MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium sp. MOTT36Y chromosome

Total Repeats: 1594

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017904	CCGC	2	8	5233	5240	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_017904	GACC	2	8	7334	7341	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017904	GGCC	2	8	13766	13773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017904	CCCG	2	8	14438	14445	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_017904	CGCC	2	8	14758	14765	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_017904	ATTC	2	8	15014	15021	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017904	GTCG	2	8	15023	15030	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017904	CCGG	2	8	24450	24457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017904	GCCG	2	8	27994	28001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017904	AGCT	2	8	31391	31398	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017904	AGGG	2	8	31400	31407	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017904	CCGG	2	8	33870	33877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017904	TCGG	2	8	41869	41876	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017904	GCCG	2	8	45030	45037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017904	AAGG	2	8	65639	65646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017904	GAAA	2	8	74902	74909	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017904	ATGT	2	8	76150	76157	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017904	TCAG	2	8	83342	83349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017904	GGTG	2	8	83633	83640	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017904	GCGT	2	8	86086	86093	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017904	GAAC	2	8	86145	86152	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017904	CGCC	2	8	86154	86161	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_017904	CGTA	2	8	87727	87734	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017904	GACA	2	8	89779	89786	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017904	GGTC	2	8	92354	92361	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017904	GCGG	2	8	92602	92609	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017904	GAAG	2	8	93322	93329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017904	CCCT	2	8	97508	97515	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_017904	GTGC	2	8	97694	97701	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017904	GGGA	2	8	97710	97717	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017904	AACC	2	8	102655	102662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017904	CCGG	2	8	113428	113435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017904	TGCG	2	8	114818	114825	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017904	CGAC	2	8	114829	114836	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017904	TTAG	2	8	121414	121421	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017904	GGAT	2	8	122107	122114	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017904	GCCG	2	8	135855	135862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017904	GGTG	2	8	136909	136916	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017904	AGGA	2	8	136941	136948	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017904	CCGA	2	8	137003	137010	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017904	CGAA	2	8	140694	140701	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017904	TCGG	2	8	145469	145476	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017904	CGGC	2	8	147719	147726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017904	CCCG	2	8	151265	151272	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_017904	CCCA	2	8	153517	153524	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_017904	GCTC	2	8	160787	160794	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017904	GTTC	2	8	172871	172878	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017904	GGTG	2	8	172905	172912	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017904	GGAC	2	8	172966	172973	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017904	GGGC	2	8	182944	182951	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017904	GTGA	2	8	185648	185655	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017904	GTGG	2	8	185752	185759	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017904	CGCC	2	8	186185	186192	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_017904	GCCC	2	8	186321	186328	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_017904	GGGC	2	8	188945	188952	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017904	ACGT	2	8	189149	189156	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017904	GCAC	2	8	195815	195822	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017904	CGGC	2	8	201187	201194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017904	CTGG	2	8	207322	207329	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017904	CGGC	2	8	207477	207484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017904	CGGC	2	8	214174	214181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017904	CGAA	2	8	214338	214345	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017904	GCAG	2	8	214444	214451	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017904	GGCC	2	8	215669	215676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017904	CCGA	2	8	218021	218028	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017904	TGGC	2	8	253681	253688	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017904	ACTT	2	8	265798	265805	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017904	GGGT	2	8	266848	266855	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017904	GAAG	2	8	267298	267305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017904	CGTG	2	8	270596	270603	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017904	GGAC	2	8	270657	270664	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017904	CACG	2	8	271612	271619	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017904	TCGT	2	8	275230	275237	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017904	ACGC	2	8	277863	277870	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017904	CGTG	2	8	285265	285272	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017904	CAGG	2	8	288230	288237	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017904	GCTG	2	8	289002	289009	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017904	CACC	2	8	292286	292293	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_017904	GCCG	2	8	292351	292358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017904	CGCC	2	8	292935	292942	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
81	NC_017904	CGAC	2	8	315770	315777	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017904	GGCC	2	8	322927	322934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017904	CACC	3	12	322961	322972	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
84	NC_017904	CCCG	2	8	322978	322985	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_017904	CAAC	2	8	323067	323074	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017904	AATC	2	8	323085	323092	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017904	TTCG	3	12	323120	323131	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017904	GTTC	2	8	323371	323378	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017904	CGAC	2	8	323878	323885	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017904	CCCT	2	8	324063	324070	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
91	NC_017904	CGAT	2	8	326587	326594	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017904	GTCG	2	8	336850	336857	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017904	GGTT	2	8	337715	337722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017904	CGGG	2	8	344599	344606	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017904	GTCG	2	8	348894	348901	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017904	GAGT	2	8	354325	354332	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017904	TTGC	2	8	354366	354373	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017904	GCCC	2	8	354413	354420	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_017904	CGCC	2	8	365222	365229	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
100	NC_017904	CGGG	2	8	369064	369071	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017904	CTCG	2	8	374329	374336	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017904	AGGA	2	8	377604	377611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017904	CCGG	2	8	386585	386592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017904	GCGA	2	8	386666	386673	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017904	TGCG	2	8	386749	386756	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017904	CTGC	2	8	386808	386815	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017904	CGAC	2	8	388788	388795	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017904	CGAA	2	8	388858	388865	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017904	CCGG	2	8	396390	396397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017904	CCGA	2	8	396419	396426	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017904	CTCG	2	8	397987	397994	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017904	GGCC	2	8	404353	404360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017904	CCGA	2	8	404484	404491	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017904	CCGC	2	8	408836	408843	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
115	NC_017904	CCCA	2	8	414875	414882	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
116	NC_017904	GGCC	2	8	416315	416322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017904	TCCG	2	8	416342	416349	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017904	CTCG	2	8	420397	420404	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017904	TCGG	2	8	424591	424598	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017904	GCCC	2	8	425707	425714	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
121	NC_017904	CCCG	2	8	431670	431677	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
122	NC_017904	TATG	2	8	433571	433578	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017904	CCGC	2	8	442110	442117	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_017904	CCGG	2	8	442851	442858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017904	CGGG	2	8	451368	451375	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017904	GACC	2	8	451621	451628	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017904	CGAT	2	8	457932	457939	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017904	GAAC	2	8	459522	459529	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017904	GGCG	2	8	475887	475894	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017904	CGCC	2	8	487232	487239	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_017904	CTGG	2	8	489098	489105	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017904	GCCG	2	8	489346	489353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017904	CAAG	2	8	507325	507332	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017904	AAGC	2	8	515084	515091	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017904	CTTG	2	8	515093	515100	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017904	ATCC	2	8	535685	535692	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017904	ATCC	2	8	535699	535706	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017904	CTGG	2	8	537497	537504	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017904	GGCC	2	8	542983	542990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017904	CCGC	2	8	549316	549323	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
141	NC_017904	CGTC	2	8	555407	555414	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017904	GCCA	2	8	558225	558232	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017904	CCCG	2	8	558291	558298	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
144	NC_017904	CCGG	2	8	571175	571182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017904	CCTG	2	8	575751	575758	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017904	CCCG	2	8	575797	575804	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
147	NC_017904	CCGC	2	8	578635	578642	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
148	NC_017904	AGCG	2	8	578679	578686	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017904	CCGA	2	8	578779	578786	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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151	NC_017904	GTCC	2	8	594800	594807	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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482	NC_017904	CCGG	2	8	1754180	1754187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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484	NC_017904	CTCG	2	8	1755986	1755993	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
485	NC_017904	CGGT	2	8	1757138	1757145	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
486	NC_017904	GTCG	2	8	1757146	1757153	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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497	NC_017904	TCGG	2	8	1833360	1833367	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
498	NC_017904	GGGC	2	8	1841359	1841366	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
499	NC_017904	CGGC	2	8	1841562	1841569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
500	NC_017904	GGTC	2	8	1847435	1847442	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

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