MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli Xuzhou21 chromosome

Total Repeats: 207

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017906	GAAAAT	2	12	10630	10641	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017906	TAAAAA	2	12	63352	63363	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017906	AAGGGA	2	12	88936	88947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017906	CGCCAT	2	12	152268	152279	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017906	TCTCCC	2	12	168866	168877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017906	TCACCC	2	12	168917	168928	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017906	GTAGTG	2	12	203724	203735	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017906	TTATAT	2	12	285949	285960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017906	CTGATA	2	12	304426	304437	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017906	TGTAAC	2	12	308954	308965	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017906	ATTATC	2	12	353401	353412	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017906	TTTTCT	2	12	364142	364153	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017906	CTATTT	2	12	365178	365189	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017906	AATTTC	2	12	370867	370878	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017906	TTTATT	2	12	402166	402177	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017906	ATGAAA	2	12	445021	445032	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017906	AACAAT	2	12	468366	468377	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017906	TATTGA	2	12	473519	473530	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017906	TTTTCA	2	12	539861	539872	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017906	CAGGCG	2	12	558536	558547	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017906	TGCAAA	2	12	695320	695331	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017906	ATCATT	2	12	758913	758924	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017906	ATTTTT	2	12	789307	789318	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017906	CGCTGG	2	12	789398	789409	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017906	TTTACC	2	12	800219	800230	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017906	AATCAG	2	12	847810	847821	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017906	TTTTCT	2	12	879833	879844	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017906	TTGTGT	2	12	893092	893103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017906	TTAAAT	2	12	900070	900081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017906	TCGCTG	2	12	900229	900240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017906	TTGTAC	2	12	901105	901116	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017906	GTGATG	2	12	902081	902092	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017906	CATTAT	2	12	902698	902709	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017906	AATATT	2	12	944135	944146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017906	CAGAAA	2	12	958440	958451	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017906	TTCGAT	2	12	986292	986303	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017906	GCCAGC	2	12	987678	987689	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017906	TAACCG	2	12	1054976	1054987	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017906	AAATAA	2	12	1085271	1085282	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017906	CTGGAA	2	12	1094834	1094845	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017906	AAAGAT	2	12	1117655	1117666	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017906	TGTCCA	2	12	1138288	1138299	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017906	TAAGGA	2	12	1160556	1160567	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017906	ATAATG	2	12	1161970	1161981	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017906	TCAAAA	2	12	1231615	1231626	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017906	AGATGT	2	12	1257015	1257026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017906	CAAAGC	2	12	1351288	1351299	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017906	TGTTAA	2	12	1389413	1389424	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017906	ACTTCA	2	12	1391644	1391655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017906	ATTCAA	2	12	1419254	1419265	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017906	ATTTGG	2	12	1419765	1419776	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017906	ATTTTT	2	12	1430450	1430461	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017906	CACTGA	2	12	1435260	1435271	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017906	CAAAAA	2	12	1482301	1482312	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017906	TGCAAA	5	30	1522670	1522699	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017906	TTACTG	2	12	1559975	1559986	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017906	ACAGCA	2	12	1576990	1577001	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017906	ATTTTA	2	12	1589565	1589576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017906	TTTCTG	2	12	1628302	1628313	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017906	CTGTCA	2	12	1631333	1631344	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017906	AATATG	2	12	1661380	1661391	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017906	GAAGTT	2	12	1664438	1664449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017906	ACGCTT	2	12	1683587	1683598	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017906	ACTCGA	2	12	1683607	1683618	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017906	CAGGCT	2	12	1683744	1683755	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017906	CTTATT	2	12	1739409	1739420	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017906	CAAAAG	2	12	1745303	1745314	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017906	CTGATC	2	12	1755782	1755793	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017906	GTTTTT	2	12	1771491	1771502	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017906	TTTATT	2	12	1781518	1781529	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017906	CTTCAT	2	12	1814960	1814971	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017906	AAAGTT	2	12	1818211	1818222	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017906	CTATAA	2	12	1867137	1867148	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017906	TTTTAT	2	12	2000976	2000987	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017906	AAAAAC	2	12	2027831	2027842	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017906	CCAGCG	2	12	2036703	2036714	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017906	TTCATA	2	12	2039411	2039422	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017906	ACCGTT	2	12	2042697	2042708	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017906	TGGTTA	2	12	2051526	2051537	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017906	CAAAAA	2	12	2105847	2105858	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017906	TTAAAT	2	12	2107646	2107657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017906	CCGGAA	2	12	2139300	2139311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017906	CAGCCA	2	12	2139714	2139725	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017906	ATTTTG	2	12	2160893	2160904	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017906	TGACCG	2	12	2164729	2164740	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017906	TTGATA	2	12	2165751	2165762	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017906	CTGCTC	2	12	2167858	2167869	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017906	AATAAA	2	12	2185047	2185058	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017906	CTGTAA	2	12	2205488	2205499	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017906	ATACTT	2	12	2291673	2291684	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017906	AAAATA	2	12	2305330	2305341	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017906	TGTTTT	2	12	2305963	2305974	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017906	AAGACT	2	12	2306223	2306234	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017906	TATTAC	2	12	2424345	2424356	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017906	TTTCTT	2	12	2442584	2442595	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017906	AGGATG	2	12	2482408	2482419	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017906	AACGGT	2	12	2514699	2514710	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017906	AATTCA	2	12	2538624	2538635	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017906	TCTTAT	2	12	2552441	2552452	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017906	ATATTT	2	12	2588110	2588121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017906	CTGATA	2	12	2602720	2602731	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017906	TGTCAG	2	12	2602824	2602835	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017906	CTGCTC	2	12	2605970	2605981	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017906	ATTTTT	2	12	2657160	2657171	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017906	CTGATA	2	12	2668699	2668710	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017906	TTTTGT	2	12	2728028	2728039	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017906	GTTTAG	2	12	2748890	2748901	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017906	TCCCCC	2	12	2758150	2758161	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
109	NC_017906	AGAAAA	2	12	2803107	2803118	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017906	CCTTAC	2	12	2812661	2812672	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017906	CCTTAC	2	12	2813270	2813281	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017906	GCTGTG	2	12	2816426	2816437	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017906	GCTGGC	2	12	2816735	2816746	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017906	TGACCG	2	12	2827290	2827301	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017906	TTGATA	2	12	2828310	2828321	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017906	CTGCTC	2	12	2830417	2830428	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017906	TATTGA	2	12	2860409	2860420	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017906	CCTGTT	2	12	2872643	2872654	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017906	TCTTCC	2	12	2926851	2926862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017906	TAAATG	2	12	3061156	3061167	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017906	TGTCAC	2	12	3074790	3074801	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017906	AGAAAA	2	12	3085070	3085081	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017906	CAACGT	2	12	3126381	3126392	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017906	GTTAAC	2	12	3132307	3132318	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017906	GTTAAC	2	12	3132371	3132382	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017906	CTGATG	2	12	3151131	3151142	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017906	GTTATG	2	12	3168971	3168982	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017906	GATGCC	2	12	3178156	3178167	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017906	CAAGTG	2	12	3183335	3183346	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017906	TCCTTC	2	12	3283066	3283077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017906	TGGACA	2	12	3337561	3337572	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_017906	CAGTTT	2	12	3352166	3352177	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_017906	TTTTTC	2	12	3404218	3404229	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_017906	ATAGAA	14	84	3418028	3418111	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017906	TTTTAC	2	12	3432943	3432954	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_017906	ATGGGT	2	12	3478440	3478451	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017906	TGCCGT	2	12	3478454	3478465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017906	AATGAT	2	12	3552107	3552118	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017906	GACAAT	2	12	3554513	3554524	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_017906	GGTTTT	2	12	3568098	3568109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017906	ACAAGA	2	12	3572429	3572440	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_017906	TTTGTT	2	12	3597365	3597376	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017906	ATTAGA	2	12	3645362	3645373	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017906	ATTCTC	2	12	3662354	3662365	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017906	GATCAT	2	12	3671625	3671636	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_017906	ATATCA	2	12	3701186	3701197	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_017906	ATCGCG	2	12	3706753	3706764	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017906	GTAAGG	2	12	3721428	3721439	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017906	GTAAGG	2	12	3721821	3721832	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017906	ACTGAG	2	12	3749899	3749910	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_017906	TCCACT	2	12	3800165	3800176	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_017906	ATAAAA	2	12	3844517	3844528	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017906	AGTTGT	2	12	3877920	3877931	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017906	CTTTTT	2	12	3882597	3882608	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_017906	AATGAT	2	12	3883432	3883443	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017906	TCTCCC	2	12	3906488	3906499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_017906	GTAACC	2	12	3932951	3932962	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_017906	AGACAA	2	12	3934571	3934582	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_017906	TGCATT	2	12	3943428	3943439	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_017906	TTTTAT	2	12	3945325	3945336	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017906	ATATAA	2	12	3956093	3956104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017906	GCTCCC	2	12	4080504	4080515	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_017906	AGCGTT	2	12	4080624	4080635	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
164	NC_017906	AATTTA	2	12	4185777	4185788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017906	TACTCG	2	12	4202722	4202733	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_017906	GAAATA	2	12	4314020	4314031	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_017906	TTAAAT	2	12	4382378	4382389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.