MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella noatunensis subsp. orientalis str. Toba 04 chromosome

Total Repeats: 429

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017909	AAATG	2	10	3838	3847	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017909	AGCAA	2	10	3853	3862	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017909	CATTT	2	10	6317	6326	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017909	CTTGG	2	10	27619	27628	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017909	TTAGT	2	10	28761	28770	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017909	ATAGT	2	10	29269	29278	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017909	ATGGG	2	10	32772	32781	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017909	AATTT	2	10	33738	33747	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017909	TAATT	2	10	33833	33842	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017909	ATAAA	2	10	34084	34093	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017909	ATGAC	2	10	35458	35467	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017909	TGGAT	2	10	35648	35657	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017909	TAGTT	2	10	37357	37366	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017909	GATTT	2	10	42969	42978	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017909	TTAAA	2	10	48571	48580	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017909	CTATA	2	10	56425	56434	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017909	AAAAT	2	10	56451	56460	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017909	TATTT	2	10	57041	57050	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017909	ATATT	2	10	57063	57072	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017909	TCAAG	2	10	59024	59033	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017909	ACAAT	2	10	59617	59626	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017909	GTAGA	2	10	59829	59838	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017909	TTAAA	2	10	61438	61447	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017909	GCTGT	2	10	79544	79553	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017909	GCCCT	2	10	85808	85817	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_017909	CTTAA	2	10	89001	89010	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017909	CTAAA	2	10	90385	90394	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017909	CTTAG	2	10	91041	91050	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017909	ATTGT	2	10	99978	99987	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017909	AATTT	2	10	101830	101839	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017909	TATGT	2	10	115562	115571	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017909	ATGTA	2	10	132262	132271	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017909	TTATC	2	10	132272	132281	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017909	TGTCG	2	10	137039	137048	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017909	TGGTT	2	10	140719	140728	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017909	TCTCT	2	10	141026	141035	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_017909	AATAA	2	10	165645	165654	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017909	ATAGT	2	10	168942	168951	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017909	TTGGA	2	10	184811	184820	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017909	AAGAA	2	10	185443	185452	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017909	TACTA	2	10	197489	197498	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017909	TGATC	2	10	197845	197854	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017909	TAAAT	2	10	199078	199087	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017909	TCTTT	2	10	204866	204875	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017909	TAATA	2	10	208426	208435	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017909	ATCAA	2	10	234270	234279	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017909	AAGTA	2	10	245163	245172	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017909	GTTTA	2	10	251435	251444	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017909	GATTT	2	10	259431	259440	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017909	CAGTA	2	10	267587	267596	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017909	GTGAT	2	10	268570	268579	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017909	TACTA	2	10	268936	268945	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017909	AATAG	2	10	269477	269486	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017909	TTATA	2	10	270659	270668	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017909	TTTGC	2	10	273599	273608	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017909	ATTTT	2	10	273982	273991	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017909	TCAAA	2	10	276597	276606	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017909	ATTTA	2	10	278324	278333	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017909	AGATA	2	10	280243	280252	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017909	ATAAA	2	10	280428	280437	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017909	ATTTA	2	10	286277	286286	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017909	AATTG	2	10	291238	291247	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017909	AAAAG	2	10	297004	297013	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017909	ATGGT	2	10	297064	297073	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017909	AAATC	2	10	301125	301134	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017909	AATAG	2	10	303236	303245	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017909	CTTGA	2	10	303481	303490	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017909	ATTTA	2	10	308611	308620	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017909	TAAAT	2	10	312960	312969	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017909	ACTAC	2	10	313663	313672	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_017909	ATTAA	2	10	315302	315311	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017909	AAAAT	2	10	316258	316267	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017909	ACTAA	2	10	319240	319249	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017909	AACAG	2	10	322162	322171	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017909	TTATA	2	10	328550	328559	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017909	GACTT	2	10	334446	334455	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017909	TAAAA	2	10	338470	338479	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017909	TAATG	2	10	338869	338878	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017909	GGATT	2	10	339946	339955	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017909	TTTTA	2	10	345028	345037	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017909	GATTG	2	10	345432	345441	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017909	TCTAA	2	10	351347	351356	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017909	TTTAA	2	10	351451	351460	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017909	TACAA	2	10	351920	351929	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017909	AATAT	2	10	352745	352754	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017909	TAAGT	2	10	361497	361506	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017909	TGATT	2	10	361560	361569	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017909	TTAAT	2	10	363875	363884	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017909	TTAAT	2	10	363947	363956	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017909	GATTT	2	10	366236	366245	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017909	TTGAA	2	10	366295	366304	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017909	AGATA	2	10	377502	377511	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017909	TATTT	2	10	378136	378145	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017909	TAGTT	2	10	378814	378823	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017909	GGTAG	2	10	390420	390429	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017909	AAATT	2	10	390751	390760	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017909	TTATT	2	10	391736	391745	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017909	CTTTA	2	10	413972	413981	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017909	ATTAT	2	10	416176	416185	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017909	TATTT	2	10	416745	416754	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017909	TCATT	2	10	417401	417410	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017909	TTGCT	2	10	422578	422587	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017909	AAAAG	2	10	427977	427986	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017909	TAAAA	2	10	433692	433701	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017909	CTTTT	2	10	436345	436354	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017909	TAGGT	2	10	436381	436390	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017909	TTTAT	2	10	443506	443515	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017909	AGCTC	2	10	444032	444041	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_017909	TTAAA	2	10	454501	454510	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017909	TAATT	2	10	458378	458387	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017909	TAAAA	2	10	459044	459053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017909	TAAAT	2	10	467728	467737	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017909	TGGGT	2	10	471526	471535	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017909	AAGAA	2	10	477526	477535	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017909	ATTAG	2	10	477558	477567	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017909	TAATG	2	10	482149	482158	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017909	ATTTT	2	10	487026	487035	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017909	TATTG	2	10	487383	487392	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017909	GACTG	2	10	487565	487574	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017909	TAGTT	2	10	491641	491650	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017909	AGTTA	2	10	492983	492992	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017909	TTTAT	2	10	493158	493167	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017909	AAAGA	2	10	494417	494426	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017909	AGGGT	2	10	498526	498535	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017909	TTTTG	2	10	498730	498739	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017909	ATCTT	2	10	499476	499485	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017909	ATTGA	2	10	499875	499884	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017909	AGATA	2	10	500309	500318	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017909	GATTT	2	10	516109	516118	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017909	ATTCA	2	10	516955	516964	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017909	TTTTA	2	10	518594	518603	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017909	GGTTT	2	10	538146	538155	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017909	TATGA	2	10	559955	559964	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017909	TTCTT	2	10	565689	565698	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017909	GTTTG	2	10	573670	573679	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017909	TAGTT	2	10	579414	579423	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017909	AAGGT	2	10	589595	589604	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017909	GTTTT	2	10	589874	589883	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017909	ATATT	2	10	593045	593054	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017909	TTTAG	2	10	603005	603014	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017909	TAAAA	2	10	620310	620319	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017909	AAGCT	3	15	629211	629225	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017909	CTTGC	2	10	630195	630204	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017909	CAATC	2	10	636490	636499	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_017909	TTTTG	2	10	637024	637033	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017909	TTGTA	2	10	638010	638019	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017909	TGATT	2	10	638719	638728	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017909	TTATT	2	10	638919	638928	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.