MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium sp. MOTT36Y chromosome

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017904	TGAAGG	2	12	2076	2087	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017904	GCGTCG	2	12	207248	207259	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017904	GGGTCG	2	12	217908	217919	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017904	CGGCTG	2	12	268347	268358	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017904	CCGCCA	2	12	286370	286381	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017904	GCGACG	2	12	288619	288630	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017904	GGACAC	2	12	288635	288646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017904	CAGCGA	2	12	289241	289252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017904	CGGTGG	2	12	320389	320400	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017904	CCAACC	2	12	323047	323058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017904	TCGGCT	2	12	326678	326689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017904	CCAGCA	2	12	373576	373587	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017904	GCGCCG	2	12	373613	373624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017904	AGGGAA	2	12	393848	393859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017904	CGGCGA	2	12	407219	407230	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017904	TCGGCG	2	12	451389	451400	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017904	TTGGCG	2	12	489086	489097	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017904	GGCGCG	2	12	657546	657557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017904	ACGAGA	2	12	717486	717497	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017904	TCGGGT	2	12	848913	848924	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017904	GGTGCG	2	12	897115	897126	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017904	TGTTAC	2	12	905176	905187	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017904	CGATCC	2	12	920946	920957	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017904	CGGCAC	2	12	928253	928264	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017904	ACGAGC	2	12	961763	961774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017904	CGGCGA	2	12	1054706	1054717	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017904	GGACTG	2	12	1139102	1139113	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017904	GCCCTC	2	12	1180531	1180542	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_017904	AATGAG	2	12	1275825	1275836	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017904	TCGCCA	2	12	1353862	1353873	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017904	TCTGCA	2	12	1363012	1363023	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017904	GTTTGC	2	12	1365517	1365528	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017904	GACCGT	2	12	1506887	1506898	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017904	CCGTCG	2	12	1537757	1537768	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017904	CGTGCC	2	12	1595589	1595600	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017904	CCGGCG	2	12	1651665	1651676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017904	CGGCGC	2	12	1678403	1678414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017904	ACACTG	2	12	1683118	1683129	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017904	TCGATG	2	12	1716371	1716382	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017904	GACGCG	2	12	1755972	1755983	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017904	CTTGCC	2	12	1756633	1756644	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017904	TTCGTG	2	12	1837346	1837357	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017904	GCAGCT	2	12	1982894	1982905	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017904	GCCCAG	2	12	1991839	1991850	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017904	GGGCTG	2	12	2106918	2106929	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017904	CAGCGC	2	12	2137531	2137542	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017904	TAATGT	2	12	2165702	2165713	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017904	CAACCT	2	12	2171793	2171804	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017904	ACCCCA	2	12	2261927	2261938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017904	TAACGC	2	12	2262338	2262349	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017904	GCTGCC	2	12	2264539	2264550	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017904	CGGCCG	2	12	2264872	2264883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017904	TTGATC	2	12	2266004	2266015	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017904	CGCTGG	2	12	2301394	2301405	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017904	GGTTGA	2	12	2351738	2351749	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017904	TCGTAT	2	12	2365763	2365774	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017904	GGCGCG	2	12	2372755	2372766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017904	CGGTCT	2	12	2390199	2390210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017904	CCGCGC	2	12	2393011	2393022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017904	GGCGCG	2	12	2395141	2395152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017904	ACGTCT	2	12	2397559	2397570	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017904	CGGGCC	2	12	2400398	2400409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017904	CTGCCG	2	12	2438329	2438340	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017904	GCGGTG	2	12	2504636	2504647	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017904	GCATGA	2	12	2546957	2546968	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017904	GCTGTG	2	12	2688563	2688574	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017904	GCCACC	2	12	2704037	2704048	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017904	CGCGGC	2	12	2730195	2730206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017904	AGCCTG	2	12	2733468	2733479	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017904	TCGGCG	2	12	2739692	2739703	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017904	GTTTCG	2	12	2754689	2754700	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017904	CGCGTC	2	12	2792495	2792506	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017904	CCCTCT	2	12	2863264	2863275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017904	CGAACG	2	12	2869734	2869745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017904	CGGGTC	2	12	2911370	2911381	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017904	CAAGAT	2	12	3079015	3079026	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017904	GGTGAT	2	12	3103369	3103380	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017904	GCCATC	2	12	3105233	3105244	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017904	CCGTTG	2	12	3120649	3120660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017904	GGCGAA	2	12	3169675	3169686	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017904	AGCTGT	2	12	3170119	3170130	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017904	GTGGGA	2	12	3250917	3250928	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017904	GAGGAC	2	12	3273064	3273075	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017904	CACCCG	2	12	3285914	3285925	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017904	CGCGCC	2	12	3315137	3315148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_017904	ACGGCG	2	12	3338404	3338415	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017904	GTTGCC	2	12	3439538	3439549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017904	CGGGCG	2	12	3507322	3507333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017904	CGGTGG	2	12	3529871	3529882	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017904	GTGGCG	2	12	3535066	3535077	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017904	CTGGCC	2	12	3737652	3737663	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017904	GCCGGG	2	12	3759798	3759809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017904	TGGTCA	2	12	3768108	3768119	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017904	CGGCCG	2	12	3779062	3779073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017904	GGCGCG	2	12	3806695	3806706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017904	CGACAT	2	12	3807687	3807698	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017904	CATCGC	2	12	3837966	3837977	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017904	CCGAGT	2	12	3855831	3855842	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017904	CGGGCG	2	12	3921377	3921388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017904	CCGGCC	2	12	3974954	3974965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017904	GGCGTG	2	12	4014520	4014531	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017904	GGCCGA	2	12	4035321	4035332	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017904	CCGTCA	2	12	4066573	4066584	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017904	TCGCCG	2	12	4130825	4130836	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017904	CCGTCC	2	12	4190142	4190153	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_017904	GGCGCC	2	12	4324141	4324152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017904	CGACGC	2	12	4335880	4335891	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017904	CACCGC	2	12	4342714	4342725	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_017904	CTTGAC	2	12	4450267	4450278	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017904	TGGCGG	2	12	4454240	4454251	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017904	GCGCGG	2	12	4493048	4493059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017904	GCTGGT	2	12	4522534	4522545	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017904	TCGCCG	2	12	4534157	4534168	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017904	TCGCCG	2	12	4534214	4534225	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017904	CGGCGA	2	12	4552983	4552994	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017904	CGGCGA	2	12	4553040	4553051	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017904	GCGATG	2	12	4574142	4574153	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017904	GCGCCG	2	12	4627289	4627300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017904	TCGATG	2	12	4648790	4648801	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017904	TTCGTC	2	12	4801825	4801836	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017904	TGTTCG	2	12	4812447	4812458	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017904	TTGTCG	2	12	4820339	4820350	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017904	AGGAGC	2	12	4853863	4853874	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017904	CGCGTC	2	12	4872108	4872119	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017904	TTGGCG	2	12	4895882	4895893	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017904	TTGGCG	2	12	4908909	4908920	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017904	CGGCAC	2	12	4948530	4948541	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017904	TACTGG	2	12	4981982	4981993	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017904	CACCGC	2	12	4998844	4998855	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017904	GCCCCT	2	12	5004953	5004964	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_017904	AACGGG	2	12	5009382	5009393	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_017904	ACCCCG	2	12	5143176	5143187	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017904	GCACCC	2	12	5145956	5145967	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_017904	CCTGTG	2	12	5155177	5155188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017904	CGTCGC	2	12	5162701	5162712	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017904	TCATTT	2	12	5210648	5210659	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_017904	GAATCT	2	12	5222621	5222632	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_017904	GTCGGG	2	12	5252300	5252311	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_017904	CGGAGG	2	12	5267762	5267773	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_017904	AAGTCG	2	12	5288106	5288117	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_017904	CAGCGC	2	12	5403376	5403387	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017904	CCCGGG	2	12	5435715	5435726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017904	CGGGCT	2	12	5456156	5456167	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017904	GCCGGA	2	12	5464788	5464799	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017904	CGGCGA	2	12	5495431	5495442	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017904	CGAGGT	2	12	5586946	5586957	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_017904	CCCGCA	2	12	5588252	5588263	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.