MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Escherichia coli Xuzhou21 plasmid pO157

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017907	CAAAGA	2	12	756	767	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017907	AAATAA	2	12	3397	3408	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387885601
3	NC_017907	GCGAAG	2	12	4293	4304	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	387885602
4	NC_017907	TTTTCC	2	12	5480	5491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387885603
5	NC_017907	ATGGAC	2	12	6650	6661	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387885603
6	NC_017907	AGGGGG	2	12	6789	6800	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	387885603
7	NC_017907	ATAAGG	2	12	8296	8307	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387885605
8	NC_017907	TAGAGG	2	12	9464	9475	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387885607
9	NC_017907	ATTTTA	2	12	16579	16590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387885616
10	NC_017907	TTTATG	2	12	19103	19114	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387885617
11	NC_017907	TTCTGT	2	12	23017	23028	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387885619
12	NC_017907	TATCCA	2	12	26084	26095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387885625
13	NC_017907	GTGTCA	2	12	26282	26293	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387885625
14	NC_017907	GCAGCG	2	12	27695	27706	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387885629
15	NC_017907	CTCTTT	2	12	28245	28256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017907	GACAGC	2	12	28709	28720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387885630
17	NC_017907	ACCGGA	2	12	40988	40999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387885643
18	NC_017907	TCCTCT	2	12	43230	43241	0 %	50 %	0 %	50 %	387885647
19	NC_017907	TCAGCA	2	12	45159	45170	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387885649
20	NC_017907	GCAGAA	2	12	45565	45576	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387885649
21	NC_017907	TACCGC	2	12	45589	45600	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387885649
22	NC_017907	TGCTAC	7	42	46469	46510	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387885651
23	NC_017907	TCAGCC	2	12	47520	47531	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387885652
24	NC_017907	GGCGCT	2	12	48532	48543	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	387885654
25	NC_017907	CAGGTG	2	12	48563	48574	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387885654
26	NC_017907	GCCGGA	2	12	48904	48915	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387885654
27	NC_017907	CACTGG	2	12	50298	50309	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387885655
28	NC_017907	TGGCAG	2	12	50974	50985	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387885656
29	NC_017907	GGAAAA	2	12	53995	54006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387885659
30	NC_017907	CTTATC	2	12	55196	55207	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017907	TGGATT	2	12	62754	62765	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387885662
32	NC_017907	ATAAAA	2	12	63285	63296	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387885662
33	NC_017907	CGTATT	2	12	65070	65081	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387885662
34	NC_017907	CGGGAG	2	12	67611	67622	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	387885665
35	NC_017907	AACACG	2	12	67762	67773	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387885666
36	NC_017907	TGGGGA	2	12	68029	68040	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	387885666
37	NC_017907	ATAGAT	2	12	75131	75142	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387885677
38	NC_017907	GCAGAA	2	12	80522	80533	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387885685
39	NC_017907	AAAGCA	2	12	82916	82927	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387885686
40	NC_017907	AAGGAC	2	12	84341	84352	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387885686

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.