MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia blattae DSM 4481 chromosome

Total Repeats: 396

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017910	AACTG	2	10	25662	25671	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017910	GACCG	2	10	28637	28646	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017910	TAACA	2	10	54014	54023	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017910	GGGGA	2	10	55829	55838	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017910	ATCGC	2	10	64462	64471	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017910	TCATT	2	10	92309	92318	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017910	CCGGC	2	10	103221	103230	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8	NC_017910	GCAGC	2	10	126198	126207	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_017910	AGAAA	2	10	136257	136266	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017910	AAAAT	2	10	158909	158918	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017910	CCGGG	2	10	182587	182596	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017910	CGGCA	2	10	189414	189423	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017910	CACTA	2	10	189452	189461	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017910	ACGCA	2	10	222604	222613	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017910	GGCGC	2	10	240271	240280	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017910	GACCG	2	10	249436	249445	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017910	TCGAA	2	10	294452	294461	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017910	AAACT	2	10	303762	303771	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017910	AACTT	2	10	304344	304353	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017910	TTGAA	2	10	333544	333553	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017910	GCTTC	2	10	335282	335291	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_017910	CGTTT	2	10	342420	342429	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017910	GAAGC	2	10	385481	385490	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017910	CGGCG	2	10	385515	385524	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_017910	TTGCC	2	10	390520	390529	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017910	GTAAA	2	10	408034	408043	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017910	TTAAA	2	10	419811	419820	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017910	AGGTT	2	10	421295	421304	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017910	CGTCC	2	10	423733	423742	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_017910	GCTTA	2	10	440026	440035	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017910	CCCGG	2	10	444192	444201	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_017910	GGAGG	2	10	458525	458534	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017910	CAGGG	2	10	458550	458559	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017910	ACACA	2	10	466652	466661	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017910	CAGGG	2	10	475694	475703	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017910	TGGTG	2	10	494885	494894	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017910	CCTGC	2	10	494983	494992	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_017910	TCATC	2	10	508213	508222	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017910	TTGTT	2	10	510660	510669	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017910	TTTTA	2	10	515950	515959	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017910	CGTAA	2	10	516990	516999	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017910	CATAT	2	10	533117	533126	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017910	AAGAA	2	10	533233	533242	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017910	TTATT	2	10	533751	533760	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017910	TTTTG	2	10	533875	533884	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017910	TTGCT	2	10	547244	547253	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017910	GAACA	2	10	552692	552701	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017910	GGTGC	2	10	564029	564038	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017910	ATTAA	2	10	604178	604187	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017910	CCAGG	2	10	613705	613714	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_017910	GGGTG	2	10	615384	615393	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017910	TTATG	2	10	616387	616396	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017910	GTGCT	2	10	634977	634986	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017910	GAACC	2	10	652852	652861	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_017910	GAGTT	2	10	658523	658532	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017910	GTTCT	2	10	658670	658679	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017910	GGACA	2	10	660588	660597	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017910	GCAGG	2	10	662603	662612	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017910	AACTC	2	10	705986	705995	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_017910	GGACA	2	10	716735	716744	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017910	GTGAT	2	10	725369	725378	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017910	TTAAA	2	10	727295	727304	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017910	CCGCT	2	10	735181	735190	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
64	NC_017910	GTGAA	2	10	759867	759876	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017910	GTCAG	2	10	769430	769439	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017910	AGGGC	2	10	773807	773816	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017910	TAAAG	2	10	775442	775451	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017910	CCCCG	2	10	791448	791457	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
69	NC_017910	AAACA	2	10	796406	796415	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017910	CCGGG	2	10	800735	800744	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
71	NC_017910	CCTGA	2	10	835191	835200	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_017910	GGACG	2	10	844135	844144	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017910	CCCGG	2	10	850426	850435	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
74	NC_017910	CCCGG	2	10	873559	873568	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
75	NC_017910	GTTTT	2	10	875069	875078	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017910	AAAGG	2	10	880746	880755	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017910	CTTTT	2	10	905159	905168	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017910	CTTAT	2	10	907646	907655	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017910	CACAA	2	10	913049	913058	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_017910	AGAAA	2	10	914687	914696	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017910	TTTAT	2	10	918161	918170	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017910	GAGGG	2	10	920649	920658	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017910	GCTCC	2	10	929363	929372	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
84	NC_017910	CTTTC	2	10	938027	938036	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_017910	GGCAA	2	10	938150	938159	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017910	GCCTG	2	10	942350	942359	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_017910	GGTAT	2	10	962199	962208	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017910	TTATA	2	10	966280	966289	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017910	TAATT	2	10	966375	966384	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017910	AAATG	2	10	977814	977823	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017910	TTGAA	2	10	991297	991306	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017910	GCTTC	2	10	993035	993044	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017910	GTAGG	2	10	1003855	1003864	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017910	CCGGG	2	10	1027646	1027655	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
95	NC_017910	GACCG	2	10	1048848	1048857	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
96	NC_017910	GCCAG	2	10	1049066	1049075	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_017910	GGGGA	2	10	1059745	1059754	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017910	ATTTT	2	10	1060511	1060520	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017910	TAAGC	2	10	1082877	1082886	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017910	GCCGG	2	10	1092778	1092787	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
101	NC_017910	TTTTC	2	10	1113581	1113590	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017910	TGCTG	2	10	1132266	1132275	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017910	GCATG	2	10	1145730	1145739	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017910	GCATG	2	10	1145850	1145859	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017910	AATGA	2	10	1149692	1149701	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017910	GCGGT	2	10	1157348	1157357	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017910	GAGCA	2	10	1160702	1160711	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017910	GTATG	2	10	1179335	1179344	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017910	ATAAC	2	10	1232289	1232298	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017910	GTATT	2	10	1249426	1249435	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017910	GCAGG	2	10	1272589	1272598	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017910	CCTGT	2	10	1276917	1276926	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_017910	CACAA	2	10	1277157	1277166	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_017910	TGCCT	2	10	1285751	1285760	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_017910	TCGAT	2	10	1290427	1290436	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017910	GGGCA	2	10	1290763	1290772	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017910	GATGC	2	10	1293233	1293242	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017910	AGCGT	2	10	1296833	1296842	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017910	ATTTT	2	10	1297084	1297093	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017910	GAACA	2	10	1303795	1303804	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017910	CCCGG	2	10	1359516	1359525	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
122	NC_017910	TTAAA	2	10	1371502	1371511	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017910	TAACA	2	10	1371819	1371828	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017910	CCGCC	2	10	1377115	1377124	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
125	NC_017910	GTGGC	2	10	1395043	1395052	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017910	TTTTA	2	10	1395905	1395914	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017910	TATCT	2	10	1402310	1402319	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017910	TTCAC	2	10	1412046	1412055	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_017910	ATTAA	2	10	1428965	1428974	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017910	AAAAC	2	10	1443901	1443910	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017910	GTAAC	2	10	1460802	1460811	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017910	TCGAT	2	10	1460962	1460971	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017910	AAACA	2	10	1467777	1467786	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017910	CGGTA	2	10	1484475	1484484	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017910	TAATA	2	10	1486213	1486222	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017910	TTAAA	2	10	1486864	1486873	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017910	TTAAA	2	10	1487869	1487878	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017910	GTCAG	2	10	1492704	1492713	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017910	GTAAT	2	10	1521744	1521753	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017910	TATTT	2	10	1522111	1522120	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017910	GTCTT	2	10	1537483	1537492	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017910	AATCA	2	10	1537591	1537600	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017910	AGTGG	2	10	1542062	1542071	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017910	CGGTG	2	10	1565125	1565134	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017910	GGCGT	2	10	1565141	1565150	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017910	AAAAT	2	10	1565178	1565187	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017910	AACCT	2	10	1565195	1565204	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_017910	CATTG	2	10	1571767	1571776	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_017910	CAGAT	2	10	1575755	1575764	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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156	NC_017910	GTGAA	2	10	1709430	1709439	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_017910	TAATA	2	10	1757083	1757092	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017910	AAAAT	2	10	1759392	1759401	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017910	AAATT	2	10	1763099	1763108	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_017910	TATTC	2	10	1822844	1822853	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
170	NC_017910	ACTGG	2	10	1822874	1822883	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
171	NC_017910	ATAGA	2	10	1834155	1834164	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_017910	ACCTG	2	10	1836371	1836380	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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181	NC_017910	CCGGT	2	10	1956491	1956500	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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184	NC_017910	TTTAC	2	10	1974657	1974666	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_017910	CCGTT	2	10	2032756	2032765	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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262	NC_017910	ATTTG	2	10	2750772	2750781	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
263	NC_017910	ATTTT	2	10	2756274	2756283	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_017910	GGCCA	2	10	2770043	2770052	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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273	NC_017910	TAAAA	2	10	2842130	2842139	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_017910	TAACA	2	10	2858689	2858698	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
278	NC_017910	CATAT	2	10	2877333	2877342	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
279	NC_017910	ATAAA	2	10	2879142	2879151	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_017910	TAAAA	2	10	2883879	2883888	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_017910	CTGGT	2	10	2950953	2950962	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
282	NC_017910	GACCT	2	10	2952885	2952894	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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284	NC_017910	AAGCA	2	10	2956806	2956815	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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286	NC_017910	CATAG	2	10	2961151	2961160	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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385	NC_017910	TCAGG	2	10	4018213	4018222	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
386	NC_017910	ATGAT	2	10	4032196	4032205	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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391	NC_017910	TAAGG	2	10	4091711	4091720	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
392	NC_017910	TTCAA	2	10	4093250	4093259	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
393	NC_017910	CCGGC	2	10	4127623	4127632	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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395	NC_017910	CGTCC	2	10	4137510	4137519	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.