MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli Xuzhou21 plasmid pO157_Sal

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017903	CTGAC	2	10	695	704	20 %	20 %	20 %	40 %	387873358
2	NC_017903	CTTAA	2	10	1588	1597	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017903	AATGC	2	10	2319	2328	40 %	20 %	20 %	20 %	387873361
4	NC_017903	ACTAC	2	10	2347	2356	40 %	20 %	0 %	40 %	387873361
5	NC_017903	ACAGT	2	10	5564	5573	40 %	20 %	20 %	20 %	387873364
6	NC_017903	AAACT	2	10	6801	6810	60 %	20 %	0 %	20 %	387873365
7	NC_017903	CAGGT	2	10	7433	7442	20 %	20 %	40 %	20 %	387873367
8	NC_017903	ACGTT	2	10	8239	8248	20 %	40 %	20 %	20 %	387873368
9	NC_017903	GATTT	2	10	10389	10398	20 %	60 %	20 %	0 %	387873370
10	NC_017903	TAAAA	2	10	12766	12775	80 %	20 %	0 %	0 %	387873371
11	NC_017903	TACAG	2	10	13695	13704	40 %	20 %	20 %	20 %	387873373
12	NC_017903	CGTTA	2	10	15550	15559	20 %	40 %	20 %	20 %	387873374
13	NC_017903	ATTGT	2	10	17596	17605	20 %	60 %	20 %	0 %	387873378
14	NC_017903	CATTA	2	10	18023	18032	40 %	40 %	0 %	20 %	387873378
15	NC_017903	TTGAT	2	10	18390	18399	20 %	60 %	20 %	0 %	387873378
16	NC_017903	TGTTA	2	10	19240	19249	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017903	ACCCT	2	10	19276	19285	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_017903	TACCC	2	10	20578	20587	20 %	20 %	0 %	60 %	387873384
19	NC_017903	CCCTA	2	10	21752	21761	20 %	20 %	0 %	60 %	387873387
20	NC_017903	TTTTA	2	10	23423	23432	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017903	ATGCC	2	10	23671	23680	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_017903	CGATA	2	10	24443	24452	40 %	20 %	20 %	20 %	387873393
23	NC_017903	ACCGC	2	10	24487	24496	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_017903	AGCGA	2	10	24519	24528	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017903	CCCGC	2	10	24666	24675	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
26	NC_017903	CCCTG	2	10	24714	24723	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_017903	TAGTT	2	10	26651	26660	20 %	60 %	20 %	0 %	387873394
28	NC_017903	AAGAT	2	10	26794	26803	60 %	20 %	20 %	0 %	387873394
29	NC_017903	ATTTC	2	10	26823	26832	20 %	60 %	0 %	20 %	387873394
30	NC_017903	ATTTA	2	10	26860	26869	40 %	60 %	0 %	0 %	387873394
31	NC_017903	TTTTC	2	10	27027	27036	0 %	80 %	0 %	20 %	387873394
32	NC_017903	TCTAC	2	10	27071	27080	20 %	40 %	0 %	40 %	387873394
33	NC_017903	TGGCT	2	10	27186	27195	0 %	40 %	40 %	20 %	387873394
34	NC_017903	ATTGT	2	10	31635	31644	20 %	60 %	20 %	0 %	387873401
35	NC_017903	ACAAT	2	10	31645	31654	60 %	20 %	0 %	20 %	387873401
36	NC_017903	ATAGT	2	10	34130	34139	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017903	GAGGG	2	10	34220	34229	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017903	TATGT	2	10	34624	34633	20 %	60 %	20 %	0 %	387873406
39	NC_017903	TAAGT	2	10	36716	36725	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017903	TTCCT	2	10	37212	37221	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.