MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli Xuzhou21 plasmid pO157

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017907	GTTTT	2	10	2815	2824	0 %	80 %	20 %	0 %	387885601
2	NC_017907	GTCAG	2	10	6627	6636	20 %	20 %	40 %	20 %	387885603
3	NC_017907	CCCTT	2	10	7558	7567	0 %	40 %	0 %	60 %	387885604
4	NC_017907	GAGGT	2	10	9060	9069	20 %	20 %	60 %	0 %	387885606
5	NC_017907	GAGGT	2	10	11515	11524	20 %	20 %	60 %	0 %	387885610
6	NC_017907	AGTGG	2	10	12475	12484	20 %	20 %	60 %	0 %	387885611
7	NC_017907	CGCTT	2	10	12802	12811	0 %	40 %	20 %	40 %	387885611
8	NC_017907	TTTCG	2	10	13478	13487	0 %	60 %	20 %	20 %	387885612
9	NC_017907	GGTTA	2	10	13503	13512	20 %	40 %	40 %	0 %	387885612
10	NC_017907	TGTTA	2	10	20564	20573	20 %	60 %	20 %	0 %	387885618
11	NC_017907	CAGGT	2	10	20907	20916	20 %	20 %	40 %	20 %	387885618
12	NC_017907	AGAAC	2	10	21615	21624	60 %	0 %	20 %	20 %	387885618
13	NC_017907	TCTCT	2	10	21992	22001	0 %	60 %	0 %	40 %	387885619
14	NC_017907	CAGAA	2	10	22379	22388	60 %	0 %	20 %	20 %	387885619
15	NC_017907	AATGG	2	10	23336	23345	40 %	20 %	40 %	0 %	387885620
16	NC_017907	CACAC	2	10	24837	24846	40 %	0 %	0 %	60 %	387885623
17	NC_017907	GGCGT	2	10	38260	38269	0 %	20 %	60 %	20 %	387885638
18	NC_017907	CGCGG	2	10	39064	39073	0 %	0 %	60 %	40 %	387885639
19	NC_017907	ACGGG	2	10	39116	39125	20 %	0 %	60 %	20 %	387885639
20	NC_017907	GCTGG	2	10	39762	39771	0 %	20 %	60 %	20 %	387885640
21	NC_017907	CCGCC	2	10	41435	41444	0 %	0 %	20 %	80 %	387885643
22	NC_017907	GGCAC	2	10	41905	41914	20 %	0 %	40 %	40 %	387885644
23	NC_017907	ACCGT	2	10	42195	42204	20 %	20 %	20 %	40 %	387885645
24	NC_017907	TGTAC	2	10	42430	42439	20 %	40 %	20 %	20 %	387885646
25	NC_017907	GGCGG	2	10	43296	43305	0 %	0 %	80 %	20 %	387885647
26	NC_017907	CCGGG	2	10	44518	44527	0 %	0 %	60 %	40 %	387885649
27	NC_017907	GGCGG	2	10	46589	46598	0 %	0 %	80 %	20 %	387885651
28	NC_017907	AAGTG	2	10	48646	48655	40 %	20 %	40 %	0 %	387885654
29	NC_017907	ACTGA	2	10	49958	49967	40 %	20 %	20 %	20 %	387885655
30	NC_017907	TTACG	2	10	52874	52883	20 %	40 %	20 %	20 %	387885658
31	NC_017907	TCTAC	2	10	56366	56375	20 %	40 %	0 %	40 %	387885662
32	NC_017907	GACTT	2	10	57222	57231	20 %	40 %	20 %	20 %	387885662
33	NC_017907	ATCAG	2	10	57454	57463	40 %	20 %	20 %	20 %	387885662
34	NC_017907	AAACG	2	10	59198	59207	60 %	0 %	20 %	20 %	387885662
35	NC_017907	TGCAT	2	10	60124	60133	20 %	40 %	20 %	20 %	387885662
36	NC_017907	GAAAG	2	10	60280	60289	60 %	0 %	40 %	0 %	387885662
37	NC_017907	AAAAT	2	10	60972	60981	80 %	20 %	0 %	0 %	387885662
38	NC_017907	CATTC	2	10	61160	61169	20 %	40 %	0 %	40 %	387885662
39	NC_017907	AATTA	2	10	61720	61729	60 %	40 %	0 %	0 %	387885662
40	NC_017907	ATATT	2	10	63039	63048	40 %	60 %	0 %	0 %	387885662
41	NC_017907	GATGT	2	10	63132	63141	20 %	40 %	40 %	0 %	387885662
42	NC_017907	TTTAT	2	10	63364	63373	20 %	80 %	0 %	0 %	387885662
43	NC_017907	TAAAT	2	10	63805	63814	60 %	40 %	0 %	0 %	387885662
44	NC_017907	AGAAA	2	10	63817	63826	80 %	0 %	20 %	0 %	387885662
45	NC_017907	ATTGT	2	10	64691	64700	20 %	60 %	20 %	0 %	387885662
46	NC_017907	TGATT	2	10	65041	65050	20 %	60 %	20 %	0 %	387885662
47	NC_017907	CGCCC	2	10	66609	66618	0 %	0 %	20 %	80 %	387885665
48	NC_017907	ACCGG	2	10	66878	66887	20 %	0 %	40 %	40 %	387885665
49	NC_017907	ACCTG	2	10	67487	67496	20 %	20 %	20 %	40 %	387885665
50	NC_017907	CTGGT	2	10	67825	67834	0 %	40 %	40 %	20 %	387885666
51	NC_017907	GAACG	2	10	68276	68285	40 %	0 %	40 %	20 %	387885666
52	NC_017907	CCGGG	2	10	70985	70994	0 %	0 %	60 %	40 %	387885670
53	NC_017907	GGGTT	2	10	74437	74446	0 %	40 %	60 %	0 %	387885675
54	NC_017907	GAAGA	2	10	77431	77440	60 %	0 %	40 %	0 %	387885682
55	NC_017907	GTCTT	2	10	81858	81867	0 %	60 %	20 %	20 %	387885686
56	NC_017907	AAAAC	2	10	82582	82591	80 %	0 %	0 %	20 %	387885686
57	NC_017907	ATGCG	2	10	83481	83490	20 %	20 %	40 %	20 %	387885686
58	NC_017907	TGGTA	2	10	88481	88490	20 %	40 %	40 %	0 %	387885689
59	NC_017907	GTTCC	2	10	90320	90329	0 %	40 %	20 %	40 %	387885690

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.