MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli Xuzhou21 plasmid pO157

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017907	GTCC	2	8	79	86	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017907	AAAC	2	8	282	289	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017907	CTGC	2	8	595	602	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017907	CAAA	2	8	1282	1289	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017907	GGCA	2	8	2195	2202	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017907	AACA	2	8	11119	11126	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017907	GACA	2	8	11391	11398	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017907	GTAA	2	8	15586	15593	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017907	ATCA	2	8	15881	15888	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017907	TTAT	2	8	16078	16085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017907	CAAA	2	8	24207	24214	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017907	CACT	2	8	25272	25279	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017907	ACTG	2	8	26423	26430	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017907	ACTT	2	8	26496	26503	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017907	TCAT	2	8	26647	26654	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017907	TACA	2	8	28237	28244	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017907	CTCC	2	8	28297	28304	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_017907	GCTG	2	8	30089	30096	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017907	TTCC	2	8	32214	32221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017907	TCGC	2	8	32629	32636	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017907	TGGT	2	8	35965	35972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017907	GCGG	2	8	40732	40739	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017907	ACGG	2	8	42386	42393	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017907	ACTG	2	8	43588	43595	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017907	ATTT	2	8	43820	43827	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017907	GTCA	2	8	43859	43866	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017907	GACT	2	8	47586	47593	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017907	GGCG	2	8	51544	51551	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017907	TAAG	2	8	54557	54564	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017907	CCTC	2	8	70085	70092	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_017907	TCAT	2	8	71146	71153	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017907	TAAT	2	8	71395	71402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017907	TGGC	2	8	72322	72329	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017907	GCTC	2	8	72521	72528	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017907	CATT	2	8	73724	73731	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017907	GACA	2	8	73765	73772	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017907	CCCT	2	8	73887	73894	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_017907	ATCA	2	8	74171	74178	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017907	CTGC	2	8	75244	75251	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017907	CCTC	2	8	79122	79129	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_017907	AACA	2	8	80641	80648	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017907	TGCC	2	8	84703	84710	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017907	AATA	2	8	85532	85539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017907	AAAT	2	8	85957	85964	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017907	AATA	2	8	86024	86031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017907	CTGC	2	8	86127	86134	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017907	TCAG	2	8	91714	91721	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017907	ACCA	2	8	91749	91756	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017907	TGCT	2	8	92331	92338	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017907	GCTT	2	8	92356	92363	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017907	ATGA	2	8	92546	92553	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017907	ATTT	2	8	92657	92664	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.