MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli Xuzhou21 plasmid pO157

Total Repeats: 264

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017907	GTCC	2	8	79	86	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017907	AAAC	2	8	282	289	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017907	CTGC	2	8	595	602	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017907	CAAA	2	8	1282	1289	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017907	GGCA	2	8	2195	2202	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017907	TTAT	2	8	2625	2632	25 %	75 %	0 %	0 %	387885601
7	NC_017907	ACAG	2	8	2986	2993	50 %	0 %	25 %	25 %	387885601
8	NC_017907	TTCT	2	8	3702	3709	0 %	75 %	0 %	25 %	387885602
9	NC_017907	GTAA	2	8	3864	3871	50 %	25 %	25 %	0 %	387885602
10	NC_017907	ACAG	2	8	5186	5193	50 %	0 %	25 %	25 %	387885602
11	NC_017907	TCAG	2	8	6321	6328	25 %	25 %	25 %	25 %	387885603
12	NC_017907	CACT	2	8	7089	7096	25 %	25 %	0 %	50 %	387885604
13	NC_017907	GAGG	2	8	8888	8895	25 %	0 %	75 %	0 %	387885606
14	NC_017907	CAGG	2	8	9091	9098	25 %	0 %	50 %	25 %	387885606
15	NC_017907	CGGA	2	8	9285	9292	25 %	0 %	50 %	25 %	387885607
16	NC_017907	GGGC	2	8	9426	9433	0 %	0 %	75 %	25 %	387885607
17	NC_017907	GCTG	2	8	9829	9836	0 %	25 %	50 %	25 %	387885608
18	NC_017907	TGAA	2	8	10130	10137	50 %	25 %	25 %	0 %	387885608
19	NC_017907	GCAG	2	8	10326	10333	25 %	0 %	50 %	25 %	387885609
20	NC_017907	ATTA	2	8	10457	10464	50 %	50 %	0 %	0 %	387885609
21	NC_017907	GATC	2	8	10582	10589	25 %	25 %	25 %	25 %	387885609
22	NC_017907	TCTG	2	8	10768	10775	0 %	50 %	25 %	25 %	387885609
23	NC_017907	TCAG	2	8	11022	11029	25 %	25 %	25 %	25 %	387885609
24	NC_017907	GGAG	2	8	11046	11053	25 %	0 %	75 %	0 %	387885609
25	NC_017907	GAGG	2	8	11095	11102	25 %	0 %	75 %	0 %	387885609
26	NC_017907	AACA	2	8	11119	11126	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017907	GACA	2	8	11391	11398	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017907	ACCC	2	8	12741	12748	25 %	0 %	0 %	75 %	387885611
29	NC_017907	GGCC	2	8	13059	13066	0 %	0 %	50 %	50 %	387885612
30	NC_017907	ATTC	2	8	13234	13241	25 %	50 %	0 %	25 %	387885612
31	NC_017907	TCTG	2	8	13452	13459	0 %	50 %	25 %	25 %	387885612
32	NC_017907	GGGA	2	8	13493	13500	25 %	0 %	75 %	0 %	387885612
33	NC_017907	AGCT	2	8	13524	13531	25 %	25 %	25 %	25 %	387885612
34	NC_017907	ATGG	2	8	13546	13553	25 %	25 %	50 %	0 %	387885612
35	NC_017907	GGCA	2	8	13557	13564	25 %	0 %	50 %	25 %	387885612
36	NC_017907	TCAG	2	8	13589	13596	25 %	25 %	25 %	25 %	387885612
37	NC_017907	CCCG	2	8	13647	13654	0 %	0 %	25 %	75 %	387885612
38	NC_017907	TCCA	2	8	13887	13894	25 %	25 %	0 %	50 %	387885613
39	NC_017907	GCAG	2	8	15265	15272	25 %	0 %	50 %	25 %	387885615
40	NC_017907	GTAA	2	8	15586	15593	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017907	ATCA	2	8	15881	15888	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017907	TTAT	2	8	16078	16085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017907	GAAA	2	8	16347	16354	75 %	0 %	25 %	0 %	387885616
44	NC_017907	GAAA	2	8	16598	16605	75 %	0 %	25 %	0 %	387885616
45	NC_017907	TAAA	2	8	16619	16626	75 %	25 %	0 %	0 %	387885617
46	NC_017907	TTCT	2	8	17312	17319	0 %	75 %	0 %	25 %	387885617
47	NC_017907	CTTT	2	8	17530	17537	0 %	75 %	0 %	25 %	387885617
48	NC_017907	GAGC	2	8	17560	17567	25 %	0 %	50 %	25 %	387885617
49	NC_017907	AATG	2	8	17857	17864	50 %	25 %	25 %	0 %	387885617
50	NC_017907	TGCT	2	8	17945	17952	0 %	50 %	25 %	25 %	387885617
51	NC_017907	AGAA	2	8	18240	18247	75 %	0 %	25 %	0 %	387885617
52	NC_017907	AACA	2	8	18379	18386	75 %	0 %	0 %	25 %	387885617
53	NC_017907	TATG	2	8	18573	18580	25 %	50 %	25 %	0 %	387885617
54	NC_017907	TTGC	2	8	19703	19710	0 %	50 %	25 %	25 %	387885618
55	NC_017907	TTGC	2	8	20360	20367	0 %	50 %	25 %	25 %	387885618
56	NC_017907	AATA	2	8	20674	20681	75 %	25 %	0 %	0 %	387885618
57	NC_017907	ATGG	2	8	20836	20843	25 %	25 %	50 %	0 %	387885618
58	NC_017907	TTCT	2	8	22245	22252	0 %	75 %	0 %	25 %	387885619
59	NC_017907	TAAA	2	8	22410	22417	75 %	25 %	0 %	0 %	387885619
60	NC_017907	AGGA	2	8	22479	22486	50 %	0 %	50 %	0 %	387885619
61	NC_017907	ATAC	2	8	22811	22818	50 %	25 %	0 %	25 %	387885619
62	NC_017907	GAAA	2	8	23090	23097	75 %	0 %	25 %	0 %	387885619
63	NC_017907	AAAC	2	8	23297	23304	75 %	0 %	0 %	25 %	387885620
64	NC_017907	CATC	2	8	24046	24053	25 %	25 %	0 %	50 %	387885622
65	NC_017907	CAAA	2	8	24207	24214	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017907	AGTG	2	8	24462	24469	25 %	25 %	50 %	0 %	387885623
67	NC_017907	TGGA	2	8	24581	24588	25 %	25 %	50 %	0 %	387885623
68	NC_017907	GTGC	2	8	24622	24629	0 %	25 %	50 %	25 %	387885623
69	NC_017907	CGCC	2	8	24640	24647	0 %	0 %	25 %	75 %	387885623
70	NC_017907	CGGG	2	8	25008	25015	0 %	0 %	75 %	25 %	387885623
71	NC_017907	CACT	2	8	25272	25279	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017907	GACT	2	8	25424	25431	25 %	25 %	25 %	25 %	387885625
73	NC_017907	GAAT	2	8	26050	26057	50 %	25 %	25 %	0 %	387885625
74	NC_017907	CCCA	2	8	26062	26069	25 %	0 %	0 %	75 %	387885625
75	NC_017907	ACTG	2	8	26423	26430	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017907	ACTT	2	8	26496	26503	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017907	TCAT	2	8	26647	26654	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017907	CAGA	2	8	26979	26986	50 %	0 %	25 %	25 %	387885628
79	NC_017907	CTTC	2	8	27614	27621	0 %	50 %	0 %	50 %	387885629
80	NC_017907	GGCG	2	8	27977	27984	0 %	0 %	75 %	25 %	387885629
81	NC_017907	ATAC	2	8	28200	28207	50 %	25 %	0 %	25 %	387885629
82	NC_017907	CATA	2	8	28217	28224	50 %	25 %	0 %	25 %	387885629
83	NC_017907	TACA	2	8	28237	28244	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017907	CTCC	2	8	28297	28304	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_017907	AGTG	2	8	29375	29382	25 %	25 %	50 %	0 %	387885632
86	NC_017907	CAGC	2	8	29627	29634	25 %	0 %	25 %	50 %	387885632
87	NC_017907	AGGA	2	8	29690	29697	50 %	0 %	50 %	0 %	387885632
88	NC_017907	GCTG	2	8	30089	30096	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017907	CCAC	2	8	30844	30851	25 %	0 %	0 %	75 %	387885633
90	NC_017907	GATG	2	8	31051	31058	25 %	25 %	50 %	0 %	387885633
91	NC_017907	GACG	2	8	31065	31072	25 %	0 %	50 %	25 %	387885633
92	NC_017907	GTAA	2	8	31211	31218	50 %	25 %	25 %	0 %	387885633
93	NC_017907	CCAC	2	8	31225	31232	25 %	0 %	0 %	75 %	387885633
94	NC_017907	TTCC	2	8	31390	31397	0 %	50 %	0 %	50 %	387885633
95	NC_017907	TTCC	2	8	32214	32221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017907	TCGC	2	8	32629	32636	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017907	TGGA	2	8	33777	33784	25 %	25 %	50 %	0 %	387885635
98	NC_017907	ACTG	2	8	34294	34301	25 %	25 %	25 %	25 %	387885636
99	NC_017907	GAAT	2	8	34519	34526	50 %	25 %	25 %	0 %	387885636
100	NC_017907	GCTG	2	8	34546	34553	0 %	25 %	50 %	25 %	387885636
101	NC_017907	TGGT	2	8	35965	35972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017907	CTTA	2	8	36310	36317	25 %	50 %	0 %	25 %	387885637
103	NC_017907	ACTC	2	8	36446	36453	25 %	25 %	0 %	50 %	387885637
104	NC_017907	ACAG	2	8	36893	36900	50 %	0 %	25 %	25 %	387885637
105	NC_017907	TGGA	2	8	37017	37024	25 %	25 %	50 %	0 %	387885637
106	NC_017907	AGGA	2	8	37239	37246	50 %	0 %	50 %	0 %	387885637
107	NC_017907	CTGG	2	8	37477	37484	0 %	25 %	50 %	25 %	387885637
108	NC_017907	GGAG	2	8	37880	37887	25 %	0 %	75 %	0 %	387885637
109	NC_017907	GTAT	2	8	38074	38081	25 %	50 %	25 %	0 %	387885638
110	NC_017907	GCTG	2	8	38299	38306	0 %	25 %	50 %	25 %	387885638
111	NC_017907	TTCA	2	8	38712	38719	25 %	50 %	0 %	25 %	387885638
112	NC_017907	TGGC	2	8	38834	38841	0 %	25 %	50 %	25 %	387885638
113	NC_017907	CGGG	2	8	38992	38999	0 %	0 %	75 %	25 %	387885639
114	NC_017907	CCGG	2	8	39106	39113	0 %	0 %	50 %	50 %	387885639
115	NC_017907	TGCG	2	8	39388	39395	0 %	25 %	50 %	25 %	387885640
116	NC_017907	GCAG	2	8	39877	39884	25 %	0 %	50 %	25 %	387885640
117	NC_017907	GCGG	2	8	40732	40739	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017907	CAGT	2	8	41020	41027	25 %	25 %	25 %	25 %	387885643
119	NC_017907	GCGG	2	8	41681	41688	0 %	0 %	75 %	25 %	387885644
120	NC_017907	ACGG	2	8	42386	42393	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017907	GGCA	2	8	42719	42726	25 %	0 %	50 %	25 %	387885646
122	NC_017907	ACTG	2	8	43588	43595	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017907	ATTT	2	8	43820	43827	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017907	GTCA	2	8	43859	43866	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017907	CGCT	2	8	44576	44583	0 %	25 %	25 %	50 %	387885649
126	NC_017907	CCCG	2	8	44688	44695	0 %	0 %	25 %	75 %	387885649
127	NC_017907	GCCA	2	8	45448	45455	25 %	0 %	25 %	50 %	387885649
128	NC_017907	CAGT	2	8	45730	45737	25 %	25 %	25 %	25 %	387885650
129	NC_017907	GTCT	2	8	46163	46170	0 %	50 %	25 %	25 %	387885650
130	NC_017907	CTGT	2	8	46540	46547	0 %	50 %	25 %	25 %	387885651
131	NC_017907	TGCC	2	8	46801	46808	0 %	25 %	25 %	50 %	387885651
132	NC_017907	CAGA	2	8	47284	47291	50 %	0 %	25 %	25 %	387885652
133	NC_017907	GACT	2	8	47586	47593	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017907	ACTA	2	8	47932	47939	50 %	25 %	0 %	25 %	387885654
135	NC_017907	GAAC	2	8	48949	48956	50 %	0 %	25 %	25 %	387885654
136	NC_017907	TCTG	2	8	49317	49324	0 %	50 %	25 %	25 %	387885654
137	NC_017907	GAAG	2	8	49414	49421	50 %	0 %	50 %	0 %	387885654
138	NC_017907	GGAT	2	8	49477	49484	25 %	25 %	50 %	0 %	387885654
139	NC_017907	TCAG	2	8	49515	49522	25 %	25 %	25 %	25 %	387885654
140	NC_017907	CTGG	2	8	49824	49831	0 %	25 %	50 %	25 %	387885654
141	NC_017907	GAGG	2	8	50781	50788	25 %	0 %	75 %	0 %	387885656
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.