MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis B420 chromosome

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017866	ATGGGC	2	12	18926	18937	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017866	TGTGGT	2	12	45550	45561	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017866	GGAAAA	2	12	51364	51375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017866	TTCCAG	2	12	57736	57747	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017866	CATGAG	2	12	60441	60452	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017866	GGGCGG	2	12	108645	108656	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017866	TCCAAA	2	12	111346	111357	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017866	TACAAA	2	12	140075	140086	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017866	CTGGCA	2	12	147190	147201	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017866	GATAGG	2	12	166273	166284	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017866	GCATGG	2	12	166564	166575	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017866	GGCGCG	2	12	201056	201067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017866	GCGCCC	2	12	225722	225733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017866	ACTATG	2	12	240037	240048	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017866	GAGACG	2	12	286877	286888	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017866	AGAGGA	2	12	291619	291630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017866	GCTGTT	2	12	299250	299261	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017866	TCGTGC	2	12	317004	317015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017866	TCACCG	2	12	318165	318176	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017866	CAACGC	2	12	320064	320075	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017866	ACACGC	2	12	320361	320372	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017866	CGAGTT	2	12	321406	321417	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017866	TCACCG	2	12	322011	322022	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017866	CACCGT	2	12	322228	322239	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017866	GGCACG	2	12	322591	322602	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017866	GTTCAG	2	12	324202	324213	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017866	GCTTTT	2	12	361232	361243	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017866	CGCATC	2	12	445670	445681	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017866	GCTGAA	2	12	482466	482477	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017866	GCAGCC	2	12	495375	495386	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017866	TGAGAT	2	12	498639	498650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017866	AAGGTA	2	12	499170	499181	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017866	TCCGCA	2	12	519552	519563	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017866	CATGCA	2	12	531099	531110	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017866	ATGCCG	2	12	564348	564359	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017866	GCGCAC	2	12	570246	570257	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017866	TCGGGA	2	12	619333	619344	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017866	GGAATC	2	12	619393	619404	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017866	TCGCTC	2	12	653804	653815	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017866	GATTGC	2	12	655742	655753	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017866	TCGCTC	2	12	655799	655810	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017866	CGACAA	2	12	669304	669315	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017866	CATGCG	2	12	726558	726569	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017866	ATGCCC	2	12	760226	760237	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017866	GCCACC	2	12	807075	807086	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017866	TTAGAC	2	12	862395	862406	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017866	ACGAAT	2	12	873775	873786	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017866	GCCCTT	2	12	898703	898714	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017866	AAAAGG	2	12	916527	916538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017866	TATCGT	2	12	935554	935565	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017866	CGCCTG	2	12	1016920	1016931	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017866	GACATG	2	12	1091579	1091590	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017866	CCCATA	2	12	1109479	1109490	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017866	TTCCCT	2	12	1231956	1231967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017866	GAGCGC	2	12	1266122	1266133	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017866	CGTAAG	2	12	1348328	1348339	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017866	TCACAT	2	12	1406463	1406474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017866	GGCCAA	2	12	1424699	1424710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017866	TGGCTG	2	12	1463584	1463595	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017866	TTGCAC	2	12	1477602	1477613	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017866	CGCTTT	2	12	1494357	1494368	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017866	CTTGCC	2	12	1501496	1501507	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017866	GCCGTT	2	12	1512868	1512879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017866	TGCGCG	2	12	1541254	1541265	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017866	CGCTTG	2	12	1580965	1580976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017866	GTCGAG	2	12	1590969	1590980	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017866	ATGTTT	2	12	1641933	1641944	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017866	TCGATT	2	12	1643299	1643310	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017866	AGAGAA	2	12	1656658	1656669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017866	CGAGAG	2	12	1657345	1657356	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017866	GTCGAC	2	12	1688099	1688110	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017866	ATCTTG	2	12	1749571	1749582	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017866	CAAAAA	2	12	1755901	1755912	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017866	CCTTTG	2	12	1809795	1809806	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017866	GCAATC	2	12	1824355	1824366	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017866	CATCTC	2	12	1836285	1836296	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017866	CAATCT	2	12	1836389	1836400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017866	ATGGGA	2	12	1862045	1862056	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017866	CCTTTG	2	12	1886013	1886024	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017866	ATCGAT	2	12	1911817	1911828	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017866	CTATAC	2	12	1934527	1934538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.