MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis Bi-07 chromosome

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017867	ATGGGC	2	12	18926	18937	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017867	AGTATG	2	12	32319	32330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017867	TGTGGT	2	12	45550	45561	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017867	GGAAAA	2	12	51364	51375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017867	TTCCAG	2	12	57736	57747	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017867	CATGAG	2	12	60441	60452	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017867	GGGCGG	2	12	108645	108656	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017867	TCCAAA	2	12	111346	111357	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017867	TACAAA	2	12	140075	140086	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017867	CTGGCA	2	12	147190	147201	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017867	GATAGG	2	12	166273	166284	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017867	GCATGG	2	12	166564	166575	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017867	GGCGCG	2	12	201057	201068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017867	GCGCCC	2	12	225723	225734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017867	GAGACG	2	12	286878	286889	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017867	AGAGGA	2	12	291620	291631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017867	GCTGTT	2	12	299252	299263	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017867	TCGTGC	2	12	317006	317017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017867	TCACCG	2	12	318167	318178	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017867	CAACGC	2	12	320066	320077	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017867	ACACGC	2	12	320363	320374	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017867	CGAGTT	2	12	321408	321419	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017867	TCACCG	2	12	322013	322024	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017867	CACCGT	2	12	322230	322241	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017867	GGCACG	2	12	322593	322604	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017867	GTTCAG	2	12	324204	324215	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017867	GCTTTT	2	12	361234	361245	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017867	CGCATC	2	12	445672	445683	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017867	GCTGAA	2	12	482468	482479	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017867	GCAGCC	2	12	495377	495388	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017867	TGAGAT	2	12	498641	498652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017867	AAGGTA	2	12	499172	499183	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017867	TCCGCA	2	12	519554	519565	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017867	CATGCA	2	12	531101	531112	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017867	ATGCCG	2	12	564350	564361	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017867	GCGCAC	2	12	570248	570259	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017867	TCGCTC	2	12	653805	653816	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017867	GATTGC	2	12	655743	655754	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017867	TCGCTC	2	12	655800	655811	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017867	CGACAA	2	12	669305	669316	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017867	CATGCG	2	12	726561	726572	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017867	ATGCCC	2	12	760229	760240	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017867	GCCACC	2	12	807078	807089	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017867	TTAGAC	2	12	862398	862409	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017867	ACGAAT	2	12	873778	873789	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017867	GCCCTT	2	12	898706	898717	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017867	AAAAGG	2	12	916530	916541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017867	TATCGT	2	12	935557	935568	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017867	CGCCTG	2	12	1016923	1016934	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017867	GACATG	2	12	1091582	1091593	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017867	CCCATA	2	12	1109482	1109493	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017867	ACTCAT	2	12	1114151	1114162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017867	TTCCCT	2	12	1231960	1231971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017867	GAGCGC	2	12	1266126	1266137	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017867	CGTAAG	2	12	1348332	1348343	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017867	TCACAT	2	12	1406467	1406478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017867	GGCCAA	2	12	1424703	1424714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017867	TGGCTG	2	12	1463589	1463600	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017867	TTGCAC	2	12	1477609	1477620	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017867	CGCTTT	2	12	1494363	1494374	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017867	TCAATC	2	12	1512523	1512534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017867	GCCGTT	2	12	1513089	1513100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017867	TGCGCG	2	12	1541475	1541486	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017867	CGCTTG	2	12	1581186	1581197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017867	ATGTTT	2	12	1642151	1642162	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017867	TCGATT	2	12	1643517	1643528	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017867	AGAGAA	2	12	1656877	1656888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017867	CGAGAG	2	12	1657564	1657575	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017867	GTCGAC	2	12	1688318	1688329	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017867	ATCTTG	2	12	1749791	1749802	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017867	CAAAAA	2	12	1756121	1756132	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017867	CAACCC	2	12	1771948	1771959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017867	CCTTTG	2	12	1810015	1810026	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017867	GCAATC	2	12	1824575	1824586	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017867	CATCTC	2	12	1836506	1836517	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017867	CAATCT	2	12	1836610	1836621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017867	ATGGGA	2	12	1862267	1862278	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017867	CCTTTG	2	12	1886237	1886248	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017867	CTATAC	2	12	1934754	1934765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.