 %	387896575
122	NC_017912	TGAA	2	8	57725	57732	50 %	25 %	25 %	0 %	387896576
123	NC_017912	GAAA	2	8	57876	57883	75 %	0 %	25 %	0 %	387896576
124	NC_017912	TTAT	2	8	58199	58206	25 %	75 %	0 %	0 %	387896576
125	NC_017912	TAAA	2	8	58709	58716	75 %	25 %	0 %	0 %	387896576
126	NC_017912	CGGC	2	8	59456	59463	0 %	0 %	50 %	50 %	387896577
127	NC_017912	ATGC	2	8	59516	59523	25 %	25 %	25 %	25 %	387896577
128	NC_017912	TATT	2	8	59710	59717	25 %	75 %	0 %	0 %	387896577
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131	NC_017912	TGAG	2	8	60092	60099	25 %	25 %	50 %	0 %	387896578
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135	NC_017912	GTTT	2	8	60648	60655	0 %	75 %	25 %	0 %	387896579
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137	NC_017912	AAAG	2	8	61454	61461	75 %	0 %	25 %	0 %	387896581
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