MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli Xuzhou21 plasmid pO157

Total Repeats: 220

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017907	AAG	2	6	26	31	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017907	CTG	2	6	70	75	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017907	TGA	2	6	96	101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017907	GAT	2	6	130	135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017907	AAT	2	6	136	141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017907	TCC	2	6	168	173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017907	TCA	2	6	175	180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017907	GGT	2	6	220	225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017907	AAT	2	6	331	336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017907	TGG	2	6	341	346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017907	TCT	2	6	501	506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017907	AAT	2	6	553	558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017907	TGT	2	6	695	700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017907	TAA	2	6	816	821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017907	TGG	2	6	894	899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017907	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017907	TGG	2	6	1080	1085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017907	AAC	2	6	1219	1224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017907	AAT	2	6	1306	1311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017907	CTG	2	6	1379	1384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017907	ATC	2	6	1423	1428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017907	TCC	2	6	1468	1473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017907	GTC	2	6	1612	1617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017907	ATA	2	6	1679	1684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017907	GAC	2	6	1869	1874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017907	TGG	2	6	1877	1882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017907	GAT	2	6	1960	1965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017907	AAG	2	6	2012	2017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017907	AAC	2	6	2053	2058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017907	TTG	2	6	2306	2311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017907	TGC	2	6	2351	2356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017907	AAT	2	6	2498	2503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017907	TAA	2	6	3625	3630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017907	CTT	2	6	8166	8171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017907	AAG	2	6	9185	9190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017907	GGA	2	6	11160	11165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017907	TGC	2	6	11360	11365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017907	TCT	2	6	11370	11375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017907	AGC	2	6	11402	11407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017907	TTC	2	6	11420	11425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017907	GGT	2	6	11454	11459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017907	AGG	2	6	12868	12873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017907	AGT	2	6	12881	12886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017907	TTG	2	6	12914	12919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017907	CGT	2	6	12970	12975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017907	TAA	2	6	13732	13737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017907	TGT	2	6	13762	13767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017907	GTG	2	6	14288	14293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017907	ATG	2	6	14303	14308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017907	TAT	2	6	15699	15704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017907	TAA	2	6	15826	15831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017907	TAT	3	9	15944	15952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017907	TGT	2	6	15959	15964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017907	CTT	2	6	16012	16017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017907	AGG	2	6	19618	19623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017907	AGG	2	6	19637	19642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017907	AAT	2	6	23266	23271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017907	TAT	2	6	23884	23889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017907	CAG	2	6	25089	25094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017907	GCA	2	6	25230	25235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017907	ATA	2	6	25287	25292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017907	TGG	2	6	28277	28282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017907	TGT	2	6	28368	28373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017907	ATG	2	6	28423	28428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017907	GGT	2	6	28438	28443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017907	ATA	2	6	28592	28597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017907	ATT	2	6	30157	30162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017907	AGT	2	6	30194	30199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017907	ATG	2	6	30208	30213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017907	AAC	2	6	30318	30323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017907	ATG	2	6	30341	30346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017907	AGT	2	6	30369	30374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017907	CGC	2	6	30378	30383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017907	ATT	2	6	30518	30523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017907	TCT	2	6	30541	30546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017907	AGA	2	6	30615	30620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017907	CCG	3	9	32106	32114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_017907	CAG	2	6	32145	32150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017907	GCC	2	6	32189	32194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017907	GAC	2	6	32196	32201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017907	GAC	2	6	32238	32243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017907	GGT	2	6	32279	32284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017907	TCA	2	6	32472	32477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017907	TGA	2	6	32479	32484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017907	TTA	2	6	32502	32507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017907	TCT	2	6	32567	32572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017907	TTC	2	6	32606	32611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017907	GCG	2	6	32656	32661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017907	ATA	2	6	32672	32677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017907	CTT	2	6	32697	32702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017907	AAC	2	6	32733	32738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017907	TGT	2	6	32768	32773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017907	TAA	2	6	32798	32803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017907	TCG	2	6	35087	35092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017907	TCG	2	6	35130	35135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017907	ATT	2	6	35141	35146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017907	GTC	2	6	35326	35331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017907	CTG	2	6	35374	35379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017907	TGC	2	6	35385	35390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017907	CCT	2	6	35510	35515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017907	TCG	2	6	35530	35535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017907	TCC	3	9	35537	35545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017907	GAG	2	6	35633	35638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017907	AAT	2	6	35687	35692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017907	TCA	2	6	35736	35741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017907	GGA	2	6	35861	35866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017907	CTG	2	6	35902	35907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017907	CGT	2	6	35911	35916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017907	CTC	2	6	35975	35980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_017907	ACC	2	6	36008	36013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_017907	TGT	2	6	36040	36045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017907	AAG	2	6	36129	36134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017907	CGC	2	6	40724	40729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017907	GGC	2	6	42394	42399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017907	GCC	2	6	42403	42408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017907	CGT	2	6	42911	42916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017907	CAC	2	6	42937	42942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017907	TTG	2	6	42951	42956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017907	CAG	2	6	42983	42988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017907	GCA	2	6	43023	43028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017907	GCC	2	6	43059	43064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_017907	CGT	2	6	43131	43136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017907	GCG	2	6	43701	43706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017907	CAG	3	9	43746	43754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017907	AGG	2	6	43901	43906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017907	GCC	2	6	44274	44279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_017907	GGC	2	6	44288	44293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017907	GGA	2	6	46305	46310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017907	GCG	2	6	46995	47000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017907	GAT	2	6	47091	47096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017907	ATT	2	6	47911	47916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017907	GCA	2	6	49932	49937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017907	ATG	2	6	51197	51202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017907	GGT	2	6	51240	51245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017907	ACA	2	6	51326	51331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017907	GAA	2	6	51366	51371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017907	GCT	2	6	51612	51617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017907	GAG	2	6	53694	53699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017907	AGA	2	6	54215	54220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017907	AAT	2	6	54613	54618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017907	TGG	2	6	54711	54716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017907	ACA	2	6	54734	54739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.